RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000299155.9

AMN-201, Transcript of amnion associated transmembrane protein, humanhuman

APPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC

Gene AMN, Length 1,907 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Endoplasmic reticulum, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AMN-201ENST00000299155 RRP7BPQ9NSQ0 103 aa38.43■■■■□ 3.74
AMN-201ENST00000299155 ZNF644Q9H582 1327 aaPredicted RBP38.42■■■■□ 3.74
AMN-201ENST00000299155 CFDP1Q9UEE9 299 aaPredicted RBP38.41■■■■□ 3.74
AMN-201ENST00000299155 TIMELESSQ9UNS1 1208 aa38.4■■■■□ 3.74
AMN-201ENST00000299155 CDC42BPAQ5VT25 1732 aa38.37■■■■□ 3.73
AMN-201ENST00000299155 SIN3AQ96ST3 1273 aa38.35■■■■□ 3.73
AMN-201ENST00000299155 KDM6BO15054 1643 aa38.34■■■■□ 3.73
AMN-201ENST00000299155 ABCC2Q92887 1545 aa38.34■■■■□ 3.73
AMN-201ENST00000299155 ACIN1Q9UKV3 1341 aaKnown RBP38.29■■■■□ 3.72
AMN-201ENST00000299155 CROCC2H7BZ55 1655 aa38.27■■■■□ 3.72
AMN-201ENST00000299155 NEUROD1Q13562 356 aa38.25■■■■□ 3.71
AMN-201ENST00000299155 ADGBQ8N7X0 1667 aa38.24■■■■□ 3.71
AMN-201ENST00000299155 ADGRL2O95490 1459 aa38.22■■■■□ 3.71
AMN-201ENST00000299155 UHRF1BP1LA0JNW5 1464 aa38.19■■■■□ 3.7
AMN-201ENST00000299155 DENND4BO75064 1496 aaPredicted RBP38.18■■■■□ 3.7
AMN-201ENST00000299155 ZNF777Q9ULD5 760 aaPredicted RBP38.18■■■■□ 3.7
AMN-201ENST00000299155 NCOA1Q15788 1441 aa38.15■■■■□ 3.7
AMN-201ENST00000299155 PREX2Q70Z35 1606 aa38.14■■■■□ 3.7
AMN-201ENST00000299155 SHANK2Q9UPX8 1470 aa38.13■■■■□ 3.69
AMN-201ENST00000299155 TRIM52Q96A61 297 aa38.12■■■■□ 3.69
AMN-201ENST00000299155 CDC42BPBQ9Y5S2 1711 aa38.09■■■■□ 3.69
AMN-201ENST00000299155 ARHGEF5Q12774 1597 aa38.07■■■■□ 3.69
AMN-201ENST00000299155 PPP1R15AO75807 674 aaPredicted RBP38.07■■■■□ 3.69
AMN-201ENST00000299155 KDM5BQ9UGL1 1544 aa38.07■■■■□ 3.68
AMN-201ENST00000299155 TONSLQ96HA7 1378 aa38.05■■■■□ 3.68
AMN-201ENST00000299155 MPHOSPH9Q99550 1183 aa38.05■■■■□ 3.68
AMN-201ENST00000299155 ZCCHC11Q5TAX3 1644 aaKnown RBP38.05■■■■□ 3.68
AMN-201ENST00000299155 ANKRD30AQ9BXX3 1397 aa38.05■■■■□ 3.68
AMN-201ENST00000299155 GEMIN5Q8TEQ6 1508 aaKnown RBP eCLIP38.04■■■■□ 3.68
AMN-201ENST00000299155 TTC37Q6PGP7 1564 aa38.03■■■■□ 3.68
AMN-201ENST00000299155 SAMD9LQ8IVG5 1584 aa38.02■■■■□ 3.68
AMN-201ENST00000299155 MBD5Q9P267 1494 aa38■■■■□ 3.67
AMN-201ENST00000299155 C9orf84Q5VXU9 1444 aa37.99■■■■□ 3.67
AMN-201ENST00000299155 MYO5CQ9NQX4 1742 aa37.93■■■■□ 3.66
AMN-201ENST00000299155 CCDC141Q6ZP82 1450 aa37.91■■■■□ 3.66
AMN-201ENST00000299155 RSPH4AQ5TD94 716 aa37.89■■■■□ 3.66
AMN-201ENST00000299155 ARHGAP5Q13017 1502 aa37.89■■■■□ 3.66
AMN-201ENST00000299155 ANKRD50Q9ULJ7 1429 aa37.89■■■■□ 3.66
AMN-201ENST00000299155 TSPY4P0CV99 314 aa37.89■■■■□ 3.66
AMN-201ENST00000299155 TSPY10P0CW01 314 aa37.89■■■■□ 3.66
AMN-201ENST00000299155 PZPP20742 1482 aa37.88■■■■□ 3.65
AMN-201ENST00000299155 HNRNPMP52272 730 aaKnown RBP eCLIP37.87■■■■□ 3.65
AMN-201ENST00000299155 ANKRD30BQ9BXX2 1392 aa37.86■■■■□ 3.65
AMN-201ENST00000299155 MIER1Q8N108 512 aa37.85■■■■□ 3.65
AMN-201ENST00000299155 PLEKHH2Q8IVE3 1493 aa37.82■■■■□ 3.65
AMN-201ENST00000299155 SLC4A1APQ9BWU0 796 aaKnown RBP37.81■■■■□ 3.64
AMN-201ENST00000299155 KIAA1107Q9UPP5 1409 aa37.81■■■■□ 3.64
AMN-201ENST00000299155 SYCP2Q9BX26 1530 aa37.81■■■■□ 3.64
AMN-201ENST00000299155 MAST1Q9Y2H9 1570 aa37.8■■■■□ 3.64
AMN-201ENST00000299155 PLCH2O75038 1416 aa37.79■■■■□ 3.64
AMN-201ENST00000299155 KCNH8Q96L42 1107 aa37.77■■■■□ 3.64
AMN-201ENST00000299155 FOXD1Q16676 465 aa37.76■■■■□ 3.64
AMN-201ENST00000299155 KIF15Q9NS87 1388 aa37.76■■■■□ 3.64
AMN-201ENST00000299155 RPRD2Q5VT52 1461 aaKnown RBP37.76■■■■□ 3.64
AMN-201ENST00000299155 KDM5DQ9BY66 1539 aa37.73■■■■□ 3.63
AMN-201ENST00000299155 ARAP3Q8WWN8 1544 aa37.69■■■■□ 3.62
AMN-201ENST00000299155 WDR7Q9Y4E6 1490 aa37.68■■■■□ 3.62
AMN-201ENST00000299155 PLXNC1O60486 1568 aa37.63■■■■□ 3.62
AMN-201ENST00000299155 ARHGEF12Q9NZN5 1544 aa37.63■■■■□ 3.62
AMN-201ENST00000299155 EFCAB2Q5VUJ9 269 aa37.63■■■■□ 3.61
AMN-201ENST00000299155 ABCC1P33527 1531 aa37.62■■■■□ 3.61
AMN-201ENST00000299155 TEX14Q8IWB6 1497 aa37.62■■■■□ 3.61
AMN-201ENST00000299155 NUP155O75694 1391 aa37.59■■■■□ 3.61
AMN-201ENST00000299155 L3MBTL2Q969R5 705 aa37.59■■■■□ 3.61
AMN-201ENST00000299155 CYB5RLQ6IPT4 315 aa37.57■■■■□ 3.6
AMN-201ENST00000299155 PKD2Q13563 968 aa37.56■■■■□ 3.6
AMN-201ENST00000299155 RIMBP3CA6NJZ7 1639 aa37.55■■■■□ 3.6
AMN-201ENST00000299155 RIMBP3BA6NNM3 1639 aa37.55■■■■□ 3.6
AMN-201ENST00000299155 RIMBP3Q9UFD9 1639 aa37.55■■■■□ 3.6
AMN-201ENST00000299155 ABCA9Q8IUA7 1624 aa37.54■■■■□ 3.6
AMN-201ENST00000299155 UNC13BO14795 1591 aa37.49■■■■□ 3.59
AMN-201ENST00000299155 ASXL2Q76L83 1435 aa37.48■■■■□ 3.59
AMN-201ENST00000299155 CENPBP07199 599 aaPredicted RBP37.48■■■■□ 3.59
AMN-201ENST00000299155 DUOX2Q9NRD8 1548 aa37.47■■■■□ 3.59
AMN-201ENST00000299155 TRAPPC8Q9Y2L5 1435 aa37.44■■■■□ 3.58
AMN-201ENST00000299155 FAM135AQ9P2D6 1515 aa37.44■■■■□ 3.58
AMN-201ENST00000299155 NPM1P06748 294 aaKnown RBP eCLIP37.44■■■■□ 3.58
AMN-201ENST00000299155 HIRIP3Q9BW71 556 aaPredicted RBP37.42■■■■□ 3.58
AMN-201ENST00000299155 ERBINQ96RT1 1412 aa37.4■■■■□ 3.58
AMN-201ENST00000299155 RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 1400 aa37.38■■■■□ 3.57
AMN-201ENST00000299155 FANCAO15360 1455 aa37.37■■■■□ 3.57
AMN-201ENST00000299155 DDX10Q13206 875 aaKnown RBP37.36■■■■□ 3.57
AMN-201ENST00000299155 MAGI2Q86UL8 1455 aa37.34■■■■□ 3.57
AMN-201ENST00000299155 IQGAP3Q86VI3 1631 aa37.33■■■■□ 3.57
AMN-201ENST00000299155 NBPF8Q3BBV2 869 aa37.33■■■■□ 3.57
AMN-201ENST00000299155 ZFYVE16Q7Z3T8 1539 aa37.31■■■■□ 3.56
AMN-201ENST00000299155 HSPA5P11021 654 aaKnown RBP37.28■■■■□ 3.56
AMN-201ENST00000299155 EIF4G2P78344 907 aaKnown RBP eCLIP37.28■■■■□ 3.56
AMN-201ENST00000299155 SPAG9O60271 1321 aaKnown RBP37.27■■■■□ 3.56
AMN-201ENST00000299155 YTHDC1Q96MU7 727 aaKnown RBP37.26■■■■□ 3.56
AMN-201ENST00000299155 INO80Q9ULG1 1556 aaPredicted RBP37.23■■■■□ 3.55
AMN-201ENST00000299155 ADGRL1O94910 1474 aa37.23■■■■□ 3.55
AMN-201ENST00000299155 AFAP1Q8N556 730 aa37.22■■■■□ 3.55
AMN-201ENST00000299155 UHRF1BP1Q6BDS2 1440 aa37.19■■■■□ 3.54
AMN-201ENST00000299155 ATP7AQ04656 1500 aa37.18■■■■□ 3.54
AMN-201ENST00000299155 SCAPERQ9BY12 1400 aa37.17■■■■□ 3.54
AMN-201ENST00000299155 SPATA31E1Q6ZUB1 1445 aa37.15■■■■□ 3.54
AMN-201ENST00000299155 GRWD1Q9BQ67 446 aaKnown RBP eCLIP37.14■■■■□ 3.54
AMN-201ENST00000299155 PLA2R1Q13018 1463 aa37.12■■■■□ 3.53
AMN-201ENST00000299155 SCAF1Q9H7N4 1312 aaKnown RBP37.11■■■■□ 3.53
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 7.7 ms