RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000284273.5

UBASH3B-201, Transcript of ubiquitin associated and SH3 domain containing B, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene UBASH3B, Length 6,912 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBASH3B-201ENST00000284273 HDGFP51858 240 aaKnown RBP15.25■□□□□ 0.03
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UBASH3B-201ENST00000284273 GOLGA6L4A6NEF3 574 aa15.23■□□□□ 0.03
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UBASH3B-201ENST00000284273 GTF2E1P29083 439 aaPredicted RBP15.22■□□□□ 0.03
UBASH3B-201ENST00000284273 FRAT2O75474 233 aaPredicted RBP15.22■□□□□ 0.03
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UBASH3B-201ENST00000284273 U2AF1Q01081 240 aaKnown RBP eCLIP15.13■□□□□ 0.01
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UBASH3B-201ENST00000284273 CNKSR2Q8WXI2 1034 aa15.02■□□□□ -0
UBASH3B-201ENST00000284273 WASHC2CQ9Y4E1 1318 aa15.02□□□□□ -0.01
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UBASH3B-201ENST00000284273 ZFP91-CNTFA0A0A6YYC7 529 aaPredicted RBP15□□□□□ -0.01
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UBASH3B-201ENST00000284273 L1TD1Q5T7N2 865 aaKnown RBP14.99□□□□□ -0.01
UBASH3B-201ENST00000284273 ROCK2O75116 1388 aaKnown RBP14.99□□□□□ -0.01
UBASH3B-201ENST00000284273 STK31Q9BXU1 1019 aa14.99□□□□□ -0.01
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UBASH3B-201ENST00000284273 CHMP4BQ9H444 224 aaKnown RBP14.98□□□□□ -0.01
UBASH3B-201ENST00000284273 PES1O00541 588 aaKnown RBP14.97□□□□□ -0.01
UBASH3B-201ENST00000284273 ZNF428Q96B54 188 aa14.97□□□□□ -0.01
UBASH3B-201ENST00000284273 TRIM34Q9BYJ4 488 aa14.97□□□□□ -0.01
UBASH3B-201ENST00000284273 FOXD4L6Q3SYB3 417 aaPredicted RBP14.97□□□□□ -0.01
UBASH3B-201ENST00000284273 FOXD4L3Q6VB84 417 aaPredicted RBP14.97□□□□□ -0.01
UBASH3B-201ENST00000284273 CTDP1Q9Y5B0 961 aaPredicted RBP14.97□□□□□ -0.01
UBASH3B-201ENST00000284273 NUTM2GQ5VZR2 741 aa14.96□□□□□ -0.01
UBASH3B-201ENST00000284273 USP35Q9P2H5 1018 aa14.96□□□□□ -0.01
UBASH3B-201ENST00000284273 MS4A1P11836 297 aa14.96□□□□□ -0.01
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UBASH3B-201ENST00000284273 A0A0U1RQG5 324 aaPredicted RBP14.93□□□□□ -0.02
UBASH3B-201ENST00000284273 FAM177BA6PVY3 158 aa14.93□□□□□ -0.02
UBASH3B-201ENST00000284273 SLKQ9H2G2 1235 aaPredicted RBP14.93□□□□□ -0.02
UBASH3B-201ENST00000284273 TCEAL9Q9UHQ7 104 aa14.92□□□□□ -0.02
UBASH3B-201ENST00000284273 MTMR7Q9Y216 660 aa14.92□□□□□ -0.02
UBASH3B-201ENST00000284273 KDM4AO75164 1064 aa14.91□□□□□ -0.02
UBASH3B-201ENST00000284273 CECR2Q9BXF3 1484 aa14.91□□□□□ -0.02
UBASH3B-201ENST00000284273 C1orf141Q5JVX7 400 aa14.91□□□□□ -0.02
UBASH3B-201ENST00000284273 FYB1O15117 783 aa14.91□□□□□ -0.02
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UBASH3B-201ENST00000284273 DCAF8L1A6NGE4 600 aa14.91□□□□□ -0.02
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