RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000235150.4

RNF19B-201, Transcript of ring finger protein 19B, humanhuman

APPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC

Gene RNF19B, Length 2,334 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNF19B-201ENST00000235150 ZNF644Q9H582 1327 aaPredicted RBP35.99■■■■□ 3.35
RNF19B-201ENST00000235150 CDC42BPAQ5VT25 1732 aa35.95■■■■□ 3.35
RNF19B-201ENST00000235150 PLEKHD1A6NEE1 506 aa35.95■■■■□ 3.35
RNF19B-201ENST00000235150 CFDP1Q9UEE9 299 aaPredicted RBP35.95■■■■□ 3.35
RNF19B-201ENST00000235150 ABCC10Q5T3U5 1492 aa35.95■■■■□ 3.34
RNF19B-201ENST00000235150 MIER1Q8N108 512 aa35.94■■■■□ 3.34
RNF19B-201ENST00000235150 CROCC2H7BZ55 1655 aa35.92■■■■□ 3.34
RNF19B-201ENST00000235150 ACIN1Q9UKV3 1341 aaKnown RBP35.91■■■■□ 3.34
RNF19B-201ENST00000235150 DENND4BO75064 1496 aaPredicted RBP35.91■■■■□ 3.34
RNF19B-201ENST00000235150 ADGBQ8N7X0 1667 aa35.9■■■■□ 3.34
RNF19B-201ENST00000235150 PPP1R15AO75807 674 aaPredicted RBP35.89■■■■□ 3.34
RNF19B-201ENST00000235150 TONSLQ96HA7 1378 aa35.86■■■■□ 3.33
RNF19B-201ENST00000235150 CLASP1Q7Z460 1538 aa35.83■■■■□ 3.33
RNF19B-201ENST00000235150 ADGRL2O95490 1459 aa35.82■■■■□ 3.32
RNF19B-201ENST00000235150 TRIM52Q96A61 297 aa35.82■■■■□ 3.32
RNF19B-201ENST00000235150 ERCC6L2Q5T890 1561 aa35.81■■■■□ 3.32
RNF19B-201ENST00000235150 NCOA1Q15788 1441 aa35.77■■■■□ 3.32
RNF19B-201ENST00000235150 MPHOSPH9Q99550 1183 aa35.75■■■■□ 3.31
RNF19B-201ENST00000235150 ABCC2Q92887 1545 aa35.74■■■■□ 3.31
RNF19B-201ENST00000235150 ZNF777Q9ULD5 760 aaPredicted RBP35.74■■■■□ 3.31
RNF19B-201ENST00000235150 KDM5BQ9UGL1 1544 aa35.73■■■■□ 3.31
RNF19B-201ENST00000235150 CENPBP07199 599 aaPredicted RBP35.73■■■■□ 3.31
RNF19B-201ENST00000235150 SHANK2Q9UPX8 1470 aa35.72■■■■□ 3.31
RNF19B-201ENST00000235150 PREX2Q70Z35 1606 aa35.69■■■■□ 3.3
RNF19B-201ENST00000235150 CDC42BPBQ9Y5S2 1711 aa35.66■■■■□ 3.3
RNF19B-201ENST00000235150 ANKRD30AQ9BXX3 1397 aa35.65■■■■□ 3.3
RNF19B-201ENST00000235150 ARHGEF5Q12774 1597 aa35.64■■■■□ 3.3
RNF19B-201ENST00000235150 C9orf84Q5VXU9 1444 aa35.58■■■■□ 3.29
RNF19B-201ENST00000235150 SAMD9LQ8IVG5 1584 aa35.58■■■■□ 3.29
RNF19B-201ENST00000235150 ANKRD30BQ9BXX2 1392 aa35.58■■■■□ 3.29
RNF19B-201ENST00000235150 PZPP20742 1482 aa35.57■■■■□ 3.28
RNF19B-201ENST00000235150 UHRF1BP1LA0JNW5 1464 aa35.56■■■■□ 3.28
RNF19B-201ENST00000235150 TTC37Q6PGP7 1564 aa35.56■■■■□ 3.28
RNF19B-201ENST00000235150 SCAF1Q9H7N4 1312 aaKnown RBP35.56■■■■□ 3.28
RNF19B-201ENST00000235150 MBD5Q9P267 1494 aa35.55■■■■□ 3.28
RNF19B-201ENST00000235150 GEMIN5Q8TEQ6 1508 aaKnown RBP eCLIP35.54■■■■□ 3.281e-6■■■□□ 15.5
RNF19B-201ENST00000235150 ANKRD50Q9ULJ7 1429 aa35.52■■■■□ 3.28
RNF19B-201ENST00000235150 RPRD2Q5VT52 1461 aaKnown RBP35.51■■■■□ 3.28
RNF19B-201ENST00000235150 SLC4A1APQ9BWU0 796 aaKnown RBP35.51■■■■□ 3.27
RNF19B-201ENST00000235150 ZCCHC11Q5TAX3 1644 aaKnown RBP35.51■■■■□ 3.27
RNF19B-201ENST00000235150 FOXD1Q16676 465 aa35.5■■■■□ 3.27
RNF19B-201ENST00000235150 MYO5CQ9NQX4 1742 aa35.48■■■■□ 3.27
RNF19B-201ENST00000235150 CCDC141Q6ZP82 1450 aa35.48■■■■□ 3.27
RNF19B-201ENST00000235150 YTHDC1Q96MU7 727 aaKnown RBP35.47■■■■□ 3.27
RNF19B-201ENST00000235150 TSPY4P0CV99 314 aa35.46■■■■□ 3.27
RNF19B-201ENST00000235150 TSPY10P0CW01 314 aa35.46■■■■□ 3.27
RNF19B-201ENST00000235150 HNRNPMP52272 730 aaKnown RBP eCLIP35.43■■■■□ 3.26
RNF19B-201ENST00000235150 ARHGAP5Q13017 1502 aa35.42■■■■□ 3.26
RNF19B-201ENST00000235150 RSPH4AQ5TD94 716 aa35.41■■■■□ 3.26
RNF19B-201ENST00000235150 TEX14Q8IWB6 1497 aa35.4■■■■□ 3.26
RNF19B-201ENST00000235150 KDM5DQ9BY66 1539 aa35.4■■■■□ 3.26
RNF19B-201ENST00000235150 KIAA1107Q9UPP5 1409 aa35.38■■■■□ 3.25
RNF19B-201ENST00000235150 SYCP2Q9BX26 1530 aa35.38■■■■□ 3.25
RNF19B-201ENST00000235150 MAST1Q9Y2H9 1570 aa35.38■■■■□ 3.25
RNF19B-201ENST00000235150 KIF15Q9NS87 1388 aa35.37■■■■□ 3.25
RNF19B-201ENST00000235150 L3MBTL2Q969R5 705 aa35.37■■■■□ 3.25
RNF19B-201ENST00000235150 HIRIP3Q9BW71 556 aaPredicted RBP35.35■■■■□ 3.25
RNF19B-201ENST00000235150 PLEKHH2Q8IVE3 1493 aa35.34■■■■□ 3.25
RNF19B-201ENST00000235150 DDX10Q13206 875 aaKnown RBP35.34■■■■□ 3.25
RNF19B-201ENST00000235150 PLCH2O75038 1416 aa35.27■■■■□ 3.24
RNF19B-201ENST00000235150 NUP155O75694 1391 aa35.26■■■■□ 3.24
RNF19B-201ENST00000235150 PKD2Q13563 968 aa35.25■■■■□ 3.23
RNF19B-201ENST00000235150 PLXNC1O60486 1568 aa35.24■■■■□ 3.23
RNF19B-201ENST00000235150 KCNH8Q96L42 1107 aa35.24■■■■□ 3.23
RNF19B-201ENST00000235150 ARHGEF12Q9NZN5 1544 aa35.18■■■■□ 3.22
RNF19B-201ENST00000235150 ARAP3Q8WWN8 1544 aa35.17■■■■□ 3.22
RNF19B-201ENST00000235150 ABCC1P33527 1531 aa35.16■■■■□ 3.22
RNF19B-201ENST00000235150 HSPA5P11021 654 aaKnown RBP35.15■■■■□ 3.22
RNF19B-201ENST00000235150 UNC13BO14795 1591 aa35.15■■■■□ 3.22
RNF19B-201ENST00000235150 GTF3C3Q9Y5Q9 886 aa35.15■■■■□ 3.22
RNF19B-201ENST00000235150 EIF4G2P78344 907 aaKnown RBP eCLIP35.14■■■■□ 3.22
RNF19B-201ENST00000235150 NBPF8Q3BBV2 869 aa35.13■■■■□ 3.21
RNF19B-201ENST00000235150 EFCAB2Q5VUJ9 269 aa35.12■■■■□ 3.21
RNF19B-201ENST00000235150 FAM135AQ9P2D6 1515 aa35.12■■■■□ 3.21
RNF19B-201ENST00000235150 WDR7Q9Y4E6 1490 aa35.11■■■■□ 3.21
RNF19B-201ENST00000235150 DUOX2Q9NRD8 1548 aa35.07■■■■□ 3.2
RNF19B-201ENST00000235150 ABCA9Q8IUA7 1624 aa35.01■■■■□ 3.2
RNF19B-201ENST00000235150 WASHC2AQ641Q2 1341 aa35.01■■■■□ 3.19
RNF19B-201ENST00000235150 IQGAP3Q86VI3 1631 aa35■■■■□ 3.19
RNF19B-201ENST00000235150 SPATA31E1Q6ZUB1 1445 aa35■■■■□ 3.19
RNF19B-201ENST00000235150 ERBINQ96RT1 1412 aa35■■■■□ 3.19
RNF19B-201ENST00000235150 ANP32CO43423 234 aa34.99■■■■□ 3.19
RNF19B-201ENST00000235150 TRAPPC8Q9Y2L5 1435 aa34.98■■■■□ 3.19
RNF19B-201ENST00000235150 MAGI2Q86UL8 1455 aa34.97■■■■□ 3.19
RNF19B-201ENST00000235150 OSCARQ8IYS5 282 aa34.97■■■■□ 3.19
RNF19B-201ENST00000235150 POLR1AO95602 1720 aaPredicted RBP34.97■■■■□ 3.19
RNF19B-201ENST00000235150 CCER2I3L3R5 266 aa34.96■■■■□ 3.19
RNF19B-201ENST00000235150 UHRF1BP1Q6BDS2 1440 aa34.95■■■■□ 3.19
RNF19B-201ENST00000235150 RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 1400 aa34.91■■■■□ 3.18
RNF19B-201ENST00000235150 ASXL2Q76L83 1435 aa34.9■■■■□ 3.18
RNF19B-201ENST00000235150 ZFYVE16Q7Z3T8 1539 aa34.89■■■■□ 3.18
RNF19B-201ENST00000235150 FANCAO15360 1455 aa34.87■■■■□ 3.17
RNF19B-201ENST00000235150 CCDC7Q96M83 1385 aa34.86■■■■□ 3.17
RNF19B-201ENST00000235150 RALGAPBQ86X10 1494 aa34.86■■■■□ 3.17
RNF19B-201ENST00000235150 CNTLNQ9NXG0 1405 aa34.83■■■■□ 3.17
RNF19B-201ENST00000235150 SPAG9O60271 1321 aaKnown RBP34.82■■■■□ 3.17
RNF19B-201ENST00000235150 C11orf95C9JLR9 678 aaPredicted RBP34.82■■■■□ 3.16
RNF19B-201ENST00000235150 KDM5CP41229 1560 aa34.81■■■■□ 3.16
RNF19B-201ENST00000235150 CCDC144AA2RUR9 1427 aa34.81■■■■□ 3.16
RNF19B-201ENST00000235150 PLA2R1Q13018 1463 aa34.81■■■■□ 3.16
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 11.7 ms