RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000522399.1

TTC13-208, Transcript of tetratricopeptide repeat domain 13, human

TSL 4

Gene TTC13, Length 529 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Nucleus .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
TTC13-208	ENST00000522399	CLEC4D	Q8WXI8	215 aa		28.97	■■■□□ 2.23
TTC13-208	ENST00000522399	KAT14	Q9H8E8	782 aa		28.97	■■■□□ 2.23
TTC13-208	ENST00000522399	GOLGA8H	P0CJ92	632 aa		28.96	■■■□□ 2.23
TTC13-208	ENST00000522399	MFSD5	Q6N075	450 aa		28.96	■■■□□ 2.23
TTC13-208	ENST00000522399	SLC30A10	Q6XR72	485 aa		28.96	■■■□□ 2.23
TTC13-208	ENST00000522399	GUCD1	Q96NT3	240 aa		28.96	■■■□□ 2.23
TTC13-208	ENST00000522399		B4E1Z4	1266 aa		28.95	■■■□□ 2.22
TTC13-208	ENST00000522399	ZSCAN10	Q96SZ4	725 aa	Predicted RBP	28.95	■■■□□ 2.22
TTC13-208	ENST00000522399	SEZ6L	Q9BYH1	1024 aa		28.95	■■■□□ 2.22
TTC13-208	ENST00000522399	SUPT16H	Q9Y5B9	1047 aa	Known RBP	28.95	■■■□□ 2.22
TTC13-208	ENST00000522399	RPS6	P62753	249 aa	Known RBP	28.94	■■■□□ 2.22
TTC13-208	ENST00000522399	PPIG	Q13427	754 aa	Known RBP eCLIP	28.94	■■■□□ 2.22
TTC13-208	ENST00000522399	DUSP28	Q4G0W2	176 aa		28.94	■■■□□ 2.22
TTC13-208	ENST00000522399	TMEM199	Q8N511	208 aa		28.94	■■■□□ 2.22
TTC13-208	ENST00000522399	ANKS1A	Q92625	1134 aa		28.94	■■■□□ 2.22
TTC13-208	ENST00000522399	KRT23	Q9C075	422 aa		28.94	■■■□□ 2.22
TTC13-208	ENST00000522399	CNNM2	Q9H8M5	875 aa		28.94	■■■□□ 2.22
TTC13-208	ENST00000522399	ITGA7	Q13683	1181 aa		28.93	■■■□□ 2.22
TTC13-208	ENST00000522399	USH1G	Q495M9	461 aa		28.93	■■■□□ 2.22
TTC13-208	ENST00000522399	SLC43A3	Q8NBI5	491 aa		28.93	■■■□□ 2.22
TTC13-208	ENST00000522399	DNER	Q8NFT8	737 aa		28.93	■■■□□ 2.22
TTC13-208	ENST00000522399	WDR11	Q9BZH6	1224 aa		28.93	■■■□□ 2.22
TTC13-208	ENST00000522399	UBA5	Q9GZZ9	404 aa		28.93	■■■□□ 2.22
TTC13-208	ENST00000522399	ZSWIM5	Q9P217	1185 aa		28.93	■■■□□ 2.22
TTC13-208	ENST00000522399		B4DLN1	442 aa		28.92	■■■□□ 2.22
TTC13-208	ENST00000522399	CD4	P01730	458 aa		28.92	■■■□□ 2.22
TTC13-208	ENST00000522399	PTGS1	P23219	599 aa		28.92	■■■□□ 2.22
TTC13-208	ENST00000522399	MRPL12	P52815	198 aa	Known RBP	28.92	■■■□□ 2.22
TTC13-208	ENST00000522399	PDE4D	Q08499	809 aa		28.92	■■■□□ 2.22
TTC13-208	ENST00000522399	ASPRV1	Q53RT3	343 aa		28.92	■■■□□ 2.22
TTC13-208	ENST00000522399	ENAH	Q8N8S7	591 aa	Predicted RBP	28.92	■■■□□ 2.22
TTC13-208	ENST00000522399	PPP1R12C	Q9BZL4	782 aa		28.92	■■■□□ 2.22
TTC13-208	ENST00000522399	TMEM63B	Q5T3F8	832 aa		28.91	■■■□□ 2.22
TTC13-208	ENST00000522399	UBAC1	Q9BSL1	405 aa		28.91	■■■□□ 2.22
TTC13-208	ENST00000522399	SEMA6B	Q9H3T3	888 aa		28.91	■■■□□ 2.22
TTC13-208	ENST00000522399	TNKS	O95271	1327 aa		28.91	■■■□□ 2.22
TTC13-208	ENST00000522399	RBM47	A0AV96	593 aa	Known RBP	28.9	■■■□□ 2.22
TTC13-208	ENST00000522399	CDC37	Q16543	378 aa	Predicted RBP	28.9	■■■□□ 2.22
TTC13-208	ENST00000522399	RGS22	Q8NE09	1264 aa		28.9	■■■□□ 2.22
TTC13-208	ENST00000522399	BUD13	Q9BRD0	619 aa	Known RBP eCLIP	28.9	■■■□□ 2.22
TTC13-208	ENST00000522399	MAF1	Q9H063	256 aa		28.9	■■■□□ 2.22
TTC13-208	ENST00000522399	CPVL	Q9H3G5	476 aa		28.9	■■■□□ 2.22
TTC13-208	ENST00000522399	MYH6	P13533	1939 aa		28.89	■■■□□ 2.22
TTC13-208	ENST00000522399	HSFX4	A0A1B0GTS1	333 aa	Predicted RBP	28.89	■■■□□ 2.22
TTC13-208	ENST00000522399	HSFX3	A0A1B0GWH4	333 aa	Predicted RBP	28.89	■■■□□ 2.22
TTC13-208	ENST00000522399	CSF2RA	P15509	400 aa		28.89	■■■□□ 2.22
TTC13-208	ENST00000522399	CPT1A	P50416	773 aa		28.89	■■■□□ 2.22
TTC13-208	ENST00000522399	TTC22	Q5TAA0	569 aa		28.89	■■■□□ 2.22
TTC13-208	ENST00000522399	POLR3E	Q9NVU0	708 aa		28.89	■■■□□ 2.22
TTC13-208	ENST00000522399	TMEM265	A0A087WTH1	108 aa		28.88	■■■□□ 2.21
TTC13-208	ENST00000522399	PARP1	P09874	1014 aa	Known RBP	28.88	■■■□□ 2.21
TTC13-208	ENST00000522399	EDNRB	P24530	442 aa		28.88	■■■□□ 2.21
TTC13-208	ENST00000522399	PDE4A	P27815	886 aa		28.88	■■■□□ 2.21
TTC13-208	ENST00000522399	PPP2R5B	Q15173	497 aa		28.88	■■■□□ 2.21
TTC13-208	ENST00000522399	BRDT	Q58F21	947 aa	Predicted RBP	28.88	■■■□□ 2.21
TTC13-208	ENST00000522399	ADGRF4	Q8IZF3	695 aa		28.88	■■■□□ 2.21
TTC13-208	ENST00000522399	CDX2	Q99626	313 aa	Predicted RBP	28.88	■■■□□ 2.21
TTC13-208	ENST00000522399	UNC80	Q8N2C7	3258 aa		28.88	■■■□□ 2.21
TTC13-208	ENST00000522399	GRIN2D	O15399	1336 aa		28.88	■■■□□ 2.21
TTC13-208	ENST00000522399	ABCB11	O95342	1321 aa		28.88	■■■□□ 2.21
TTC13-208	ENST00000522399	RAD50	Q92878	1312 aa		28.88	■■■□□ 2.21
TTC13-208	ENST00000522399	NKRF	O15226	690 aa	Known RBP eCLIP	28.87	■■■□□ 2.21
TTC13-208	ENST00000522399	DHX16	O60231	1041 aa	Known RBP	28.87	■■■□□ 2.21
TTC13-208	ENST00000522399	PSMC6	P62333	389 aa		28.87	■■■□□ 2.21
TTC13-208	ENST00000522399	PSRC1	Q6PGN9	363 aa	Predicted RBP	28.87	■■■□□ 2.21
TTC13-208	ENST00000522399	OR6J1	Q8NGC5	347 aa		28.87	■■■□□ 2.21
TTC13-208	ENST00000522399	SCFD2	Q8WU76	684 aa		28.87	■■■□□ 2.21
TTC13-208	ENST00000522399	RUFY2	Q8WXA3	655 aa		28.87	■■■□□ 2.21
TTC13-208	ENST00000522399	TTYH1	Q9H313	450 aa	Predicted RBP	28.87	■■■□□ 2.21
TTC13-208	ENST00000522399	HIPK3	Q9H422	1215 aa		28.87	■■■□□ 2.21
TTC13-208	ENST00000522399	CDH23	Q9H251	3354 aa		28.87	■■■□□ 2.21
TTC13-208	ENST00000522399	DLL1	O00548	723 aa		28.86	■■■□□ 2.21
TTC13-208	ENST00000522399	GSPT1	P15170	499 aa	Known RBP	28.86	■■■□□ 2.21
TTC13-208	ENST00000522399	CYP2C18	P33260	490 aa		28.86	■■■□□ 2.21
TTC13-208	ENST00000522399	TMEM240	Q5SV17	173 aa		28.86	■■■□□ 2.21
TTC13-208	ENST00000522399	IFIT1B	Q5T764	474 aa	Known RBP	28.86	■■■□□ 2.21
TTC13-208	ENST00000522399	IL25	Q9H293	177 aa		28.86	■■■□□ 2.21
TTC13-208	ENST00000522399	GPHN	Q9NQX3	736 aa	Predicted RBP	28.86	■■■□□ 2.21
TTC13-208	ENST00000522399	C16orf59	Q7L2K0	433 aa		28.85	■■■□□ 2.21
TTC13-208	ENST00000522399	MCF2L2	Q86YR7	1114 aa		28.85	■■■□□ 2.21
TTC13-208	ENST00000522399	CUL9	Q8IWT3	2517 aa		28.84	■■■□□ 2.21
TTC13-208	ENST00000522399	B4GALT4	O60513	344 aa		28.84	■■■□□ 2.21
TTC13-208	ENST00000522399	PURA	Q00577	322 aa	Known RBP	28.84	■■■□□ 2.21
TTC13-208	ENST00000522399	TRDN	Q13061	729 aa		28.84	■■■□□ 2.21
TTC13-208	ENST00000522399	TRPV6	Q9H1D0	765 aa		28.84	■■■□□ 2.21
TTC13-208	ENST00000522399	IL23A	Q9NPF7	189 aa		28.84	■■■□□ 2.21
TTC13-208	ENST00000522399	MYL3	P08590	195 aa		28.83	■■■□□ 2.21
TTC13-208	ENST00000522399	DNAJB2	P25686	324 aa		28.83	■■■□□ 2.21
TTC13-208	ENST00000522399	QRICH1	Q2TAL8	776 aa		28.83	■■■□□ 2.21
TTC13-208	ENST00000522399	FBXO11	Q86XK2	927 aa		28.83	■■■□□ 2.21
TTC13-208	ENST00000522399	VAT1L	Q9HCJ6	419 aa		28.83	■■■□□ 2.21
TTC13-208	ENST00000522399	MRPL11	Q9Y3B7	192 aa	Known RBP	28.83	■■■□□ 2.21
TTC13-208	ENST00000522399	EYS	Q5T1H1	3165 aa		28.83	■■■□□ 2.21
TTC13-208	ENST00000522399	ACR	P10323	421 aa		28.82	■■■□□ 2.2
TTC13-208	ENST00000522399	TXN	P10599	105 aa	Known RBP	28.82	■■■□□ 2.2
TTC13-208	ENST00000522399	TTLL4	Q14679	1199 aa		28.82	■■■□□ 2.2
TTC13-208	ENST00000522399	ZNF365	Q70YC5	407 aa		28.82	■■■□□ 2.2
TTC13-208	ENST00000522399	NSUN6	Q8TEA1	469 aa	Known RBP	28.82	■■■□□ 2.2
TTC13-208	ENST00000522399	MTG1	Q9BT17	334 aa	Predicted RBP	28.82	■■■□□ 2.2
TTC13-208	ENST00000522399	ALDH8A1	Q9H2A2	487 aa	Predicted RBP	28.82	■■■□□ 2.2

Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 54.7 ms