RNA–Protein interactions for RNA: YKL195W

MIA40, Transcript of Mitochondrial oxidoreductase, yeast

Gene MIA40, Length 1,212 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Mitochondria .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
MIA40	YKL195W	IBD2	P53892	351 aa		6.46	□□□□□ -1.38
MIA40	YKL195W	YNL143C	P53908	130 aa		6.46	□□□□□ -1.38
MIA40	YKL195W	ARP4	P80428	489 aa		6.46	□□□□□ -1.38
MIA40	YKL195W	SPO19	Q03029	223 aa		6.46	□□□□□ -1.38
MIA40	YKL195W	GOT1	Q03554	138 aa		6.46	□□□□□ -1.38
MIA40	YKL195W	SPO71	Q03868	1245 aa		6.46	□□□□□ -1.38
MIA40	YKL195W	RCO1	Q04779	684 aa		6.46	□□□□□ -1.38
MIA40	YKL195W	MCP2	Q06567	569 aa		6.46	□□□□□ -1.38
MIA40	YKL195W	BSP1	Q06604	576 aa		6.46	□□□□□ -1.38
MIA40	YKL195W	CDA1	Q06702	301 aa		6.46	□□□□□ -1.38
MIA40	YKL195W	ASA1	Q06822	443 aa		6.46	□□□□□ -1.38
MIA40	YKL195W	YDL121C	Q07541	149 aa		6.46	□□□□□ -1.38
MIA40	YKL195W	MEU1	Q07938	337 aa	Known RBP RIP-Chip data	6.46	□□□□□ -1.38	not detected
MIA40	YKL195W	YOL019W	Q08157	551 aa		6.46	□□□□□ -1.38
MIA40	YKL195W	MCH5	Q08777	521 aa		6.46	□□□□□ -1.38
MIA40	YKL195W	NSL1	Q12143	216 aa		6.46	□□□□□ -1.38
MIA40	YKL195W	AHA1	Q12449	350 aa	Known RBP	6.46	□□□□□ -1.38
MIA40	YKL195W	CMR1	Q12510	522 aa	Known RBP	6.46	□□□□□ -1.38
MIA40	YKL195W	YLR149C	Q99296	730 aa		6.46	□□□□□ -1.38
MIA40	YKL195W	ATP2	P00830	511 aa	Known RBP	6.45	□□□□□ -1.38
MIA40	YKL195W	TPK2	P06245	380 aa		6.45	□□□□□ -1.38
MIA40	YKL195W	COS2	P0CX12	379 aa		6.45	□□□□□ -1.38
MIA40	YKL195W	COS3	P0CX13	379 aa		6.45	□□□□□ -1.38
MIA40	YKL195W	ARF2	P19146	181 aa	Known RBP	6.45	□□□□□ -1.38
MIA40	YKL195W	CCA1	P21269	546 aa		6.45	□□□□□ -1.38
MIA40	YKL195W	DAL81	P21657	970 aa		6.45	□□□□□ -1.38
MIA40	YKL195W	PEX1	P24004	1043 aa		6.45	□□□□□ -1.38
MIA40	YKL195W	DBR1	P24309	405 aa	Known RBP	6.45	□□□□□ -1.38
MIA40	YKL195W	BUB2	P26448	306 aa	Predicted RBP	6.45	□□□□□ -1.38
MIA40	YKL195W	DPH5	P32469	300 aa	Predicted RBP	6.45	□□□□□ -1.38
MIA40	YKL195W	NGG1	P32494	702 aa		6.45	□□□□□ -1.38
MIA40	YKL195W	WHI3	P34761	661 aa	Known RBP	6.45	□□□□□ -1.38
MIA40	YKL195W	LDB7	P38210	180 aa		6.45	□□□□□ -1.38
MIA40	YKL195W	ARP1	P38696	384 aa		6.45	□□□□□ -1.38
MIA40	YKL195W	PPX1	P38698	397 aa		6.45	□□□□□ -1.38
MIA40	YKL195W	STB5	P38699	743 aa		6.45	□□□□□ -1.38
MIA40	YKL195W	FMP10	P40098	244 aa		6.45	□□□□□ -1.38
MIA40	YKL195W	COS4	P43542	379 aa		6.45	□□□□□ -1.38
MIA40	YKL195W	PET130	P47065	347 aa		6.45	□□□□□ -1.38
MIA40	YKL195W	MPS3	P47069	682 aa		6.45	□□□□□ -1.38
MIA40	YKL195W	YJR154W	P47181	346 aa		6.45	□□□□□ -1.38
MIA40	YKL195W	AIM14	P53109	570 aa		6.45	□□□□□ -1.38
MIA40	YKL195W	GET1	P53192	235 aa		6.45	□□□□□ -1.38
MIA40	YKL195W	TOF2	Q02208	771 aa		6.45	□□□□□ -1.38
MIA40	YKL195W	YML131W	Q03102	365 aa		6.45	□□□□□ -1.38
MIA40	YKL195W	YMR206W	Q03695	313 aa		6.45	□□□□□ -1.38
MIA40	YKL195W	YDR132C	Q03900	495 aa		6.45	□□□□□ -1.38
MIA40	YKL195W	RIF2	Q06208	395 aa		6.45	□□□□□ -1.38
MIA40	YKL195W	MUM3	Q08750	479 aa		6.45	□□□□□ -1.38
MIA40	YKL195W	YLR049C	Q12110	428 aa		6.45	□□□□□ -1.38
MIA40	YKL195W	ICT1	Q12385	394 aa		6.45	□□□□□ -1.38
MIA40	YKL195W	SAS5	Q99314	248 aa		6.45	□□□□□ -1.38
MIA40	YKL195W	SPS1	P08458	490 aa		6.44	□□□□□ -1.38
MIA40	YKL195W	TUB1	P09733	447 aa	Known RBP	6.44	□□□□□ -1.38
MIA40	YKL195W	PMA2	P19657	947 aa		6.44	□□□□□ -1.38
MIA40	YKL195W	SFP1	P32432	683 aa		6.44	□□□□□ -1.38
MIA40	YKL195W	SFA1	P32771	386 aa		6.44	□□□□□ -1.38
MIA40	YKL195W	COX13	P32799	129 aa		6.44	□□□□□ -1.38
MIA40	YKL195W	LIP5	P32875	414 aa		6.44	□□□□□ -1.38
MIA40	YKL195W	CSE1	P33307	960 aa		6.44	□□□□□ -1.38
MIA40	YKL195W	CYC2	P38909	366 aa		6.44	□□□□□ -1.38
MIA40	YKL195W	DHH1	P39517	506 aa	Known RBP	6.44	□□□□□ -1.38
MIA40	YKL195W	PDS1	P40316	373 aa	Predicted RBP	6.44	□□□□□ -1.38
MIA40	YKL195W	PAN6	P40459	309 aa		6.44	□□□□□ -1.38
MIA40	YKL195W	MET18	P40469	1032 aa		6.44	□□□□□ -1.38
MIA40	YKL195W	GTS1	P40956	396 aa		6.44	□□□□□ -1.38
MIA40	YKL195W	NOP9	P47077	666 aa	Known RBP	6.44	□□□□□ -1.38
MIA40	YKL195W	IMA1	P53051	589 aa		6.44	□□□□□ -1.38
MIA40	YKL195W	COG1	P53079	417 aa		6.44	□□□□□ -1.38
MIA40	YKL195W	ARI1	P53111	347 aa	Known RBP	6.44	□□□□□ -1.38
MIA40	YKL195W	GPI1	P53306	609 aa		6.44	□□□□□ -1.38
MIA40	YKL195W	NAN1	Q02931	896 aa	Known RBP	6.44	□□□□□ -1.38
MIA40	YKL195W	HSP31	Q04432	237 aa		6.44	□□□□□ -1.38
MIA40	YKL195W	HEL2	Q05580	639 aa	Known RBP	6.44	□□□□□ -1.38
MIA40	YKL195W	YPR114W	Q06107	315 aa		6.44	□□□□□ -1.38
MIA40	YKL195W	GMC2	Q06201	188 aa		6.44	□□□□□ -1.38
MIA40	YKL195W	VTA1	Q06263	330 aa		6.44	□□□□□ -1.38
MIA40	YKL195W	HUA2	Q12134	243 aa		6.44	□□□□□ -1.38
MIA40	YKL195W	YLR046C	Q12253	270 aa		6.44	□□□□□ -1.38
MIA40	YKL195W	UBR2	Q07963	1872 aa		6.44	□□□□□ -1.38
MIA40	YKL195W	ATP6	P00854	259 aa		6.43	□□□□□ -1.38
MIA40	YKL195W	MSB1	P21339	1137 aa	Known RBP	6.43	□□□□□ -1.38
MIA40	YKL195W	MNE1	P24720	663 aa		6.43	□□□□□ -1.38
MIA40	YKL195W	RVS161	P25343	265 aa	Known RBP	6.43	□□□□□ -1.38
MIA40	YKL195W	YKL100C	P34248	587 aa		6.43	□□□□□ -1.38
MIA40	YKL195W	TDP1	P38319	544 aa		6.43	□□□□□ -1.38
MIA40	YKL195W	GND1	P38720	489 aa	Known RBP	6.43	□□□□□ -1.38
MIA40	YKL195W	YHR045W	P38775	560 aa		6.43	□□□□□ -1.38
MIA40	YKL195W	TDA11	P38854	504 aa		6.43	□□□□□ -1.38
MIA40	YKL195W	IMA5	P40884	581 aa		6.43	□□□□□ -1.38
MIA40	YKL195W	IME4	P41833	600 aa		6.43	□□□□□ -1.38
MIA40	YKL195W	RMD8	P43620	662 aa		6.43	□□□□□ -1.38
MIA40	YKL195W	MTR3	P48240	250 aa	Predicted RBP	6.43	□□□□□ -1.38
MIA40	YKL195W	IPI3	P53877	555 aa		6.43	□□□□□ -1.38
MIA40	YKL195W	PRP38	Q00723	242 aa	Predicted RBP	6.43	□□□□□ -1.38
MIA40	YKL195W	PRP3	Q03338	469 aa	Predicted RBP	6.43	□□□□□ -1.38
MIA40	YKL195W	GAS3	Q03655	524 aa		6.43	□□□□□ -1.38
MIA40	YKL195W	YKU80	Q04437	629 aa		6.43	□□□□□ -1.38
MIA40	YKL195W	GGA1	Q06336	557 aa		6.43	□□□□□ -1.38
MIA40	YKL195W	VAM6	Q07468	1049 aa		6.43	□□□□□ -1.38

Retrieved 100 of 5,963 RNA–protein pairs in 30.5 ms