RNA–Protein interactions for RNA: YHR104W

GRE3, Transcript of Aldose reductase, yeast

Gene GRE3, Length 984 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
GRE3	YHR104W	HSP42	Q12329	375 aa		4.91	□□□□□ -1.62
GRE3	YHR104W	BI2	P03873	423 aa		4.9	□□□□□ -1.63
GRE3	YHR104W	ARG81	P05085	880 aa		4.9	□□□□□ -1.63
GRE3	YHR104W	SPS4	P09937	338 aa		4.9	□□□□□ -1.63
GRE3	YHR104W	RPL1A	P0CX43	217 aa	Known RBP	4.9	□□□□□ -1.63
GRE3	YHR104W	RPL1B	P0CX44	217 aa	Known RBP	4.9	□□□□□ -1.63
GRE3	YHR104W	PPH22	P23595	377 aa		4.9	□□□□□ -1.63
GRE3	YHR104W	PHO84	P25297	587 aa	Known RBP	4.9	□□□□□ -1.63
GRE3	YHR104W	POT1	P27796	417 aa	Known RBP RIP-Chip data	4.9	□□□□□ -1.63	not detected
GRE3	YHR104W	RAD14	P28519	371 aa		4.9	□□□□□ -1.63
GRE3	YHR104W	MUP3	P38734	546 aa		4.9	□□□□□ -1.63
GRE3	YHR104W	ATF1	P40353	525 aa		4.9	□□□□□ -1.63
GRE3	YHR104W	STU2	P46675	888 aa		4.9	□□□□□ -1.63
GRE3	YHR104W	COS5	P47187	383 aa		4.9	□□□□□ -1.63
GRE3	YHR104W	TOF1	P53840	1238 aa		4.9	□□□□□ -1.63
GRE3	YHR104W	KIN4	Q01919	800 aa		4.9	□□□□□ -1.63
GRE3	YHR104W	PRP3	Q03338	469 aa	Predicted RBP	4.9	□□□□□ -1.63
GRE3	YHR104W	YMR206W	Q03695	313 aa		4.9	□□□□□ -1.63
GRE3	YHR104W	RAD34	Q06665	692 aa		4.9	□□□□□ -1.63
GRE3	YHR104W	COS7	Q07788	383 aa		4.9	□□□□□ -1.63
GRE3	YHR104W	KEL3	Q08979	651 aa	Predicted RBP	4.9	□□□□□ -1.63
GRE3	YHR104W	RTC1	Q08281	1341 aa		4.9	□□□□□ -1.63
GRE3	YHR104W	HEM1	P09950	548 aa	Predicted RBP	4.89	□□□□□ -1.63
GRE3	YHR104W	KIN3	P22209	435 aa		4.89	□□□□□ -1.63
GRE3	YHR104W	MSS51	P32335	436 aa		4.89	□□□□□ -1.63
GRE3	YHR104W	SAC1	P32368	623 aa	Known RBP	4.89	□□□□□ -1.63
GRE3	YHR104W	WSS1	P38838	269 aa		4.89	□□□□□ -1.63
GRE3	YHR104W	IRC24	P40580	263 aa		4.89	□□□□□ -1.63
GRE3	YHR104W	ALK1	P43633	760 aa	Known RBP	4.89	□□□□□ -1.63
GRE3	YHR104W	MLC1	P53141	149 aa		4.89	□□□□□ -1.63
GRE3	YHR104W	TOF2	Q02208	771 aa		4.89	□□□□□ -1.63
GRE3	YHR104W	ADA2	Q02336	434 aa		4.89	□□□□□ -1.63
GRE3	YHR104W	PFA5	Q03289	374 aa		4.89	□□□□□ -1.63
GRE3	YHR104W	TAP42	Q04372	366 aa		4.89	□□□□□ -1.63
GRE3	YHR104W	YLR456W	Q06199	204 aa		4.89	□□□□□ -1.63
GRE3	YHR104W	ECM30	Q06673	1274 aa		4.89	□□□□□ -1.63
GRE3	YHR104W	YOR389W	Q08912	624 aa		4.89	□□□□□ -1.63
GRE3	YHR104W	AEP3	Q12089	606 aa		4.89	□□□□□ -1.63
GRE3	YHR104W	REX3	Q12090	404 aa		4.89	□□□□□ -1.63
GRE3	YHR104W	KRS1	P15180	591 aa	Known RBP	4.88	□□□□□ -1.63
GRE3	YHR104W	GAC1	P28006	793 aa		4.88	□□□□□ -1.63
GRE3	YHR104W	EMP70	P32802	667 aa		4.88	□□□□□ -1.63
GRE3	YHR104W	GYP6	P32806	458 aa		4.88	□□□□□ -1.63
GRE3	YHR104W	RPC34	P32910	317 aa		4.88	□□□□□ -1.63
GRE3	YHR104W	ARA1	P38115	344 aa		4.88	□□□□□ -1.63
GRE3	YHR104W	THI2	P38141	450 aa		4.88	□□□□□ -1.63
GRE3	YHR104W	SIF2	P38262	535 aa		4.88	□□□□□ -1.63
GRE3	YHR104W	RRF1	P38771	230 aa		4.88	□□□□□ -1.63
GRE3	YHR104W	RIX1	P38883	763 aa	Predicted RBP	4.88	□□□□□ -1.63
GRE3	YHR104W	EXO1	P39875	702 aa		4.88	□□□□□ -1.63
GRE3	YHR104W	MEP1	P40260	492 aa		4.88	□□□□□ -1.63
GRE3	YHR104W	YJL107C	P42947	387 aa		4.88	□□□□□ -1.63
GRE3	YHR104W	YPR003C	P53394	754 aa		4.88	□□□□□ -1.63
GRE3	YHR104W	RPT4	P53549	437 aa	Known RBP	4.88	□□□□□ -1.63
GRE3	YHR104W	MUK1	Q02866	612 aa		4.88	□□□□□ -1.63
GRE3	YHR104W	ACL4	Q03771	387 aa		4.88	□□□□□ -1.63
GRE3	YHR104W	YLR455W	Q06188	304 aa		4.88	□□□□□ -1.63
GRE3	YHR104W	UAF30	Q08747	228 aa		4.88	□□□□□ -1.63
GRE3	YHR104W	SPO7	P18410	259 aa		4.87	□□□□□ -1.63
GRE3	YHR104W	PRP2	P20095	876 aa	Predicted RBP	4.87	□□□□□ -1.63
GRE3	YHR104W	TKL1	P23254	680 aa	Known RBP	4.87	□□□□□ -1.63
GRE3	YHR104W	SAT4	P25333	603 aa	Known RBP	4.87	□□□□□ -1.63
GRE3	YHR104W	RRP1	P35178	278 aa	Predicted RBP	4.87	□□□□□ -1.63
GRE3	YHR104W	IMD2	P38697	523 aa	Known RBP	4.87	□□□□□ -1.63
GRE3	YHR104W	YGR126W	P53274	230 aa		4.87	□□□□□ -1.63
GRE3	YHR104W	NCS2	P53923	493 aa	Predicted RBP	4.87	□□□□□ -1.63
GRE3	YHR104W	YMR130W	Q04223	302 aa		4.87	□□□□□ -1.63
GRE3	YHR104W	SIL1	Q08199	421 aa		4.87	□□□□□ -1.63
GRE3	YHR104W	BRR1	Q99177	341 aa	Predicted RBP	4.87	□□□□□ -1.63
GRE3	YHR104W	YLR278C	Q05854	1341 aa		4.87	□□□□□ -1.63
GRE3	YHR104W	RPN13	O13563	156 aa		4.86	□□□□□ -1.63
GRE3	YHR104W	GPH1	P06738	902 aa	Known RBP	4.86	□□□□□ -1.63
GRE3	YHR104W	RHO2	P06781	192 aa		4.86	□□□□□ -1.63
GRE3	YHR104W	CHO1	P08456	276 aa		4.86	□□□□□ -1.63
GRE3	YHR104W	LPD1	P09624	499 aa	Known RBP	4.86	□□□□□ -1.63
GRE3	YHR104W	GLK1	P17709	500 aa	Known RBP	4.86	□□□□□ -1.63
GRE3	YHR104W	URA4	P20051	364 aa		4.86	□□□□□ -1.63
GRE3	YHR104W	CLN1	P20437	546 aa		4.86	□□□□□ -1.63
GRE3	YHR104W	AFG1	P32317	509 aa		4.86	□□□□□ -1.63
GRE3	YHR104W	YEL043W	P32618	956 aa		4.86	□□□□□ -1.63
GRE3	YHR104W	MIA40	P36046	403 aa		4.86	□□□□□ -1.63
GRE3	YHR104W	MMS4	P38257	691 aa		4.86	□□□□□ -1.63
GRE3	YHR104W	GND1	P38720	489 aa	Known RBP	4.86	□□□□□ -1.63
GRE3	YHR104W	YJL132W	P47014	750 aa		4.86	□□□□□ -1.63
GRE3	YHR104W	RSM23	Q01163	450 aa		4.86	□□□□□ -1.63
GRE3	YHR104W	CTF4	Q01454	927 aa		4.86	□□□□□ -1.63
GRE3	YHR104W	YMR160W	Q03823	816 aa		4.86	□□□□□ -1.63
GRE3	YHR104W	GIS1	Q03833	894 aa		4.86	□□□□□ -1.63
GRE3	YHR104W	PPM1	Q04081	328 aa		4.86	□□□□□ -1.63
GRE3	YHR104W	MGR3	Q04472	501 aa		4.86	□□□□□ -1.63
GRE3	YHR104W	COQ9	Q05779	260 aa		4.86	□□□□□ -1.63
GRE3	YHR104W	YOL159C	Q08300	171 aa		4.86	□□□□□ -1.63
GRE3	YHR104W	APL5	Q08951	932 aa	Known RBP	4.86	□□□□□ -1.63
GRE3	YHR104W	YDR061W	Q12298	539 aa		4.86	□□□□□ -1.63
GRE3	YHR104W	PUT2	P07275	575 aa		4.85	□□□□□ -1.63
GRE3	YHR104W	ELO2	P25358	347 aa		4.85	□□□□□ -1.63
GRE3	YHR104W	MCM4	P30665	933 aa	Known RBP	4.85	□□□□□ -1.63
GRE3	YHR104W	TIF4631	P39935	952 aa	Known RBP	4.85	□□□□□ -1.63
GRE3	YHR104W	SDS3	P40505	327 aa		4.85	□□□□□ -1.63
GRE3	YHR104W	ATG27	P46989	271 aa		4.85	□□□□□ -1.63

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