RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000641643.1

SYT6-210, Transcript of synaptotagmin 6, humanhuman

BASIC

Gene SYT6, Length 1,587 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Exosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYT6-210ENST00000641643 NR2E3Q9Y5X4 410 aa26.07■■□□□ 1.76
SYT6-210ENST00000641643 PTPDC1A2A3K4 754 aa26.07■■□□□ 1.76
SYT6-210ENST00000641643 ASB14A6NK59 587 aa26.07■■□□□ 1.76
SYT6-210ENST00000641643 KLRF2D3W0D1 207 aa26.07■■□□□ 1.76
SYT6-210ENST00000641643 NFIBO00712 420 aa26.07■■□□□ 1.76
SYT6-210ENST00000641643 PRC1O43663 620 aa26.07■■□□□ 1.76
SYT6-210ENST00000641643 CCDC144CPQ8IYA2 1237 aa26.07■■□□□ 1.76
SYT6-210ENST00000641643 STAG2Q8N3U4 1231 aa26.07■■□□□ 1.76
SYT6-210ENST00000641643 IGDCC4Q8TDY8 1250 aa26.07■■□□□ 1.76
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SYT6-210ENST00000641643 MAD2L2Q9UI95 211 aa26.07■■□□□ 1.76
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SYT6-210ENST00000641643 ADD3Q9UEY8 706 aaKnown RBP26.06■■□□□ 1.76
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SYT6-210ENST00000641643 ACVR2BQ13705 512 aa26.05■■□□□ 1.76
SYT6-210ENST00000641643 GJC2Q5T442 439 aaPredicted RBP26.05■■□□□ 1.76
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SYT6-210ENST00000641643 PALM3A6NDB9 673 aaPredicted RBP26.04■■□□□ 1.76
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SYT6-210ENST00000641643 KBTBD13C9JR72 458 aa26.04■■□□□ 1.76
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SYT6-210ENST00000641643 QRICH1Q2TAL8 776 aa26.04■■□□□ 1.76
SYT6-210ENST00000641643 RNF207Q6ZRF8 634 aa26.04■■□□□ 1.76
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SYT6-210ENST00000641643 SENP6Q9GZR1 1112 aaPredicted RBP26.03■■□□□ 1.76
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SYT6-210ENST00000641643 ABCB11O95342 1321 aa26.03■■□□□ 1.76
SYT6-210ENST00000641643 H0YGN5 161 aa26.02■■□□□ 1.76
SYT6-210ENST00000641643 RNF180Q86T96 592 aa26.02■■□□□ 1.76
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SYT6-210ENST00000641643 SH2B2O14492 632 aaPredicted RBP26.01■■□□□ 1.75
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SYT6-210ENST00000641643 RPS6P62753 249 aaKnown RBP26.01■■□□□ 1.75
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SYT6-210ENST00000641643 SLC30A10Q6XR72 485 aa26■■□□□ 1.75
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SYT6-210ENST00000641643 RGS22Q8NE09 1264 aa25.99■■□□□ 1.75
SYT6-210ENST00000641643 MAP3K14Q99558 947 aa25.99■■□□□ 1.75
SYT6-210ENST00000641643 MAF1Q9H063 256 aa25.99■■□□□ 1.75
SYT6-210ENST00000641643 SPC25Q9HBM1 224 aa25.99■■□□□ 1.75
SYT6-210ENST00000641643 MCM3APO60318 1980 aa25.99■■□□□ 1.75
SYT6-210ENST00000641643 LOC102724159A0A0B4J2E5 919 aa25.99■■□□□ 1.75
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SYT6-210ENST00000641643 RASEFQ8IZ41 740 aa25.98■■□□□ 1.75
SYT6-210ENST00000641643 MTMR8Q96EF0 704 aa25.98■■□□□ 1.75
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SYT6-210ENST00000641643 MRPL12P52815 198 aaKnown RBP25.97■■□□□ 1.75
SYT6-210ENST00000641643 DNERQ8NFT8 737 aa25.97■■□□□ 1.75
SYT6-210ENST00000641643 KATNBL1Q9H079 304 aa25.97■■□□□ 1.75
SYT6-210ENST00000641643 PCDHA1Q9Y5I3 950 aa25.97■■□□□ 1.75
SYT6-210ENST00000641643 ATN1P54259 1190 aaPredicted RBP25.96■■□□□ 1.75
SYT6-210ENST00000641643 COL9A3Q14050 684 aaPredicted RBP25.96■■□□□ 1.75
SYT6-210ENST00000641643 SYNE3Q6ZMZ3 975 aa25.96■■□□□ 1.75
SYT6-210ENST00000641643 DHX32Q7L7V1 743 aaKnown RBP25.96■■□□□ 1.75
SYT6-210ENST00000641643 FBXO16Q8IX29 292 aaPredicted RBP25.96■■□□□ 1.75
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