RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000467996.1

RNF13-208, Transcript of ring finger protein 13, human

TSL 5

Gene RNF13, Length 767 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum .

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RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
RNF13-208	ENST00000467996	NUCB2	P80303	420 aa		13.63	□□□□□ -0.23
RNF13-208	ENST00000467996	HTRA3	P83110	453 aa		13.63	□□□□□ -0.23
RNF13-208	ENST00000467996	KIF23	Q02241	960 aa	Predicted RBP	13.63	□□□□□ -0.23
RNF13-208	ENST00000467996	TRAF1	Q13077	416 aa		13.63	□□□□□ -0.23
RNF13-208	ENST00000467996	NPY5R	Q15761	445 aa		13.63	□□□□□ -0.23
RNF13-208	ENST00000467996	IFNL1	Q8IU54	200 aa		13.63	□□□□□ -0.23
RNF13-208	ENST00000467996	MB21D1	Q8N884	522 aa		13.63	□□□□□ -0.23
RNF13-208	ENST00000467996	GTF3C2	Q8WUA4	911 aa	Predicted RBP	13.63	□□□□□ -0.23
RNF13-208	ENST00000467996	PARK7	Q99497	189 aa	Known RBP	13.63	□□□□□ -0.23
RNF13-208	ENST00000467996	ZMYND12	Q9H0C1	365 aa		13.63	□□□□□ -0.23
RNF13-208	ENST00000467996	ZCCHC17	Q9NP64	241 aa	Known RBP	13.63	□□□□□ -0.23
RNF13-208	ENST00000467996	BTBD7	Q9P203	1132 aa		13.63	□□□□□ -0.23
RNF13-208	ENST00000467996	ZDHHC9	Q9Y397	364 aa		13.63	□□□□□ -0.23
RNF13-208	ENST00000467996	ATP2A1	O14983	1001 aa		13.62	□□□□□ -0.23
RNF13-208	ENST00000467996	PEX10	O60683	326 aa		13.62	□□□□□ -0.23
RNF13-208	ENST00000467996	AOC2	O75106	756 aa		13.62	□□□□□ -0.23
RNF13-208	ENST00000467996	CNMD	O75829	334 aa		13.62	□□□□□ -0.23
RNF13-208	ENST00000467996	ZSCAN22	P10073	491 aa	Predicted RBP	13.62	□□□□□ -0.23
RNF13-208	ENST00000467996	CALML3	P27482	149 aa		13.62	□□□□□ -0.23
RNF13-208	ENST00000467996	ADCY7	P51828	1080 aa		13.62	□□□□□ -0.23
RNF13-208	ENST00000467996	FOXD4L5	Q5VV16	416 aa	Predicted RBP	13.62	□□□□□ -0.23
RNF13-208	ENST00000467996	SNRNP48	Q6IEG0	339 aa	Known RBP	13.62	□□□□□ -0.23
RNF13-208	ENST00000467996	DIS3L2	Q8IYB7	885 aa	Known RBP	13.62	□□□□□ -0.23
RNF13-208	ENST00000467996	DAGLB	Q8NCG7	672 aa		13.62	□□□□□ -0.23
RNF13-208	ENST00000467996	SMCR8	Q8TEV9	937 aa	Predicted RBP	13.62	□□□□□ -0.23
RNF13-208	ENST00000467996	FOXD4L4	Q8WXT5	416 aa	Predicted RBP	13.62	□□□□□ -0.23
RNF13-208	ENST00000467996	PAGR1	Q9BTK6	254 aa		13.62	□□□□□ -0.23
RNF13-208	ENST00000467996	TEX13B	Q9BXU2	312 aa		13.62	□□□□□ -0.23
RNF13-208	ENST00000467996	TXNRD2	Q9NNW7	524 aa		13.62	□□□□□ -0.23
RNF13-208	ENST00000467996	PNMA2	Q9UL42	364 aa		13.62	□□□□□ -0.23
RNF13-208	ENST00000467996	ADGRA2	Q96PE1	1338 aa		13.62	□□□□□ -0.23
RNF13-208	ENST00000467996	MYH7B	A7E2Y1	1941 aa		13.61	□□□□□ -0.23
RNF13-208	ENST00000467996	SMCO2	A6NFE2	343 aa		13.61	□□□□□ -0.23
RNF13-208	ENST00000467996	KIF28P	B7ZC32	967 aa		13.61	□□□□□ -0.23
RNF13-208	ENST00000467996	OPLAH	O14841	1288 aa		13.61	□□□□□ -0.23
RNF13-208	ENST00000467996	ADAMTS3	O15072	1205 aa		13.61	□□□□□ -0.23
RNF13-208	ENST00000467996	F13A1	P00488	732 aa		13.61	□□□□□ -0.23
RNF13-208	ENST00000467996	ALAS1	P13196	640 aa		13.61	□□□□□ -0.23
RNF13-208	ENST00000467996	KRT2	P35908	639 aa		13.61	□□□□□ -0.23
RNF13-208	ENST00000467996	TM4SF4	P48230	202 aa		13.61	□□□□□ -0.23
RNF13-208	ENST00000467996	PLS1	Q14651	629 aa		13.61	□□□□□ -0.23
RNF13-208	ENST00000467996	SAFB	Q15424	915 aa	Known RBP eCLIP	13.61	□□□□□ -0.23
RNF13-208	ENST00000467996	MCTP1	Q6DN14	999 aa		13.61	□□□□□ -0.23
RNF13-208	ENST00000467996	GALNT17	Q6IS24	598 aa		13.61	□□□□□ -0.23
RNF13-208	ENST00000467996	OXER1	Q8TDS5	423 aa		13.61	□□□□□ -0.23
RNF13-208	ENST00000467996	C6orf50	Q9HD87	102 aa		13.61	□□□□□ -0.23
RNF13-208	ENST00000467996	RBPJL	Q9UBG7	517 aa		13.61	□□□□□ -0.23
RNF13-208	ENST00000467996	PCDHA4	Q9UN74	947 aa		13.61	□□□□□ -0.23
RNF13-208	ENST00000467996	MRPL11	Q9Y3B7	192 aa	Known RBP	13.61	□□□□□ -0.23
RNF13-208	ENST00000467996	RABGAP1	Q9Y3P9	1069 aa		13.61	□□□□□ -0.23
RNF13-208	ENST00000467996	MGAM	O43451	1857 aa		13.61	□□□□□ -0.23
RNF13-208	ENST00000467996	BTBD18	B2RXH4	712 aa		13.6	□□□□□ -0.23
RNF13-208	ENST00000467996		M0R2N6	131 aa		13.6	□□□□□ -0.23
RNF13-208	ENST00000467996	GNA11	P29992	359 aa		13.6	□□□□□ -0.23
RNF13-208	ENST00000467996	STAT3	P40763	770 aa		13.6	□□□□□ -0.23
RNF13-208	ENST00000467996	REST	Q13127	1097 aa		13.6	□□□□□ -0.23
RNF13-208	ENST00000467996	TAF1C	Q15572	869 aa	Predicted RBP	13.6	□□□□□ -0.23
RNF13-208	ENST00000467996	MUM1L1	Q5H9M0	696 aa		13.6	□□□□□ -0.23
RNF13-208	ENST00000467996	FERMT3	Q86UX7	667 aa		13.6	□□□□□ -0.23
RNF13-208	ENST00000467996	BLID	Q8IZY5	108 aa		13.6	□□□□□ -0.23
RNF13-208	ENST00000467996	CLEC4D	Q8WXI8	215 aa		13.6	□□□□□ -0.23
RNF13-208	ENST00000467996	CUL5	Q93034	780 aa		13.6	□□□□□ -0.23
RNF13-208	ENST00000467996	SPATC1L	Q9H0A9	340 aa		13.6	□□□□□ -0.23
RNF13-208	ENST00000467996	BRMS1	Q9HCU9	246 aa		13.6	□□□□□ -0.23
RNF13-208	ENST00000467996	RIC8A	Q9NPQ8	531 aa		13.6	□□□□□ -0.23
RNF13-208	ENST00000467996	HOMER2	Q9NSB8	354 aa		13.6	□□□□□ -0.23
RNF13-208	ENST00000467996	RNF146	Q9NTX7	359 aa		13.6	□□□□□ -0.23
RNF13-208	ENST00000467996	RIPK3	Q9Y572	518 aa		13.6	□□□□□ -0.23
RNF13-208	ENST00000467996	TCHH	Q07283	1943 aa		13.6	□□□□□ -0.23
RNF13-208	ENST00000467996	ZNFX1	Q9P2E3	1918 aa	Known RBP	13.59	□□□□□ -0.23
RNF13-208	ENST00000467996	NFIB	O00712	420 aa		13.59	□□□□□ -0.23
RNF13-208	ENST00000467996	GCLC	P48506	637 aa	Predicted RBP	13.59	□□□□□ -0.23
RNF13-208	ENST00000467996	CLK2	P49760	499 aa	Known RBP	13.59	□□□□□ -0.23
RNF13-208	ENST00000467996	VEGFB	P49765	207 aa		13.59	□□□□□ -0.23
RNF13-208	ENST00000467996	ERVK-9	P63128	1117 aa		13.59	□□□□□ -0.23
RNF13-208	ENST00000467996	ERVK-24	P63145	666 aa		13.59	□□□□□ -0.23
RNF13-208	ENST00000467996	NR5A1	Q13285	461 aa		13.59	□□□□□ -0.23
RNF13-208	ENST00000467996	GNL2	Q13823	731 aa	Known RBP	13.59	□□□□□ -0.23
RNF13-208	ENST00000467996	UBE2S	Q16763	222 aa		13.59	□□□□□ -0.23
RNF13-208	ENST00000467996	TKFC	Q3LXA3	575 aa		13.59	□□□□□ -0.23
RNF13-208	ENST00000467996	RIOX2	Q8IUF8	465 aa		13.59	□□□□□ -0.23
RNF13-208	ENST00000467996	REM2	Q8IYK8	340 aa	Predicted RBP	13.59	□□□□□ -0.23
RNF13-208	ENST00000467996	ANKRD13C	Q8N6S4	541 aa		13.59	□□□□□ -0.23
RNF13-208	ENST00000467996	BICD2	Q8TD16	824 aa		13.59	□□□□□ -0.23
RNF13-208	ENST00000467996	RASGRP4	Q8TDF6	673 aa		13.59	□□□□□ -0.23
RNF13-208	ENST00000467996	TNFRSF25	Q93038	417 aa		13.59	□□□□□ -0.23
RNF13-208	ENST00000467996	TRERF1	Q96PN7	1200 aa		13.59	□□□□□ -0.23
RNF13-208	ENST00000467996	GLT8D2	Q9H1C3	349 aa		13.59	□□□□□ -0.23
RNF13-208	ENST00000467996	FOXP1	Q9H334	677 aa	Predicted RBP	13.59	□□□□□ -0.23
RNF13-208	ENST00000467996	PSTPIP2	Q9H939	334 aa		13.59	□□□□□ -0.23
RNF13-208	ENST00000467996	MORF4L1	Q9UBU8	362 aa		13.59	□□□□□ -0.23
RNF13-208	ENST00000467996	ZNF236	Q9UL36	1845 aa		13.59	□□□□□ -0.23
RNF13-208	ENST00000467996	PLXNA1	Q9UIW2	1896 aa		13.59	□□□□□ -0.23
RNF13-208	ENST00000467996	MEIS2	O14770	477 aa		13.58	□□□□□ -0.24
RNF13-208	ENST00000467996	U2AF2	P26368	475 aa	Known RBP eCLIP	13.58	□□□□□ -0.24
RNF13-208	ENST00000467996	MRPL12	P52815	198 aa	Known RBP	13.58	□□□□□ -0.24
RNF13-208	ENST00000467996		Q3C1V9	767 aa		13.58	□□□□□ -0.24
RNF13-208	ENST00000467996	NOSTRIN	Q8IVI9	506 aa		13.58	□□□□□ -0.24
RNF13-208	ENST00000467996	REXO1	Q8N1G1	1221 aa	Known RBP	13.58	□□□□□ -0.24
RNF13-208	ENST00000467996	MOV10L1	Q9BXT6	1211 aa	Known RBP	13.58	□□□□□ -0.24

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