RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000459159.1

SNORD54-201, Transcript of small nucleolar RNA, C/D box 54, humanhuman

BASIC

Gene SNORD54, Length 67 nt, Biotype snoRNA.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNORD54-201ENST00000459159 NRP2O60462 931 aa-1.44□□□□□ -2.64
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SNORD54-201ENST00000459159 LGR5O75473 907 aa-1.44□□□□□ -2.64
SNORD54-201ENST00000459159 WISP2O76076 250 aa-1.44□□□□□ -2.64
SNORD54-201ENST00000459159 RNF224P0DH78 156 aa-1.44□□□□□ -2.64
SNORD54-201ENST00000459159 CD99P14209 185 aa-1.44□□□□□ -2.64
SNORD54-201ENST00000459159 ARSAP15289 507 aa-1.44□□□□□ -2.64
SNORD54-201ENST00000459159 CR2P20023 1033 aa-1.44□□□□□ -2.64
SNORD54-201ENST00000459159 TPSB2P20231 275 aa-1.44□□□□□ -2.64
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SNORD54-201ENST00000459159 TPSAB1Q15661 275 aa-1.44□□□□□ -2.64
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SNORD54-201ENST00000459159 CDAN1Q8IWY9 1227 aa-1.44□□□□□ -2.64
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SNORD54-201ENST00000459159 CREB3L1Q96BA8 519 aa-1.44□□□□□ -2.64
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SNORD54-201ENST00000459159 ABI2Q9NYB9 513 aaPredicted RBP-1.44□□□□□ -2.64
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SNORD54-201ENST00000459159 TMEM181Q9P2C4 612 aa-1.44□□□□□ -2.64
SNORD54-201ENST00000459159 STK17AQ9UEE5 414 aa-1.44□□□□□ -2.64
SNORD54-201ENST00000459159 MBD1Q9UIS9 605 aaPredicted RBP-1.44□□□□□ -2.64
SNORD54-201ENST00000459159 CNOT11Q9UKZ1 510 aaKnown RBP-1.44□□□□□ -2.64
SNORD54-201ENST00000459159 PCDHGB4Q9UN71 923 aa-1.44□□□□□ -2.64
SNORD54-201ENST00000459159 EPB41L3Q9Y2J2 1087 aaPredicted RBP-1.44□□□□□ -2.64
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SNORD54-201ENST00000459159 PRAG1Q86YV5 1406 aa-1.44□□□□□ -2.64
SNORD54-201ENST00000459159 SSC5DA1L4H1 1573 aa-1.44□□□□□ -2.64
SNORD54-201ENST00000459159 NCANO14594 1321 aa-1.44□□□□□ -2.64
SNORD54-201ENST00000459159 TIAM2Q8IVF5 1701 aa-1.45□□□□□ -2.64
SNORD54-201ENST00000459159 CDC42BPGQ6DT37 1551 aa-1.45□□□□□ -2.64
SNORD54-201ENST00000459159 RGS12O14924 1447 aa-1.45□□□□□ -2.64
SNORD54-201ENST00000459159 IGKV1D-8A0A087WSZ0 117 aa-1.45□□□□□ -2.64
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SNORD54-201ENST00000459159 GLI1P08151 1106 aa-1.45□□□□□ -2.64
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SNORD54-201ENST00000459159 NRG1Q02297 640 aaPredicted RBP-1.45□□□□□ -2.64
SNORD54-201ENST00000459159 KCNC4Q03721 635 aa-1.45□□□□□ -2.64
SNORD54-201ENST00000459159 STRN3Q13033 797 aa-1.45□□□□□ -2.64
SNORD54-201ENST00000459159 ZNF268Q14587 947 aaPredicted RBP-1.45□□□□□ -2.64
SNORD54-201ENST00000459159 LAPTM4AQ15012 233 aa-1.45□□□□□ -2.64
SNORD54-201ENST00000459159 CSRP2Q16527 193 aa-1.45□□□□□ -2.64
SNORD54-201ENST00000459159 ANGEL2Q5VTE6 544 aaKnown RBP-1.45□□□□□ -2.64
SNORD54-201ENST00000459159 FAM53AQ6NSI3 398 aaPredicted RBP-1.45□□□□□ -2.64
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SNORD54-201ENST00000459159 DLEU7Q6UYE1 221 aa-1.45□□□□□ -2.64
SNORD54-201ENST00000459159 C3orf67Q6ZVT6 689 aa-1.45□□□□□ -2.64
SNORD54-201ENST00000459159 FAM122BQ7Z309 247 aa-1.45□□□□□ -2.64
SNORD54-201ENST00000459159 ADM2Q7Z4H4 148 aa-1.45□□□□□ -2.64
SNORD54-201ENST00000459159 RTN4RL1Q86UN2 441 aaPredicted RBP-1.45□□□□□ -2.64
SNORD54-201ENST00000459159 SKAP1Q86WV1 359 aa-1.45□□□□□ -2.64
SNORD54-201ENST00000459159 SFTPA1Q8IWL2 248 aa-1.45□□□□□ -2.64
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SNORD54-201ENST00000459159 PRR26Q8N8Z3 221 aa-1.45□□□□□ -2.64
SNORD54-201ENST00000459159 ZNF784Q8NCA9 323 aaPredicted RBP-1.45□□□□□ -2.64
SNORD54-201ENST00000459159 FAM110DQ8TAY7 271 aaPredicted RBP-1.45□□□□□ -2.64
SNORD54-201ENST00000459159 RNF217Q8TC41 542 aa-1.45□□□□□ -2.64
SNORD54-201ENST00000459159 SARAFQ96BY9 339 aa-1.45□□□□□ -2.64
SNORD54-201ENST00000459159 NMD3Q96D46 503 aaKnown RBP-1.45□□□□□ -2.64
SNORD54-201ENST00000459159 CLIP3Q96DZ5 547 aa-1.45□□□□□ -2.64
SNORD54-201ENST00000459159 FOXN4Q96NZ1 517 aa-1.45□□□□□ -2.64
SNORD54-201ENST00000459159 LITAFQ99732 161 aa-1.45□□□□□ -2.64
SNORD54-201ENST00000459159 WWTR1Q9GZV5 400 aa-1.45□□□□□ -2.64
SNORD54-201ENST00000459159 RASSF4Q9H2L5 321 aa-1.45□□□□□ -2.64
SNORD54-201ENST00000459159 DDX31Q9H8H2 851 aaKnown RBP-1.45□□□□□ -2.64
SNORD54-201ENST00000459159 MRPL15Q9P015 296 aaKnown RBP-1.45□□□□□ -2.64
SNORD54-201ENST00000459159 ANKMY1Q9P2S6 941 aa-1.45□□□□□ -2.64
SNORD54-201ENST00000459159 IKZF3Q9UKT9 509 aa-1.45□□□□□ -2.64
SNORD54-201ENST00000459159 AKAP2Q9Y2D5 859 aa-1.45□□□□□ -2.64
SNORD54-201ENST00000459159 PCDHB11Q9Y5F2 797 aa-1.45□□□□□ -2.64
SNORD54-201ENST00000459159 MAGI2Q86UL8 1455 aa-1.45□□□□□ -2.64
SNORD54-201ENST00000459159 BRD4O60885 1362 aaPredicted RBP-1.46□□□□□ -2.64
SNORD54-201ENST00000459159 MUC21A0A0G2JKD1 596 aa-1.46□□□□□ -2.64
SNORD54-201ENST00000459159 MUC21A0A140T8X8 626 aa-1.46□□□□□ -2.64
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