RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000040584.5

HOXC8-201, Transcript of homeobox C8, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene HOXC8, Length 1,889 nt, Biotype protein coding.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXC8-201ENST00000040584 RCOR1Q9UKL0 485 aa25.15■■□□□ 1.62
HOXC8-201ENST00000040584 PCDHA6Q9UN73 950 aa25.15■■□□□ 1.62
HOXC8-201ENST00000040584 PCDHA8Q9Y5H6 950 aa25.15■■□□□ 1.62
HOXC8-201ENST00000040584 FKBP1BP68106 108 aa25.15■■□□□ 1.62
HOXC8-201ENST00000040584 PPIL2Q13356 520 aa25.15■■□□□ 1.62
HOXC8-201ENST00000040584 C2orf69Q8N8R5 385 aa25.15■■□□□ 1.62
HOXC8-201ENST00000040584 PPP1R9AQ9ULJ8 1098 aa25.15■■□□□ 1.62
HOXC8-201ENST00000040584 CLIC4Q9Y696 253 aa25.15■■□□□ 1.62
HOXC8-201ENST00000040584 GOLGA6L4A6NEF3 574 aa25.14■■□□□ 1.61
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HOXC8-201ENST00000040584 CST9Q5W186 159 aa25.14■■□□□ 1.61
HOXC8-201ENST00000040584 PIK3AP1Q6ZUJ8 805 aa25.14■■□□□ 1.61
HOXC8-201ENST00000040584 CXCL11O14625 94 aa25.13■■□□□ 1.61
HOXC8-201ENST00000040584 PTPRFP10586 1907 aa25.13■■□□□ 1.61
HOXC8-201ENST00000040584 A0A0G2JLL6 359 aaPredicted RBP25.13■■□□□ 1.61
HOXC8-201ENST00000040584 GJA5P36382 358 aa25.13■■□□□ 1.61
HOXC8-201ENST00000040584 TREML2Q5T2D2 321 aa25.13■■□□□ 1.61
HOXC8-201ENST00000040584 CATSPERGQ6ZRH7 1159 aa25.13■■□□□ 1.61
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HOXC8-201ENST00000040584 UNCXA6NJT0 531 aa25.12■■□□□ 1.61
HOXC8-201ENST00000040584 ATP2B1P20020 1258 aa25.12■■□□□ 1.61
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HOXC8-201ENST00000040584 ANO1Q5XXA6 986 aa25.12■■□□□ 1.61
HOXC8-201ENST00000040584 GADL1Q6ZQY3 521 aa25.12■■□□□ 1.61
HOXC8-201ENST00000040584 PSTPIP2Q9H939 334 aa25.12■■□□□ 1.61
HOXC8-201ENST00000040584 BIN2Q9UBW5 565 aaPredicted RBP25.12■■□□□ 1.61
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HOXC8-201ENST00000040584 USP17L13C9JLJ4 530 aa25.11■■□□□ 1.61
HOXC8-201ENST00000040584 USP17L11C9JVI0 530 aa25.11■■□□□ 1.61
HOXC8-201ENST00000040584 USP17L18D6R9N7 530 aa25.11■■□□□ 1.61
HOXC8-201ENST00000040584 USP17L22D6RA61 530 aa25.11■■□□□ 1.61
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HOXC8-201ENST00000040584 USP17L19D6RCP7 530 aa25.11■■□□□ 1.61
HOXC8-201ENST00000040584 USP17L20D6RJB6 530 aa25.11■■□□□ 1.61
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HOXC8-201ENST00000040584 USP17L24Q0WX57 530 aa25.11■■□□□ 1.61
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HOXC8-201ENST00000040584 CUL5Q93034 780 aa25.11■■□□□ 1.61
HOXC8-201ENST00000040584 ATG4CQ96DT6 458 aa25.11■■□□□ 1.61
HOXC8-201ENST00000040584 WNK4Q96J92 1243 aa25.11■■□□□ 1.61
HOXC8-201ENST00000040584 SLC38A10Q9HBR0 1119 aa25.11■■□□□ 1.61
HOXC8-201ENST00000040584 TMEM260Q9NX78 707 aa25.11■■□□□ 1.61
HOXC8-201ENST00000040584 SMCHD1A6NHR9 2005 aa25.1■■□□□ 1.61
HOXC8-201ENST00000040584 ZNF536O15090 1300 aa25.1■■□□□ 1.61
HOXC8-201ENST00000040584 CCDC194A0A1B0GVG4 234 aa25.1■■□□□ 1.61
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HOXC8-201ENST00000040584 PROCA1Q8NCQ7 364 aaPredicted RBP25.09■■□□□ 1.61
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HOXC8-201ENST00000040584 KIF3CO14782 793 aa25.09■■□□□ 1.61
HOXC8-201ENST00000040584 PCDHB6Q9Y5E3 794 aa25.09■■□□□ 1.61
HOXC8-201ENST00000040584 PARP14Q460N5 1801 aa25.08■■□□□ 1.61
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HOXC8-201ENST00000040584 ADCY5O95622 1261 aa25.08■■□□□ 1.61
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HOXC8-201ENST00000040584 STK38Q15208 465 aa25.08■■□□□ 1.61
HOXC8-201ENST00000040584 USP17L6PQ6QN14 398 aa25.08■■□□□ 1.61
HOXC8-201ENST00000040584 PGBD1Q96JS3 809 aa25.08■■□□□ 1.61
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HOXC8-201ENST00000040584 CTDP1Q9Y5B0 961 aaPredicted RBP25.08■■□□□ 1.61
HOXC8-201ENST00000040584 RLFQ13129 1914 aa25.08■■□□□ 1.61
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HOXC8-201ENST00000040584 ZBED4O75132 1171 aa25.07■■□□□ 1.6
HOXC8-201ENST00000040584 SLC39A14Q15043 492 aa25.07■■□□□ 1.6
HOXC8-201ENST00000040584 PTPAQ15257 358 aa25.07■■□□□ 1.6
HOXC8-201ENST00000040584 KRT25Q7Z3Z0 450 aa25.07■■□□□ 1.6
HOXC8-201ENST00000040584 KCNG4Q8TDN1 519 aa25.07■■□□□ 1.6
HOXC8-201ENST00000040584 CLK2P49760 499 aaKnown RBP25.06■■□□□ 1.6
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HOXC8-201ENST00000040584 MOGSQ13724 837 aa25.06■■□□□ 1.6
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HOXC8-201ENST00000040584 HOXC10Q9NYD6 342 aa25.06■■□□□ 1.6
HOXC8-201ENST00000040584 USP25Q9UHP3 1055 aa25.06■■□□□ 1.6
HOXC8-201ENST00000040584 LOC285556D6RIA3 1793 aa25.06■■□□□ 1.6
HOXC8-201ENST00000040584 TRAPPC10P48553 1259 aa25.06■■□□□ 1.6
HOXC8-201ENST00000040584 SNAPC2Q13487 334 aa25.06■■□□□ 1.6
HOXC8-201ENST00000040584 GLT8D2Q9H1C3 349 aa25.06■■□□□ 1.6
HOXC8-201ENST00000040584 ADAMTS5Q9UNA0 930 aa25.06■■□□□ 1.6
HOXC8-201ENST00000040584 TRPM7Q96QT4 1865 aa25.05■■□□□ 1.6
HOXC8-201ENST00000040584 MEIS2O14770 477 aa25.05■■□□□ 1.6
HOXC8-201ENST00000040584 SPTLC2O15270 562 aa25.05■■□□□ 1.6
HOXC8-201ENST00000040584 CAVIN2O95810 425 aa25.05■■□□□ 1.6
HOXC8-201ENST00000040584 FDX1P10109 184 aa25.05■■□□□ 1.6
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