RNA–Protein interactions for RNA: YOR033C

EXO1, Transcript of 5'-3' exonuclease and flap-endonuclease, yeast

Gene EXO1, Length 2,109 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
EXO1	YOR033C	PUT2	P07275	575 aa		5.11	□□□□□ -1.59
EXO1	YOR033C	CHL1	P22516	861 aa	Predicted RBP	5.11	□□□□□ -1.59
EXO1	YOR033C	VPS34	P22543	875 aa		5.11	□□□□□ -1.59
EXO1	YOR033C	SYP1	P25623	870 aa	Known RBP	5.11	□□□□□ -1.59
EXO1	YOR033C	HMX1	P32339	317 aa		5.11	□□□□□ -1.59
EXO1	YOR033C	PET309	P32522	965 aa	Predicted RBP	5.11	□□□□□ -1.59
EXO1	YOR033C	RPD3	P32561	433 aa		5.11	□□□□□ -1.59
EXO1	YOR033C	SSE2	P32590	693 aa	Known RBP	5.11	□□□□□ -1.59
EXO1	YOR033C	JEN1	P36035	616 aa		5.11	□□□□□ -1.59
EXO1	YOR033C	ATG7	P38862	630 aa		5.11	□□□□□ -1.59
EXO1	YOR033C	SUR2	P38992	349 aa		5.11	□□□□□ -1.59
EXO1	YOR033C	LYS9	P38999	446 aa		5.11	□□□□□ -1.59
EXO1	YOR033C	RGI2	P40188	164 aa		5.11	□□□□□ -1.59
EXO1	YOR033C	DPH1	P40487	425 aa	Known RBP	5.11	□□□□□ -1.59
EXO1	YOR033C	ICE2	P40499	491 aa		5.11	□□□□□ -1.59
EXO1	YOR033C	NBP1	P52919	319 aa	Predicted RBP	5.11	□□□□□ -1.59
EXO1	YOR033C	SNF12	P53628	566 aa		5.11	□□□□□ -1.59
EXO1	YOR033C	MRPS17	Q03246	237 aa	Predicted RBP	5.11	□□□□□ -1.59
EXO1	YOR033C	RSN1	Q03516	953 aa		5.11	□□□□□ -1.59
EXO1	YOR033C	SCS7	Q03529	384 aa		5.11	□□□□□ -1.59
EXO1	YOR033C	CSN9	Q03981	162 aa		5.11	□□□□□ -1.59
EXO1	YOR033C	SOV1	Q04748	898 aa		5.11	□□□□□ -1.59
EXO1	YOR033C	PAL1	Q05518	499 aa	Known RBP	5.11	□□□□□ -1.59
EXO1	YOR033C	IWR1	Q07532	353 aa	Predicted RBP	5.11	□□□□□ -1.59
EXO1	YOR033C	HBT1	Q07653	1046 aa	Known RBP	5.11	□□□□□ -1.59
EXO1	YOR033C	ZEO1	Q08245	113 aa		5.11	□□□□□ -1.59
EXO1	YOR033C	MLH3	Q12083	715 aa		5.11	□□□□□ -1.59
EXO1	YOR033C	YDR061W	Q12298	539 aa		5.11	□□□□□ -1.59
EXO1	YOR033C	MDM12	Q92328	271 aa		5.11	□□□□□ -1.59
EXO1	YOR033C	DFG16	Q99234	619 aa		5.11	□□□□□ -1.59
EXO1	YOR033C	APA1	P16550	321 aa	Known RBP	5.1	□□□□□ -1.59
EXO1	YOR033C	FAS2	P19097	1887 aa	Known RBP	5.1	□□□□□ -1.59
EXO1	YOR033C	SAR1	P20606	190 aa	Known RBP	5.1	□□□□□ -1.59
EXO1	YOR033C	UTR1	P21373	530 aa		5.1	□□□□□ -1.59
EXO1	YOR033C	SBA1	P28707	216 aa	Known RBP	5.1	□□□□□ -1.59
EXO1	YOR033C	SSH4	P32343	579 aa		5.1	□□□□□ -1.59
EXO1	YOR033C	ECM25	P32525	599 aa		5.1	□□□□□ -1.59
EXO1	YOR033C	BEM3	P32873	1128 aa		5.1	□□□□□ -1.59
EXO1	YOR033C	YKL077W	P36081	392 aa		5.1	□□□□□ -1.59
EXO1	YOR033C	HMT1	P38074	348 aa		5.1	□□□□□ -1.59
EXO1	YOR033C	DIA4	P38705	446 aa	Predicted RBP	5.1	□□□□□ -1.59
EXO1	YOR033C	SPC97	P38863	823 aa		5.1	□□□□□ -1.59
EXO1	YOR033C	NVJ1	P38881	321 aa		5.1	□□□□□ -1.59
EXO1	YOR033C	MNL1	P38888	796 aa		5.1	□□□□□ -1.59
EXO1	YOR033C	VPS45	P38932	577 aa		5.1	□□□□□ -1.59
EXO1	YOR033C	TMA108	P40462	946 aa		5.1	□□□□□ -1.59
EXO1	YOR033C	ALR2	P43553	858 aa		5.1	□□□□□ -1.59
EXO1	YOR033C	DLD2	P46681	530 aa	Known RBP	5.1	□□□□□ -1.59
EXO1	YOR033C	USE1	P53146	245 aa		5.1	□□□□□ -1.59
EXO1	YOR033C	PIB2	P53191	635 aa		5.1	□□□□□ -1.59
EXO1	YOR033C	RPN14	P53196	417 aa		5.1	□□□□□ -1.59
EXO1	YOR033C	YGR012W	P53206	393 aa		5.1	□□□□□ -1.59
EXO1	YOR033C	CPR6	P53691	371 aa	Known RBP	5.1	□□□□□ -1.59
EXO1	YOR033C	CBK1	P53894	756 aa		5.1	□□□□□ -1.59
EXO1	YOR033C	ASI2	P53895	289 aa		5.1	□□□□□ -1.59
EXO1	YOR033C	ARP4	P80428	489 aa		5.1	□□□□□ -1.59
EXO1	YOR033C	RNY1	Q02933	434 aa	Known RBP	5.1	□□□□□ -1.59
EXO1	YOR033C	RLI1	Q03195	608 aa	Known RBP	5.1	□□□□□ -1.59
EXO1	YOR033C	SND1	Q04007	877 aa		5.1	□□□□□ -1.59
EXO1	YOR033C	MRL1	Q06815	381 aa		5.1	□□□□□ -1.59
EXO1	YOR033C	YPR084W	Q06821	456 aa		5.1	□□□□□ -1.59
EXO1	YOR033C	FRA1	Q07825	749 aa		5.1	□□□□□ -1.59
EXO1	YOR033C	BDS1	Q08347	646 aa		5.1	□□□□□ -1.59
EXO1	YOR033C	ALE1	Q08548	619 aa		5.1	□□□□□ -1.59
EXO1	YOR033C	YPL216W	Q08964	1102 aa		5.1	□□□□□ -1.59
EXO1	YOR033C	AI5_BETA	Q9ZZX0	354 aa		5.1	□□□□□ -1.59
EXO1	YOR033C	AI5_ALPHA	Q9ZZX1	630 aa		5.1	□□□□□ -1.59
EXO1	YOR033C	COR1	P07256	457 aa		5.09	□□□□□ -1.59
EXO1	YOR033C	CLN3	P13365	580 aa		5.09	□□□□□ -1.59
EXO1	YOR033C	PET9	P18239	318 aa	Known RBP	5.09	□□□□□ -1.59
EXO1	YOR033C	RAM1	P22007	431 aa		5.09	□□□□□ -1.59
EXO1	YOR033C	RNA15	P25299	296 aa	Predicted RBP	5.09	□□□□□ -1.59
EXO1	YOR033C	MSS1	P32559	526 aa	Predicted RBP	5.09	□□□□□ -1.59
EXO1	YOR033C	LHP1	P33399	275 aa	Known RBP	5.09	□□□□□ -1.59
EXO1	YOR033C	PHO11	P35842	467 aa		5.09	□□□□□ -1.59
EXO1	YOR033C	YPK3	P38070	525 aa		5.09	□□□□□ -1.59
EXO1	YOR033C	RFT1	P38206	574 aa	Predicted RBP	5.09	□□□□□ -1.59
EXO1	YOR033C	UBX7	P38349	436 aa		5.09	□□□□□ -1.59
EXO1	YOR033C	PHO12	P38693	467 aa		5.09	□□□□□ -1.59
EXO1	YOR033C	YHR078W	P38799	552 aa		5.09	□□□□□ -1.59
EXO1	YOR033C	RRN7	P40992	514 aa		5.09	□□□□□ -1.59
EXO1	YOR033C	DAK2	P43550	591 aa		5.09	□□□□□ -1.59
EXO1	YOR033C	CAF16	P43569	289 aa		5.09	□□□□□ -1.59
EXO1	YOR033C	BNA1	P47096	177 aa		5.09	□□□□□ -1.59
EXO1	YOR033C	PEX8	P53248	589 aa		5.09	□□□□□ -1.59
EXO1	YOR033C	VPS62	P53285	467 aa		5.09	□□□□□ -1.59
EXO1	YOR033C	SLI1	P53304	468 aa		5.09	□□□□□ -1.59
EXO1	YOR033C	SEG1	Q04279	960 aa		5.09	□□□□□ -1.59
EXO1	YOR033C	PNP1	Q05788	311 aa		5.09	□□□□□ -1.59
EXO1	YOR033C	CDA1	Q06702	301 aa		5.09	□□□□□ -1.59
EXO1	YOR033C	SNA4	Q07549	140 aa		5.09	□□□□□ -1.59
EXO1	YOR033C	UAF30	Q08747	228 aa		5.09	□□□□□ -1.59
EXO1	YOR033C	AFT2	Q08957	416 aa		5.09	□□□□□ -1.59
EXO1	YOR033C	GIS3	Q12418	502 aa		5.09	□□□□□ -1.59
EXO1	YOR033C	AIR2	Q12476	344 aa	Known RBP	5.09	□□□□□ -1.59
EXO1	YOR033C	RAD10	P06838	210 aa		5.09	□□□□□ -1.59
EXO1	YOR033C	ILV2	P07342	687 aa	Known RBP	5.09	□□□□□ -1.59
EXO1	YOR033C	SPS4	P09937	338 aa		5.09	□□□□□ -1.59
EXO1	YOR033C	APA2	P22108	325 aa		5.09	□□□□□ -1.59
EXO1	YOR033C	DBP2	P24783	546 aa	Known RBP	5.09	□□□□□ -1.59

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