RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000590211.5

CAPNS1-210, Transcript of calpain small subunit 1, humanhuman

TSL 5

Gene CAPNS1, Length 403 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAPNS1-210ENST00000590211 SLC7A14Q8TBB6 771 aa5.4□□□□□ -1.54
CAPNS1-210ENST00000590211 EDARADDQ8WWZ3 215 aa5.4□□□□□ -1.54
CAPNS1-210ENST00000590211 OSBP2Q969R2 916 aa5.4□□□□□ -1.54
CAPNS1-210ENST00000590211 HAUS7Q99871 368 aa5.4□□□□□ -1.54
CAPNS1-210ENST00000590211 FBRSQ9HAH7 460 aa5.4□□□□□ -1.54
CAPNS1-210ENST00000590211 TRIM39Q9HCM9 518 aa5.4□□□□□ -1.54
CAPNS1-210ENST00000590211 CRIM1Q9NZV1 1036 aa5.4□□□□□ -1.54
CAPNS1-210ENST00000590211 APEX2Q9UBZ4 518 aa5.4□□□□□ -1.54
CAPNS1-210ENST00000590211 WASHC2AQ641Q2 1341 aa5.4□□□□□ -1.55
CAPNS1-210ENST00000590211 USP47Q96K76 1375 aa5.4□□□□□ -1.55
CAPNS1-210ENST00000590211 TRAPPC8Q9Y2L5 1435 aa5.4□□□□□ -1.55
CAPNS1-210ENST00000590211 ATP10AO60312 1499 aa5.39□□□□□ -1.55
CAPNS1-210ENST00000590211 LMTK3Q96Q04 1460 aa5.39□□□□□ -1.55
CAPNS1-210ENST00000590211 TRPM2O94759 1503 aa5.39□□□□□ -1.55
CAPNS1-210ENST00000590211 PRDM15P57071 1507 aaPredicted RBP5.39□□□□□ -1.55
CAPNS1-210ENST00000590211 CBFA2T2O43439 604 aa5.39□□□□□ -1.55
CAPNS1-210ENST00000590211 OIP5O43482 229 aa5.39□□□□□ -1.55
CAPNS1-210ENST00000590211 ADAMTS2O95450 1211 aa5.39□□□□□ -1.55
CAPNS1-210ENST00000590211 C6orf222P0C671 652 aaPredicted RBP5.39□□□□□ -1.55
CAPNS1-210ENST00000590211 SLFN14P0C7P3 912 aa5.39□□□□□ -1.55
CAPNS1-210ENST00000590211 POU3F2P20265 443 aaPredicted RBP5.39□□□□□ -1.55
CAPNS1-210ENST00000590211 YARSP54577 528 aaKnown RBP5.39□□□□□ -1.55
CAPNS1-210ENST00000590211 HNRNPUQ00839 825 aaKnown RBP eCLIP5.39□□□□□ -1.55
CAPNS1-210ENST00000590211 BIRC2Q13490 618 aa5.39□□□□□ -1.55
CAPNS1-210ENST00000590211 MTMR1Q13613 665 aa5.39□□□□□ -1.55
CAPNS1-210ENST00000590211 NKG7Q16617 165 aa5.39□□□□□ -1.55
CAPNS1-210ENST00000590211 CCSAPQ6IQ19 270 aaPredicted RBP5.39□□□□□ -1.55
CAPNS1-210ENST00000590211 NECAB2Q7Z6G3 386 aa5.39□□□□□ -1.55
CAPNS1-210ENST00000590211 MRPL41Q8IXM3 137 aaKnown RBP5.39□□□□□ -1.55
CAPNS1-210ENST00000590211 DMRTC2Q8IXT2 367 aaPredicted RBP5.39□□□□□ -1.55
CAPNS1-210ENST00000590211 AHI1Q8N157 1196 aa5.39□□□□□ -1.55
CAPNS1-210ENST00000590211 PPM1KQ8N3J5 372 aa5.39□□□□□ -1.55
CAPNS1-210ENST00000590211 GALNT6Q8NCL4 622 aa5.39□□□□□ -1.55
CAPNS1-210ENST00000590211 WDR66Q8TBY9 1149 aa5.39□□□□□ -1.55
CAPNS1-210ENST00000590211 UBASH3BQ8TF42 649 aa5.39□□□□□ -1.55
CAPNS1-210ENST00000590211 FBXO41Q8TF61 875 aa5.39□□□□□ -1.55
CAPNS1-210ENST00000590211 PPP1R14AQ96A00 147 aa5.39□□□□□ -1.55
CAPNS1-210ENST00000590211 TMEM87BQ96K49 555 aa5.39□□□□□ -1.55
CAPNS1-210ENST00000590211 FGD4Q96M96 766 aa5.39□□□□□ -1.55
CAPNS1-210ENST00000590211 RPS6KC1Q96S38 1066 aa5.39□□□□□ -1.55
CAPNS1-210ENST00000590211 SPOCK3Q9BQ16 436 aa5.39□□□□□ -1.55
CAPNS1-210ENST00000590211 USP26Q9BXU7 913 aa5.39□□□□□ -1.55
CAPNS1-210ENST00000590211 TMPRSS13Q9BYE2 586 aa5.39□□□□□ -1.55
CAPNS1-210ENST00000590211 MTFR1LQ9H019 292 aa5.39□□□□□ -1.55
CAPNS1-210ENST00000590211 KLHL25Q9H0H3 589 aa5.39□□□□□ -1.55
CAPNS1-210ENST00000590211 GSX1Q9H4S2 264 aaPredicted RBP5.39□□□□□ -1.55
CAPNS1-210ENST00000590211 DISC1Q9NRI5 854 aa5.39□□□□□ -1.55
CAPNS1-210ENST00000590211 SLC5A4Q9NY91 659 aa5.39□□□□□ -1.55
CAPNS1-210ENST00000590211 SFMBT1Q9UHJ3 866 aa5.39□□□□□ -1.55
CAPNS1-210ENST00000590211 SPAG9O60271 1321 aaKnown RBP5.39□□□□□ -1.55
CAPNS1-210ENST00000590211 KIDINS220Q9ULH0 1771 aa5.39□□□□□ -1.55
CAPNS1-210ENST00000590211 KIF1BO60333 1816 aa5.39□□□□□ -1.55
CAPNS1-210ENST00000590211 COL17A1Q9UMD9 1497 aaPredicted RBP5.39□□□□□ -1.55
CAPNS1-210ENST00000590211 VWDEQ8N2E2 1590 aa5.38□□□□□ -1.55
CAPNS1-210ENST00000590211 HECW2Q9P2P5 1572 aa5.38□□□□□ -1.55
CAPNS1-210ENST00000590211 FANCGO15287 622 aa5.38□□□□□ -1.55
CAPNS1-210ENST00000590211 TBX1O43435 398 aa5.38□□□□□ -1.55
CAPNS1-210ENST00000590211 AKAP10O43572 662 aa5.38□□□□□ -1.55
CAPNS1-210ENST00000590211 EIF3JO75822 258 aaKnown RBP5.38□□□□□ -1.55
CAPNS1-210ENST00000590211 WISP1O95388 367 aa5.38□□□□□ -1.55
CAPNS1-210ENST00000590211 SCGB1D2O95969 90 aa5.38□□□□□ -1.55
CAPNS1-210ENST00000590211 NEFMP07197 916 aa5.38□□□□□ -1.55
CAPNS1-210ENST00000590211 SLURP2P0DP57 97 aa5.38□□□□□ -1.55
CAPNS1-210ENST00000590211 CD68P34810 354 aaPredicted RBP5.38□□□□□ -1.55
CAPNS1-210ENST00000590211 NEK2P51955 445 aa5.38□□□□□ -1.55
CAPNS1-210ENST00000590211 UBE4AQ14139 1066 aa5.38□□□□□ -1.55
CAPNS1-210ENST00000590211 EXOSC6Q5RKV6 272 aaKnown RBP5.38□□□□□ -1.55
CAPNS1-210ENST00000590211 SLC6A19Q695T7 634 aa5.38□□□□□ -1.55
CAPNS1-210ENST00000590211 PKN3Q6P5Z2 889 aa5.38□□□□□ -1.55
CAPNS1-210ENST00000590211 FGD2Q7Z6J4 655 aa5.38□□□□□ -1.55
CAPNS1-210ENST00000590211 C14orf80Q86SX3 495 aa5.38□□□□□ -1.55
CAPNS1-210ENST00000590211 HID1Q8IV36 788 aa5.38□□□□□ -1.55
CAPNS1-210ENST00000590211 MAP4K3Q8IVH8 894 aa5.38□□□□□ -1.55
CAPNS1-210ENST00000590211 BAHD1Q8TBE0 780 aaPredicted RBP5.38□□□□□ -1.55
CAPNS1-210ENST00000590211 CCDC74BQ96LY2 380 aa5.38□□□□□ -1.55
CAPNS1-210ENST00000590211 FANCD2OSQ96PS1 177 aa5.38□□□□□ -1.55
CAPNS1-210ENST00000590211 CCDC8Q9H0W5 538 aaPredicted RBP5.38□□□□□ -1.55
CAPNS1-210ENST00000590211 LRRC4BQ9NT99 713 aa5.38□□□□□ -1.55
CAPNS1-210ENST00000590211 ZIM2Q9NZV7 527 aa5.38□□□□□ -1.55
CAPNS1-210ENST00000590211 TNPO3Q9Y5L0 923 aaKnown RBP5.38□□□□□ -1.55
CAPNS1-210ENST00000590211 ROCK2O75116 1388 aaKnown RBP5.38□□□□□ -1.55
CAPNS1-210ENST00000590211 PRAG1Q86YV5 1406 aa5.38□□□□□ -1.55
CAPNS1-210ENST00000590211 ZNF518AQ6AHZ1 1483 aa5.38□□□□□ -1.55
CAPNS1-210ENST00000590211 NEURL4Q96JN8 1562 aa5.38□□□□□ -1.55
CAPNS1-210ENST00000590211 CLTCL1P53675 1640 aa5.37□□□□□ -1.55
CAPNS1-210ENST00000590211 DLL1O00548 723 aa5.37□□□□□ -1.55
CAPNS1-210ENST00000590211 GPR39O43194 453 aa5.37□□□□□ -1.55
CAPNS1-210ENST00000590211 CAND2O75155 1236 aa5.37□□□□□ -1.55
CAPNS1-210ENST00000590211 CLEC3AO75596 197 aa5.37□□□□□ -1.55
CAPNS1-210ENST00000590211 NPTXRO95502 500 aa5.37□□□□□ -1.55
CAPNS1-210ENST00000590211 GBP1P32455 592 aa5.37□□□□□ -1.55
CAPNS1-210ENST00000590211 CAP2P40123 477 aa5.37□□□□□ -1.55
CAPNS1-210ENST00000590211 NEK4P51957 841 aa5.37□□□□□ -1.55
CAPNS1-210ENST00000590211 ID3Q02535 119 aa5.37□□□□□ -1.55
CAPNS1-210ENST00000590211 SLBPQ14493 270 aaKnown RBP eCLIP5.37□□□□□ -1.55
CAPNS1-210ENST00000590211 ZNF460Q14592 562 aa5.37□□□□□ -1.55
CAPNS1-210ENST00000590211 STAT4Q14765 748 aa5.37□□□□□ -1.55
CAPNS1-210ENST00000590211 DHCR24Q15392 516 aa5.37□□□□□ -1.55
CAPNS1-210ENST00000590211 LCE2CQ5TA81 110 aa5.37□□□□□ -1.55
CAPNS1-210ENST00000590211 RNF219Q5W0B1 726 aaPredicted RBP5.37□□□□□ -1.55
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