RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000568388.5

SPNS1-210, Transcript of sphingolipid transporter 1 (putative), humanhuman

TSL 3

Gene SPNS1, Length 759 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPNS1-210ENST00000568388 CCL15-CCL14A0A0B4J2E2 113 aa21.63■■□□□ 1.05
SPNS1-210ENST00000568388 MANSC4A6NHS7 340 aaPredicted RBP21.63■■□□□ 1.05
SPNS1-210ENST00000568388 hCG_1984214I3L0E3 225 aa21.63■■□□□ 1.05
SPNS1-210ENST00000568388 LBX1P52954 281 aa21.63■■□□□ 1.05
SPNS1-210ENST00000568388 INHBEP58166 350 aa21.63■■□□□ 1.05
SPNS1-210ENST00000568388 CCL15Q16663 113 aa21.63■■□□□ 1.05
SPNS1-210ENST00000568388 LARP1BQ659C4 914 aaKnown RBP21.63■■□□□ 1.05
SPNS1-210ENST00000568388 ANKRD23Q86SG2 305 aa21.63■■□□□ 1.05
SPNS1-210ENST00000568388 ZNF713Q8N859 430 aaPredicted RBP21.63■■□□□ 1.05
SPNS1-210ENST00000568388 KIFC2Q96AC6 838 aa21.63■■□□□ 1.05
SPNS1-210ENST00000568388 ALG1Q9BT22 464 aa21.63■■□□□ 1.05
SPNS1-210ENST00000568388 SMCHD1A6NHR9 2005 aa21.62■■□□□ 1.05
SPNS1-210ENST00000568388 hCG_1642624A0A1W2PR95 340 aa21.62■■□□□ 1.05
SPNS1-210ENST00000568388 CDC37Q16543 378 aaPredicted RBP21.62■■□□□ 1.05
SPNS1-210ENST00000568388 QRICH1Q2TAL8 776 aa21.62■■□□□ 1.05
SPNS1-210ENST00000568388 LBX2Q6XYB7 198 aa21.62■■□□□ 1.05
SPNS1-210ENST00000568388 BRI3BPQ8WY22 251 aa21.62■■□□□ 1.05
SPNS1-210ENST00000568388 SH3GLB2Q9NR46 395 aa21.62■■□□□ 1.05
SPNS1-210ENST00000568388 SYT1P21579 422 aa21.61■■□□□ 1.05
SPNS1-210ENST00000568388 OSBPP22059 807 aa21.61■■□□□ 1.05
SPNS1-210ENST00000568388 MKRN3Q13064 507 aaKnown RBP21.61■■□□□ 1.05
SPNS1-210ENST00000568388 TRAF1Q13077 416 aa21.61■■□□□ 1.05
SPNS1-210ENST00000568388 HOMER1Q86YM7 354 aa21.61■■□□□ 1.05
SPNS1-210ENST00000568388 AIFM3Q96NN9 605 aa21.61■■□□□ 1.05
SPNS1-210ENST00000568388 SLC38A10Q9HBR0 1119 aa21.61■■□□□ 1.05
SPNS1-210ENST00000568388 PNMA2Q9UL42 364 aa21.61■■□□□ 1.05
SPNS1-210ENST00000568388 CIZ1Q9ULV3 898 aaPredicted RBP21.61■■□□□ 1.05
SPNS1-210ENST00000568388 A0A0G2JMZ2 1700 aa21.6■■□□□ 1.05
SPNS1-210ENST00000568388 BTBD19C9JJ37 291 aa21.6■■□□□ 1.05
SPNS1-210ENST00000568388 VWA5AO00534 786 aa21.6■■□□□ 1.05
SPNS1-210ENST00000568388 ZBED4O75132 1171 aa21.6■■□□□ 1.05
SPNS1-210ENST00000568388 XBP1P17861 261 aa21.6■■□□□ 1.05
SPNS1-210ENST00000568388 FBXO18Q8NFZ0 1043 aa21.6■■□□□ 1.05
SPNS1-210ENST00000568388 PIBF1Q8WXW3 757 aa21.6■■□□□ 1.05
SPNS1-210ENST00000568388 C8orf76Q96K31 380 aa21.6■■□□□ 1.05
SPNS1-210ENST00000568388 ZIC5Q96T25 663 aa21.6■■□□□ 1.05
SPNS1-210ENST00000568388 ASCC2Q9H1I8 757 aaPredicted RBP21.6■■□□□ 1.05
SPNS1-210ENST00000568388 ZCCHC17Q9NP64 241 aaKnown RBP21.6■■□□□ 1.05
SPNS1-210ENST00000568388 BARHL2Q9NY43 387 aa21.6■■□□□ 1.05
SPNS1-210ENST00000568388 SPDYE16A6NNV3 312 aaPredicted RBP21.59■■□□□ 1.05
SPNS1-210ENST00000568388 IRX3P78415 501 aaPredicted RBP21.59■■□□□ 1.05
SPNS1-210ENST00000568388 NOGQ13253 232 aa21.59■■□□□ 1.05
SPNS1-210ENST00000568388 WWC2Q6AWC2 1192 aa21.59■■□□□ 1.05
SPNS1-210ENST00000568388 FBXO11Q86XK2 927 aa21.59■■□□□ 1.05
SPNS1-210ENST00000568388 REPS2Q8NFH8 660 aa21.59■■□□□ 1.05
SPNS1-210ENST00000568388 ATG4CQ96DT6 458 aa21.59■■□□□ 1.05
SPNS1-210ENST00000568388 P2RX7Q99572 595 aaKnown RBP21.59■■□□□ 1.05
SPNS1-210ENST00000568388 PTPN18Q99952 460 aa21.59■■□□□ 1.05
SPNS1-210ENST00000568388 AMNQ9BXJ7 453 aa21.59■■□□□ 1.05
SPNS1-210ENST00000568388 PNMA3Q9UL41 463 aa21.59■■□□□ 1.05
SPNS1-210ENST00000568388 STXBP3O00186 592 aa21.58■■□□□ 1.05
SPNS1-210ENST00000568388 ATP2A1O14983 1001 aa21.58■■□□□ 1.05
SPNS1-210ENST00000568388 STX6O43752 255 aa21.58■■□□□ 1.05
SPNS1-210ENST00000568388 PPP1R11O60927 126 aaPredicted RBP21.58■■□□□ 1.05
SPNS1-210ENST00000568388 OAZ1P54368 228 aa21.58■■□□□ 1.05
SPNS1-210ENST00000568388 MB21D1Q8N884 522 aa21.58■■□□□ 1.05
SPNS1-210ENST00000568388 BEGAINQ9BUH8 593 aa21.58■■□□□ 1.05
SPNS1-210ENST00000568388 ZNF536O15090 1300 aa21.57■■□□□ 1.04
SPNS1-210ENST00000568388 PDHXO00330 501 aa21.57■■□□□ 1.04
SPNS1-210ENST00000568388 ICAM1P05362 532 aa21.57■■□□□ 1.04
SPNS1-210ENST00000568388 TM4SF4P48230 202 aa21.57■■□□□ 1.04
SPNS1-210ENST00000568388 SNAP25P60880 206 aa21.57■■□□□ 1.04
SPNS1-210ENST00000568388 NUCB2P80303 420 aa21.57■■□□□ 1.04
SPNS1-210ENST00000568388 TRIM29Q14134 588 aa21.57■■□□□ 1.04
SPNS1-210ENST00000568388 KRT40Q6A162 431 aa21.57■■□□□ 1.04
SPNS1-210ENST00000568388 PPP1R18Q6NYC8 613 aa21.57■■□□□ 1.04
SPNS1-210ENST00000568388 HEATR3Q7Z4Q2 680 aa21.57■■□□□ 1.04
SPNS1-210ENST00000568388 GTF3C2Q8WUA4 911 aaPredicted RBP21.57■■□□□ 1.04
SPNS1-210ENST00000568388 CCDC12Q8WUD4 166 aaPredicted RBP21.57■■□□□ 1.04
SPNS1-210ENST00000568388 ESYT2A0FGR8 921 aa21.56■■□□□ 1.04
SPNS1-210ENST00000568388 HERVK_113P62684 666 aa21.56■■□□□ 1.04
SPNS1-210ENST00000568388 SREBF2Q12772 1141 aa21.56■■□□□ 1.04
SPNS1-210ENST00000568388 REM2Q8IYK8 340 aaPredicted RBP21.56■■□□□ 1.04
SPNS1-210ENST00000568388 FAM43AQ8N2R8 423 aa21.56■■□□□ 1.04
SPNS1-210ENST00000568388 CCDC148Q8NFR7 591 aa21.56■■□□□ 1.04
SPNS1-210ENST00000568388 GPKOWQ92917 476 aaPredicted RBP eCLIP21.56■■□□□ 1.04
SPNS1-210ENST00000568388 COA7Q96BR5 231 aa21.56■■□□□ 1.04
SPNS1-210ENST00000568388 SHISA4Q96DD7 197 aa21.56■■□□□ 1.04
SPNS1-210ENST00000568388 PHF20Q9BVI0 1012 aa21.56■■□□□ 1.04
SPNS1-210ENST00000568388 CHMP5Q9NZZ3 219 aa21.56■■□□□ 1.04
SPNS1-210ENST00000568388 VPS54Q9P1Q0 977 aa21.56■■□□□ 1.04
SPNS1-210ENST00000568388 MTMR6Q9Y217 621 aa21.56■■□□□ 1.04
SPNS1-210ENST00000568388 CTDP1Q9Y5B0 961 aaPredicted RBP21.56■■□□□ 1.04
SPNS1-210ENST00000568388 PCDHA1Q9Y5I3 950 aa21.56■■□□□ 1.04
SPNS1-210ENST00000568388 H3BQV1 296 aa21.55■■□□□ 1.04
SPNS1-210ENST00000568388 GALNT17Q6IS24 598 aa21.55■■□□□ 1.04
SPNS1-210ENST00000568388 TYW1BQ6NUM6 668 aa21.55■■□□□ 1.04
SPNS1-210ENST00000568388 CCDC174Q6PII3 467 aa21.55■■□□□ 1.04
SPNS1-210ENST00000568388 POTEEQ6S8J3 1075 aa21.55■■□□□ 1.04
SPNS1-210ENST00000568388 SAMD1Q6SPF0 538 aaPredicted RBP21.55■■□□□ 1.04
SPNS1-210ENST00000568388 TEX2Q8IWB9 1127 aa21.55■■□□□ 1.04
SPNS1-210ENST00000568388 ZMYND12Q9H0C1 365 aa21.55■■□□□ 1.04
SPNS1-210ENST00000568388 GJB4Q9NTQ9 266 aa21.55■■□□□ 1.04
SPNS1-210ENST00000568388 TSKSQ9UJT2 592 aa21.55■■□□□ 1.04
SPNS1-210ENST00000568388 ABCB11O95342 1321 aa21.55■■□□□ 1.04
SPNS1-210ENST00000568388 BRD1O95696 1058 aa21.54■■□□□ 1.04
SPNS1-210ENST00000568388 MMP1P03956 469 aa21.54■■□□□ 1.04
SPNS1-210ENST00000568388 CALML3P27482 149 aa21.54■■□□□ 1.04
SPNS1-210ENST00000568388 NAPAP54920 295 aa21.54■■□□□ 1.04
SPNS1-210ENST00000568388 OTUD7BQ6GQQ9 843 aa21.54■■□□□ 1.04
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