RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000502484.6

PDE4D-208, Transcript of phosphodiesterase 4D, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene PDE4D, Length 2,478 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDE4D-208ENST00000502484 KRT25Q7Z3Z0 450 aa9.32□□□□□ -0.92
PDE4D-208ENST00000502484 SMARCE1Q969G3 411 aa9.32□□□□□ -0.92
PDE4D-208ENST00000502484 DHX58Q96C10 678 aa9.32□□□□□ -0.92
PDE4D-208ENST00000502484 PYM1Q9BRP8 204 aaKnown RBP9.32□□□□□ -0.92
PDE4D-208ENST00000502484 MYH7BA7E2Y1 1941 aa9.31□□□□□ -0.92
PDE4D-208ENST00000502484 ZC3H4Q9UPT8 1303 aaKnown RBP9.31□□□□□ -0.92
PDE4D-208ENST00000502484 LAD1O00515 517 aa9.31□□□□□ -0.92
PDE4D-208ENST00000502484 MPHOSPH10O00566 681 aaKnown RBP9.31□□□□□ -0.92
PDE4D-208ENST00000502484 ENTPD3O75355 529 aa9.31□□□□□ -0.92
PDE4D-208ENST00000502484 PTGS1P23219 599 aa9.31□□□□□ -0.92
PDE4D-208ENST00000502484 MYL5Q02045 173 aa9.31□□□□□ -0.92
PDE4D-208ENST00000502484 CXCL9Q07325 125 aa9.31□□□□□ -0.92
PDE4D-208ENST00000502484 MORC3Q14149 939 aa9.31□□□□□ -0.92
PDE4D-208ENST00000502484 INF2Q27J81 1249 aa9.31□□□□□ -0.92
PDE4D-208ENST00000502484 GPATCH4Q5T3I0 446 aaKnown RBP9.31□□□□□ -0.92
PDE4D-208ENST00000502484 DPY19L2Q6NUT2 758 aa9.31□□□□□ -0.92
PDE4D-208ENST00000502484 HSD3B7Q9H2F3 369 aa9.31□□□□□ -0.92
PDE4D-208ENST00000502484 VAT1LQ9HCJ6 419 aa9.31□□□□□ -0.92
PDE4D-208ENST00000502484 NRBP1Q9UHY1 535 aa9.31□□□□□ -0.92
PDE4D-208ENST00000502484 SLURP2P0DP57 97 aa9.31□□□□□ -0.92
PDE4D-208ENST00000502484 NONOQ15233 471 aaKnown RBP eCLIP9.31□□□□□ -0.92
PDE4D-208ENST00000502484 E2F4Q16254 413 aa9.31□□□□□ -0.92
PDE4D-208ENST00000502484 CFAP100Q494V2 611 aa9.31□□□□□ -0.92
PDE4D-208ENST00000502484 CERKLQ49MI3 558 aaPredicted RBP9.31□□□□□ -0.92
PDE4D-208ENST00000502484 PDZRN4Q6ZMN7 1036 aaPredicted RBP9.31□□□□□ -0.92
PDE4D-208ENST00000502484 GRAMD1CQ8IYS0 662 aa9.31□□□□□ -0.92
PDE4D-208ENST00000502484 MLKLQ8NB16 471 aa9.31□□□□□ -0.92
PDE4D-208ENST00000502484 MKL1Q969V6 931 aa9.31□□□□□ -0.92
PDE4D-208ENST00000502484 PAGE5Q96GU1 130 aa9.31□□□□□ -0.92
PDE4D-208ENST00000502484 NYAP2Q9P242 653 aa9.31□□□□□ -0.92
PDE4D-208ENST00000502484 GJA3Q9Y6H8 435 aa9.31□□□□□ -0.92
PDE4D-208ENST00000502484 ZNF541Q9H0D2 1346 aa9.3□□□□□ -0.92
PDE4D-208ENST00000502484 MYO1BO43795 1136 aa9.3□□□□□ -0.92
PDE4D-208ENST00000502484 SMC2O95347 1197 aa9.3□□□□□ -0.92
PDE4D-208ENST00000502484 PRPHP41219 470 aa9.3□□□□□ -0.92
PDE4D-208ENST00000502484 TNIP1Q15025 636 aa9.3□□□□□ -0.92
PDE4D-208ENST00000502484 CIAPIN1Q6FI81 312 aa9.3□□□□□ -0.92
PDE4D-208ENST00000502484 PPP1R18Q6NYC8 613 aa9.3□□□□□ -0.92
PDE4D-208ENST00000502484 IQUBQ8NA54 791 aa9.3□□□□□ -0.92
PDE4D-208ENST00000502484 KIAA1524Q8TCG1 905 aa9.3□□□□□ -0.92
PDE4D-208ENST00000502484 PRMT6Q96LA8 375 aaPredicted RBP9.3□□□□□ -0.92
PDE4D-208ENST00000502484 TDRD3Q9H7E2 651 aaKnown RBP9.3□□□□□ -0.92
PDE4D-208ENST00000502484 DACH1Q9UI36 760 aa9.3□□□□□ -0.92
PDE4D-208ENST00000502484 FAM196BA6NMK8 535 aa9.3□□□□□ -0.92
PDE4D-208ENST00000502484 PSMD14O00487 310 aa9.3□□□□□ -0.92
PDE4D-208ENST00000502484 DPYDQ12882 1025 aa9.3□□□□□ -0.92
PDE4D-208ENST00000502484 ORC2Q13416 577 aaPredicted RBP9.3□□□□□ -0.92
PDE4D-208ENST00000502484 CCDC144BQ3MJ40 725 aa9.3□□□□□ -0.92
PDE4D-208ENST00000502484 RSBN1LQ6PCB5 846 aaPredicted RBP9.3□□□□□ -0.92
PDE4D-208ENST00000502484 DTHD1Q6ZMT9 781 aa9.3□□□□□ -0.92
PDE4D-208ENST00000502484 ZSCAN29Q8IWY8 852 aaPredicted RBP9.3□□□□□ -0.92
PDE4D-208ENST00000502484 ADGRF4Q8IZF3 695 aa9.3□□□□□ -0.92
PDE4D-208ENST00000502484 REXO1Q8N1G1 1221 aaKnown RBP9.3□□□□□ -0.92
PDE4D-208ENST00000502484 MTMR8Q96EF0 704 aa9.3□□□□□ -0.92
PDE4D-208ENST00000502484 TMEM60Q9H2L4 133 aa9.3□□□□□ -0.92
PDE4D-208ENST00000502484 KANSL2Q9H9L4 492 aa9.3□□□□□ -0.92
PDE4D-208ENST00000502484 JMJD4Q9H9V9 463 aa9.3□□□□□ -0.92
PDE4D-208ENST00000502484 GPCPD1Q9NPB8 672 aa9.3□□□□□ -0.92
PDE4D-208ENST00000502484 PNMA6FA0A0J9YX94 578 aa9.29□□□□□ -0.92
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PDE4D-208ENST00000502484 VIL1P09327 827 aaKnown RBP9.29□□□□□ -0.92
PDE4D-208ENST00000502484 NOLC1Q14978 699 aaKnown RBP eCLIP9.29□□□□□ -0.92
PDE4D-208ENST00000502484 CT47A1Q5JQC4 288 aaPredicted RBP9.29□□□□□ -0.92
PDE4D-208ENST00000502484 PDXDC2PQ6P474 469 aa9.29□□□□□ -0.92
PDE4D-208ENST00000502484 TMEM179Q6ZVK1 233 aa9.29□□□□□ -0.92
PDE4D-208ENST00000502484 NEK8Q86SG6 692 aa9.29□□□□□ -0.92
PDE4D-208ENST00000502484 GPC2Q8N158 579 aa9.29□□□□□ -0.92
PDE4D-208ENST00000502484 GSDMAQ96QA5 445 aa9.29□□□□□ -0.92
PDE4D-208ENST00000502484 GMLQ99445 158 aa9.29□□□□□ -0.92
PDE4D-208ENST00000502484 TRIM34Q9BYJ4 488 aa9.29□□□□□ -0.92
PDE4D-208ENST00000502484 SPTLC3Q9NUV7 552 aa9.29□□□□□ -0.92
PDE4D-208ENST00000502484 GLTPD2A6NH11 291 aa9.29□□□□□ -0.92
PDE4D-208ENST00000502484 EEF2P13639 858 aaKnown RBP9.29□□□□□ -0.92
PDE4D-208ENST00000502484 LMOD1P29536 600 aaPredicted RBP9.29□□□□□ -0.92
PDE4D-208ENST00000502484 TXLNAP40222 546 aa9.29□□□□□ -0.92
PDE4D-208ENST00000502484 AFMP43652 599 aa9.29□□□□□ -0.92
PDE4D-208ENST00000502484 ATP2B2Q01814 1243 aa9.29□□□□□ -0.92
PDE4D-208ENST00000502484 TTBK2Q6IQ55 1244 aa9.29□□□□□ -0.92
PDE4D-208ENST00000502484 ZNF526Q8TF50 670 aaPredicted RBP9.29□□□□□ -0.92
PDE4D-208ENST00000502484 DCAF4Q8WV16 495 aa9.29□□□□□ -0.92
PDE4D-208ENST00000502484 COA7Q96BR5 231 aa9.29□□□□□ -0.92
PDE4D-208ENST00000502484 XPO4Q9C0E2 1151 aaKnown RBP9.29□□□□□ -0.92
PDE4D-208ENST00000502484 IFNKQ9P0W0 207 aa9.29□□□□□ -0.92
PDE4D-208ENST00000502484 PYCARDQ9ULZ3 195 aa9.29□□□□□ -0.92
PDE4D-208ENST00000502484 ZBTB12Q9Y330 459 aaPredicted RBP9.29□□□□□ -0.92
PDE4D-208ENST00000502484 SPDYE2BA6NHP3 402 aa9.28□□□□□ -0.92
PDE4D-208ENST00000502484 ZBTB5O15062 677 aa9.28□□□□□ -0.92
PDE4D-208ENST00000502484 SPDYE6P0CI01 402 aa9.28□□□□□ -0.92
PDE4D-208ENST00000502484 ADCY7P51828 1080 aa9.28□□□□□ -0.92
PDE4D-208ENST00000502484 FANCCQ00597 558 aa9.28□□□□□ -0.92
PDE4D-208ENST00000502484 CCDC96Q2M329 555 aa9.28□□□□□ -0.92
PDE4D-208ENST00000502484 SIAH1Q8IUQ4 282 aa9.28□□□□□ -0.92
PDE4D-208ENST00000502484 ENOX1Q8TC92 643 aaKnown RBP9.28□□□□□ -0.92
PDE4D-208ENST00000502484 TBCKQ8TEA7 893 aa9.28□□□□□ -0.92
PDE4D-208ENST00000502484 CACTINQ8WUQ7 758 aaKnown RBP9.28□□□□□ -0.92
PDE4D-208ENST00000502484 CCSER1Q9C0I3 900 aa9.28□□□□□ -0.92
PDE4D-208ENST00000502484 IMPACTQ9P2X3 320 aa9.28□□□□□ -0.92
PDE4D-208ENST00000502484 BIN2Q9UBW5 565 aaPredicted RBP9.28□□□□□ -0.92
PDE4D-208ENST00000502484 HDAC9Q9UKV0 1011 aa9.28□□□□□ -0.92
PDE4D-208ENST00000502484 NEMFO60524 1076 aa9.28□□□□□ -0.92
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