RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000384557.1

RNU6-1274P-201, Transcript of RNA, U6 small nuclear 1274, pseudogene, humanhuman

BASIC

Gene RNU6-1274P, Length 107 nt, Biotype snRNA.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNU6-1274P-201ENST00000384557 SEPHS1P49903 392 aa3.21□□□□□ -1.9
RNU6-1274P-201ENST00000384557 NEK4P51957 841 aa3.21□□□□□ -1.9
RNU6-1274P-201ENST00000384557 SNW1Q13573 536 aaKnown RBP3.21□□□□□ -1.9
RNU6-1274P-201ENST00000384557 DPY19L1Q2PZI1 675 aa3.21□□□□□ -1.9
RNU6-1274P-201ENST00000384557 DUSP27Q5VZP5 1158 aa3.21□□□□□ -1.9
RNU6-1274P-201ENST00000384557 GPAT2Q6NUI2 795 aa3.21□□□□□ -1.9
RNU6-1274P-201ENST00000384557 CRTC3Q6UUV7 619 aa3.21□□□□□ -1.9
RNU6-1274P-201ENST00000384557 SEZ6L2Q6UXD5 910 aa3.21□□□□□ -1.9
RNU6-1274P-201ENST00000384557 DDX46Q7L014 1031 aaKnown RBP3.21□□□□□ -1.9
RNU6-1274P-201ENST00000384557 TMC3Q7Z5M5 1100 aa3.21□□□□□ -1.9
RNU6-1274P-201ENST00000384557 ZAR1Q86SH2 424 aa3.21□□□□□ -1.9
RNU6-1274P-201ENST00000384557 PPIL6Q8IXY8 311 aa3.21□□□□□ -1.9
RNU6-1274P-201ENST00000384557 ARMC10Q8N2F6 343 aa3.21□□□□□ -1.9
RNU6-1274P-201ENST00000384557 ZNF655Q8N720 491 aaPredicted RBP3.21□□□□□ -1.9
RNU6-1274P-201ENST00000384557 TMEM145Q8NBT3 493 aa3.21□□□□□ -1.9
RNU6-1274P-201ENST00000384557 ENOX1Q8TC92 643 aaKnown RBP3.21□□□□□ -1.9
RNU6-1274P-201ENST00000384557 DCAF4Q8WV16 495 aa3.21□□□□□ -1.9
RNU6-1274P-201ENST00000384557 LEO1Q8WVC0 666 aaPredicted RBP3.21□□□□□ -1.9
RNU6-1274P-201ENST00000384557 CCDC136Q96JN2 1154 aa3.21□□□□□ -1.9
RNU6-1274P-201ENST00000384557 MEGF10Q96KG7 1140 aa3.21□□□□□ -1.9
RNU6-1274P-201ENST00000384557 MAGEB10Q96LZ2 347 aaPredicted RBP3.21□□□□□ -1.9
RNU6-1274P-201ENST00000384557 FAM83CQ9BQN1 747 aa3.21□□□□□ -1.9
RNU6-1274P-201ENST00000384557 TARS2Q9BW92 718 aaKnown RBP3.21□□□□□ -1.9
RNU6-1274P-201ENST00000384557 IRF2BPLQ9H1B7 796 aa3.21□□□□□ -1.9
RNU6-1274P-201ENST00000384557 SLC52A2Q9HAB3 445 aa3.21□□□□□ -1.9
RNU6-1274P-201ENST00000384557 C1GALT1Q9NS00 363 aa3.21□□□□□ -1.9
RNU6-1274P-201ENST00000384557 KLHL42Q9P2K6 505 aa3.21□□□□□ -1.9
RNU6-1274P-201ENST00000384557 STOML1Q9UBI4 398 aa3.21□□□□□ -1.9
RNU6-1274P-201ENST00000384557 BACE2Q9Y5Z0 518 aa3.21□□□□□ -1.9
RNU6-1274P-201ENST00000384557 COL17A1Q9UMD9 1497 aaPredicted RBP3.21□□□□□ -1.9
RNU6-1274P-201ENST00000384557 TRBV23OR9-2A0A075B6M9 112 aa3.2□□□□□ -1.9
RNU6-1274P-201ENST00000384557 A0A087X0B3 334 aa3.2□□□□□ -1.9
RNU6-1274P-201ENST00000384557 H0Y8X5 98 aa3.2□□□□□ -1.9
RNU6-1274P-201ENST00000384557 KCNQ2O43526 872 aa3.2□□□□□ -1.9
RNU6-1274P-201ENST00000384557 DNAJC8O75937 253 aaPredicted RBP3.2□□□□□ -1.9
RNU6-1274P-201ENST00000384557 PDGFRBP09619 1106 aa3.2□□□□□ -1.9
RNU6-1274P-201ENST00000384557 ZNF865P0CJ78 1059 aaPredicted RBP3.2□□□□□ -1.9
RNU6-1274P-201ENST00000384557 COL8A1P27658 744 aa3.2□□□□□ -1.9
RNU6-1274P-201ENST00000384557 PMLP29590 882 aa3.2□□□□□ -1.9
RNU6-1274P-201ENST00000384557 BMP8BP34820 402 aa3.2□□□□□ -1.9
RNU6-1274P-201ENST00000384557 PCBP3P57721 371 aaKnown RBP3.2□□□□□ -1.9
RNU6-1274P-201ENST00000384557 SCRN1Q12765 414 aa3.2□□□□□ -1.9
RNU6-1274P-201ENST00000384557 KCNAB2Q13303 367 aa3.2□□□□□ -1.9
RNU6-1274P-201ENST00000384557 PLEKHG6Q3KR16 790 aa3.2□□□□□ -1.9
RNU6-1274P-201ENST00000384557 HSP90AB2PQ58FF8 381 aa3.2□□□□□ -1.9
RNU6-1274P-201ENST00000384557 ODR4Q5SWX8 454 aa3.2□□□□□ -1.9
RNU6-1274P-201ENST00000384557 ACBD5Q5T8D3 534 aaPredicted RBP3.2□□□□□ -1.9
RNU6-1274P-201ENST00000384557 EEF1DP3Q658K8 133 aa3.2□□□□□ -1.9
RNU6-1274P-201ENST00000384557 OGFOD3Q6PK18 319 aa3.2□□□□□ -1.9
RNU6-1274P-201ENST00000384557 NOL8Q76FK4 1167 aaKnown RBP3.2□□□□□ -1.9
RNU6-1274P-201ENST00000384557 RNF180Q86T96 592 aa3.2□□□□□ -1.9
RNU6-1274P-201ENST00000384557 DDX53Q86TM3 631 aaKnown RBP3.2□□□□□ -1.9
RNU6-1274P-201ENST00000384557 MTDHQ86UE4 582 aaKnown RBP3.2□□□□□ -1.9
RNU6-1274P-201ENST00000384557 RPUSD2Q8IZ73 545 aaKnown RBP3.2□□□□□ -1.9
RNU6-1274P-201ENST00000384557 DAGLBQ8NCG7 672 aa3.2□□□□□ -1.9
RNU6-1274P-201ENST00000384557 GSTCDQ8NEC7 633 aa3.2□□□□□ -1.9
RNU6-1274P-201ENST00000384557 OR2W6PQ8NHA6 318 aa3.2□□□□□ -1.9
RNU6-1274P-201ENST00000384557 CLUHP3Q96NS8 147 aa3.2□□□□□ -1.9
RNU6-1274P-201ENST00000384557 ZFYVE21Q9BQ24 234 aa3.2□□□□□ -1.9
RNU6-1274P-201ENST00000384557 ALG1Q9BT22 464 aa3.2□□□□□ -1.9
RNU6-1274P-201ENST00000384557 METTL22Q9BUU2 404 aaPredicted RBP3.2□□□□□ -1.9
RNU6-1274P-201ENST00000384557 HDAC8Q9BY41 377 aa3.2□□□□□ -1.9
RNU6-1274P-201ENST00000384557 C7orf69Q9H7B7 122 aa3.2□□□□□ -1.9
RNU6-1274P-201ENST00000384557 XPO5Q9HAV4 1204 aaKnown RBP eCLIP3.2□□□□□ -1.9
RNU6-1274P-201ENST00000384557 TRIM39Q9HCM9 518 aa3.2□□□□□ -1.9
RNU6-1274P-201ENST00000384557 RAXQ9Y2V3 346 aa3.2□□□□□ -1.9
RNU6-1274P-201ENST00000384557 TNPO3Q9Y5L0 923 aaKnown RBP3.2□□□□□ -1.9
RNU6-1274P-201ENST00000384557 ST14Q9Y5Y6 855 aa3.2□□□□□ -1.9
RNU6-1274P-201ENST00000384557 BLACEA4D250 179 aa3.19□□□□□ -1.9
RNU6-1274P-201ENST00000384557 C2orf71A6NGG8 1288 aa3.19□□□□□ -1.9
RNU6-1274P-201ENST00000384557 AURKAO14965 403 aa3.19□□□□□ -1.9
RNU6-1274P-201ENST00000384557 GSC2O15499 205 aa3.19□□□□□ -1.9
RNU6-1274P-201ENST00000384557 MYO1BO43795 1136 aa3.19□□□□□ -1.9
RNU6-1274P-201ENST00000384557 BRINP1O60477 761 aa3.19□□□□□ -1.9
RNU6-1274P-201ENST00000384557 KPNA6O60684 536 aa3.19□□□□□ -1.9
RNU6-1274P-201ENST00000384557 VAMP4O75379 141 aa3.19□□□□□ -1.9
RNU6-1274P-201ENST00000384557 NPTXRO95502 500 aa3.19□□□□□ -1.9
RNU6-1274P-201ENST00000384557 CAPNS1P04632 268 aa3.19□□□□□ -1.9
RNU6-1274P-201ENST00000384557 C6orf222P0C671 652 aaPredicted RBP3.19□□□□□ -1.9
RNU6-1274P-201ENST00000384557 SDSP20132 328 aa3.19□□□□□ -1.9
RNU6-1274P-201ENST00000384557 LTBRP36941 435 aa3.19□□□□□ -1.9
RNU6-1274P-201ENST00000384557 EXOSC10Q01780 885 aaKnown RBP3.19□□□□□ -1.9
RNU6-1274P-201ENST00000384557 GUCY1A3Q02108 690 aa3.19□□□□□ -1.9
RNU6-1274P-201ENST00000384557 SART3Q15020 963 aaKnown RBP3.19□□□□□ -1.9
RNU6-1274P-201ENST00000384557 SF1Q15637 639 aaKnown RBP3.19□□□□□ -1.9
RNU6-1274P-201ENST00000384557 CPSF6Q16630 551 aaKnown RBP eCLIP3.19□□□□□ -1.9
RNU6-1274P-201ENST00000384557 CFAP100Q494V2 611 aa3.19□□□□□ -1.9
RNU6-1274P-201ENST00000384557 SLC35F1Q5T1Q4 408 aa3.19□□□□□ -1.9
RNU6-1274P-201ENST00000384557 CCDC181Q5TID7 509 aa3.19□□□□□ -1.9
RNU6-1274P-201ENST00000384557 E4F1Q66K89 784 aaPredicted RBP3.19□□□□□ -1.9
RNU6-1274P-201ENST00000384557 STYK1Q6J9G0 422 aa3.19□□□□□ -1.9
RNU6-1274P-201ENST00000384557 RSPO2Q6UXX9 243 aaPredicted RBP3.19□□□□□ -1.9
RNU6-1274P-201ENST00000384557 DDX42Q86XP3 938 aaKnown RBP eCLIP3.19□□□□□ -1.9
RNU6-1274P-201ENST00000384557 FBXL6Q8N531 539 aa3.19□□□□□ -1.9
RNU6-1274P-201ENST00000384557 UBR7Q8N806 425 aa3.19□□□□□ -1.9
RNU6-1274P-201ENST00000384557 NAT16Q8N8M0 369 aa3.19□□□□□ -1.9
RNU6-1274P-201ENST00000384557 PUM2Q8TB72 1066 aaKnown RBP eCLIP3.19□□□□□ -1.9
RNU6-1274P-201ENST00000384557 SLC7A14Q8TBB6 771 aa3.19□□□□□ -1.9
RNU6-1274P-201ENST00000384557 PANK1Q8TE04 598 aa3.19□□□□□ -1.9
RNU6-1274P-201ENST00000384557 JDP2Q8WYK2 163 aa3.19□□□□□ -1.9
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 22.8 ms