RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000368547.3

ECHS1-201, Transcript of enoyl-CoA hydratase, short chain 1, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene ECHS1, Length 1,617 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ECHS1-201ENST00000368547 SSRP1Q08945 709 aaKnown RBP34.22■■■■□ 3.07
ECHS1-201ENST00000368547 RNF26Q9BY78 433 aaPredicted RBP34.22■■■■□ 3.07
ECHS1-201ENST00000368547 CTDP1Q9Y5B0 961 aaPredicted RBP34.22■■■■□ 3.07
ECHS1-201ENST00000368547 PTPDC1A2A3K4 754 aa34.21■■■■□ 3.07
ECHS1-201ENST00000368547 JAK2O60674 1132 aa34.21■■■■□ 3.07
ECHS1-201ENST00000368547 FMNL1O95466 1100 aaPredicted RBP34.21■■■■□ 3.07
ECHS1-201ENST00000368547 ALDH1A1P00352 501 aa34.21■■■■□ 3.07
ECHS1-201ENST00000368547 CCDC174Q6PII3 467 aa34.21■■■■□ 3.07
ECHS1-201ENST00000368547 TRIM22Q8IYM9 498 aa34.21■■■■□ 3.07
ECHS1-201ENST00000368547 ZSCAN21Q9Y5A6 473 aaPredicted RBP34.21■■■■□ 3.07
ECHS1-201ENST00000368547 CEP350Q5VT06 3117 aa34.2■■■■□ 3.07
ECHS1-201ENST00000368547 ZBTB5O15062 677 aa34.2■■■■□ 3.07
ECHS1-201ENST00000368547 PRPF3O43395 683 aaKnown RBP34.2■■■■□ 3.07
ECHS1-201ENST00000368547 QRICH1Q2TAL8 776 aa34.2■■■■□ 3.07
ECHS1-201ENST00000368547 FOXD4L1Q9NU39 408 aa34.2■■■■□ 3.07
ECHS1-201ENST00000368547 SEC63Q9UGP8 760 aaKnown RBP34.2■■■■□ 3.07
ECHS1-201ENST00000368547 AKAP17AQ02040 695 aaKnown RBP34.19■■■■□ 3.06
ECHS1-201ENST00000368547 DNAJC5GQ8N7S2 189 aa34.19■■■■□ 3.06
ECHS1-201ENST00000368547 MB21D1Q8N884 522 aa34.19■■■■□ 3.06
ECHS1-201ENST00000368547 REPS2Q8NFH8 660 aa34.19■■■■□ 3.06
ECHS1-201ENST00000368547 PAGR1Q9BTK6 254 aa34.19■■■■□ 3.06
ECHS1-201ENST00000368547 PNMA6FA0A0J9YX94 578 aa34.19■■■■□ 3.06
ECHS1-201ENST00000368547 PEX10O60683 326 aa34.19■■■■□ 3.06
ECHS1-201ENST00000368547 CPXCR1Q8N123 301 aa34.19■■■■□ 3.06
ECHS1-201ENST00000368547 GTF3C2Q8WUA4 911 aaPredicted RBP34.19■■■■□ 3.06
ECHS1-201ENST00000368547 DDX11Q96FC9 970 aa34.19■■■■□ 3.06
ECHS1-201ENST00000368547 ZFYVE28Q9HCC9 887 aa34.19■■■■□ 3.06
ECHS1-201ENST00000368547 BTBD7Q9P203 1132 aa34.19■■■■□ 3.06
ECHS1-201ENST00000368547 RBPJLQ9UBG7 517 aa34.19■■■■□ 3.06
ECHS1-201ENST00000368547 PCNTO95613 3336 aa34.18■■■■□ 3.06
ECHS1-201ENST00000368547 GCLCP48506 637 aaPredicted RBP34.18■■■■□ 3.06
ECHS1-201ENST00000368547 CRHR2Q13324 411 aa34.18■■■■□ 3.06
ECHS1-201ENST00000368547 TMEM132BQ14DG7 1078 aa34.18■■■■□ 3.06
ECHS1-201ENST00000368547 SMARCC2Q8TAQ2 1214 aa34.18■■■■□ 3.06
ECHS1-201ENST00000368547 RAVER2Q9HCJ3 691 aaKnown RBP34.18■■■■□ 3.06
ECHS1-201ENST00000368547 TXNRD2Q9NNW7 524 aa34.18■■■■□ 3.06
ECHS1-201ENST00000368547 RBM27Q9P2N5 1060 aaKnown RBP34.18■■■■□ 3.06
ECHS1-201ENST00000368547 ZNF536O15090 1300 aa34.17■■■■□ 3.06
ECHS1-201ENST00000368547 CA12O43570 354 aa34.17■■■■□ 3.06
ECHS1-201ENST00000368547 ORC3Q9UBD5 711 aaPredicted RBP34.17■■■■□ 3.06
ECHS1-201ENST00000368547 ZNF214Q9UL59 606 aaPredicted RBP34.17■■■■□ 3.06
ECHS1-201ENST00000368547 RABGAP1Q9Y3P9 1069 aa34.17■■■■□ 3.06
ECHS1-201ENST00000368547 ADGRA2Q96PE1 1338 aa34.16■■■■□ 3.06
ECHS1-201ENST00000368547 STK36Q9NRP7 1315 aa34.16■■■■□ 3.06
ECHS1-201ENST00000368547 PPP1R11O60927 126 aaPredicted RBP34.16■■■■□ 3.06
ECHS1-201ENST00000368547 CNMDO75829 334 aa34.16■■■■□ 3.06
ECHS1-201ENST00000368547 FDPSP14324 419 aaKnown RBP34.15■■■■□ 3.06
ECHS1-201ENST00000368547 PLS1Q14651 629 aa34.15■■■■□ 3.06
ECHS1-201ENST00000368547 PKN1Q16512 942 aa34.15■■■■□ 3.06
ECHS1-201ENST00000368547 ANKRD13CQ8N6S4 541 aa34.15■■■■□ 3.06
ECHS1-201ENST00000368547 SMCHD1A6NHR9 2005 aa34.15■■■■□ 3.06
ECHS1-201ENST00000368547 TLR2O60603 784 aa34.15■■■■□ 3.06
ECHS1-201ENST00000368547 DEXIO95424 95 aa34.15■■■■□ 3.06
ECHS1-201ENST00000368547 ICAM1P05362 532 aa34.15■■■■□ 3.06
ECHS1-201ENST00000368547 OAZ1P54368 228 aa34.15■■■■□ 3.06
ECHS1-201ENST00000368547 AGBL1Q96MI9 1066 aa34.15■■■■□ 3.06
ECHS1-201ENST00000368547 RNF186Q9NXI6 227 aa34.15■■■■□ 3.06
ECHS1-201ENST00000368547 HMGN5P82970 282 aaKnown RBP34.14■■■■□ 3.06
ECHS1-201ENST00000368547 PFKFB3Q16875 520 aaPredicted RBP34.14■■■■□ 3.06
ECHS1-201ENST00000368547 FBXO11Q86XK2 927 aa34.14■■■■□ 3.06
ECHS1-201ENST00000368547 AMNQ9BXJ7 453 aa34.14■■■■□ 3.06
ECHS1-201ENST00000368547 CPA4Q9UI42 421 aa34.14■■■■□ 3.06
ECHS1-201ENST00000368547 ATP2A1O14983 1001 aa34.13■■■■□ 3.05
ECHS1-201ENST00000368547 SCG2P13521 617 aa34.13■■■■□ 3.05
ECHS1-201ENST00000368547 TAL1P17542 331 aaPredicted RBP34.13■■■■□ 3.05
ECHS1-201ENST00000368547 USH1GQ495M9 461 aa34.13■■■■□ 3.05
ECHS1-201ENST00000368547 CCPG1Q9ULG6 757 aa34.13■■■■□ 3.05
ECHS1-201ENST00000368547 SMC3Q9UQE7 1217 aa34.13■■■■□ 3.05
ECHS1-201ENST00000368547 TRPA1O75762 1119 aa34.12■■■■□ 3.05
ECHS1-201ENST00000368547 SNRNP48Q6IEG0 339 aaKnown RBP34.12■■■■□ 3.05
ECHS1-201ENST00000368547 GPKOWQ92917 476 aaPredicted RBP eCLIP34.12■■■■□ 3.05
ECHS1-201ENST00000368547 TEX13BQ9BXU2 312 aa34.12■■■■□ 3.05
ECHS1-201ENST00000368547 STAT3P40763 770 aa34.12■■■■□ 3.05
ECHS1-201ENST00000368547 ERVK-9P63128 1117 aa34.12■■■■□ 3.05
ECHS1-201ENST00000368547 ERVK-24P63145 666 aa34.12■■■■□ 3.05
ECHS1-201ENST00000368547 Q3C1V9 767 aa34.12■■■■□ 3.05
ECHS1-201ENST00000368547 HEATR3Q7Z4Q2 680 aa34.12■■■■□ 3.05
ECHS1-201ENST00000368547 AIFM3Q96NN9 605 aa34.12■■■■□ 3.05
ECHS1-201ENST00000368547 SPATC1LQ9H0A9 340 aa34.12■■■■□ 3.05
ECHS1-201ENST00000368547 MORF4L1Q9UBU8 362 aa34.12■■■■□ 3.05
ECHS1-201ENST00000368547 NUCB2P80303 420 aa34.11■■■■□ 3.05
ECHS1-201ENST00000368547 WWC2Q6AWC2 1192 aa34.11■■■■□ 3.05
ECHS1-201ENST00000368547 GPRC5AQ8NFJ5 357 aa34.11■■■■□ 3.05
ECHS1-201ENST00000368547 COA7Q96BR5 231 aa34.11■■■■□ 3.05
ECHS1-201ENST00000368547 R3HDMLQ9H3Y0 253 aa34.11■■■■□ 3.05
ECHS1-201ENST00000368547 PCDHA1Q9Y5I3 950 aa34.11■■■■□ 3.05
ECHS1-201ENST00000368547 TBC1D8O95759 1140 aa34.1■■■■□ 3.05
ECHS1-201ENST00000368547 GJB2P29033 226 aa34.1■■■■□ 3.05
ECHS1-201ENST00000368547 MAP2K1Q02750 393 aaPredicted RBP34.1■■■■□ 3.05
ECHS1-201ENST00000368547 FAM110CQ1W6H9 321 aa34.1■■■■□ 3.05
ECHS1-201ENST00000368547 C17orf99Q6UX52 265 aa34.1■■■■□ 3.05
ECHS1-201ENST00000368547 RIPK3Q9Y572 518 aa34.1■■■■□ 3.05
ECHS1-201ENST00000368547 BCRP11274 1271 aa34.09■■■■□ 3.05
ECHS1-201ENST00000368547 WASF1Q92558 559 aa34.09■■■■□ 3.05
ECHS1-201ENST00000368547 PNMA2Q9UL42 364 aa34.09■■■■□ 3.05
ECHS1-201ENST00000368547 ALAS1P13196 640 aa34.08■■■■□ 3.05
ECHS1-201ENST00000368547 FAM184AQ8NB25 1140 aa34.08■■■■□ 3.05
ECHS1-201ENST00000368547 CFHR5Q9BXR6 569 aa34.08■■■■□ 3.05
ECHS1-201ENST00000368547 MOV10L1Q9BXT6 1211 aaKnown RBP34.08■■■■□ 3.05
ECHS1-201ENST00000368547 TRAF1Q13077 416 aa34.08■■■■□ 3.05
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