RNA–Protein interactions for RNA: YOL052C-A

DDR2, Transcript of Multi-stress response protein, yeast

Gene DDR2, Length 186 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
DDR2	YOL052C-A	DCW1	P36091	449 aa		10.8	□□□□□ -0.68
DDR2	YOL052C-A	TSC10	P38342	320 aa		10.8	□□□□□ -0.68
DDR2	YOL052C-A	MPT5	P39016	859 aa	Known RBP RIP-Chip data	10.8	□□□□□ -0.68	not detected
DDR2	YOL052C-A	YIR007W	P40566	764 aa		10.8	□□□□□ -0.68
DDR2	YOL052C-A	CCT7	P42943	550 aa	Known RBP	10.8	□□□□□ -0.68
DDR2	YOL052C-A	EMC4	P53073	190 aa		10.8	□□□□□ -0.68
DDR2	YOL052C-A	NOP19	P53317	196 aa	Predicted RBP	10.8	□□□□□ -0.68
DDR2	YOL052C-A	VAC7	P53950	1165 aa		10.8	□□□□□ -0.68
DDR2	YOL052C-A	ARP4	P80428	489 aa		10.8	□□□□□ -0.68
DDR2	YOL052C-A	OSH6	Q02201	448 aa		10.8	□□□□□ -0.68
DDR2	YOL052C-A	GOT1	Q03554	138 aa		10.8	□□□□□ -0.68
DDR2	YOL052C-A	TAF12	Q03761	539 aa		10.8	□□□□□ -0.68
DDR2	YOL052C-A	IRC10	Q08118	586 aa		10.8	□□□□□ -0.68
DDR2	YOL052C-A	MCD1	Q12158	566 aa		10.8	□□□□□ -0.68
DDR2	YOL052C-A	AHA1	Q12449	350 aa	Known RBP	10.8	□□□□□ -0.68
DDR2	YOL052C-A	SEC63	P14906	663 aa		10.79	□□□□□ -0.68
DDR2	YOL052C-A	GAL11	P19659	1081 aa		10.79	□□□□□ -0.68
DDR2	YOL052C-A	VAN1	P23642	535 aa		10.79	□□□□□ -0.68
DDR2	YOL052C-A	SSE1	P32589	693 aa	Known RBP	10.79	□□□□□ -0.68
DDR2	YOL052C-A	PTH2	P34222	208 aa		10.79	□□□□□ -0.68
DDR2	YOL052C-A	EAP1	P36041	632 aa	Known RBP	10.79	□□□□□ -0.68
DDR2	YOL052C-A	DBP8	P38719	431 aa		10.79	□□□□□ -0.68
DDR2	YOL052C-A	UTP9	P38882	575 aa	Known RBP	10.79	□□□□□ -0.68
DDR2	YOL052C-A	MIG2	P53035	382 aa		10.79	□□□□□ -0.68
DDR2	YOL052C-A	CUS2	P53830	285 aa	Predicted RBP	10.79	□□□□□ -0.68
DDR2	YOL052C-A	IBD2	P53892	351 aa		10.79	□□□□□ -0.68
DDR2	YOL052C-A	JIP5	Q06214	492 aa	Predicted RBP	10.79	□□□□□ -0.68
DDR2	YOL052C-A	PRP6	P19735	899 aa	Predicted RBP	10.78	□□□□□ -0.68
DDR2	YOL052C-A	MRM1	P25270	412 aa		10.78	□□□□□ -0.68
DDR2	YOL052C-A	PUP3	P25451	205 aa	Known RBP	10.78	□□□□□ -0.68
DDR2	YOL052C-A	RAD14	P28519	371 aa		10.78	□□□□□ -0.68
DDR2	YOL052C-A	MLS1	P30952	554 aa		10.78	□□□□□ -0.68
DDR2	YOL052C-A	SPR1	P32603	445 aa		10.78	□□□□□ -0.68
DDR2	YOL052C-A	TIP20	P33891	701 aa		10.78	□□□□□ -0.68
DDR2	YOL052C-A	CUE2	P36075	443 aa	Known RBP	10.78	□□□□□ -0.68
DDR2	YOL052C-A	ARP1	P38696	384 aa		10.78	□□□□□ -0.68
DDR2	YOL052C-A	ARN1	P38731	627 aa		10.78	□□□□□ -0.68
DDR2	YOL052C-A	PCL5	P38794	229 aa		10.78	□□□□□ -0.68
DDR2	YOL052C-A	NNF1	P47149	201 aa		10.78	□□□□□ -0.68
DDR2	YOL052C-A	NUP84	P52891	726 aa		10.78	□□□□□ -0.68
DDR2	YOL052C-A	USE1	P53146	245 aa		10.78	□□□□□ -0.68
DDR2	YOL052C-A	SWC4	P53201	476 aa		10.78	□□□□□ -0.68
DDR2	YOL052C-A	SHY1	P53266	389 aa		10.78	□□□□□ -0.68
DDR2	YOL052C-A	GTR2	P53290	341 aa		10.78	□□□□□ -0.68
DDR2	YOL052C-A	FRE4	P53746	719 aa		10.78	□□□□□ -0.68
DDR2	YOL052C-A	PEX13	P80667	386 aa		10.78	□□□□□ -0.68
DDR2	YOL052C-A	CET1	O13297	549 aa	Predicted RBP	10.77	□□□□□ -0.69
DDR2	YOL052C-A	ARD1	P07347	238 aa	Predicted RBP	10.77	□□□□□ -0.69
DDR2	YOL052C-A	FUS1	P11710	512 aa		10.77	□□□□□ -0.69
DDR2	YOL052C-A	RSR1	P13856	272 aa		10.77	□□□□□ -0.69
DDR2	YOL052C-A	ART10	P18634	518 aa	Known RBP	10.77	□□□□□ -0.69
DDR2	YOL052C-A	PWP1	P21304	576 aa	Known RBP	10.77	□□□□□ -0.69
DDR2	YOL052C-A	EPT1	P22140	391 aa		10.77	□□□□□ -0.69
DDR2	YOL052C-A	PHO84	P25297	587 aa	Known RBP	10.77	□□□□□ -0.69
DDR2	YOL052C-A	OXP1	P28273	1286 aa		10.77	□□□□□ -0.69
DDR2	YOL052C-A	PMT1	P33775	817 aa		10.77	□□□□□ -0.69
DDR2	YOL052C-A	YKL100C	P34248	587 aa		10.77	□□□□□ -0.69
DDR2	YOL052C-A	YPT52	P36018	234 aa	Known RBP	10.77	□□□□□ -0.69
DDR2	YOL052C-A	RIM11	P38615	370 aa		10.77	□□□□□ -0.69
DDR2	YOL052C-A	YER034W	P40022	185 aa	Known RBP	10.77	□□□□□ -0.69
DDR2	YOL052C-A	SCS2	P40075	244 aa	Known RBP	10.77	□□□□□ -0.69
DDR2	YOL052C-A	COG7	P53195	279 aa		10.77	□□□□□ -0.69
DDR2	YOL052C-A	TGL2	P54857	326 aa		10.77	□□□□□ -0.69
DDR2	YOL052C-A	YML131W	Q03102	365 aa		10.77	□□□□□ -0.69
DDR2	YOL052C-A	GAS3	Q03655	524 aa		10.77	□□□□□ -0.69
DDR2	YOL052C-A	SSL1	Q04673	461 aa	Predicted RBP	10.77	□□□□□ -0.69
DDR2	YOL052C-A	VAM6	Q07468	1049 aa		10.77	□□□□□ -0.69
DDR2	YOL052C-A	OSW1	Q08692	278 aa		10.77	□□□□□ -0.69
DDR2	YOL052C-A	YIG1	Q08956	461 aa		10.77	□□□□□ -0.69
DDR2	YOL052C-A	SMF3	Q12078	473 aa	Predicted RBP	10.77	□□□□□ -0.69
DDR2	YOL052C-A	CPA1	P07258	411 aa	Known RBP	10.76	□□□□□ -0.69
DDR2	YOL052C-A	SFP1	P32432	683 aa		10.76	□□□□□ -0.69
DDR2	YOL052C-A	YHL008C	P38750	627 aa		10.76	□□□□□ -0.69
DDR2	YOL052C-A	HSE1	P38753	452 aa		10.76	□□□□□ -0.69
DDR2	YOL052C-A	SSN3	P39073	555 aa		10.76	□□□□□ -0.69
DDR2	YOL052C-A	TIM17	P39515	158 aa		10.76	□□□□□ -0.69
DDR2	YOL052C-A	YNL010W	P53981	241 aa	Known RBP	10.76	□□□□□ -0.69
DDR2	YOL052C-A	YPR084W	Q06821	456 aa		10.76	□□□□□ -0.69
DDR2	YOL052C-A	UPC2	Q12151	913 aa		10.76	□□□□□ -0.69
DDR2	YOL052C-A	CSE1	P33307	960 aa		10.75	□□□□□ -0.69
DDR2	YOL052C-A	DHH1	P39517	506 aa	Known RBP	10.75	□□□□□ -0.69
DDR2	YOL052C-A	YFR018C	P43599	363 aa		10.75	□□□□□ -0.69
DDR2	YOL052C-A	TDA7	P53882	636 aa	Predicted RBP	10.75	□□□□□ -0.69
DDR2	YOL052C-A	CLU1	Q03690	1277 aa	Known RBP	10.75	□□□□□ -0.69
DDR2	YOL052C-A	GNT1	Q12096	491 aa		10.75	□□□□□ -0.69
DDR2	YOL052C-A	DBR1	P24309	405 aa	Known RBP	10.74	□□□□□ -0.69
DDR2	YOL052C-A	PHO87	P25360	923 aa		10.74	□□□□□ -0.69
DDR2	YOL052C-A	GUT1	P32190	709 aa		10.74	□□□□□ -0.69
DDR2	YOL052C-A	RPS1A	P33442	255 aa	Known RBP	10.74	□□□□□ -0.69
DDR2	YOL052C-A	NUP120	P35729	1037 aa		10.74	□□□□□ -0.69
DDR2	YOL052C-A	IML3	P38265	245 aa		10.74	□□□□□ -0.69
DDR2	YOL052C-A	YHR020W	P38708	688 aa	Known RBP	10.74	□□□□□ -0.69
DDR2	YOL052C-A	YEN1	P40028	759 aa		10.74	□□□□□ -0.69
DDR2	YOL052C-A	SER33	P40510	469 aa		10.74	□□□□□ -0.69
DDR2	YOL052C-A	IAH1	P41734	238 aa		10.74	□□□□□ -0.69
DDR2	YOL052C-A	VMA13	P41807	478 aa	Known RBP	10.74	□□□□□ -0.69
DDR2	YOL052C-A	YRB1	P41920	201 aa	Known RBP	10.74	□□□□□ -0.69
DDR2	YOL052C-A	GAT1	P43574	510 aa		10.74	□□□□□ -0.69
DDR2	YOL052C-A	NMA2	P53204	395 aa		10.74	□□□□□ -0.69
DDR2	YOL052C-A	REX2	P54964	269 aa	Known RBP	10.74	□□□□□ -0.69

Retrieved 100 of 5,963 RNA–protein pairs in 53.5 ms