RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000636120.1

PDE4D-228, Transcript of phosphodiesterase 4D, humanhuman

TSL 5 BASIC

Gene PDE4D, Length 6,659 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDE4D-228ENST00000636120 PANK4Q9NVE7 773 aa7.17□□□□□ -1.26
PDE4D-228ENST00000636120 PCDHA12Q9UN75 941 aa7.17□□□□□ -1.26
PDE4D-228ENST00000636120 UTP11Q9Y3A2 253 aaKnown RBP7.17□□□□□ -1.26
PDE4D-228ENST00000636120 CSADQ9Y600 493 aa7.17□□□□□ -1.26
PDE4D-228ENST00000636120 SPDYE4A6NLX3 237 aa7.17□□□□□ -1.26
PDE4D-228ENST00000636120 ACTN4O43707 911 aaKnown RBP7.17□□□□□ -1.26
PDE4D-228ENST00000636120 RPS6KA4O75676 772 aa7.17□□□□□ -1.26
PDE4D-228ENST00000636120 GTF2F1P35269 517 aaKnown RBP eCLIP7.17□□□□□ -1.26
PDE4D-228ENST00000636120 EVCP57679 992 aa7.17□□□□□ -1.26
PDE4D-228ENST00000636120 NECTIN1Q15223 517 aa7.17□□□□□ -1.26
PDE4D-228ENST00000636120 SPATA1Q5VX52 437 aa7.17□□□□□ -1.26
PDE4D-228ENST00000636120 TTLL11Q8NHH1 800 aa7.17□□□□□ -1.26
PDE4D-228ENST00000636120 KIAA1524Q8TCG1 905 aa7.17□□□□□ -1.26
PDE4D-228ENST00000636120 ALDH8A1Q9H2A2 487 aaPredicted RBP7.17□□□□□ -1.26
PDE4D-228ENST00000636120 VWDEQ8N2E2 1590 aa7.17□□□□□ -1.26
PDE4D-228ENST00000636120 CEP170BQ9Y4F5 1589 aaPredicted RBP7.17□□□□□ -1.26
PDE4D-228ENST00000636120 ZNF335Q9H4Z2 1342 aaPredicted RBP7.17□□□□□ -1.26
PDE4D-228ENST00000636120 COL15A1P39059 1388 aa7.17□□□□□ -1.26
PDE4D-228ENST00000636120 CYP27B1O15528 508 aa7.17□□□□□ -1.26
PDE4D-228ENST00000636120 EXOC3O60645 756 aa7.17□□□□□ -1.26
PDE4D-228ENST00000636120 IGSF3O75054 1194 aa7.17□□□□□ -1.26
PDE4D-228ENST00000636120 MMP1P03956 469 aa7.17□□□□□ -1.26
PDE4D-228ENST00000636120 P4HA1P13674 534 aa7.17□□□□□ -1.26
PDE4D-228ENST00000636120 IRX3P78415 501 aaPredicted RBP7.17□□□□□ -1.26
PDE4D-228ENST00000636120 ZYXQ15942 572 aaKnown RBP7.17□□□□□ -1.26
PDE4D-228ENST00000636120 SLFN13Q68D06 897 aa7.17□□□□□ -1.26
PDE4D-228ENST00000636120 RASEFQ8IZ41 740 aa7.17□□□□□ -1.26
PDE4D-228ENST00000636120 GSDMAQ96QA5 445 aa7.17□□□□□ -1.26
PDE4D-228ENST00000636120 METTL14Q9HCE5 456 aaKnown RBP7.17□□□□□ -1.26
PDE4D-228ENST00000636120 CLIC4Q9Y696 253 aa7.17□□□□□ -1.26
PDE4D-228ENST00000636120 STK36Q9NRP7 1315 aa7.16□□□□□ -1.26
PDE4D-228ENST00000636120 SPOPO43791 374 aa7.16□□□□□ -1.26
PDE4D-228ENST00000636120 KRT9P35527 623 aa7.16□□□□□ -1.26
PDE4D-228ENST00000636120 TECP42680 631 aa7.16□□□□□ -1.26
PDE4D-228ENST00000636120 SP4Q02446 784 aa7.16□□□□□ -1.26
PDE4D-228ENST00000636120 MCM6Q14566 821 aa7.16□□□□□ -1.26
PDE4D-228ENST00000636120 INF2Q27J81 1249 aa7.16□□□□□ -1.26
PDE4D-228ENST00000636120 GNL3Q9BVP2 549 aaKnown RBP eCLIP7.16□□□□□ -1.26
PDE4D-228ENST00000636120 XPO4Q9C0E2 1151 aaKnown RBP7.16□□□□□ -1.26
PDE4D-228ENST00000636120 COA1Q9GZY4 146 aa7.16□□□□□ -1.26
PDE4D-228ENST00000636120 IKBKBO14920 756 aa7.16□□□□□ -1.26
PDE4D-228ENST00000636120 SEPT2Q15019 361 aa7.16□□□□□ -1.26
PDE4D-228ENST00000636120 C8orf74Q6P047 294 aa7.16□□□□□ -1.26
PDE4D-228ENST00000636120 MYRIPQ8NFW9 859 aa7.16□□□□□ -1.26
PDE4D-228ENST00000636120 STAG1Q8WVM7 1258 aa7.16□□□□□ -1.26
PDE4D-228ENST00000636120 SYMPKQ92797 1274 aaKnown RBP7.16□□□□□ -1.26
PDE4D-228ENST00000636120 SSX2IPQ9Y2D8 614 aa7.16□□□□□ -1.26
PDE4D-228ENST00000636120 SOS2Q07890 1332 aaPredicted RBP7.16□□□□□ -1.26
PDE4D-228ENST00000636120 RIMS1Q86UR5 1692 aaKnown RBP7.16□□□□□ -1.26
PDE4D-228ENST00000636120 TECPR2O15040 1411 aa7.16□□□□□ -1.26
PDE4D-228ENST00000636120 ERCC5P28715 1186 aaPredicted RBP7.16□□□□□ -1.26
PDE4D-228ENST00000636120 NDUFA8P51970 172 aa7.16□□□□□ -1.26
PDE4D-228ENST00000636120 KLHL30Q0D2K2 578 aa7.16□□□□□ -1.26
PDE4D-228ENST00000636120 SUSD4Q5VX71 490 aa7.16□□□□□ -1.26
PDE4D-228ENST00000636120 AMNQ9BXJ7 453 aa7.16□□□□□ -1.26
PDE4D-228ENST00000636120 SEC31BQ9NQW1 1179 aa7.16□□□□□ -1.26
PDE4D-228ENST00000636120 COL4A3BPQ9Y5P4 624 aa7.16□□□□□ -1.26
PDE4D-228ENST00000636120 DDX39AO00148 427 aaKnown RBP7.16□□□□□ -1.26
PDE4D-228ENST00000636120 RHOXF2BP0C7M4 288 aa7.16□□□□□ -1.26
PDE4D-228ENST00000636120 IFNAR1P17181 557 aa7.16□□□□□ -1.26
PDE4D-228ENST00000636120 GAP43P17677 238 aa7.16□□□□□ -1.26
PDE4D-228ENST00000636120 GJC1P36383 396 aa7.16□□□□□ -1.26
PDE4D-228ENST00000636120 DOK7Q18PE1 504 aa7.16□□□□□ -1.26
PDE4D-228ENST00000636120 CFAP58Q5T655 872 aa7.16□□□□□ -1.26
PDE4D-228ENST00000636120 TPH2Q8IWU9 490 aa7.16□□□□□ -1.26
PDE4D-228ENST00000636120 LRRC47Q8N1G4 583 aaKnown RBP7.16□□□□□ -1.26
PDE4D-228ENST00000636120 LCORLQ8N3X6 602 aa7.16□□□□□ -1.26
PDE4D-228ENST00000636120 CCDC114Q96M63 670 aa7.16□□□□□ -1.26
PDE4D-228ENST00000636120 RHOXF2Q9BQY4 288 aa7.16□□□□□ -1.26
PDE4D-228ENST00000636120 MAPK8IP1Q9UQF2 711 aa7.16□□□□□ -1.26
PDE4D-228ENST00000636120 GAS8O95995 478 aa7.16□□□□□ -1.26
PDE4D-228ENST00000636120 XRCC5P13010 732 aaKnown RBP7.16□□□□□ -1.26
PDE4D-228ENST00000636120 RXRBP28702 533 aa7.16□□□□□ -1.26
PDE4D-228ENST00000636120 WHAMMP3Q1A5X7 153 aa7.16□□□□□ -1.26
PDE4D-228ENST00000636120 TDRD7Q8NHU6 1098 aaKnown RBP7.16□□□□□ -1.26
PDE4D-228ENST00000636120 PUS7LQ9H0K6 701 aaKnown RBP7.16□□□□□ -1.26
PDE4D-228ENST00000636120 GPHNQ9NQX3 736 aaPredicted RBP7.16□□□□□ -1.26
PDE4D-228ENST00000636120 TMEM131LA2VDJ0 1609 aa7.15□□□□□ -1.26
PDE4D-228ENST00000636120 KIF23Q02241 960 aaPredicted RBP7.15□□□□□ -1.26
PDE4D-228ENST00000636120 FAM76AQ8TAV0 307 aa7.15□□□□□ -1.26
PDE4D-228ENST00000636120 IFT81Q8WYA0 676 aa7.15□□□□□ -1.26
PDE4D-228ENST00000636120 OSBP2Q969R2 916 aa7.15□□□□□ -1.26
PDE4D-228ENST00000636120 DHTKD1Q96HY7 919 aaPredicted RBP7.15□□□□□ -1.26
PDE4D-228ENST00000636120 KANSL2Q9H9L4 492 aa7.15□□□□□ -1.26
PDE4D-228ENST00000636120 RNF216Q9NWF9 866 aaPredicted RBP7.15□□□□□ -1.26
PDE4D-228ENST00000636120 AGTPBP1Q9UPW5 1226 aa7.15□□□□□ -1.26
PDE4D-228ENST00000636120 USP42Q9H9J4 1324 aaKnown RBP7.15□□□□□ -1.26
PDE4D-228ENST00000636120 hCG_1642624A0A1W2PR95 340 aa7.15□□□□□ -1.26
PDE4D-228ENST00000636120 BTBD18B2RXH4 712 aa7.15□□□□□ -1.26
PDE4D-228ENST00000636120 MAGEA1P43355 309 aa7.15□□□□□ -1.26
PDE4D-228ENST00000636120 PLCB3Q01970 1234 aa7.15□□□□□ -1.26
PDE4D-228ENST00000636120 CFAP221Q4G0U5 840 aa7.15□□□□□ -1.26
PDE4D-228ENST00000636120 PRR16Q569H4 304 aa7.15□□□□□ -1.26
PDE4D-228ENST00000636120 EXOC8Q8IYI6 725 aa7.15□□□□□ -1.26
PDE4D-228ENST00000636120 TRIM58Q8NG06 486 aa7.15□□□□□ -1.26
PDE4D-228ENST00000636120 LSM14BQ9BX40 385 aaKnown RBP7.15□□□□□ -1.26
PDE4D-228ENST00000636120 STK17AQ9UEE5 414 aa7.15□□□□□ -1.26
PDE4D-228ENST00000636120 NARFQ9UHQ1 456 aa7.15□□□□□ -1.26
PDE4D-228ENST00000636120 NCOA3Q9Y6Q9 1424 aa7.15□□□□□ -1.26
PDE4D-228ENST00000636120 TCP10L2B9ZVM9 353 aa7.15□□□□□ -1.26
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