RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000591041.5

CAPNS1-212, Transcript of calpain small subunit 1, humanhuman

TSL 3

Gene CAPNS1, Length 812 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAPNS1-212ENST00000591041 MIGA2Q7L4E1 593 aa25.94■■□□□ 1.74
CAPNS1-212ENST00000591041 HOMER1Q86YM7 354 aa25.94■■□□□ 1.74
CAPNS1-212ENST00000591041 CHURC1Q8WUH1 139 aa25.94■■□□□ 1.74
CAPNS1-212ENST00000591041 KLRG1Q96E93 195 aa25.94■■□□□ 1.74
CAPNS1-212ENST00000591041 PGAP2Q9UHJ9 254 aa25.94■■□□□ 1.74
CAPNS1-212ENST00000591041 A0A1W2PQ27 194 aa25.93■■□□□ 1.74
CAPNS1-212ENST00000591041 A0A1W2PQ64 194 aa25.93■■□□□ 1.74
CAPNS1-212ENST00000591041 A0A1W2PQD8 194 aa25.93■■□□□ 1.74
CAPNS1-212ENST00000591041 GADD45BO75293 160 aaPredicted RBP25.93■■□□□ 1.74
CAPNS1-212ENST00000591041 ADALQ6DHV7 355 aa25.93■■□□□ 1.74
CAPNS1-212ENST00000591041 KRT25Q7Z3Z0 450 aa25.93■■□□□ 1.74
CAPNS1-212ENST00000591041 TEPSINQ96N21 525 aa25.93■■□□□ 1.74
CAPNS1-212ENST00000591041 FEZ1Q99689 392 aa25.93■■□□□ 1.74
CAPNS1-212ENST00000591041 GGA3Q9NZ52 723 aa25.93■■□□□ 1.74
CAPNS1-212ENST00000591041 MORC2Q9Y6X9 1032 aaPredicted RBP25.93■■□□□ 1.74
CAPNS1-212ENST00000591041 IQCA1LA6NCM1 817 aa25.92■■□□□ 1.74
CAPNS1-212ENST00000591041 STXBP3O00186 592 aa25.92■■□□□ 1.74
CAPNS1-212ENST00000591041 ZBTB5O15062 677 aa25.92■■□□□ 1.74
CAPNS1-212ENST00000591041 CYTH3O43739 400 aa25.92■■□□□ 1.74
CAPNS1-212ENST00000591041 L1TD1Q5T7N2 865 aaKnown RBP25.92■■□□□ 1.74
CAPNS1-212ENST00000591041 WWC2Q6AWC2 1192 aa25.92■■□□□ 1.74
CAPNS1-212ENST00000591041 USP50Q70EL3 339 aaPredicted RBP25.92■■□□□ 1.74
CAPNS1-212ENST00000591041 FAM160B2Q86V87 743 aa25.92■■□□□ 1.74
CAPNS1-212ENST00000591041 CLEC10AQ8IUN9 316 aa25.92■■□□□ 1.74
CAPNS1-212ENST00000591041 ADGRF4Q8IZF3 695 aa25.92■■□□□ 1.74
CAPNS1-212ENST00000591041 PIGSQ96S52 555 aa25.92■■□□□ 1.74
CAPNS1-212ENST00000591041 UBA5Q9GZZ9 404 aa25.92■■□□□ 1.74
CAPNS1-212ENST00000591041 PICK1Q9NRD5 415 aa25.92■■□□□ 1.74
CAPNS1-212ENST00000591041 DDNO94850 711 aaPredicted RBP25.91■■□□□ 1.74
CAPNS1-212ENST00000591041 NDUFB10O96000 172 aa25.91■■□□□ 1.74
CAPNS1-212ENST00000591041 USP14P54578 494 aa25.91■■□□□ 1.74
CAPNS1-212ENST00000591041 SULF1Q8IWU6 871 aa25.91■■□□□ 1.74
CAPNS1-212ENST00000591041 ZMYND12Q9H0C1 365 aa25.91■■□□□ 1.74
CAPNS1-212ENST00000591041 EIF4ENIF1Q9NRA8 985 aaKnown RBP25.91■■□□□ 1.74
CAPNS1-212ENST00000591041 PNMA2Q9UL42 364 aa25.91■■□□□ 1.74
CAPNS1-212ENST00000591041 EGFRP00533 1210 aa25.9■■□□□ 1.74
CAPNS1-212ENST00000591041 NF2P35240 595 aa25.9■■□□□ 1.74
CAPNS1-212ENST00000591041 EPS15P42566 896 aa25.9■■□□□ 1.74
CAPNS1-212ENST00000591041 MRPL12P52815 198 aaKnown RBP25.9■■□□□ 1.74
CAPNS1-212ENST00000591041 ZC3H15Q8WU90 426 aaKnown RBP25.9■■□□□ 1.74
CAPNS1-212ENST00000591041 MRPS27Q92552 414 aaKnown RBP25.9■■□□□ 1.74
CAPNS1-212ENST00000591041 LPAR1Q92633 364 aa25.9■■□□□ 1.74
CAPNS1-212ENST00000591041 GPKOWQ92917 476 aaPredicted RBP eCLIP25.9■■□□□ 1.74
CAPNS1-212ENST00000591041 L3MBTL3Q96JM7 780 aaPredicted RBP25.9■■□□□ 1.74
CAPNS1-212ENST00000591041 VCPKMTQ9H867 229 aa25.9■■□□□ 1.74
CAPNS1-212ENST00000591041 RRAGCQ9HB90 399 aa25.9■■□□□ 1.74
CAPNS1-212ENST00000591041 CLIC4Q9Y696 253 aa25.9■■□□□ 1.74
CAPNS1-212ENST00000591041 GOLGA6L3A6NEY3 463 aa25.89■■□□□ 1.74
CAPNS1-212ENST00000591041 SMCO2A6NFE2 343 aa25.89■■□□□ 1.74
CAPNS1-212ENST00000591041 UBE2Q2LH0YL09 131 aa25.89■■□□□ 1.74
CAPNS1-212ENST00000591041 CTAGE5O15320 804 aa25.89■■□□□ 1.74
CAPNS1-212ENST00000591041 PLA2G6O60733 806 aa25.89■■□□□ 1.74
CAPNS1-212ENST00000591041 CUTAO60888 179 aa25.89■■□□□ 1.74
CAPNS1-212ENST00000591041 ADCY7P51828 1080 aa25.89■■□□□ 1.74
CAPNS1-212ENST00000591041 STAT2P52630 851 aa25.89■■□□□ 1.74
CAPNS1-212ENST00000591041 ZNF445P59923 1031 aa25.89■■□□□ 1.74
CAPNS1-212ENST00000591041 NR5A1Q13285 461 aa25.89■■□□□ 1.74
CAPNS1-212ENST00000591041 ORC2Q13416 577 aaPredicted RBP25.89■■□□□ 1.74
CAPNS1-212ENST00000591041 ZSCAN23Q3MJ62 389 aa25.89■■□□□ 1.74
CAPNS1-212ENST00000591041 SYDE2Q5VT97 1194 aa25.89■■□□□ 1.74
CAPNS1-212ENST00000591041 KCTD1Q719H9 257 aa25.89■■□□□ 1.74
CAPNS1-212ENST00000591041 TRPM4Q8TD43 1214 aa25.89■■□□□ 1.74
CAPNS1-212ENST00000591041 CCDC34Q96HJ3 373 aa25.89■■□□□ 1.74
CAPNS1-212ENST00000591041 JMJD4Q9H9V9 463 aa25.89■■□□□ 1.74
CAPNS1-212ENST00000591041 BTNL9Q6UXG8 535 aa25.88■■□□□ 1.73
CAPNS1-212ENST00000591041 CCAR1Q8IX12 1150 aaKnown RBP25.88■■□□□ 1.73
CAPNS1-212ENST00000591041 NAP1L4Q99733 375 aaKnown RBP25.88■■□□□ 1.73
CAPNS1-212ENST00000591041 FEM1BQ9UK73 627 aa25.88■■□□□ 1.73
CAPNS1-212ENST00000591041 PHF20L1A8MW92 1017 aa25.87■■□□□ 1.73
CAPNS1-212ENST00000591041 KINO60870 393 aaKnown RBP25.87■■□□□ 1.73
CAPNS1-212ENST00000591041 CAPN15O75808 1086 aa25.87■■□□□ 1.73
CAPNS1-212ENST00000591041 COL13A1Q5TAT6 717 aaPredicted RBP25.87■■□□□ 1.73
CAPNS1-212ENST00000591041 SIAH1Q8IUQ4 282 aa25.87■■□□□ 1.73
CAPNS1-212ENST00000591041 KRI1Q8N9T8 703 aaKnown RBP25.87■■□□□ 1.73
CAPNS1-212ENST00000591041 CUL5Q93034 780 aa25.87■■□□□ 1.73
CAPNS1-212ENST00000591041 MTMR8Q96EF0 704 aa25.87■■□□□ 1.73
CAPNS1-212ENST00000591041 AMNQ9BXJ7 453 aa25.87■■□□□ 1.73
CAPNS1-212ENST00000591041 NUP62CLQ9H1M0 184 aa25.87■■□□□ 1.73
CAPNS1-212ENST00000591041 TMEM232C9JQI7 657 aa25.86■■□□□ 1.73
CAPNS1-212ENST00000591041 TTC38Q5R3I4 469 aa25.86■■□□□ 1.73
CAPNS1-212ENST00000591041 SCYL3Q8IZE3 742 aa25.86■■□□□ 1.73
CAPNS1-212ENST00000591041 REXO1Q8N1G1 1221 aaKnown RBP25.86■■□□□ 1.73
CAPNS1-212ENST00000591041 OXER1Q8TDS5 423 aa25.86■■□□□ 1.73
CAPNS1-212ENST00000591041 FERMT2Q96AC1 680 aa25.86■■□□□ 1.73
CAPNS1-212ENST00000591041 FAM13BQ9NYF5 915 aa25.86■■□□□ 1.73
CAPNS1-212ENST00000591041 ZNF112Q9UJU3 913 aa25.86■■□□□ 1.73
CAPNS1-212ENST00000591041 PCDHA7Q9UN72 937 aa25.86■■□□□ 1.73
CAPNS1-212ENST00000591041 PPP1R12BO60237 982 aaPredicted RBP25.85■■□□□ 1.73
CAPNS1-212ENST00000591041 CMA1P23946 247 aa25.85■■□□□ 1.73
CAPNS1-212ENST00000591041 FAM160A1Q05DH4 1040 aa25.85■■□□□ 1.73
CAPNS1-212ENST00000591041 RRP1BQ14684 758 aaKnown RBP25.85■■□□□ 1.73
CAPNS1-212ENST00000591041 NONOQ15233 471 aaKnown RBP eCLIP25.85■■□□□ 1.73
CAPNS1-212ENST00000591041 NBPF12Q5TAG4 269 aaPredicted RBP25.85■■□□□ 1.73
CAPNS1-212ENST00000591041 PIK3AP1Q6ZUJ8 805 aa25.85■■□□□ 1.73
CAPNS1-212ENST00000591041 FSIP1Q8NA03 581 aa25.85■■□□□ 1.73
CAPNS1-212ENST00000591041 KIAA1683Q9H0B3 1180 aa25.85■■□□□ 1.73
CAPNS1-212ENST00000591041 GLTPD2A6NH11 291 aa25.84■■□□□ 1.73
CAPNS1-212ENST00000591041 LAD1O00515 517 aa25.84■■□□□ 1.73
CAPNS1-212ENST00000591041 WDR46O15213 610 aaKnown RBP25.84■■□□□ 1.73
CAPNS1-212ENST00000591041 SLURP2P0DP57 97 aa25.84■■□□□ 1.73
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 14.6 ms