RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000530579.6

NEDD8-MDP1-201, Transcript of NEDD8-MDP1 readthrough, humanhuman

TSL 2

Gene NEDD8-MDP1, Length 471 nt, Biotype nonsense mediated decay.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 CIZ1Q9ULV3 898 aaPredicted RBP9.84□□□□□ -0.83
NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 ABT1Q9ULW3 272 aaKnown RBP9.84□□□□□ -0.83
NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 CTDP1Q9Y5B0 961 aaPredicted RBP9.84□□□□□ -0.83
NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 CNTNAP5Q8WYK1 1306 aa9.83□□□□□ -0.84
NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 PASKQ96RG2 1323 aa9.83□□□□□ -0.84
NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 USP17L15C9J2P7 530 aa9.83□□□□□ -0.84
NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 USP17L13C9JLJ4 530 aa9.83□□□□□ -0.84
NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 USP17L11C9JVI0 530 aa9.83□□□□□ -0.84
NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 USP17L18D6R9N7 530 aa9.83□□□□□ -0.84
NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 USP17L22D6RA61 530 aa9.83□□□□□ -0.84
NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 USP17L17D6RBQ6 530 aa9.83□□□□□ -0.84
NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 USP17L19D6RCP7 530 aa9.83□□□□□ -0.84
NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 USP17L20D6RJB6 530 aa9.83□□□□□ -0.84
NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 STX6O43752 255 aa9.83□□□□□ -0.84
NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 FLOT1O75955 427 aa9.83□□□□□ -0.84
NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 SCG2P13521 617 aa9.83□□□□□ -0.84
NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 PDIA4P13667 645 aaKnown RBP9.83□□□□□ -0.84
NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 XBP1P17861 261 aa9.83□□□□□ -0.84
NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 ZNF157P51786 506 aaPredicted RBP9.83□□□□□ -0.84
NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 SNAP25P60880 206 aa9.83□□□□□ -0.84
NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 USP17L24Q0WX57 530 aa9.83□□□□□ -0.84
NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 SNAPC2Q13487 334 aa9.83□□□□□ -0.84
NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 PKN1Q16512 942 aa9.83□□□□□ -0.84
NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 SH3D19Q5HYK7 790 aa9.83□□□□□ -0.84
NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 OTUD7BQ6GQQ9 843 aa9.83□□□□□ -0.84
NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 BTNL9Q6UXG8 535 aa9.83□□□□□ -0.84
NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 FASTKD5Q7L8L6 764 aaKnown RBP9.83□□□□□ -0.84
NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 HEATR3Q7Z4Q2 680 aa9.83□□□□□ -0.84
NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 WNK4Q96J92 1243 aa9.83□□□□□ -0.84
NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 C12orf42Q96LP6 360 aa9.83□□□□□ -0.84
NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 AIFM3Q96NN9 605 aa9.83□□□□□ -0.84
NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 SLF1Q9BQI6 1058 aa9.83□□□□□ -0.84
NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 FBXO28Q9NVF7 368 aa9.83□□□□□ -0.84
NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 PRR12Q9ULL5 1215 aa9.83□□□□□ -0.84
NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 WDR33Q9C0J8 1336 aaKnown RBP9.82□□□□□ -0.84
NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 A0A0G2JLL6 359 aaPredicted RBP9.82□□□□□ -0.84
NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 PNMA6FA0A0J9YX94 578 aa9.82□□□□□ -0.84
NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 TMEM88BA6NKF7 163 aa9.82□□□□□ -0.84
NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 PLA2G6O60733 806 aa9.82□□□□□ -0.84
NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 ZBED4O75132 1171 aa9.82□□□□□ -0.84
NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 DDIT3P35638 169 aa9.82□□□□□ -0.84
NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 GJA5P36382 358 aa9.82□□□□□ -0.84
NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 GTF2A2P52657 109 aa9.82□□□□□ -0.84
NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 COG2Q14746 738 aa9.82□□□□□ -0.84
NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 SAFBQ15424 915 aaKnown RBP eCLIP9.82□□□□□ -0.84
NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 PFKFB3Q16875 520 aaPredicted RBP9.82□□□□□ -0.84
NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 MCTP1Q6DN14 999 aa9.82□□□□□ -0.84
NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 RGMBQ6NW40 437 aa9.82□□□□□ -0.84
NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 CCDC174Q6PII3 467 aa9.82□□□□□ -0.84
NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 PRRT2Q7Z6L0 340 aaPredicted RBP9.82□□□□□ -0.84
NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 PRPF38AQ8NAV1 312 aaKnown RBP9.82□□□□□ -0.84
NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 PROCA1Q8NCQ7 364 aaPredicted RBP9.82□□□□□ -0.84
NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 GPKOWQ92917 476 aaPredicted RBP eCLIP9.82□□□□□ -0.84
NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 GJB4Q9NTQ9 266 aa9.82□□□□□ -0.84
NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 VPS54Q9P1Q0 977 aa9.82□□□□□ -0.84
NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 KCNH4Q9UQ05 1017 aa9.82□□□□□ -0.84
NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 ZBTB5O15062 677 aa9.81□□□□□ -0.84
NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 ZSCAN22P10073 491 aaPredicted RBP9.81□□□□□ -0.84
NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 CETPP11597 493 aa9.81□□□□□ -0.84
NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 NAPAP54920 295 aa9.81□□□□□ -0.84
NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 NLRP5P59047 1200 aa9.81□□□□□ -0.84
NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 PABPC4Q13310 644 aaKnown RBP eCLIP9.81□□□□□ -0.845e-9■■■■□ 19.8
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NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 PKP1Q13835 747 aa9.81□□□□□ -0.84
NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 CDC37Q16543 378 aaPredicted RBP9.81□□□□□ -0.84
NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 QRICH1Q2TAL8 776 aa9.81□□□□□ -0.84
NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 TREML2Q5T2D2 321 aa9.81□□□□□ -0.84
NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 SPRYD7Q5W111 196 aa9.81□□□□□ -0.84
NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 KRT40Q6A162 431 aa9.81□□□□□ -0.84
NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 CATSPERGQ6ZRH7 1159 aa9.81□□□□□ -0.84
NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 PAXIP1Q6ZW49 1069 aaPredicted RBP9.81□□□□□ -0.84
NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 SAPCD2Q86UD0 394 aa9.81□□□□□ -0.84
NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 FBXO11Q86XK2 927 aa9.81□□□□□ -0.84
NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 FBXO18Q8NFZ0 1043 aa9.81□□□□□ -0.84
NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 HOXC10Q9NYD6 342 aa9.81□□□□□ -0.84
NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 KCNJ14Q9UNX9 436 aa9.81□□□□□ -0.84
NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 MTMR6Q9Y217 621 aa9.81□□□□□ -0.84
NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 TLL2Q9Y6L7 1015 aa9.81□□□□□ -0.84
NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 GREB1LQ9C091 1923 aaPredicted RBP9.8□□□□□ -0.84
NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 CCL15-CCL14A0A0B4J2E2 113 aa9.8□□□□□ -0.84
NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 STXBP3O00186 592 aa9.8□□□□□ -0.84
NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 BRD1O95696 1058 aa9.8□□□□□ -0.84
NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 ZBTB48P10074 688 aaPredicted RBP9.8□□□□□ -0.84
NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 OSBPP22059 807 aa9.8□□□□□ -0.84
NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 DSG3P32926 999 aa9.8□□□□□ -0.84
NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 IRX3P78415 501 aaPredicted RBP9.8□□□□□ -0.84
NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 TRAF1Q13077 416 aa9.8□□□□□ -0.84
NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 GRM1Q13255 1194 aa9.8□□□□□ -0.84
NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 CCL15Q16663 113 aa9.8□□□□□ -0.84
NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 WWC2Q6AWC2 1192 aa9.8□□□□□ -0.84
NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 FERMT3Q86UX7 667 aa9.8□□□□□ -0.84
NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 CCDC148Q8NFR7 591 aa9.8□□□□□ -0.84
NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 CCDC12Q8WUD4 166 aaPredicted RBP9.8□□□□□ -0.84
NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 COA7Q96BR5 231 aa9.8□□□□□ -0.84
NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 MTMR8Q96EF0 704 aa9.8□□□□□ -0.84
NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 P2RX7Q99572 595 aaKnown RBP9.8□□□□□ -0.84
NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 AMNQ9BXJ7 453 aa9.8□□□□□ -0.84
NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 BRMS1Q9HCU9 246 aa9.8□□□□□ -0.84
NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 SH3GLB2Q9NR46 395 aa9.8□□□□□ -0.84
NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 BARHL2Q9NY43 387 aa9.8□□□□□ -0.84
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