RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000511955.5

TRAPPC11-208, Transcript of trafficking protein particle complex 11, humanhuman

TSL 2

Gene TRAPPC11, Length 2,342 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAPPC11-208ENST00000511955 RILPL1Q5EBL4 403 aa5.76□□□□□ -1.49
TRAPPC11-208ENST00000511955 SLC10A5Q5PT55 438 aa5.76□□□□□ -1.49
TRAPPC11-208ENST00000511955 HIBCHQ6NVY1 386 aaPredicted RBP5.76□□□□□ -1.49
TRAPPC11-208ENST00000511955 ZC3H8Q8N5P1 291 aaKnown RBP eCLIP5.76□□□□□ -1.49
TRAPPC11-208ENST00000511955 MIGA1Q8NAN2 632 aa5.76□□□□□ -1.49
TRAPPC11-208ENST00000511955 NEK9Q8TD19 979 aa5.76□□□□□ -1.49
TRAPPC11-208ENST00000511955 TRPM4Q8TD43 1214 aa5.76□□□□□ -1.49
TRAPPC11-208ENST00000511955 BHMTQ93088 406 aa5.76□□□□□ -1.49
TRAPPC11-208ENST00000511955 CDH19Q9H159 772 aa5.76□□□□□ -1.49
TRAPPC11-208ENST00000511955 DBNDD1Q9H9R9 158 aa5.76□□□□□ -1.49
TRAPPC11-208ENST00000511955 CXXC1Q9P0U4 656 aaPredicted RBP5.76□□□□□ -1.49
TRAPPC11-208ENST00000511955 GGT7Q9UJ14 662 aa5.76□□□□□ -1.49
TRAPPC11-208ENST00000511955 FBXL5Q9UKA1 691 aa5.76□□□□□ -1.49
TRAPPC11-208ENST00000511955 TRIM35Q9UPQ4 493 aa5.76□□□□□ -1.49
TRAPPC11-208ENST00000511955 DGKBQ9Y6T7 804 aa5.76□□□□□ -1.49
TRAPPC11-208ENST00000511955 HTR3AP46098 478 aa5.75□□□□□ -1.49
TRAPPC11-208ENST00000511955 RBM5P52756 815 aaKnown RBP eCLIP5.75□□□□□ -1.49
TRAPPC11-208ENST00000511955 EHHADHQ08426 723 aa5.75□□□□□ -1.49
TRAPPC11-208ENST00000511955 APOBRQ0VD83 1088 aa5.75□□□□□ -1.49
TRAPPC11-208ENST00000511955 COX10Q12887 443 aa5.75□□□□□ -1.49
TRAPPC11-208ENST00000511955 TCIRG1Q13488 830 aa5.75□□□□□ -1.49
TRAPPC11-208ENST00000511955 ITPK1Q13572 414 aa5.75□□□□□ -1.49
TRAPPC11-208ENST00000511955 NCOA4Q13772 614 aa5.75□□□□□ -1.49
TRAPPC11-208ENST00000511955 SMC1AQ14683 1233 aaKnown RBP5.75□□□□□ -1.49
TRAPPC11-208ENST00000511955 OCLNQ16625 522 aa5.75□□□□□ -1.49
TRAPPC11-208ENST00000511955 KRT24Q2M2I5 525 aa5.75□□□□□ -1.49
TRAPPC11-208ENST00000511955 LLGL2Q6P1M3 1020 aa5.75□□□□□ -1.49
TRAPPC11-208ENST00000511955 ZNF790Q6PG37 636 aa5.75□□□□□ -1.49
TRAPPC11-208ENST00000511955 C1orf122Q6ZSJ8 110 aa5.75□□□□□ -1.49
TRAPPC11-208ENST00000511955 TEKT1Q969V4 418 aa5.75□□□□□ -1.49
TRAPPC11-208ENST00000511955 ZMAT2Q96NC0 199 aaKnown RBP5.75□□□□□ -1.49
TRAPPC11-208ENST00000511955 SLC4A9Q96Q91 983 aa5.75□□□□□ -1.49
TRAPPC11-208ENST00000511955 LZTS2Q9BRK4 669 aa5.75□□□□□ -1.49
TRAPPC11-208ENST00000511955 RBSNQ9H1K0 784 aa5.75□□□□□ -1.49
TRAPPC11-208ENST00000511955 PLEKHA5Q9HAU0 1116 aa5.75□□□□□ -1.49
TRAPPC11-208ENST00000511955 AASDHPPTQ9NRN7 309 aa5.75□□□□□ -1.49
TRAPPC11-208ENST00000511955 TFCP2L1Q9NZI6 479 aa5.75□□□□□ -1.49
TRAPPC11-208ENST00000511955 TSPYL4Q9UJ04 414 aa5.75□□□□□ -1.49
TRAPPC11-208ENST00000511955 NOD1Q9Y239 953 aa5.75□□□□□ -1.49
TRAPPC11-208ENST00000511955 ERBB4Q15303 1308 aa5.75□□□□□ -1.49
TRAPPC11-208ENST00000511955 ITGB4P16144 1822 aa5.75□□□□□ -1.49
TRAPPC11-208ENST00000511955 IQCA1LA6NCM1 817 aa5.75□□□□□ -1.49
TRAPPC11-208ENST00000511955 KLF4O43474 513 aa5.75□□□□□ -1.49
TRAPPC11-208ENST00000511955 KIAA0754O94854 1291 aa5.75□□□□□ -1.49
TRAPPC11-208ENST00000511955 CTNNA1P35221 906 aaKnown RBP5.75□□□□□ -1.49
TRAPPC11-208ENST00000511955 PRPHP41219 470 aa5.75□□□□□ -1.49
TRAPPC11-208ENST00000511955 HNRNPUQ00839 825 aaKnown RBP eCLIP5.75□□□□□ -1.49
TRAPPC11-208ENST00000511955 MRPL28Q13084 256 aaKnown RBP5.75□□□□□ -1.49
TRAPPC11-208ENST00000511955 TAF7Q15545 349 aaPredicted RBP5.75□□□□□ -1.49
TRAPPC11-208ENST00000511955 PKN2Q16513 984 aaKnown RBP5.75□□□□□ -1.49
TRAPPC11-208ENST00000511955 ZNF827Q17R98 1081 aa5.75□□□□□ -1.49
TRAPPC11-208ENST00000511955 GFOD2Q3B7J2 385 aa5.75□□□□□ -1.49
TRAPPC11-208ENST00000511955 LARP7Q4G0J3 582 aaKnown RBP eCLIP5.75□□□□□ -1.49
TRAPPC11-208ENST00000511955 ISM2Q6H9L7 571 aa5.75□□□□□ -1.49
TRAPPC11-208ENST00000511955 GALNT17Q6IS24 598 aa5.75□□□□□ -1.49
TRAPPC11-208ENST00000511955 MZT2BQ6NZ67 158 aa5.75□□□□□ -1.49
TRAPPC11-208ENST00000511955 HS2ST1Q7LGA3 356 aa5.75□□□□□ -1.49
TRAPPC11-208ENST00000511955 MTERF4Q7Z6M4 381 aaKnown RBP5.75□□□□□ -1.49
TRAPPC11-208ENST00000511955 DNAJC10Q8IXB1 793 aa5.75□□□□□ -1.49
TRAPPC11-208ENST00000511955 NKAIN3Q8N8D7 197 aa5.75□□□□□ -1.49
TRAPPC11-208ENST00000511955 FAM174AQ8TBP5 190 aa5.75□□□□□ -1.49
TRAPPC11-208ENST00000511955 ZBTB10Q96DT7 871 aa5.75□□□□□ -1.49
TRAPPC11-208ENST00000511955 UROC1Q96N76 676 aa5.75□□□□□ -1.49
TRAPPC11-208ENST00000511955 RBCK1Q9BYM8 510 aa5.75□□□□□ -1.49
TRAPPC11-208ENST00000511955 RPAP3Q9H6T3 665 aaPredicted RBP5.75□□□□□ -1.49
TRAPPC11-208ENST00000511955 KCTD5Q9NXV2 234 aa5.75□□□□□ -1.49
TRAPPC11-208ENST00000511955 KLHL33A6NCF5 533 aa5.74□□□□□ -1.49
TRAPPC11-208ENST00000511955 TIPRLO75663 272 aa5.74□□□□□ -1.49
TRAPPC11-208ENST00000511955 MSL3P1P0C860 447 aa5.74□□□□□ -1.49
TRAPPC11-208ENST00000511955 SETSIPP0DME0 302 aa5.74□□□□□ -1.49
TRAPPC11-208ENST00000511955 MTHFD1P11586 935 aaKnown RBP5.74□□□□□ -1.49
TRAPPC11-208ENST00000511955 TRIM27P14373 513 aa5.74□□□□□ -1.49
TRAPPC11-208ENST00000511955 MAPK9P45984 424 aa5.74□□□□□ -1.49
TRAPPC11-208ENST00000511955 PURAQ00577 322 aaKnown RBP5.74□□□□□ -1.49
TRAPPC11-208ENST00000511955 KCNH2Q12809 1159 aa5.74□□□□□ -1.49
TRAPPC11-208ENST00000511955 PLCB4Q15147 1175 aa5.74□□□□□ -1.49
TRAPPC11-208ENST00000511955 FAM102BQ5T8I3 360 aa5.74□□□□□ -1.49
TRAPPC11-208ENST00000511955 NBPF14Q5TI25 921 aa5.74□□□□□ -1.49
TRAPPC11-208ENST00000511955 CYP26C1Q6V0L0 522 aa5.74□□□□□ -1.49
TRAPPC11-208ENST00000511955 THNSL2Q86YJ6 484 aa5.74□□□□□ -1.49
TRAPPC11-208ENST00000511955 TCEAL8Q8IYN2 117 aa5.74□□□□□ -1.49
TRAPPC11-208ENST00000511955 MAGEB6Q8N7X4 407 aa5.74□□□□□ -1.49
TRAPPC11-208ENST00000511955 LINC00116Q8NCU8 138 aa5.74□□□□□ -1.49
TRAPPC11-208ENST00000511955 PJA1Q8NG27 643 aa5.74□□□□□ -1.49
TRAPPC11-208ENST00000511955 CHAC2Q8WUX2 184 aa5.74□□□□□ -1.49
TRAPPC11-208ENST00000511955 HOOK2Q96ED9 719 aa5.74□□□□□ -1.49
TRAPPC11-208ENST00000511955 CRELD1Q96HD1 420 aa5.74□□□□□ -1.49
TRAPPC11-208ENST00000511955 STRBPQ96SI9 672 aaKnown RBP5.74□□□□□ -1.49
TRAPPC11-208ENST00000511955 ELAC2Q9BQ52 826 aaKnown RBP5.74□□□□□ -1.49
TRAPPC11-208ENST00000511955 PRKD2Q9BZL6 878 aa5.74□□□□□ -1.49
TRAPPC11-208ENST00000511955 MCM8Q9UJA3 840 aa5.74□□□□□ -1.49
TRAPPC11-208ENST00000511955 ZNF232Q9UNY5 417 aa5.74□□□□□ -1.49
TRAPPC11-208ENST00000511955 TMX2Q9Y320 296 aa5.74□□□□□ -1.49
TRAPPC11-208ENST00000511955 N6AMT1Q9Y5N5 214 aa5.74□□□□□ -1.49
TRAPPC11-208ENST00000511955 CEMIPQ8WUJ3 1361 aa5.74□□□□□ -1.49
TRAPPC11-208ENST00000511955 KLRG2A4D1S0 409 aaPredicted RBP5.74□□□□□ -1.49
TRAPPC11-208ENST00000511955 FAM25EA8MYX2 175 aa5.74□□□□□ -1.49
TRAPPC11-208ENST00000511955 BBOX1O75936 387 aa5.74□□□□□ -1.49
TRAPPC11-208ENST00000511955 GFPT2O94808 682 aa5.74□□□□□ -1.49
TRAPPC11-208ENST00000511955 ZBTB7AO95365 584 aa5.74□□□□□ -1.49
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