RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000492741.5

PSPC1-204, Transcript of paraspeckle component 1, humanhuman

TSL 2

Gene PSPC1, Length 1,709 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PSPC1-204ENST00000492741 PIGSQ96S52 555 aa25.49■■□□□ 1.67
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PSPC1-204ENST00000492741 FEM1BQ9UK73 627 aa25.49■■□□□ 1.67
PSPC1-204ENST00000492741 TOMM70O94826 608 aa25.48■■□□□ 1.67
PSPC1-204ENST00000492741 SCG2P13521 617 aa25.48■■□□□ 1.67
PSPC1-204ENST00000492741 GUCY1B3Q02153 619 aa25.48■■□□□ 1.67
PSPC1-204ENST00000492741 PPIL2Q13356 520 aa25.48■■□□□ 1.67
PSPC1-204ENST00000492741 PKN1Q16512 942 aa25.48■■□□□ 1.67
PSPC1-204ENST00000492741 SYDE2Q5VT97 1194 aa25.48■■□□□ 1.67
PSPC1-204ENST00000492741 JMJD4Q9H9V9 463 aa25.48■■□□□ 1.67
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PSPC1-204ENST00000492741 ZNF784Q8NCA9 323 aaPredicted RBP25.46■■□□□ 1.67
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PSPC1-204ENST00000492741 MCTP1Q6DN14 999 aa25.44■■□□□ 1.66
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PSPC1-204ENST00000492741 VPS54Q9P1Q0 977 aa25.44■■□□□ 1.66
PSPC1-204ENST00000492741 MTMR6Q9Y217 621 aa25.44■■□□□ 1.66
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PSPC1-204ENST00000492741 ZBTB5O15062 677 aa25.43■■□□□ 1.66
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PSPC1-204ENST00000492741 ZSCAN22P10073 491 aaPredicted RBP25.43■■□□□ 1.66
PSPC1-204ENST00000492741 KRT40Q6A162 431 aa25.43■■□□□ 1.66
PSPC1-204ENST00000492741 GPKOWQ92917 476 aaPredicted RBP eCLIP25.43■■□□□ 1.66
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PSPC1-204ENST00000492741 WNK4Q96J92 1243 aa25.42■■□□□ 1.66
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PSPC1-204ENST00000492741 USP17L13C9JLJ4 530 aa25.4■■□□□ 1.66
PSPC1-204ENST00000492741 USP17L11C9JVI0 530 aa25.4■■□□□ 1.66
PSPC1-204ENST00000492741 USP17L18D6R9N7 530 aa25.4■■□□□ 1.66
PSPC1-204ENST00000492741 USP17L22D6RA61 530 aa25.4■■□□□ 1.66
PSPC1-204ENST00000492741 USP17L17D6RBQ6 530 aa25.4■■□□□ 1.66
PSPC1-204ENST00000492741 USP17L19D6RCP7 530 aa25.4■■□□□ 1.66
PSPC1-204ENST00000492741 USP17L20D6RJB6 530 aa25.4■■□□□ 1.66
PSPC1-204ENST00000492741 NLRP5P59047 1200 aa25.4■■□□□ 1.66
PSPC1-204ENST00000492741 USP17L24Q0WX57 530 aa25.4■■□□□ 1.66
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PSPC1-204ENST00000492741 CATSPERGQ6ZRH7 1159 aa25.39■■□□□ 1.65
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PSPC1-204ENST00000492741 RGS22Q8NE09 1264 aa25.39■■□□□ 1.65
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PSPC1-204ENST00000492741 COA7Q96BR5 231 aa25.39■■□□□ 1.65
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PSPC1-204ENST00000492741 hCG_1984214I3L0E3 225 aa25.38■■□□□ 1.65
PSPC1-204ENST00000492741 STXBP3O00186 592 aa25.38■■□□□ 1.65
PSPC1-204ENST00000492741 MMP1P03956 469 aa25.38■■□□□ 1.65
PSPC1-204ENST00000492741 COG2Q14746 738 aa25.38■■□□□ 1.65
PSPC1-204ENST00000492741 TREML2Q5T2D2 321 aa25.38■■□□□ 1.65
PSPC1-204ENST00000492741 CCDC174Q6PII3 467 aa25.38■■□□□ 1.65
PSPC1-204ENST00000492741 ZNF713Q8N859 430 aaPredicted RBP25.38■■□□□ 1.65
PSPC1-204ENST00000492741 BRMS1Q9HCU9 246 aa25.38■■□□□ 1.65
PSPC1-204ENST00000492741 TMEM88BA6NKF7 163 aa25.37■■□□□ 1.65
PSPC1-204ENST00000492741 GTF2A2P52657 109 aa25.37■■□□□ 1.65
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