RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000489527.1

GTPBP1-213, Transcript of GTP binding protein 1, human

TSL 3

Gene GTPBP1, Length 418 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus, Ribosome .

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RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
GTPBP1-213	ENST00000489527	SRRD	Q9UH36	339 aa		4.88	□□□□□ -1.63
GTPBP1-213	ENST00000489527	FEM1B	Q9UK73	627 aa		4.88	□□□□□ -1.63
GTPBP1-213	ENST00000489527	STX8	Q9UNK0	236 aa		4.88	□□□□□ -1.63
GTPBP1-213	ENST00000489527	ROBO3	Q96MS0	1386 aa		4.88	□□□□□ -1.63
GTPBP1-213	ENST00000489527	CDH23	Q9H251	3354 aa		4.87	□□□□□ -1.63
GTPBP1-213	ENST00000489527	BAHCC1	Q9P281	2608 aa		4.87	□□□□□ -1.63
GTPBP1-213	ENST00000489527	MSC	O60682	206 aa		4.87	□□□□□ -1.63
GTPBP1-213	ENST00000489527	FARP2	O94887	1054 aa	Predicted RBP	4.87	□□□□□ -1.63
GTPBP1-213	ENST00000489527	FGR	P09769	529 aa		4.87	□□□□□ -1.63
GTPBP1-213	ENST00000489527	CYP2D6	P10635	497 aa		4.87	□□□□□ -1.63
GTPBP1-213	ENST00000489527	TOP1	P11387	765 aa	Known RBP	4.87	□□□□□ -1.63
GTPBP1-213	ENST00000489527	FCER1A	P12319	257 aa		4.87	□□□□□ -1.63
GTPBP1-213	ENST00000489527	BMP3	P12645	472 aa		4.87	□□□□□ -1.63
GTPBP1-213	ENST00000489527	XRCC5	P13010	732 aa	Known RBP	4.87	□□□□□ -1.63
GTPBP1-213	ENST00000489527	ZKSCAN1	P17029	563 aa	Predicted RBP	4.87	□□□□□ -1.63
GTPBP1-213	ENST00000489527	RASA1	P20936	1047 aa		4.87	□□□□□ -1.63
GTPBP1-213	ENST00000489527	CTGF	P29279	349 aa		4.87	□□□□□ -1.63
GTPBP1-213	ENST00000489527	DSG3	P32926	999 aa		4.87	□□□□□ -1.63
GTPBP1-213	ENST00000489527	STAT2	P52630	851 aa		4.87	□□□□□ -1.63
GTPBP1-213	ENST00000489527	OAZ1	P54368	228 aa		4.87	□□□□□ -1.63
GTPBP1-213	ENST00000489527	ERVK-9	P63128	1117 aa		4.87	□□□□□ -1.63
GTPBP1-213	ENST00000489527	ERVK-24	P63145	666 aa		4.87	□□□□□ -1.63
GTPBP1-213	ENST00000489527	MOGS	Q13724	837 aa		4.87	□□□□□ -1.63
GTPBP1-213	ENST00000489527	PLS1	Q14651	629 aa		4.87	□□□□□ -1.63
GTPBP1-213	ENST00000489527	KCTD2	Q14681	263 aa		4.87	□□□□□ -1.63
GTPBP1-213	ENST00000489527	SKOR2	Q2VWA4	1001 aa	Predicted RBP	4.87	□□□□□ -1.63
GTPBP1-213	ENST00000489527	BMP2KL	Q5H9B9	411 aa		4.87	□□□□□ -1.63
GTPBP1-213	ENST00000489527	TREML2	Q5T2D2	321 aa		4.87	□□□□□ -1.63
GTPBP1-213	ENST00000489527	MFSD14C	Q5VZR4	134 aa		4.87	□□□□□ -1.63
GTPBP1-213	ENST00000489527	PLEKHH3	Q7Z736	793 aa		4.87	□□□□□ -1.63
GTPBP1-213	ENST00000489527	DGKH	Q86XP1	1220 aa		4.87	□□□□□ -1.63
GTPBP1-213	ENST00000489527	C7orf61	Q8IZ16	206 aa		4.87	□□□□□ -1.63
GTPBP1-213	ENST00000489527	STK11IP	Q8N1F8	1099 aa		4.87	□□□□□ -1.63
GTPBP1-213	ENST00000489527	SHCBP1	Q8NEM2	672 aa		4.87	□□□□□ -1.63
GTPBP1-213	ENST00000489527	NCOA7	Q8NI08	942 aa		4.87	□□□□□ -1.63
GTPBP1-213	ENST00000489527	ADAMTS19	Q8TE59	1207 aa		4.87	□□□□□ -1.63
GTPBP1-213	ENST00000489527	DCAF4	Q8WV16	495 aa		4.87	□□□□□ -1.63
GTPBP1-213	ENST00000489527	STAG1	Q8WVM7	1258 aa		4.87	□□□□□ -1.63
GTPBP1-213	ENST00000489527	UBE2Q2	Q8WVN8	375 aa		4.87	□□□□□ -1.63
GTPBP1-213	ENST00000489527	SNX21	Q969T3	373 aa		4.87	□□□□□ -1.63
GTPBP1-213	ENST00000489527	FAM227B	Q96M60	508 aa		4.87	□□□□□ -1.63
GTPBP1-213	ENST00000489527	GBP4	Q96PP9	640 aa		4.87	□□□□□ -1.63
GTPBP1-213	ENST00000489527	SEC62	Q99442	399 aa	Known RBP	4.87	□□□□□ -1.63
GTPBP1-213	ENST00000489527	SLF1	Q9BQI6	1058 aa		4.87	□□□□□ -1.63
GTPBP1-213	ENST00000489527	MAF1	Q9H063	256 aa		4.87	□□□□□ -1.63
GTPBP1-213	ENST00000489527	TTYH1	Q9H313	450 aa	Predicted RBP	4.87	□□□□□ -1.63
GTPBP1-213	ENST00000489527	SEMA6B	Q9H3T3	888 aa		4.87	□□□□□ -1.63
GTPBP1-213	ENST00000489527	KAT14	Q9H8E8	782 aa		4.87	□□□□□ -1.63
GTPBP1-213	ENST00000489527	C11orf16	Q9NQ32	467 aa		4.87	□□□□□ -1.63
GTPBP1-213	ENST00000489527	MORF4L1	Q9UBU8	362 aa		4.87	□□□□□ -1.63
GTPBP1-213	ENST00000489527	FBXO40	Q9UH90	709 aa		4.87	□□□□□ -1.63
GTPBP1-213	ENST00000489527	ZNFX1	Q9P2E3	1918 aa	Known RBP	4.87	□□□□□ -1.63
GTPBP1-213	ENST00000489527	LOC285556	D6RIA3	1793 aa		4.86	□□□□□ -1.63
GTPBP1-213	ENST00000489527	SIPA1L1	O43166	1804 aa		4.86	□□□□□ -1.63
GTPBP1-213	ENST00000489527	CYP2D7	A0A087X1C5	515 aa		4.86	□□□□□ -1.63
GTPBP1-213	ENST00000489527		A0A0D9SFI3	127 aa		4.86	□□□□□ -1.63
GTPBP1-213	ENST00000489527	GOLGA6L3	A6NEY3	463 aa		4.86	□□□□□ -1.63
GTPBP1-213	ENST00000489527	SLC15A5	A6NIM6	579 aa		4.86	□□□□□ -1.63
GTPBP1-213	ENST00000489527	ADCY3	O60266	1144 aa		4.86	□□□□□ -1.63
GTPBP1-213	ENST00000489527	PLA2G6	O60733	806 aa		4.86	□□□□□ -1.63
GTPBP1-213	ENST00000489527	PRDM1	O75626	825 aa		4.86	□□□□□ -1.63
GTPBP1-213	ENST00000489527	REC8	O95072	547 aa		4.86	□□□□□ -1.63
GTPBP1-213	ENST00000489527	HMGCR	P04035	888 aa		4.86	□□□□□ -1.63
GTPBP1-213	ENST00000489527	GJB1	P08034	283 aa		4.86	□□□□□ -1.63
GTPBP1-213	ENST00000489527	HMGB1	P09429	215 aa	Known RBP	4.86	□□□□□ -1.63
GTPBP1-213	ENST00000489527	CCL5	P13501	91 aa		4.86	□□□□□ -1.63
GTPBP1-213	ENST00000489527	MCC	P23508	829 aa		4.86	□□□□□ -1.63
GTPBP1-213	ENST00000489527	CHML	P26374	656 aa		4.86	□□□□□ -1.63
GTPBP1-213	ENST00000489527	STAT3	P40763	770 aa		4.86	□□□□□ -1.63
GTPBP1-213	ENST00000489527	FLT3LG	P49771	235 aa		4.86	□□□□□ -1.63
GTPBP1-213	ENST00000489527	CTDSPL2	Q05D32	466 aa		4.86	□□□□□ -1.63
GTPBP1-213	ENST00000489527	KRT32	Q14532	448 aa		4.86	□□□□□ -1.63
GTPBP1-213	ENST00000489527	RRP1B	Q14684	758 aa	Known RBP	4.86	□□□□□ -1.63
GTPBP1-213	ENST00000489527	TKFC	Q3LXA3	575 aa		4.86	□□□□□ -1.63
GTPBP1-213	ENST00000489527	SLFNL1	Q499Z3	407 aa		4.86	□□□□□ -1.63
GTPBP1-213	ENST00000489527	GPATCH4	Q5T3I0	446 aa	Known RBP	4.86	□□□□□ -1.63
GTPBP1-213	ENST00000489527	SLFN13	Q68D06	897 aa		4.86	□□□□□ -1.63
GTPBP1-213	ENST00000489527	SYNE3	Q6ZMZ3	975 aa		4.86	□□□□□ -1.63
GTPBP1-213	ENST00000489527	CCDC129	Q6ZRS4	1044 aa		4.86	□□□□□ -1.63
GTPBP1-213	ENST00000489527	GPR142	Q7Z601	462 aa		4.86	□□□□□ -1.63
GTPBP1-213	ENST00000489527	CCDC84	Q86UT8	332 aa	Predicted RBP	4.86	□□□□□ -1.63
GTPBP1-213	ENST00000489527	NCAPG2	Q86XI2	1143 aa		4.86	□□□□□ -1.63
GTPBP1-213	ENST00000489527	ABRA	Q8N0Z2	381 aa		4.86	□□□□□ -1.63
GTPBP1-213	ENST00000489527	SPICE1	Q8N0Z3	855 aa		4.86	□□□□□ -1.63
GTPBP1-213	ENST00000489527	SLC44A5	Q8NCS7	719 aa		4.86	□□□□□ -1.63
GTPBP1-213	ENST00000489527	CHST13	Q8NET6	341 aa		4.86	□□□□□ -1.63
GTPBP1-213	ENST00000489527	ACER1	Q8TDN7	264 aa		4.86	□□□□□ -1.63
GTPBP1-213	ENST00000489527	DIS3L	Q8TF46	1054 aa	Known RBP	4.86	□□□□□ -1.63
GTPBP1-213	ENST00000489527	KHSRP	Q92945	711 aa	Known RBP eCLIP	4.86	□□□□□ -1.63
GTPBP1-213	ENST00000489527	DDX11	Q96FC9	970 aa		4.86	□□□□□ -1.63
GTPBP1-213	ENST00000489527	CEP95	Q96GE4	821 aa		4.86	□□□□□ -1.63
GTPBP1-213	ENST00000489527	GMCL1	Q96IK5	515 aa		4.86	□□□□□ -1.63
GTPBP1-213	ENST00000489527	MTA3	Q9BTC8	594 aa		4.86	□□□□□ -1.63
GTPBP1-213	ENST00000489527	TEX13B	Q9BXU2	312 aa		4.86	□□□□□ -1.63
GTPBP1-213	ENST00000489527	SPATC1L	Q9H0A9	340 aa		4.86	□□□□□ -1.63
GTPBP1-213	ENST00000489527	EPB41L4A	Q9HCS5	686 aa	Predicted RBP	4.86	□□□□□ -1.63
GTPBP1-213	ENST00000489527	HMX1	Q9NP08	348 aa	Predicted RBP	4.86	□□□□□ -1.63
GTPBP1-213	ENST00000489527	PPP1R9A	Q9ULJ8	1098 aa		4.86	□□□□□ -1.63
GTPBP1-213	ENST00000489527	HCN4	Q9Y3Q4	1203 aa		4.86	□□□□□ -1.63
GTPBP1-213	ENST00000489527	CACNA1B	Q00975	2339 aa		4.86	□□□□□ -1.63

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