RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000480416.1

TNS1-215, Transcript of tensin 1, human

TSL 2

Gene TNS1, Length 335 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
TNS1-215	ENST00000480416	SMAD3	P84022	425 aa	Known RBP	4.26	□□□□□ -1.73
TNS1-215	ENST00000480416	CTBS	Q01459	385 aa		4.26	□□□□□ -1.73
TNS1-215	ENST00000480416	NHLH1	Q02575	133 aa		4.26	□□□□□ -1.73
TNS1-215	ENST00000480416	TNP2	Q05952	138 aa		4.26	□□□□□ -1.73
TNS1-215	ENST00000480416	NCOA4	Q13772	614 aa		4.26	□□□□□ -1.73
TNS1-215	ENST00000480416	TEAD4	Q15561	434 aa		4.26	□□□□□ -1.73
TNS1-215	ENST00000480416	MIGA2	Q7L4E1	593 aa		4.26	□□□□□ -1.73
TNS1-215	ENST00000480416	ANKRD23	Q86SG2	305 aa		4.26	□□□□□ -1.73
TNS1-215	ENST00000480416	RTF1	Q92541	710 aa	Known RBP	4.26	□□□□□ -1.73
TNS1-215	ENST00000480416	BAD	Q92934	168 aa		4.26	□□□□□ -1.73
TNS1-215	ENST00000480416	BTBD6	Q96KE9	485 aa		4.26	□□□□□ -1.73
TNS1-215	ENST00000480416	ISCA1	Q9BUE6	129 aa		4.26	□□□□□ -1.73
TNS1-215	ENST00000480416	PRDM12	Q9H4Q4	367 aa		4.26	□□□□□ -1.73
TNS1-215	ENST00000480416	CD320	Q9NPF0	282 aa		4.26	□□□□□ -1.73
TNS1-215	ENST00000480416	DNAAF2	Q9NVR5	837 aa	Known RBP	4.26	□□□□□ -1.73
TNS1-215	ENST00000480416	MARK1	Q9P0L2	795 aa		4.26	□□□□□ -1.73
TNS1-215	ENST00000480416	SCHIP1	Q9P0W5	487 aa	Predicted RBP	4.26	□□□□□ -1.73
TNS1-215	ENST00000480416	THEG	Q9P2T0	379 aa		4.26	□□□□□ -1.73
TNS1-215	ENST00000480416	ZNF70	Q9UC06	446 aa	Predicted RBP	4.26	□□□□□ -1.73
TNS1-215	ENST00000480416	MINPP1	Q9UNW1	487 aa		4.26	□□□□□ -1.73
TNS1-215	ENST00000480416	ZNF232	Q9UNY5	417 aa		4.26	□□□□□ -1.73
TNS1-215	ENST00000480416	PCDHGA11	Q9Y5H2	935 aa		4.26	□□□□□ -1.73
TNS1-215	ENST00000480416	PPP2R3B	Q9Y5P8	575 aa		4.26	□□□□□ -1.73
TNS1-215	ENST00000480416	TTC28	Q96AY4	2481 aa		4.26	□□□□□ -1.73
TNS1-215	ENST00000480416	XDH	P47989	1333 aa		4.25	□□□□□ -1.73
TNS1-215	ENST00000480416	MYO3B	Q8WXR4	1341 aa		4.25	□□□□□ -1.73
TNS1-215	ENST00000480416	COL1A1	P02452	1464 aa	Predicted RBP	4.25	□□□□□ -1.73
TNS1-215	ENST00000480416	SERTM1	A2A2V5	107 aa		4.25	□□□□□ -1.73
TNS1-215	ENST00000480416	GRXCR1	A8MXD5	290 aa		4.25	□□□□□ -1.73
TNS1-215	ENST00000480416	C2CD2L	O14523	706 aa		4.25	□□□□□ -1.73
TNS1-215	ENST00000480416	TNPO2	O14787	897 aa	Known RBP	4.25	□□□□□ -1.73
TNS1-215	ENST00000480416	PEX10	O60683	326 aa		4.25	□□□□□ -1.73
TNS1-215	ENST00000480416	U2AF1L5	P0DN76	240 aa	Predicted RBP	4.25	□□□□□ -1.73
TNS1-215	ENST00000480416	ITGB8	P26012	769 aa		4.25	□□□□□ -1.73
TNS1-215	ENST00000480416	INPP5B	P32019	993 aa		4.25	□□□□□ -1.73
TNS1-215	ENST00000480416	CCT4	P50991	539 aa	Known RBP	4.25	□□□□□ -1.73
TNS1-215	ENST00000480416	RBM5	P52756	815 aa	Known RBP eCLIP	4.25	□□□□□ -1.73
TNS1-215	ENST00000480416	CACNB3	P54284	484 aa		4.25	□□□□□ -1.73
TNS1-215	ENST00000480416	U2AF1	Q01081	240 aa	Known RBP eCLIP	4.25	□□□□□ -1.73
TNS1-215	ENST00000480416	SNAPC2	Q13487	334 aa		4.25	□□□□□ -1.73
TNS1-215	ENST00000480416	HIF1A	Q16665	826 aa		4.25	□□□□□ -1.73
TNS1-215	ENST00000480416	CC2D1B	Q5T0F9	858 aa	Known RBP	4.25	□□□□□ -1.73
TNS1-215	ENST00000480416	ERO1B	Q86YB8	467 aa		4.25	□□□□□ -1.73
TNS1-215	ENST00000480416	PLEKHM2	Q8IWE5	1019 aa		4.25	□□□□□ -1.73
TNS1-215	ENST00000480416	FBXL18	Q96ME1	805 aa		4.25	□□□□□ -1.73
TNS1-215	ENST00000480416	LBHD1	Q9BQE6	289 aa	Predicted RBP	4.25	□□□□□ -1.73
TNS1-215	ENST00000480416	SENP6	Q9GZR1	1112 aa	Predicted RBP	4.25	□□□□□ -1.73
TNS1-215	ENST00000480416	COA1	Q9GZY4	146 aa		4.25	□□□□□ -1.73
TNS1-215	ENST00000480416	ZNF576	Q9H609	170 aa		4.25	□□□□□ -1.73
TNS1-215	ENST00000480416	CD209	Q9NNX6	404 aa		4.25	□□□□□ -1.73
TNS1-215	ENST00000480416	ZCCHC17	Q9NP64	241 aa	Known RBP	4.25	□□□□□ -1.73
TNS1-215	ENST00000480416	ZNF358	Q9NW07	568 aa		4.25	□□□□□ -1.73
TNS1-215	ENST00000480416	GJD2	Q9UKL4	321 aa		4.25	□□□□□ -1.73
TNS1-215	ENST00000480416	IQSEC3	Q9UPP2	1182 aa	Predicted RBP	4.25	□□□□□ -1.73
TNS1-215	ENST00000480416	CSAD	Q9Y600	493 aa		4.25	□□□□□ -1.73
TNS1-215	ENST00000480416	ECM29	Q5VYK3	1845 aa		4.25	□□□□□ -1.73
TNS1-215	ENST00000480416	LTBP2	Q14767	1821 aa		4.24	□□□□□ -1.73
TNS1-215	ENST00000480416	LOC100996750	A0A140TA64	210 aa		4.24	□□□□□ -1.73
TNS1-215	ENST00000480416	TRIM43B	A6NCK2	446 aa		4.24	□□□□□ -1.73
TNS1-215	ENST00000480416	PIK3CD	O00329	1044 aa		4.24	□□□□□ -1.73
TNS1-215	ENST00000480416	WDHD1	O75717	1129 aa	Predicted RBP	4.24	□□□□□ -1.73
TNS1-215	ENST00000480416	CD33	P20138	364 aa		4.24	□□□□□ -1.73
TNS1-215	ENST00000480416	CYP2B6	P20813	491 aa		4.24	□□□□□ -1.73
TNS1-215	ENST00000480416	IGFBP4	P22692	258 aa		4.24	□□□□□ -1.73
TNS1-215	ENST00000480416	CCND3	P30281	292 aa	Predicted RBP	4.24	□□□□□ -1.73
TNS1-215	ENST00000480416	NOS2	P35228	1153 aa		4.24	□□□□□ -1.73
TNS1-215	ENST00000480416	PSMA6	P60900	246 aa	Known RBP	4.24	□□□□□ -1.73
TNS1-215	ENST00000480416	PPIL2	Q13356	520 aa		4.24	□□□□□ -1.73
TNS1-215	ENST00000480416	GRIK5	Q16478	980 aa		4.24	□□□□□ -1.73
TNS1-215	ENST00000480416	KRT24	Q2M2I5	525 aa		4.24	□□□□□ -1.73
TNS1-215	ENST00000480416	HSP90AB3P	Q58FF7	597 aa		4.24	□□□□□ -1.73
TNS1-215	ENST00000480416	ZNF468	Q5VIY5	522 aa	Predicted RBP	4.24	□□□□□ -1.73
TNS1-215	ENST00000480416	C1orf53	Q5VUE5	145 aa		4.24	□□□□□ -1.73
TNS1-215	ENST00000480416	CHSY3	Q70JA7	882 aa		4.24	□□□□□ -1.73
TNS1-215	ENST00000480416	ANKRD18A	Q8IVF6	992 aa		4.24	□□□□□ -1.73
TNS1-215	ENST00000480416	ANKRD13C	Q8N6S4	541 aa		4.24	□□□□□ -1.73
TNS1-215	ENST00000480416	TRIB2	Q92519	343 aa		4.24	□□□□□ -1.73
TNS1-215	ENST00000480416	TRIM43	Q96BQ3	446 aa	Predicted RBP	4.24	□□□□□ -1.73
TNS1-215	ENST00000480416	WRNIP1	Q96S55	665 aa		4.24	□□□□□ -1.73
TNS1-215	ENST00000480416	KRTAP4-6	Q9BYQ5	205 aa		4.24	□□□□□ -1.73
TNS1-215	ENST00000480416	MED23	Q9ULK4	1368 aa		4.24	□□□□□ -1.73
TNS1-215	ENST00000480416	PLXNB2	O15031	1838 aa		4.23	□□□□□ -1.73
TNS1-215	ENST00000480416	DCHS1	Q96JQ0	3298 aa		4.23	□□□□□ -1.73
TNS1-215	ENST00000480416	PALM3	A6NDB9	673 aa	Predicted RBP	4.23	□□□□□ -1.73
TNS1-215	ENST00000480416		K7ELQ4	463 aa	Predicted RBP	4.23	□□□□□ -1.73
TNS1-215	ENST00000480416		M0R2N6	131 aa		4.23	□□□□□ -1.73
TNS1-215	ENST00000480416	MYO1B	O43795	1136 aa		4.23	□□□□□ -1.73
TNS1-215	ENST00000480416	CAPN2	P17655	700 aa		4.23	□□□□□ -1.73
TNS1-215	ENST00000480416	RTP1	P59025	263 aa		4.23	□□□□□ -1.73
TNS1-215	ENST00000480416	PPAT	Q06203	517 aa		4.23	□□□□□ -1.73
TNS1-215	ENST00000480416	CACNB2	Q08289	660 aa	Predicted RBP	4.23	□□□□□ -1.73
TNS1-215	ENST00000480416	PRRT3	Q5FWE3	981 aa		4.23	□□□□□ -1.73
TNS1-215	ENST00000480416	USP17L2	Q6R6M4	530 aa		4.23	□□□□□ -1.73
TNS1-215	ENST00000480416	LINC00114	Q6XXX2	140 aa		4.23	□□□□□ -1.73
TNS1-215	ENST00000480416	C1orf229	Q6ZS94	237 aa	Predicted RBP	4.23	□□□□□ -1.73
TNS1-215	ENST00000480416	SLC9A9	Q8IVB4	645 aa		4.23	□□□□□ -1.73
TNS1-215	ENST00000480416	SERBP1	Q8NC51	408 aa	Known RBP eCLIP	4.23	□□□□□ -1.73
TNS1-215	ENST00000480416	TPCN2	Q8NHX9	752 aa		4.23	□□□□□ -1.73
TNS1-215	ENST00000480416	RHPN1	Q8TCX5	695 aa		4.23	□□□□□ -1.73
TNS1-215	ENST00000480416	PRDM5	Q9NQX1	630 aa	Predicted RBP	4.23	□□□□□ -1.73

Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 59.1 ms