RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000455580.5

PPP1CB-208, Transcript of protein phosphatase 1 catalytic subunit beta, human

TSL 3

Gene PPP1CB, Length 721 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
PPP1CB-208	ENST00000455580	CNGA1	P29973	690 aa		28.45	■■■□□ 2.14
PPP1CB-208	ENST00000455580	TEX13B	Q9BXU2	312 aa		28.45	■■■□□ 2.14
PPP1CB-208	ENST00000455580	ZMYM6	O95789	1325 aa		28.44	■■■□□ 2.14
PPP1CB-208	ENST00000455580	MSC	O60682	206 aa		28.44	■■■□□ 2.14
PPP1CB-208	ENST00000455580	NOV	P48745	357 aa		28.44	■■■□□ 2.14
PPP1CB-208	ENST00000455580	KCTD2	Q14681	263 aa		28.44	■■■□□ 2.14
PPP1CB-208	ENST00000455580	KIFC2	Q96AC6	838 aa		28.44	■■■□□ 2.14
PPP1CB-208	ENST00000455580	SLC38A10	Q9HBR0	1119 aa		28.44	■■■□□ 2.14
PPP1CB-208	ENST00000455580	STX8	Q9UNK0	236 aa		28.44	■■■□□ 2.14
PPP1CB-208	ENST00000455580	RIPK3	Q9Y572	518 aa		28.44	■■■□□ 2.14
PPP1CB-208	ENST00000455580	NMT2	O60551	498 aa		28.43	■■■□□ 2.14
PPP1CB-208	ENST00000455580	PGK2	P07205	417 aa		28.43	■■■□□ 2.14
PPP1CB-208	ENST00000455580	COL6A1	P12109	1028 aa		28.43	■■■□□ 2.14
PPP1CB-208	ENST00000455580	MFAP1	P55081	439 aa	Known RBP	28.43	■■■□□ 2.14
PPP1CB-208	ENST00000455580	SNRNP48	Q6IEG0	339 aa	Known RBP	28.43	■■■□□ 2.14
PPP1CB-208	ENST00000455580	GMCL1	Q96IK5	515 aa		28.43	■■■□□ 2.14
PPP1CB-208	ENST00000455580	DIS3	Q9Y2L1	958 aa	Known RBP	28.43	■■■□□ 2.14
PPP1CB-208	ENST00000455580	ZNF792	Q3KQV3	632 aa		28.42	■■■□□ 2.14
PPP1CB-208	ENST00000455580	CPXCR1	Q8N123	301 aa		28.42	■■■□□ 2.14
PPP1CB-208	ENST00000455580	CTDP1	Q9Y5B0	961 aa	Predicted RBP	28.42	■■■□□ 2.14
PPP1CB-208	ENST00000455580	PFAS	O15067	1338 aa		28.42	■■■□□ 2.14
PPP1CB-208	ENST00000455580	TMEM232	C9JQI7	657 aa		28.41	■■■□□ 2.14
PPP1CB-208	ENST00000455580	MCC	P23508	829 aa		28.41	■■■□□ 2.14
PPP1CB-208	ENST00000455580	RAVER2	Q9HCJ3	691 aa	Known RBP	28.41	■■■□□ 2.14
PPP1CB-208	ENST00000455580	ZNFX1	Q9P2E3	1918 aa	Known RBP	28.41	■■■□□ 2.14
PPP1CB-208	ENST00000455580	FDX1	P10109	184 aa		28.4	■■■□□ 2.14
PPP1CB-208	ENST00000455580	SLC1A4	P43007	532 aa		28.4	■■■□□ 2.14
PPP1CB-208	ENST00000455580	IRX6	P78412	446 aa	Predicted RBP	28.4	■■■□□ 2.14
PPP1CB-208	ENST00000455580	PRAMEF19	Q5SWL8	479 aa		28.4	■■■□□ 2.14
PPP1CB-208	ENST00000455580	CHRDL2	Q6WN34	429 aa		28.4	■■■□□ 2.14
PPP1CB-208	ENST00000455580	CHURC1	Q8WUH1	139 aa		28.4	■■■□□ 2.14
PPP1CB-208	ENST00000455580	STAG1	Q8WVM7	1258 aa		28.4	■■■□□ 2.14
PPP1CB-208	ENST00000455580	TOMM22	Q9NS69	142 aa		28.4	■■■□□ 2.14
PPP1CB-208	ENST00000455580	CEP290	O15078	2479 aa		28.4	■■■□□ 2.14
PPP1CB-208	ENST00000455580	HIP1	O00291	1037 aa		28.39	■■■□□ 2.14
PPP1CB-208	ENST00000455580	SEPT4	O43236	478 aa		28.39	■■■□□ 2.14
PPP1CB-208	ENST00000455580	PLA2G6	O60733	806 aa		28.39	■■■□□ 2.14
PPP1CB-208	ENST00000455580	STAT2	P52630	851 aa		28.39	■■■□□ 2.14
PPP1CB-208	ENST00000455580	OAZ1	P54368	228 aa		28.39	■■■□□ 2.14
PPP1CB-208	ENST00000455580	HAND2	P61296	217 aa		28.39	■■■□□ 2.14
PPP1CB-208	ENST00000455580	RCSD1	Q6JBY9	416 aa		28.39	■■■□□ 2.14
PPP1CB-208	ENST00000455580	CWC27	Q6UX04	472 aa	Known RBP	28.39	■■■□□ 2.14
PPP1CB-208	ENST00000455580	FAM160B2	Q86V87	743 aa		28.39	■■■□□ 2.14
PPP1CB-208	ENST00000455580	DIAPH3	Q9NSV4	1193 aa		28.39	■■■□□ 2.14
PPP1CB-208	ENST00000455580	TCP11L1	Q9NUJ3	509 aa		28.39	■■■□□ 2.14
PPP1CB-208	ENST00000455580	PDE4A	P27815	886 aa		28.38	■■■□□ 2.13
PPP1CB-208	ENST00000455580	RRP12	Q5JTH9	1297 aa	Known RBP	28.38	■■■□□ 2.13
PPP1CB-208	ENST00000455580	DHX30	Q7L2E3	1194 aa	Known RBP eCLIP	28.38	■■■□□ 2.13
PPP1CB-208	ENST00000455580	TINF2	Q9BSI4	451 aa		28.38	■■■□□ 2.13
PPP1CB-208	ENST00000455580	NRBP1	Q9UHY1	535 aa		28.38	■■■□□ 2.13
PPP1CB-208	ENST00000455580	PC	P11498	1178 aa	Known RBP	28.37	■■■□□ 2.13
PPP1CB-208	ENST00000455580	SLC4A3	P48751	1232 aa		28.37	■■■□□ 2.13
PPP1CB-208	ENST00000455580	AKNAD1	Q5T1N1	836 aa		28.37	■■■□□ 2.13
PPP1CB-208	ENST00000455580	CHMP4C	Q96CF2	233 aa		28.37	■■■□□ 2.13
PPP1CB-208	ENST00000455580	PRO3102	Q9H379	93 aa		28.37	■■■□□ 2.13
PPP1CB-208	ENST00000455580	ALPK3	Q96L96	1907 aa		28.36	■■■□□ 2.13
PPP1CB-208	ENST00000455580	MFSD6	Q6ZSS7	791 aa		28.36	■■■□□ 2.13
PPP1CB-208	ENST00000455580	KCTD1	Q719H9	257 aa		28.36	■■■□□ 2.13
PPP1CB-208	ENST00000455580	C7orf61	Q8IZ16	206 aa		28.36	■■■□□ 2.13
PPP1CB-208	ENST00000455580	DDX11	Q96FC9	970 aa		28.36	■■■□□ 2.13
PPP1CB-208	ENST00000455580	RBM27	Q9P2N5	1060 aa	Known RBP	28.36	■■■□□ 2.13
PPP1CB-208	ENST00000455580	ISY1	Q9ULR0	285 aa	Known RBP	28.36	■■■□□ 2.13
PPP1CB-208	ENST00000455580	DNAJC25-GNG10	A0A024R161	153 aa		28.35	■■■□□ 2.13
PPP1CB-208	ENST00000455580	CHST13	Q8NET6	341 aa		28.35	■■■□□ 2.13
PPP1CB-208	ENST00000455580	FBXO40	Q9UH90	709 aa		28.35	■■■□□ 2.13
PPP1CB-208	ENST00000455580	DNM1L	O00429	736 aa		28.34	■■■□□ 2.13
PPP1CB-208	ENST00000455580	ZNF213	O14771	459 aa		28.34	■■■□□ 2.13
PPP1CB-208	ENST00000455580	IK	Q13123	557 aa	Predicted RBP	28.34	■■■□□ 2.13
PPP1CB-208	ENST00000455580	ANO1	Q5XXA6	986 aa		28.34	■■■□□ 2.13
PPP1CB-208	ENST00000455580	TBC1D10C	Q8IV04	446 aa		28.34	■■■□□ 2.13
PPP1CB-208	ENST00000455580	MSL3	Q8N5Y2	521 aa	Known RBP	28.34	■■■□□ 2.13
PPP1CB-208	ENST00000455580	ARRDC4	Q8NCT1	418 aa		28.34	■■■□□ 2.13
PPP1CB-208	ENST00000455580	TMEM47	Q9BQJ4	181 aa		28.34	■■■□□ 2.13
PPP1CB-208	ENST00000455580	SENP6	Q9GZR1	1112 aa	Predicted RBP	28.34	■■■□□ 2.13
PPP1CB-208	ENST00000455580	RNF41	Q9H4P4	317 aa	Predicted RBP	28.34	■■■□□ 2.13
PPP1CB-208	ENST00000455580	TOP1	P11387	765 aa	Known RBP	28.33	■■■□□ 2.13
PPP1CB-208	ENST00000455580	DCAF4	Q8WV16	495 aa		28.33	■■■□□ 2.13
PPP1CB-208	ENST00000455580	TTC14	Q96N46	770 aa		28.33	■■■□□ 2.13
PPP1CB-208	ENST00000455580	ZNF536	O15090	1300 aa		28.33	■■■□□ 2.13
PPP1CB-208	ENST00000455580	FRMPD3	Q5JV73	1810 aa		28.32	■■■□□ 2.12
PPP1CB-208	ENST00000455580	FXR1	P51114	621 aa	Known RBP eCLIP	28.32	■■■□□ 2.12
PPP1CB-208	ENST00000455580	LRRC26	Q2I0M4	334 aa		28.32	■■■□□ 2.12
PPP1CB-208	ENST00000455580	GJC2	Q5T442	439 aa	Predicted RBP	28.32	■■■□□ 2.12
PPP1CB-208	ENST00000455580	TTC22	Q5TAA0	569 aa		28.32	■■■□□ 2.12
PPP1CB-208	ENST00000455580	RASGRP2	Q7LDG7	609 aa		28.32	■■■□□ 2.12
PPP1CB-208	ENST00000455580	ANKRD35	Q8N283	1001 aa		28.32	■■■□□ 2.12
PPP1CB-208	ENST00000455580	PRR12	Q9ULL5	1215 aa		28.32	■■■□□ 2.12
PPP1CB-208	ENST00000455580	MTMR7	Q9Y216	660 aa		28.32	■■■□□ 2.12
PPP1CB-208	ENST00000455580	ZNF865	P0CJ78	1059 aa	Predicted RBP	28.31	■■■□□ 2.12
PPP1CB-208	ENST00000455580	GSPT1	P15170	499 aa	Known RBP	28.31	■■■□□ 2.12
PPP1CB-208	ENST00000455580	TAL1	P17542	331 aa	Predicted RBP	28.31	■■■□□ 2.12
PPP1CB-208	ENST00000455580	MAMDC4	Q6UXC1	1216 aa		28.31	■■■□□ 2.12
PPP1CB-208	ENST00000455580	ZNF467	Q7Z7K2	595 aa	Predicted RBP	28.31	■■■□□ 2.12
PPP1CB-208	ENST00000455580	AGBL1	Q96MI9	1066 aa		28.31	■■■□□ 2.12
PPP1CB-208	ENST00000455580	DSCC1	Q9BVC3	393 aa		28.31	■■■□□ 2.12
PPP1CB-208	ENST00000455580	ZMYND8	Q9ULU4	1186 aa	Predicted RBP	28.31	■■■□□ 2.12
PPP1CB-208	ENST00000455580	PLXNA1	Q9UIW2	1896 aa		28.29	■■■□□ 2.12
PPP1CB-208	ENST00000455580	SYNGAP1	Q96PV0	1343 aa		28.29	■■■□□ 2.12
PPP1CB-208	ENST00000455580	SNAI1	O95863	264 aa	Predicted RBP	28.29	■■■□□ 2.12
PPP1CB-208	ENST00000455580	NT5C2	P49902	561 aa		28.29	■■■□□ 2.12

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