RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000358813.4

CCL20-201, Transcript of C-C motif chemokine ligand 20, humanhuman

APPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC

Gene CCL20, Length 800 nt, Biotype protein coding.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCL20-201ENST00000358813 TKFCQ3LXA3 575 aa7.36□□□□□ -1.23
CCL20-201ENST00000358813 NKAPLQ5M9Q1 402 aa7.36□□□□□ -1.23
CCL20-201ENST00000358813 C12orf50Q8NA57 414 aaPredicted RBP7.36□□□□□ -1.23
CCL20-201ENST00000358813 EHMT1Q9H9B1 1298 aa7.36□□□□□ -1.23
CCL20-201ENST00000358813 PTCH2Q9Y6C5 1203 aa7.36□□□□□ -1.23
CCL20-201ENST00000358813 DCCP43146 1447 aa7.35□□□□□ -1.23
CCL20-201ENST00000358813 TET3O43151 1660 aa7.35□□□□□ -1.23
CCL20-201ENST00000358813 ASMTLO95671 621 aa7.35□□□□□ -1.23
CCL20-201ENST00000358813 ECEL1O95672 775 aa7.35□□□□□ -1.23
CCL20-201ENST00000358813 CTSBP07858 339 aa7.35□□□□□ -1.23
CCL20-201ENST00000358813 PDE3AQ14432 1141 aa7.35□□□□□ -1.23
CCL20-201ENST00000358813 LRRFIP1Q32MZ4 808 aaKnown RBP7.35□□□□□ -1.23
CCL20-201ENST00000358813 SCARA3Q6AZY7 606 aa7.35□□□□□ -1.23
CCL20-201ENST00000358813 LLGL2Q6P1M3 1020 aa7.35□□□□□ -1.23
CCL20-201ENST00000358813 FERMT3Q86UX7 667 aa7.35□□□□□ -1.23
CCL20-201ENST00000358813 ZSWIM2Q8NEG5 633 aa7.35□□□□□ -1.23
CCL20-201ENST00000358813 UTP4Q969X6 686 aaKnown RBP7.35□□□□□ -1.23
CCL20-201ENST00000358813 CCDC136Q96JN2 1154 aa7.35□□□□□ -1.23
CCL20-201ENST00000358813 ZC3H12CQ9C0D7 883 aaKnown RBP7.35□□□□□ -1.23
CCL20-201ENST00000358813 SEMA6BQ9H3T3 888 aa7.35□□□□□ -1.23
CCL20-201ENST00000358813 RAD18Q9NS91 495 aa7.35□□□□□ -1.23
CCL20-201ENST00000358813 PFDN2Q9UHV9 154 aa7.35□□□□□ -1.23
CCL20-201ENST00000358813 LMTK2Q8IWU2 1503 aa7.35□□□□□ -1.23
CCL20-201ENST00000358813 ASXL1Q8IXJ9 1541 aa7.35□□□□□ -1.23
CCL20-201ENST00000358813 PTPN23Q9H3S7 1636 aa7.34□□□□□ -1.23
CCL20-201ENST00000358813 ATE1O95260 518 aa7.34□□□□□ -1.23
CCL20-201ENST00000358813 PREPP48147 710 aa7.34□□□□□ -1.23
CCL20-201ENST00000358813 RPL6Q02878 288 aaKnown RBP7.34□□□□□ -1.23
CCL20-201ENST00000358813 UVSSAQ2YD98 709 aa7.34□□□□□ -1.23
CCL20-201ENST00000358813 FAM178BQ8IXR5 827 aa7.34□□□□□ -1.23
CCL20-201ENST00000358813 SMG8Q8ND04 991 aaKnown RBP7.34□□□□□ -1.23
CCL20-201ENST00000358813 FAM46AQ96IP4 442 aaKnown RBP7.34□□□□□ -1.23
CCL20-201ENST00000358813 SUGCTQ9HAC7 445 aa7.34□□□□□ -1.23
CCL20-201ENST00000358813 HOMER2Q9NSB8 354 aa7.34□□□□□ -1.23
CCL20-201ENST00000358813 MAGEC2Q9UBF1 373 aaPredicted RBP7.34□□□□□ -1.23
CCL20-201ENST00000358813 ZMYM5Q9UJ78 669 aa7.34□□□□□ -1.23
CCL20-201ENST00000358813 PCDHB14Q9Y5E9 798 aa7.34□□□□□ -1.23
CCL20-201ENST00000358813 CROCC2H7BZ55 1655 aa7.34□□□□□ -1.23
CCL20-201ENST00000358813 ABCC5O15440 1437 aa7.34□□□□□ -1.23
CCL20-201ENST00000358813 NOS1P29475 1434 aa7.34□□□□□ -1.23
CCL20-201ENST00000358813 SETD5Q9C0A6 1442 aa7.34□□□□□ -1.23
CCL20-201ENST00000358813 SIPA1L2Q9P2F8 1722 aaPredicted RBP7.33□□□□□ -1.24
CCL20-201ENST00000358813 GCC2Q8IWJ2 1684 aa7.33□□□□□ -1.24
CCL20-201ENST00000358813 DHX15O43143 795 aaKnown RBP7.33□□□□□ -1.24
CCL20-201ENST00000358813 DYRK3O43781 588 aa7.33□□□□□ -1.24
CCL20-201ENST00000358813 GAS2O43903 313 aaKnown RBP7.33□□□□□ -1.24
CCL20-201ENST00000358813 DIAPH1O60610 1272 aaKnown RBP7.33□□□□□ -1.24
CCL20-201ENST00000358813 GSTP1P09211 210 aaKnown RBP7.33□□□□□ -1.24
CCL20-201ENST00000358813 H2AFB1P0C5Y9 115 aa7.33□□□□□ -1.24
CCL20-201ENST00000358813 H2AFB2P0C5Z0 115 aa7.33□□□□□ -1.24
CCL20-201ENST00000358813 ARNTP27540 789 aa7.33□□□□□ -1.24
CCL20-201ENST00000358813 CNGA1P29973 690 aa7.33□□□□□ -1.24
CCL20-201ENST00000358813 DALRD3Q5D0E6 543 aaKnown RBP7.33□□□□□ -1.24
CCL20-201ENST00000358813 SPATC1Q76KD6 591 aa7.33□□□□□ -1.24
CCL20-201ENST00000358813 SULF2Q8IWU5 870 aa7.33□□□□□ -1.24
CCL20-201ENST00000358813 JDP2Q8WYK2 163 aa7.33□□□□□ -1.24
CCL20-201ENST00000358813 CBX8Q9HC52 389 aa7.33□□□□□ -1.24
CCL20-201ENST00000358813 RIPOR2Q9Y4F9 1068 aa7.33□□□□□ -1.24
CCL20-201ENST00000358813 SLC12A7Q9Y666 1083 aa7.33□□□□□ -1.24
CCL20-201ENST00000358813 ANKRD50Q9ULJ7 1429 aa7.33□□□□□ -1.24
CCL20-201ENST00000358813 PNPLA6Q8IY17 1366 aa7.33□□□□□ -1.24
CCL20-201ENST00000358813 CHD2O14647 1828 aaKnown RBP7.32□□□□□ -1.24
CCL20-201ENST00000358813 A0A1W2PQH9 124 aa7.32□□□□□ -1.24
CCL20-201ENST00000358813 TPD52L2O43399 206 aaKnown RBP7.32□□□□□ -1.24
CCL20-201ENST00000358813 ADAM23O75077 832 aa7.32□□□□□ -1.24
CCL20-201ENST00000358813 DRD2P14416 443 aa7.32□□□□□ -1.24
CCL20-201ENST00000358813 HNRNPUQ00839 825 aaKnown RBP eCLIP7.32□□□□□ -1.24
CCL20-201ENST00000358813 ZC3H12BQ5HYM0 836 aaKnown RBP7.32□□□□□ -1.24
CCL20-201ENST00000358813 AKAP4Q5JQC9 854 aa7.32□□□□□ -1.24
CCL20-201ENST00000358813 ODR4Q5SWX8 454 aa7.32□□□□□ -1.24
CCL20-201ENST00000358813 RASIP1Q5U651 963 aa7.32□□□□□ -1.24
CCL20-201ENST00000358813 C6orf15Q6UXA7 325 aaPredicted RBP7.32□□□□□ -1.24
CCL20-201ENST00000358813 PRR23CQ6ZRP0 262 aa7.32□□□□□ -1.24
CCL20-201ENST00000358813 ARMC10Q8N2F6 343 aa7.32□□□□□ -1.24
CCL20-201ENST00000358813 MYRFLQ96LU7 910 aa7.32□□□□□ -1.24
CCL20-201ENST00000358813 TM9SF2Q99805 663 aa7.32□□□□□ -1.24
CCL20-201ENST00000358813 MYH16Q9H6N6 1097 aa7.32□□□□□ -1.24
CCL20-201ENST00000358813 ZFYVE9O95405 1425 aa7.32□□□□□ -1.24
CCL20-201ENST00000358813 TIAF1O95411 115 aa7.31□□□□□ -1.24
CCL20-201ENST00000358813 BMP3P12645 472 aa7.31□□□□□ -1.24
CCL20-201ENST00000358813 LIG1P18858 919 aa7.31□□□□□ -1.24
CCL20-201ENST00000358813 SOX4Q06945 474 aaPredicted RBP7.31□□□□□ -1.24
CCL20-201ENST00000358813 LONRF2Q1L5Z9 754 aa7.31□□□□□ -1.24
CCL20-201ENST00000358813 TMEM67Q5HYA8 995 aa7.31□□□□□ -1.24
CCL20-201ENST00000358813 PPP1R3FQ6ZSY5 799 aaPredicted RBP7.31□□□□□ -1.24
CCL20-201ENST00000358813 EEPD1Q7L9B9 569 aa7.31□□□□□ -1.24
CCL20-201ENST00000358813 TTC6Q86TZ1 520 aa7.31□□□□□ -1.24
CCL20-201ENST00000358813 FMNL3Q8IVF7 1028 aa7.31□□□□□ -1.24
CCL20-201ENST00000358813 CCAR1Q8IX12 1150 aaKnown RBP7.31□□□□□ -1.24
CCL20-201ENST00000358813 STK35Q8TDR2 534 aa7.31□□□□□ -1.24
CCL20-201ENST00000358813 IER2Q9BTL4 223 aa7.31□□□□□ -1.24
CCL20-201ENST00000358813 PCGF6Q9BYE7 350 aa7.31□□□□□ -1.24
CCL20-201ENST00000358813 KCNF1Q9H3M0 494 aa7.31□□□□□ -1.24
CCL20-201ENST00000358813 CCDC86Q9H6F5 360 aaKnown RBP7.31□□□□□ -1.24
CCL20-201ENST00000358813 GEMIN8Q9NWZ8 242 aaKnown RBP7.31□□□□□ -1.24
CCL20-201ENST00000358813 RAXQ9Y2V3 346 aa7.31□□□□□ -1.24
CCL20-201ENST00000358813 CD2APQ9Y5K6 639 aa7.31□□□□□ -1.24
CCL20-201ENST00000358813 MST1RQ04912 1400 aa7.3□□□□□ -1.24
CCL20-201ENST00000358813 PTCH1Q13635 1447 aa7.3□□□□□ -1.24
CCL20-201ENST00000358813 CCDC163A0A0D9SF12 145 aa7.3□□□□□ -1.24
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 14.3 ms