RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000331789.9

ACTB-201, Transcript of actin beta, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene ACTB, Length 1,917 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cell leading edge, Cytoplasm, Cytosol, Exosome, Lamellipodium, Mitochondria, Nucleus, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACTB-201ENST00000331789 ZNF70Q9UC06 446 aaPredicted RBP20.43■□□□□ 0.86
ACTB-201ENST00000331789 FER1L6Q2WGJ9 1857 aa20.43■□□□□ 0.86
ACTB-201ENST00000331789 CCDC194A0A1B0GVG4 234 aa20.43■□□□□ 0.86
ACTB-201ENST00000331789 SMCO2A6NFE2 343 aa20.43■□□□□ 0.86
ACTB-201ENST00000331789 SEPT2Q15019 361 aa20.43■□□□□ 0.86
ACTB-201ENST00000331789 R3HDM1Q15032 1099 aaKnown RBP20.43■□□□□ 0.86
ACTB-201ENST00000331789 FERMT2Q96AC1 680 aa20.43■□□□□ 0.86
ACTB-201ENST00000331789 SERTAD1Q9UHV2 236 aa20.43■□□□□ 0.86
ACTB-201ENST00000331789 FOXN1O15353 648 aa20.42■□□□□ 0.86
ACTB-201ENST00000331789 CXCL9Q07325 125 aa20.42■□□□□ 0.86
ACTB-201ENST00000331789 HS1BP3Q53T59 392 aa20.42■□□□□ 0.86
ACTB-201ENST00000331789 SIAH1Q8IUQ4 282 aa20.42■□□□□ 0.86
ACTB-201ENST00000331789 FAM177A1Q8N128 213 aaPredicted RBP20.42■□□□□ 0.86
ACTB-201ENST00000331789 OGFOD1Q8N543 542 aa20.42■□□□□ 0.86
ACTB-201ENST00000331789 EPSTI1Q96J88 318 aa20.42■□□□□ 0.86
ACTB-201ENST00000331789 TMOD2Q9NZR1 351 aa20.42■□□□□ 0.86
ACTB-201ENST00000331789 NLRP12P59046 1061 aa20.41■□□□□ 0.86
ACTB-201ENST00000331789 JAG1P78504 1218 aa20.41■□□□□ 0.86
ACTB-201ENST00000331789 RRP1BQ14684 758 aaKnown RBP20.41■□□□□ 0.86
ACTB-201ENST00000331789 INF2Q27J81 1249 aa20.41■□□□□ 0.86
ACTB-201ENST00000331789 CCDC96Q2M329 555 aa20.41■□□□□ 0.86
ACTB-201ENST00000331789 ABCB5Q2M3G0 1257 aa20.41■□□□□ 0.86
ACTB-201ENST00000331789 DPCR1Q3MIW9 517 aa20.41■□□□□ 0.86
ACTB-201ENST00000331789 PPP4R3BQ5MIZ7 849 aa20.41■□□□□ 0.86
ACTB-201ENST00000331789 ISM2Q6H9L7 571 aa20.41■□□□□ 0.86
ACTB-201ENST00000331789 KCTD1Q719H9 257 aa20.41■□□□□ 0.86
ACTB-201ENST00000331789 ADGRF4Q8IZF3 695 aa20.41■□□□□ 0.86
ACTB-201ENST00000331789 PDILTQ8N807 584 aa20.41■□□□□ 0.86
ACTB-201ENST00000331789 CCDC12Q8WUD4 166 aaPredicted RBP20.41■□□□□ 0.86
ACTB-201ENST00000331789 CSRNP1Q96S65 589 aa20.41■□□□□ 0.86
ACTB-201ENST00000331789 KANSL2Q9H9L4 492 aa20.41■□□□□ 0.86
ACTB-201ENST00000331789 JMJD4Q9H9V9 463 aa20.41■□□□□ 0.86
ACTB-201ENST00000331789 C6orf50Q9HD87 102 aa20.41■□□□□ 0.86
ACTB-201ENST00000331789 NYAP2Q9P242 653 aa20.41■□□□□ 0.86
ACTB-201ENST00000331789 CCDC39Q9UFE4 941 aa20.41■□□□□ 0.86
ACTB-201ENST00000331789 TUBE1Q9UJT0 475 aa20.41■□□□□ 0.86
ACTB-201ENST00000331789 VWA3AA6NCI4 1184 aa20.41■□□□□ 0.86
ACTB-201ENST00000331789 SLC16A2P36021 539 aa20.41■□□□□ 0.86
ACTB-201ENST00000331789 MDM2Q00987 491 aaPredicted RBP20.41■□□□□ 0.86
ACTB-201ENST00000331789 ZRSR1Q15695 479 aaKnown RBP20.41■□□□□ 0.86
ACTB-201ENST00000331789 IL17AQ16552 155 aa20.41■□□□□ 0.86
ACTB-201ENST00000331789 DHX40Q8IX18 779 aaKnown RBP20.41■□□□□ 0.86
ACTB-201ENST00000331789 CEP57L1Q8IYX8 460 aa20.41■□□□□ 0.86
ACTB-201ENST00000331789 C4orf32Q8N8J7 132 aa20.41■□□□□ 0.86
ACTB-201ENST00000331789 MKL1Q969V6 931 aa20.41■□□□□ 0.86
ACTB-201ENST00000331789 COA7Q96BR5 231 aa20.41■□□□□ 0.86
ACTB-201ENST00000331789 RAD21O60216 631 aa20.4■□□□□ 0.86
ACTB-201ENST00000331789 PTMAP06454 111 aaKnown RBP20.4■□□□□ 0.86
ACTB-201ENST00000331789 AGBL3Q8NEM8 1001 aa20.4■□□□□ 0.86
ACTB-201ENST00000331789 SYMPKQ92797 1274 aaKnown RBP20.4■□□□□ 0.86
ACTB-201ENST00000331789 COL2A1P02458 1487 aaPredicted RBP20.4■□□□□ 0.86
ACTB-201ENST00000331789 A0A087X0B3 334 aa20.39■□□□□ 0.86
ACTB-201ENST00000331789 SPDYE2Q495Y8 402 aa20.39■□□□□ 0.86
ACTB-201ENST00000331789 TMEM179Q6ZVK1 233 aa20.39■□□□□ 0.86
ACTB-201ENST00000331789 TAOK3Q9H2K8 898 aa20.39■□□□□ 0.86
ACTB-201ENST00000331789 ACTN4O43707 911 aaKnown RBP20.39■□□□□ 0.85
ACTB-201ENST00000331789 GNA11P29992 359 aa20.39■□□□□ 0.85
ACTB-201ENST00000331789 ICA1Q05084 483 aa20.39■□□□□ 0.85
ACTB-201ENST00000331789 GPATCH4Q5T3I0 446 aaKnown RBP20.39■□□□□ 0.85
ACTB-201ENST00000331789 ELOA2Q8IYF1 753 aaPredicted RBP20.39■□□□□ 0.85
ACTB-201ENST00000331789 CNTNAP1P78357 1384 aa20.38■□□□□ 0.85
ACTB-201ENST00000331789 USP17L10C9JJH3 530 aa20.38■□□□□ 0.85
ACTB-201ENST00000331789 GOLGA6L19H0YKK7 550 aa20.38■□□□□ 0.85
ACTB-201ENST00000331789 PRR29P0C7W0 189 aa20.38■□□□□ 0.85
ACTB-201ENST00000331789 RBM26Q5T8P6 1007 aaKnown RBP20.38■□□□□ 0.85
ACTB-201ENST00000331789 SLFN13Q68D06 897 aa20.38■□□□□ 0.85
ACTB-201ENST00000331789 ZSCAN30Q86W11 494 aa20.38■□□□□ 0.85
ACTB-201ENST00000331789 GRAMD1CQ8IYS0 662 aa20.38■□□□□ 0.85
ACTB-201ENST00000331789 AOPEPQ8N6M6 819 aa20.38■□□□□ 0.85
ACTB-201ENST00000331789 FAM151AQ8WW52 585 aa20.38■□□□□ 0.85
ACTB-201ENST00000331789 NAT10Q9H0A0 1025 aaKnown RBP20.38■□□□□ 0.85
ACTB-201ENST00000331789 XPO5Q9HAV4 1204 aaKnown RBP eCLIP20.38■□□□□ 0.852e-7■■□□□ 13.5
ACTB-201ENST00000331789 VEZTQ9HBM0 779 aa20.38■□□□□ 0.85
ACTB-201ENST00000331789 BIN2Q9UBW5 565 aaPredicted RBP20.38■□□□□ 0.85
ACTB-201ENST00000331789 PCDHA5Q9Y5H7 936 aa20.38■□□□□ 0.85
ACTB-201ENST00000331789 GOLGB1Q14789 3259 aaKnown RBP20.38■□□□□ 0.85
ACTB-201ENST00000331789 PNMA6FA0A0J9YX94 578 aa20.37■□□□□ 0.85
ACTB-201ENST00000331789 SHTN1A0MZ66 631 aa20.37■□□□□ 0.85
ACTB-201ENST00000331789 BECN2A8MW95 431 aa20.37■□□□□ 0.85
ACTB-201ENST00000331789 NFKBIEO00221 500 aa20.37■□□□□ 0.85
ACTB-201ENST00000331789 PPP1R11O60927 126 aaPredicted RBP20.37■□□□□ 0.85
ACTB-201ENST00000331789 GH2P01242 217 aa20.37■□□□□ 0.85
ACTB-201ENST00000331789 CIAPIN1Q6FI81 312 aa20.37■□□□□ 0.85
ACTB-201ENST00000331789 KRT25Q7Z3Z0 450 aa20.37■□□□□ 0.85
ACTB-201ENST00000331789 DHX58Q96C10 678 aa20.37■□□□□ 0.85
ACTB-201ENST00000331789 TMEM260Q9NX78 707 aa20.37■□□□□ 0.85
ACTB-201ENST00000331789 hCG_1984214I3L0E3 225 aa20.37■□□□□ 0.85
ACTB-201ENST00000331789 JAKMIP3Q5VZ66 844 aa20.37■□□□□ 0.85
ACTB-201ENST00000331789 ZNF713Q8N859 430 aaPredicted RBP20.37■□□□□ 0.85
ACTB-201ENST00000331789 MTMR14Q8NCE2 650 aa20.37■□□□□ 0.85
ACTB-201ENST00000331789 JDP2Q8WYK2 163 aa20.37■□□□□ 0.85
ACTB-201ENST00000331789 EIF2AK3Q9NZJ5 1116 aaKnown RBP20.37■□□□□ 0.85
ACTB-201ENST00000331789 ARFGEF1Q9Y6D6 1849 aa20.36■□□□□ 0.85
ACTB-201ENST00000331789 ESYT2A0FGR8 921 aa20.36■□□□□ 0.85
ACTB-201ENST00000331789 SLC1A4P43007 532 aa20.36■□□□□ 0.85
ACTB-201ENST00000331789 POSTNQ15063 836 aa20.36■□□□□ 0.85
ACTB-201ENST00000331789 NONOQ15233 471 aaKnown RBP eCLIP20.36■□□□□ 0.853e-11■■■■■ 39.9
ACTB-201ENST00000331789 DCAF4Q8WV16 495 aa20.36■□□□□ 0.85
ACTB-201ENST00000331789 SGIP1Q9BQI5 828 aa20.36■□□□□ 0.85
ACTB-201ENST00000331789 TMEM60Q9H2L4 133 aa20.36■□□□□ 0.85
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