RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000312060.9

CTU2-201, Transcript of cytosolic thiouridylase subunit 2, humanhuman

APPRIS P3 TSL 5 BASIC

Gene CTU2, Length 1,672 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTU2-201ENST00000312060 JMJD4Q9H9V9 463 aa25.6■■□□□ 1.69
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CTU2-201ENST00000312060 FOXD4L5Q5VV16 416 aaPredicted RBP25.59■■□□□ 1.69
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CTU2-201ENST00000312060 CHURC1Q8WUH1 139 aa25.59■■□□□ 1.69
CTU2-201ENST00000312060 FOXD4L4Q8WXT5 416 aaPredicted RBP25.59■■□□□ 1.69
CTU2-201ENST00000312060 OPTNQ96CV9 577 aa25.59■■□□□ 1.69
CTU2-201ENST00000312060 C12orf42Q96LP6 360 aa25.59■■□□□ 1.69
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CTU2-201ENST00000312060 GJB4Q9NTQ9 266 aa25.59■■□□□ 1.69
CTU2-201ENST00000312060 TMOD4Q9NZQ9 345 aa25.59■■□□□ 1.69
CTU2-201ENST00000312060 SEC63Q9UGP8 760 aaKnown RBP25.59■■□□□ 1.69
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CTU2-201ENST00000312060 TRIM29Q14134 588 aa25.58■■□□□ 1.69
CTU2-201ENST00000312060 SH3D19Q5HYK7 790 aa25.58■■□□□ 1.69
CTU2-201ENST00000312060 OTUD7BQ6GQQ9 843 aa25.58■■□□□ 1.69
CTU2-201ENST00000312060 SMC1BQ8NDV3 1235 aa25.58■■□□□ 1.69
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CTU2-201ENST00000312060 CXCL11O14625 94 aa25.58■■□□□ 1.68
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CTU2-201ENST00000312060 PPIL2Q13356 520 aa25.58■■□□□ 1.68
CTU2-201ENST00000312060 SYDE2Q5VT97 1194 aa25.58■■□□□ 1.68
CTU2-201ENST00000312060 RGS22Q8NE09 1264 aa25.58■■□□□ 1.68
CTU2-201ENST00000312060 PLA2G6O60733 806 aa25.57■■□□□ 1.68
CTU2-201ENST00000312060 YY1P25490 414 aa25.57■■□□□ 1.68
CTU2-201ENST00000312060 FAM160B2Q86V87 743 aa25.57■■□□□ 1.68
CTU2-201ENST00000312060 VPS54Q9P1Q0 977 aa25.57■■□□□ 1.68
CTU2-201ENST00000312060 PARP14Q460N5 1801 aa25.56■■□□□ 1.68
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CTU2-201ENST00000312060 RPAP3Q9H6T3 665 aaPredicted RBP25.56■■□□□ 1.68
CTU2-201ENST00000312060 PRR12Q9ULL5 1215 aa25.56■■□□□ 1.68
CTU2-201ENST00000312060 PASKQ96RG2 1323 aa25.56■■□□□ 1.68
CTU2-201ENST00000312060 PNMA6FA0A0J9YX94 578 aa25.55■■□□□ 1.68
CTU2-201ENST00000312060 KIFC2Q96AC6 838 aa25.55■■□□□ 1.68
CTU2-201ENST00000312060 TANGO6Q9C0B7 1094 aa25.55■■□□□ 1.68
CTU2-201ENST00000312060 KCNH4Q9UQ05 1017 aa25.55■■□□□ 1.68
CTU2-201ENST00000312060 ZBTB5O15062 677 aa25.55■■□□□ 1.68
CTU2-201ENST00000312060 TOMM70O94826 608 aa25.55■■□□□ 1.68
CTU2-201ENST00000312060 HEATR3Q7Z4Q2 680 aa25.55■■□□□ 1.68
CTU2-201ENST00000312060 GPKOWQ92917 476 aaPredicted RBP eCLIP25.55■■□□□ 1.68
CTU2-201ENST00000312060 FBXO28Q9NVF7 368 aa25.55■■□□□ 1.68
CTU2-201ENST00000312060 TCHHQ07283 1943 aa25.54■■□□□ 1.68
CTU2-201ENST00000312060 LOC285556D6RIA3 1793 aa25.54■■□□□ 1.68
CTU2-201ENST00000312060 KCNJ14Q9UNX9 436 aa25.54■■□□□ 1.68
CTU2-201ENST00000312060 SMCHD1A6NHR9 2005 aa25.53■■□□□ 1.68
CTU2-201ENST00000312060 A0A0G2JLL6 359 aaPredicted RBP25.53■■□□□ 1.68
CTU2-201ENST00000312060 FLOT1O75955 427 aa25.53■■□□□ 1.68
CTU2-201ENST00000312060 F13A1P00488 732 aa25.53■■□□□ 1.68
CTU2-201ENST00000312060 CDC37Q16543 378 aaPredicted RBP25.53■■□□□ 1.68
CTU2-201ENST00000312060 WWC2Q6AWC2 1192 aa25.53■■□□□ 1.68
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CTU2-201ENST00000312060 QRICH1Q2TAL8 776 aa25.52■■□□□ 1.68
CTU2-201ENST00000312060 MCTP1Q6DN14 999 aa25.52■■□□□ 1.68
CTU2-201ENST00000312060 FERMT3Q86UX7 667 aa25.52■■□□□ 1.68
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CTU2-201ENST00000312060 TNPO1Q92973 898 aaKnown RBP25.52■■□□□ 1.68
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CTU2-201ENST00000312060 SLF1Q9BQI6 1058 aa25.52■■□□□ 1.68
CTU2-201ENST00000312060 RLFQ13129 1914 aa25.52■■□□□ 1.68
CTU2-201ENST00000312060 hCG_1984214I3L0E3 225 aa25.52■■□□□ 1.68
CTU2-201ENST00000312060 MMP1P03956 469 aa25.52■■□□□ 1.68
CTU2-201ENST00000312060 SNAP25P60880 206 aa25.52■■□□□ 1.68
CTU2-201ENST00000312060 ZNF713Q8N859 430 aaPredicted RBP25.52■■□□□ 1.68
CTU2-201ENST00000312060 ZNF784Q8NCA9 323 aaPredicted RBP25.52■■□□□ 1.68
CTU2-201ENST00000312060 GADL1Q6ZQY3 521 aa25.51■■□□□ 1.67
CTU2-201ENST00000312060 PROCA1Q8NCQ7 364 aaPredicted RBP25.51■■□□□ 1.67
CTU2-201ENST00000312060 WNK4Q96J92 1243 aa25.51■■□□□ 1.67
CTU2-201ENST00000312060 PHF20Q9BVI0 1012 aa25.51■■□□□ 1.67
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CTU2-201ENST00000312060 NLRP5P59047 1200 aa25.5■■□□□ 1.67
CTU2-201ENST00000312060 SNAPC2Q13487 334 aa25.5■■□□□ 1.67
CTU2-201ENST00000312060 SAFBQ15424 915 aaKnown RBP eCLIP25.5■■□□□ 1.67
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CTU2-201ENST00000312060 CATSPERGQ6ZRH7 1159 aa25.5■■□□□ 1.67
CTU2-201ENST00000312060 CCDC148Q8NFR7 591 aa25.5■■□□□ 1.67
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CTU2-201ENST00000312060 USP17L15C9J2P7 530 aa25.49■■□□□ 1.67
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CTU2-201ENST00000312060 USP17L18D6R9N7 530 aa25.49■■□□□ 1.67
CTU2-201ENST00000312060 USP17L22D6RA61 530 aa25.49■■□□□ 1.67
CTU2-201ENST00000312060 USP17L17D6RBQ6 530 aa25.49■■□□□ 1.67
CTU2-201ENST00000312060 USP17L19D6RCP7 530 aa25.49■■□□□ 1.67
CTU2-201ENST00000312060 USP17L20D6RJB6 530 aa25.49■■□□□ 1.67
CTU2-201ENST00000312060 PPP1R11O60927 126 aaPredicted RBP25.49■■□□□ 1.67
CTU2-201ENST00000312060 NAPAP54920 295 aa25.49■■□□□ 1.67
CTU2-201ENST00000312060 USP17L24Q0WX57 530 aa25.49■■□□□ 1.67
CTU2-201ENST00000312060 CCDC12Q8WUD4 166 aaPredicted RBP25.49■■□□□ 1.67
CTU2-201ENST00000312060 COA7Q96BR5 231 aa25.49■■□□□ 1.67
CTU2-201ENST00000312060 ZSCAN16Q9H4T2 348 aaPredicted RBP25.49■■□□□ 1.67
CTU2-201ENST00000312060 PPP1R9AQ9ULJ8 1098 aa25.49■■□□□ 1.67
CTU2-201ENST00000312060 MYH15Q9Y2K3 1946 aa25.49■■□□□ 1.67
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