RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000225648.3

HOXB6-201, Transcript of homeobox B6, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene HOXB6, Length 1,660 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXB6-201ENST00000225648 ISY1Q9ULR0 285 aaKnown RBP22.26■■□□□ 1.15
HOXB6-201ENST00000225648 MAPK4P31152 587 aa22.25■■□□□ 1.15
HOXB6-201ENST00000225648 CCNA1P78396 465 aa22.25■■□□□ 1.15
HOXB6-201ENST00000225648 FBXO46Q6PJ61 603 aaPredicted RBP22.25■■□□□ 1.15
HOXB6-201ENST00000225648 DHX32Q7L7V1 743 aaKnown RBP22.25■■□□□ 1.15
HOXB6-201ENST00000225648 GJD2Q9UKL4 321 aa22.25■■□□□ 1.15
HOXB6-201ENST00000225648 PRR12Q9ULL5 1215 aa22.25■■□□□ 1.15
HOXB6-201ENST00000225648 ZSWIM8A7E2V4 1837 aa22.24■■□□□ 1.15
HOXB6-201ENST00000225648 CENPFP49454 3210 aa22.24■■□□□ 1.15
HOXB6-201ENST00000225648 SH2B2O14492 632 aaPredicted RBP22.24■■□□□ 1.15
HOXB6-201ENST00000225648 GOLGA8HP0CJ92 632 aa22.24■■□□□ 1.15
HOXB6-201ENST00000225648 SLC16A2P36021 539 aa22.24■■□□□ 1.15
HOXB6-201ENST00000225648 GABRQQ9UN88 632 aa22.24■■□□□ 1.15
HOXB6-201ENST00000225648 A0A0G2JMZ2 1700 aa22.23■■□□□ 1.15
HOXB6-201ENST00000225648 ATP2A1O14983 1001 aa22.23■■□□□ 1.15
HOXB6-201ENST00000225648 HOXD10P28358 340 aa22.23■■□□□ 1.15
HOXB6-201ENST00000225648 PRKCZQ05513 592 aa22.23■■□□□ 1.15
HOXB6-201ENST00000225648 TROAPQ12815 778 aa22.23■■□□□ 1.15
HOXB6-201ENST00000225648 IKQ13123 557 aaPredicted RBP22.23■■□□□ 1.15
HOXB6-201ENST00000225648 PLS1Q14651 629 aa22.23■■□□□ 1.15
HOXB6-201ENST00000225648 GPATCH4Q5T3I0 446 aaKnown RBP22.23■■□□□ 1.15
HOXB6-201ENST00000225648 GPR142Q7Z601 462 aa22.23■■□□□ 1.15
HOXB6-201ENST00000225648 TNS4Q8IZW8 715 aa22.23■■□□□ 1.15
HOXB6-201ENST00000225648 COA7Q96BR5 231 aa22.23■■□□□ 1.15
HOXB6-201ENST00000225648 LRRC2Q9BYS8 371 aa22.23■■□□□ 1.15
HOXB6-201ENST00000225648 PARP14Q460N5 1801 aa22.23■■□□□ 1.15
HOXB6-201ENST00000225648 ZBED4O75132 1171 aa22.23■■□□□ 1.15
HOXB6-201ENST00000225648 HMGB1P09429 215 aaKnown RBP22.23■■□□□ 1.15
HOXB6-201ENST00000225648 FDX1P10109 184 aa22.23■■□□□ 1.15
HOXB6-201ENST00000225648 STAT3P40763 770 aa22.23■■□□□ 1.15
HOXB6-201ENST00000225648 LIFRP42702 1097 aa22.23■■□□□ 1.15
HOXB6-201ENST00000225648 PRMT2P55345 433 aa22.23■■□□□ 1.15
HOXB6-201ENST00000225648 SHCBP1Q8NEM2 672 aa22.23■■□□□ 1.15
HOXB6-201ENST00000225648 TCEANC2Q96MN5 208 aa22.23■■□□□ 1.15
HOXB6-201ENST00000225648 JAKMIP1Q96N16 626 aaKnown RBP22.23■■□□□ 1.15
HOXB6-201ENST00000225648 WDR19Q8NEZ3 1342 aa22.22■■□□□ 1.15
HOXB6-201ENST00000225648 CPA1P15085 419 aa22.22■■□□□ 1.15
HOXB6-201ENST00000225648 ERCC3P19447 782 aa22.22■■□□□ 1.15
HOXB6-201ENST00000225648 FLT3LGP49771 235 aa22.22■■□□□ 1.15
HOXB6-201ENST00000225648 RIOX2Q8IUF8 465 aa22.22■■□□□ 1.15
HOXB6-201ENST00000225648 TMTC2Q8N394 836 aa22.22■■□□□ 1.15
HOXB6-201ENST00000225648 PTCH2Q9Y6C5 1203 aa22.22■■□□□ 1.15
HOXB6-201ENST00000225648 ZNF536O15090 1300 aa22.22■■□□□ 1.15
HOXB6-201ENST00000225648 ASPRV1Q53RT3 343 aa22.21■■□□□ 1.15
HOXB6-201ENST00000225648 PLEKHH3Q7Z736 793 aa22.21■■□□□ 1.15
HOXB6-201ENST00000225648 CCAR1Q8IX12 1150 aaKnown RBP22.21■■□□□ 1.15
HOXB6-201ENST00000225648 STAG2Q8N3U4 1231 aa22.21■■□□□ 1.15
HOXB6-201ENST00000225648 TEX13BQ9BXU2 312 aa22.21■■□□□ 1.15
HOXB6-201ENST00000225648 CPVLQ9H3G5 476 aa22.21■■□□□ 1.15
HOXB6-201ENST00000225648 RAVER2Q9HCJ3 691 aaKnown RBP22.21■■□□□ 1.15
HOXB6-201ENST00000225648 RIPK3Q9Y572 518 aa22.21■■□□□ 1.15
HOXB6-201ENST00000225648 PARP1P09874 1014 aaKnown RBP22.2■■□□□ 1.15
HOXB6-201ENST00000225648 OAZ1P54368 228 aa22.2■■□□□ 1.15
HOXB6-201ENST00000225648 SNAP25P60880 206 aa22.2■■□□□ 1.15
HOXB6-201ENST00000225648 SYDE2Q5VT97 1194 aa22.2■■□□□ 1.15
HOXB6-201ENST00000225648 CPXCR1Q8N123 301 aa22.2■■□□□ 1.15
HOXB6-201ENST00000225648 USP6NLQ92738 828 aa22.2■■□□□ 1.15
HOXB6-201ENST00000225648 UBA5Q9GZZ9 404 aa22.2■■□□□ 1.15
HOXB6-201ENST00000225648 MROH8Q9H579 483 aa22.2■■□□□ 1.15
HOXB6-201ENST00000225648 MAD2L2Q9UI95 211 aa22.2■■□□□ 1.15
HOXB6-201ENST00000225648 PALM3A6NDB9 673 aaPredicted RBP22.2■■□□□ 1.14
HOXB6-201ENST00000225648 SLC25A27O95847 323 aa22.2■■□□□ 1.14
HOXB6-201ENST00000225648 MORN1Q5T089 497 aa22.2■■□□□ 1.14
HOXB6-201ENST00000225648 SGMS1Q86VZ5 419 aa22.2■■□□□ 1.14
HOXB6-201ENST00000225648 RANBP17Q9H2T7 1088 aaKnown RBP22.2■■□□□ 1.14
HOXB6-201ENST00000225648 HPS5Q9UPZ3 1129 aa22.2■■□□□ 1.14
HOXB6-201ENST00000225648 EIF5BO60841 1220 aaKnown RBP22.19■■□□□ 1.14
HOXB6-201ENST00000225648 PTPREP23469 700 aa22.19■■□□□ 1.14
HOXB6-201ENST00000225648 IRF5Q13568 498 aa22.19■■□□□ 1.14
HOXB6-201ENST00000225648 GRM4Q14833 912 aa22.19■■□□□ 1.14
HOXB6-201ENST00000225648 SNRNP48Q6IEG0 339 aaKnown RBP22.19■■□□□ 1.14
HOXB6-201ENST00000225648 CATIPQ7Z7H3 387 aa22.19■■□□□ 1.14
HOXB6-201ENST00000225648 NCAPG2Q86XI2 1143 aa22.19■■□□□ 1.14
HOXB6-201ENST00000225648 ZNF654Q8IZM8 581 aa22.19■■□□□ 1.14
HOXB6-201ENST00000225648 PSMA5P28066 241 aa22.18■■□□□ 1.14
HOXB6-201ENST00000225648 WDR78Q5VTH9 848 aa22.18■■□□□ 1.14
HOXB6-201ENST00000225648 BLOC1S2Q6QNY1 142 aa22.18■■□□□ 1.14
HOXB6-201ENST00000225648 AGBL1Q96MI9 1066 aa22.18■■□□□ 1.14
HOXB6-201ENST00000225648 MYL10Q9BUA6 226 aa22.18■■□□□ 1.14
HOXB6-201ENST00000225648 ZSWIM6Q9HCJ5 1215 aa22.18■■□□□ 1.14
HOXB6-201ENST00000225648 STRNO43815 780 aa22.17■■□□□ 1.14
HOXB6-201ENST00000225648 CASTP20810 708 aaKnown RBP22.17■■□□□ 1.14
HOXB6-201ENST00000225648 RPS6KB1P23443 525 aa22.17■■□□□ 1.14
HOXB6-201ENST00000225648 GRB14Q14449 540 aa22.17■■□□□ 1.14
HOXB6-201ENST00000225648 ABHD8Q96I13 439 aa22.17■■□□□ 1.14
HOXB6-201ENST00000225648 MAP3K14Q99558 947 aa22.17■■□□□ 1.14
HOXB6-201ENST00000225648 TM6SF1Q9BZW5 370 aa22.17■■□□□ 1.14
HOXB6-201ENST00000225648 CTDP1Q9Y5B0 961 aaPredicted RBP22.17■■□□□ 1.14
HOXB6-201ENST00000225648 CCDC69A6NI79 296 aa22.17■■□□□ 1.14
HOXB6-201ENST00000225648 SLC15A5A6NIM6 579 aa22.17■■□□□ 1.14
HOXB6-201ENST00000225648 KLRF2D3W0D1 207 aa22.17■■□□□ 1.14
HOXB6-201ENST00000225648 DDAH1O94760 285 aa22.17■■□□□ 1.14
HOXB6-201ENST00000225648 SLC35G1Q2M3R5 365 aa22.17■■□□□ 1.14
HOXB6-201ENST00000225648 NFXL1Q6ZNB6 911 aa22.17■■□□□ 1.14
HOXB6-201ENST00000225648 ADGRF4Q8IZF3 695 aa22.17■■□□□ 1.14
HOXB6-201ENST00000225648 FBXL16Q8N461 479 aa22.17■■□□□ 1.14
HOXB6-201ENST00000225648 RAET1EQ8TD07 263 aa22.17■■□□□ 1.14
HOXB6-201ENST00000225648 SOCS4Q8WXH5 440 aa22.17■■□□□ 1.14
HOXB6-201ENST00000225648 NUDT12Q9BQG2 462 aa22.17■■□□□ 1.14
HOXB6-201ENST00000225648 CCDC174Q6PII3 467 aa22.16■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 73.2 ms