RNA–Protein interactions for RNA: YNL057W

YNL057W, Transcript of Dubious open reading frame, yeast

Gene YNL057W, Length 333 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
YNL057W	YNL057W	ECM9	Q02202	377 aa		4.39	□□□□□ -1.71
YNL057W	YNL057W	RSC4	Q02206	625 aa		4.39	□□□□□ -1.71
YNL057W	YNL057W	YDR132C	Q03900	495 aa		4.39	□□□□□ -1.71
YNL057W	YNL057W	IVY1	Q04934	453 aa		4.39	□□□□□ -1.71
YNL057W	YNL057W	ARP9	Q05123	467 aa		4.39	□□□□□ -1.71
YNL057W	YNL057W	RRP45	Q05636	305 aa	Known RBP	4.39	□□□□□ -1.71
YNL057W	YNL057W	AAD15	Q08361	143 aa		4.39	□□□□□ -1.71
YNL057W	YNL057W	MCA1	Q08601	432 aa		4.39	□□□□□ -1.71
YNL057W	YNL057W	HSP42	Q12329	375 aa		4.39	□□□□□ -1.71
YNL057W	YNL057W	AI5_ALPHA	Q9ZZX1	630 aa		4.39	□□□□□ -1.71
YNL057W	YNL057W	STT4	P37297	1900 aa		4.38	□□□□□ -1.71
YNL057W	YNL057W	RPL7A	P05737	244 aa	Known RBP	4.38	□□□□□ -1.71
YNL057W	YNL057W	URA4	P20051	364 aa		4.38	□□□□□ -1.71
YNL057W	YNL057W	PRI2	P20457	528 aa		4.38	□□□□□ -1.71
YNL057W	YNL057W	SEC62	P21825	274 aa		4.38	□□□□□ -1.71
YNL057W	YNL057W	VPS34	P22543	875 aa		4.38	□□□□□ -1.71
YNL057W	YNL057W	VAN1	P23642	535 aa		4.38	□□□□□ -1.71
YNL057W	YNL057W	PHO84	P25297	587 aa	Known RBP	4.38	□□□□□ -1.71
YNL057W	YNL057W	PET112	P33893	541 aa		4.38	□□□□□ -1.71
YNL057W	YNL057W	KAE1	P36132	386 aa		4.38	□□□□□ -1.71
YNL057W	YNL057W	MRPL37	P36532	105 aa		4.38	□□□□□ -1.71
YNL057W	YNL057W	FTH1	P38310	465 aa		4.38	□□□□□ -1.71
YNL057W	YNL057W	YHR033W	P38690	423 aa		4.38	□□□□□ -1.71
YNL057W	YNL057W	DBP8	P38719	431 aa		4.38	□□□□□ -1.71
YNL057W	YNL057W	RGI2	P40188	164 aa		4.38	□□□□□ -1.71
YNL057W	YNL057W	GND2	P53319	492 aa		4.38	□□□□□ -1.71
YNL057W	YNL057W	NOG2	P53742	486 aa	Known RBP	4.38	□□□□□ -1.71
YNL057W	YNL057W	UME1	Q03010	460 aa		4.38	□□□□□ -1.71
YNL057W	YNL057W	ROT1	Q03691	256 aa		4.38	□□□□□ -1.71
YNL057W	YNL057W	BUD7	Q08754	746 aa		4.38	□□□□□ -1.71
YNL057W	YNL057W	RPL7B	Q12213	244 aa	Known RBP	4.38	□□□□□ -1.71
YNL057W	YNL057W	YLR149C	Q99296	730 aa		4.38	□□□□□ -1.71
YNL057W	YNL057W	FRT1	Q99332	602 aa		4.38	□□□□□ -1.71
YNL057W	YNL057W	YSR3	P23501	404 aa		4.37	□□□□□ -1.71
YNL057W	YNL057W	YSP3	P25036	478 aa		4.37	□□□□□ -1.71
YNL057W	YNL057W	CPR3	P25719	182 aa		4.37	□□□□□ -1.71
YNL057W	YNL057W	MSH1	P25846	959 aa		4.37	□□□□□ -1.71
YNL057W	YNL057W	MRPL9	P31334	269 aa		4.37	□□□□□ -1.71
YNL057W	YNL057W	NIP1	P32497	812 aa	Known RBP	4.37	□□□□□ -1.71
YNL057W	YNL057W	PET127	P32606	800 aa		4.37	□□□□□ -1.71
YNL057W	YNL057W	GDA1	P32621	518 aa		4.37	□□□□□ -1.71
YNL057W	YNL057W	MIA40	P36046	403 aa		4.37	□□□□□ -1.71
YNL057W	YNL057W	FMP46	P36141	133 aa	Known RBP	4.37	□□□□□ -1.71
YNL057W	YNL057W	GLY1	P37303	387 aa	Known RBP	4.37	□□□□□ -1.71
YNL057W	YNL057W	PHB1	P40961	287 aa		4.37	□□□□□ -1.71
YNL057W	YNL057W	YJL107C	P42947	387 aa		4.37	□□□□□ -1.71
YNL057W	YNL057W	SIW14	P53965	281 aa		4.37	□□□□□ -1.71
YNL057W	YNL057W	SRP1	Q02821	542 aa	Known RBP	4.37	□□□□□ -1.71
YNL057W	YNL057W	ERV41	Q04651	352 aa		4.37	□□□□□ -1.71
YNL057W	YNL057W	DFG5	Q05031	458 aa		4.37	□□□□□ -1.71
YNL057W	YNL057W	ETT1	Q08421	412 aa	Known RBP	4.37	□□□□□ -1.71
YNL057W	YNL057W	DIN7	Q12086	430 aa		4.37	□□□□□ -1.71
YNL057W	YNL057W	MCD1	Q12158	566 aa		4.37	□□□□□ -1.71
YNL057W	YNL057W	PCT1	P13259	424 aa		4.36	□□□□□ -1.71
YNL057W	YNL057W	HEM12	P32347	362 aa	Predicted RBP	4.36	□□□□□ -1.71
YNL057W	YNL057W	PRP18	P33411	251 aa	Predicted RBP	4.36	□□□□□ -1.71
YNL057W	YNL057W	TRM7	P38238	310 aa	Known RBP	4.36	□□□□□ -1.71
YNL057W	YNL057W	GIC1	P38785	314 aa		4.36	□□□□□ -1.71
YNL057W	YNL057W	FLC2	P39719	783 aa		4.36	□□□□□ -1.71
YNL057W	YNL057W	SAW1	P39735	261 aa		4.36	□□□□□ -1.71
YNL057W	YNL057W	VFA1	P40080	203 aa		4.36	□□□□□ -1.71
YNL057W	YNL057W	ALY2	P47029	1046 aa		4.36	□□□□□ -1.71
YNL057W	YNL057W	NNF2	P53253	936 aa		4.36	□□□□□ -1.71
YNL057W	YNL057W	ESF2	P53743	316 aa	Known RBP	4.36	□□□□□ -1.71
YNL057W	YNL057W	NUP100	Q02629	959 aa		4.36	□□□□□ -1.71
YNL057W	YNL057W	CTK1	Q03957	528 aa	Known RBP	4.36	□□□□□ -1.71
YNL057W	YNL057W	YET2	Q04210	160 aa		4.36	□□□□□ -1.71
YNL057W	YNL057W	RRN11	Q04712	507 aa		4.36	□□□□□ -1.71
YNL057W	YNL057W	YLR287C	Q05881	355 aa		4.36	□□□□□ -1.71
YNL057W	YNL057W	YLR001C	Q07895	862 aa		4.36	□□□□□ -1.71
YNL057W	YNL057W	GFA1	P14742	717 aa	Known RBP	4.35	□□□□□ -1.71
YNL057W	YNL057W	SEC23	P15303	768 aa	Known RBP	4.35	□□□□□ -1.71
YNL057W	YNL057W	ADH7	P25377	361 aa		4.35	□□□□□ -1.71
YNL057W	YNL057W	NAM9	P27929	486 aa		4.35	□□□□□ -1.71
YNL057W	YNL057W	MSP1	P28737	362 aa		4.35	□□□□□ -1.71
YNL057W	YNL057W	DBF4	P32325	704 aa		4.35	□□□□□ -1.71
YNL057W	YNL057W	IMP3	P32899	183 aa	Predicted RBP	4.35	□□□□□ -1.71
YNL057W	YNL057W	CTF13	P35203	478 aa		4.35	□□□□□ -1.71
YNL057W	YNL057W	DEF1	P35732	738 aa	Known RBP	4.35	□□□□□ -1.71
YNL057W	YNL057W	MRPL15	P36523	253 aa		4.35	□□□□□ -1.71
YNL057W	YNL057W	YBP1	P38315	674 aa		4.35	□□□□□ -1.71
YNL057W	YNL057W	PLB1	P39105	664 aa		4.35	□□□□□ -1.71
YNL057W	YNL057W	YAT2	P40017	923 aa		4.35	□□□□□ -1.71
YNL057W	YNL057W	ALA1	P40825	983 aa	Known RBP	4.35	□□□□□ -1.71
YNL057W	YNL057W	SCW11	P53189	542 aa		4.35	□□□□□ -1.71
YNL057W	YNL057W	YNR021W	P53723	404 aa	Known RBP	4.35	□□□□□ -1.71
YNL057W	YNL057W	ZRG17	P53735	605 aa		4.35	□□□□□ -1.71
YNL057W	YNL057W	CCE1	Q03702	353 aa		4.35	□□□□□ -1.71
YNL057W	YNL057W	YDR278C	Q05612	105 aa		4.35	□□□□□ -1.71
YNL057W	YNL057W	THI7	Q05998	598 aa		4.35	□□□□□ -1.71
YNL057W	YNL057W	ESC2	Q06340	456 aa		4.35	□□□□□ -1.71
YNL057W	YNL057W	REH1	Q06709	432 aa		4.35	□□□□□ -1.71
YNL057W	YNL057W	NRT1	Q08485	598 aa		4.35	□□□□□ -1.71
YNL057W	YNL057W	CMR1	Q12510	522 aa	Known RBP	4.35	□□□□□ -1.71
YNL057W	YNL057W	MDM35	O60200	86 aa		4.34	□□□□□ -1.71
YNL057W	YNL057W	SEM1	O94742	89 aa		4.34	□□□□□ -1.71
YNL057W	YNL057W	SLY1	P22213	666 aa		4.34	□□□□□ -1.71
YNL057W	YNL057W	RSC6	P25632	483 aa		4.34	□□□□□ -1.71
YNL057W	YNL057W	MEI5	P32489	222 aa		4.34	□□□□□ -1.71
YNL057W	YNL057W	UTR2	P32623	467 aa		4.34	□□□□□ -1.71

Retrieved 100 of 5,963 RNA–protein pairs in 13.2 ms