RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000640499.1

VEGFA-231, Transcript of vascular endothelial growth factor A, human

APPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC

Gene VEGFA, Length 1,188 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Nucleus, Ribosome .

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RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
VEGFA-231	ENST00000640499	TMEM47	Q9BQJ4	181 aa		31.51	■■■□□ 2.63
VEGFA-231	ENST00000640499	SRRD	Q9UH36	339 aa		31.51	■■■□□ 2.63
VEGFA-231	ENST00000640499	GABRQ	Q9UN88	632 aa		31.51	■■■□□ 2.63
VEGFA-231	ENST00000640499	GNRH1	P01148	92 aa		31.5	■■■□□ 2.63
VEGFA-231	ENST00000640499	ARHGEF6	Q15052	776 aa		31.5	■■■□□ 2.63
VEGFA-231	ENST00000640499	PORCN	Q9H237	461 aa		31.5	■■■□□ 2.63
VEGFA-231	ENST00000640499	PTCH2	Q9Y6C5	1203 aa		31.5	■■■□□ 2.63
VEGFA-231	ENST00000640499	NECTIN1	Q15223	517 aa		31.49	■■■□□ 2.63
VEGFA-231	ENST00000640499	KIAA1211	Q6ZU35	1233 aa		31.49	■■■□□ 2.63
VEGFA-231	ENST00000640499	ANO2	Q9NQ90	1003 aa		31.49	■■■□□ 2.63
VEGFA-231	ENST00000640499	MYPN	Q86TC9	1320 aa		31.49	■■■□□ 2.63
VEGFA-231	ENST00000640499	PRKCZ	Q05513	592 aa		31.48	■■■□□ 2.63
VEGFA-231	ENST00000640499	PPP4R3B	Q5MIZ7	849 aa		31.48	■■■□□ 2.63
VEGFA-231	ENST00000640499	CYB5R4	Q7L1T6	521 aa		31.48	■■■□□ 2.63
VEGFA-231	ENST00000640499	CHMP4C	Q96CF2	233 aa		31.48	■■■□□ 2.63
VEGFA-231	ENST00000640499	KRT23	Q9C075	422 aa		31.48	■■■□□ 2.63
VEGFA-231	ENST00000640499	PPP1R9A	Q9ULJ8	1098 aa		31.48	■■■□□ 2.63
VEGFA-231	ENST00000640499	PLXNB2	O15031	1838 aa		31.47	■■■□□ 2.63
VEGFA-231	ENST00000640499		E7EWF7	191 aa		31.47	■■■□□ 2.63
VEGFA-231	ENST00000640499	MCC	P23508	829 aa		31.47	■■■□□ 2.63
VEGFA-231	ENST00000640499	NT5C2	P49902	561 aa		31.47	■■■□□ 2.63
VEGFA-231	ENST00000640499	GMCL1	Q96IK5	515 aa		31.47	■■■□□ 2.63
VEGFA-231	ENST00000640499	TTC14	Q96N46	770 aa		31.47	■■■□□ 2.63
VEGFA-231	ENST00000640499	GJD2	Q9UKL4	321 aa		31.47	■■■□□ 2.63
VEGFA-231	ENST00000640499	TNPO2	O14787	897 aa	Known RBP	31.46	■■■□□ 2.63
VEGFA-231	ENST00000640499	TOP1	P11387	765 aa	Known RBP	31.46	■■■□□ 2.63
VEGFA-231	ENST00000640499	COL9A3	Q14050	684 aa	Predicted RBP	31.46	■■■□□ 2.63
VEGFA-231	ENST00000640499	REPS2	Q8NFH8	660 aa		31.46	■■■□□ 2.63
VEGFA-231	ENST00000640499	ANKS1A	Q92625	1134 aa		31.46	■■■□□ 2.63
VEGFA-231	ENST00000640499	CNNM2	Q9H8M5	875 aa		31.46	■■■□□ 2.63
VEGFA-231	ENST00000640499	COL11A1	P12107	1806 aa	Predicted RBP	31.46	■■■□□ 2.63
VEGFA-231	ENST00000640499	BMP3	P12645	472 aa		31.45	■■■□□ 2.63
VEGFA-231	ENST00000640499	TMEM132B	Q14DG7	1078 aa		31.45	■■■□□ 2.63
VEGFA-231	ENST00000640499	SAMD1	Q6SPF0	538 aa	Predicted RBP	31.45	■■■□□ 2.63
VEGFA-231	ENST00000640499	VWA5A	O00534	786 aa		31.44	■■■□□ 2.62
VEGFA-231	ENST00000640499	SLC27A2	O14975	620 aa		31.44	■■■□□ 2.62
VEGFA-231	ENST00000640499	PRMT2	P55345	433 aa		31.44	■■■□□ 2.62
VEGFA-231	ENST00000640499	DGKH	Q86XP1	1220 aa		31.44	■■■□□ 2.62
VEGFA-231	ENST00000640499	ENAH	Q8N8S7	591 aa	Predicted RBP	31.44	■■■□□ 2.62
VEGFA-231	ENST00000640499	ZSCAN10	Q96SZ4	725 aa	Predicted RBP	31.44	■■■□□ 2.62
VEGFA-231	ENST00000640499	SLF1	Q9BQI6	1058 aa		31.44	■■■□□ 2.62
VEGFA-231	ENST00000640499	CENPF	P49454	3210 aa		31.44	■■■□□ 2.62
VEGFA-231	ENST00000640499	HOXD10	P28358	340 aa		31.43	■■■□□ 2.62
VEGFA-231	ENST00000640499	FLT3LG	P49771	235 aa		31.43	■■■□□ 2.62
VEGFA-231	ENST00000640499	CREB3L3	Q68CJ9	461 aa		31.43	■■■□□ 2.62
VEGFA-231	ENST00000640499	CASC1	Q6TDU7	716 aa		31.43	■■■□□ 2.62
VEGFA-231	ENST00000640499	MOV10L1	Q9BXT6	1211 aa	Known RBP	31.43	■■■□□ 2.62
VEGFA-231	ENST00000640499	SLC1A4	P43007	532 aa		31.42	■■■□□ 2.62
VEGFA-231	ENST00000640499	SEC23A	Q15436	765 aa		31.42	■■■□□ 2.62
VEGFA-231	ENST00000640499	MB21D1	Q8N884	522 aa		31.42	■■■□□ 2.62
VEGFA-231	ENST00000640499	SPATC1L	Q9H0A9	340 aa		31.42	■■■□□ 2.62
VEGFA-231	ENST00000640499	FEM1B	Q9UK73	627 aa		31.42	■■■□□ 2.62
VEGFA-231	ENST00000640499	MTMR7	Q9Y216	660 aa		31.42	■■■□□ 2.62
VEGFA-231	ENST00000640499	KCTD1	Q719H9	257 aa		31.41	■■■□□ 2.62
VEGFA-231	ENST00000640499	IQCA1	Q86XH1	822 aa		31.41	■■■□□ 2.62
VEGFA-231	ENST00000640499	PRPF38A	Q8NAV1	312 aa	Known RBP	31.41	■■■□□ 2.62
VEGFA-231	ENST00000640499	COA7	Q96BR5	231 aa		31.41	■■■□□ 2.62
VEGFA-231	ENST00000640499	ZNF214	Q9UL59	606 aa	Predicted RBP	31.41	■■■□□ 2.62
VEGFA-231	ENST00000640499	TNKS	O95271	1327 aa		31.41	■■■□□ 2.62
VEGFA-231	ENST00000640499	TMEM232	C9JQI7	657 aa		31.4	■■■□□ 2.62
VEGFA-231	ENST00000640499	MAPK4	P31152	587 aa		31.4	■■■□□ 2.62
VEGFA-231	ENST00000640499	ANTXR2	P58335	489 aa		31.4	■■■□□ 2.62
VEGFA-231	ENST00000640499	GPR142	Q7Z601	462 aa		31.4	■■■□□ 2.62
VEGFA-231	ENST00000640499	MB21D2	Q8IYB1	491 aa	Predicted RBP	31.4	■■■□□ 2.62
VEGFA-231	ENST00000640499	SNHG28	P0DPA3	235 aa		31.39	■■■□□ 2.62
VEGFA-231	ENST00000640499	PDHB	P11177	359 aa		31.39	■■■□□ 2.62
VEGFA-231	ENST00000640499	TTBK2	Q6IQ55	1244 aa		31.39	■■■□□ 2.62
VEGFA-231	ENST00000640499	NCOA7	Q8NI08	942 aa		31.39	■■■□□ 2.62
VEGFA-231	ENST00000640499	DCAF4	Q8WV16	495 aa		31.39	■■■□□ 2.62
VEGFA-231	ENST00000640499	USP6NL	Q92738	828 aa		31.39	■■■□□ 2.62
VEGFA-231	ENST00000640499	KIFC2	Q96AC6	838 aa		31.39	■■■□□ 2.62
VEGFA-231	ENST00000640499	ARMC5	Q96C12	935 aa		31.39	■■■□□ 2.62
VEGFA-231	ENST00000640499	CCNA1	P78396	465 aa		31.38	■■■□□ 2.61
VEGFA-231	ENST00000640499	IRF5	Q13568	498 aa		31.38	■■■□□ 2.61
VEGFA-231	ENST00000640499	MORN1	Q5T089	497 aa		31.38	■■■□□ 2.61
VEGFA-231	ENST00000640499	PLEKHH3	Q7Z736	793 aa		31.38	■■■□□ 2.61
VEGFA-231	ENST00000640499	SH3TC2	Q8TF17	1288 aa		31.38	■■■□□ 2.61
VEGFA-231	ENST00000640499	SENP2	Q9HC62	589 aa		31.38	■■■□□ 2.61
VEGFA-231	ENST00000640499	CCDC85C	A6NKD9	419 aa		31.37	■■■□□ 2.61
VEGFA-231	ENST00000640499	PLA2G6	O60733	806 aa		31.37	■■■□□ 2.61
VEGFA-231	ENST00000640499	TRDN	Q13061	729 aa		31.37	■■■□□ 2.61
VEGFA-231	ENST00000640499	CCDC178	Q5BJE1	867 aa		31.37	■■■□□ 2.61
VEGFA-231	ENST00000640499	CHST3	Q7LGC8	479 aa		31.37	■■■□□ 2.61
VEGFA-231	ENST00000640499	RASEF	Q8IZ41	740 aa		31.37	■■■□□ 2.61
VEGFA-231	ENST00000640499	RAET1E	Q8TD07	263 aa		31.37	■■■□□ 2.61
VEGFA-231	ENST00000640499	SLC38A10	Q9HBR0	1119 aa		31.37	■■■□□ 2.61
VEGFA-231	ENST00000640499	FRMPD2	Q68DX3	1309 aa	Predicted RBP	31.36	■■■□□ 2.61
VEGFA-231	ENST00000640499	ERCC3	P19447	782 aa		31.36	■■■□□ 2.61
VEGFA-231	ENST00000640499	PLS1	Q14651	629 aa		31.36	■■■□□ 2.61
VEGFA-231	ENST00000640499	SHCBP1	Q8NEM2	672 aa		31.36	■■■□□ 2.61
VEGFA-231	ENST00000640499	CAPN15	O75808	1086 aa		31.35	■■■□□ 2.61
VEGFA-231	ENST00000640499	STAT2	P52630	851 aa		31.35	■■■□□ 2.61
VEGFA-231	ENST00000640499	PNMA1	Q8ND90	353 aa		31.35	■■■□□ 2.61
VEGFA-231	ENST00000640499	UBAC1	Q9BSL1	405 aa		31.35	■■■□□ 2.61
VEGFA-231	ENST00000640499	PTPRE	P23469	700 aa		31.34	■■■□□ 2.61
VEGFA-231	ENST00000640499	STAT3	P40763	770 aa		31.34	■■■□□ 2.61
VEGFA-231	ENST00000640499	SLC9C1	Q4G0N8	1177 aa		31.34	■■■□□ 2.61
VEGFA-231	ENST00000640499	BTNL9	Q6UXG8	535 aa		31.34	■■■□□ 2.61
VEGFA-231	ENST00000640499	FAM160B2	Q86V87	743 aa		31.34	■■■□□ 2.61
VEGFA-231	ENST00000640499	CHURC1	Q8WUH1	139 aa		31.34	■■■□□ 2.61

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