RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000615445.4

PTPRJ-208, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type J, humanhuman

APPRIS ALT2 TSL 5 BASIC

Gene PTPRJ, Length 4,773 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Endoplasmic reticulum, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRJ-208ENST00000615445 TRIML1Q8N9V2 468 aa23.01■■□□□ 1.27
PTPRJ-208ENST00000615445 FMNL1O95466 1100 aaPredicted RBP23■■□□□ 1.27
PTPRJ-208ENST00000615445 PCDHB13Q9Y5F0 798 aa23■■□□□ 1.27
PTPRJ-208ENST00000615445 CYP2D7A0A087X1C5 515 aa23■■□□□ 1.27
PTPRJ-208ENST00000615445 KLHL30Q0D2K2 578 aa23■■□□□ 1.27
PTPRJ-208ENST00000615445 DIXDC1Q155Q3 683 aa23■■□□□ 1.27
PTPRJ-208ENST00000615445 SECISBP2LQ93073 1101 aaKnown RBP23■■□□□ 1.27
PTPRJ-208ENST00000615445 TMEM232C9JQI7 657 aa23■■□□□ 1.27
PTPRJ-208ENST00000615445 CLEC4GQ6UXB4 293 aa23■■□□□ 1.27
PTPRJ-208ENST00000615445 ATRIPQ8WXE1 791 aa23■■□□□ 1.27
PTPRJ-208ENST00000615445 CCDC17Q96LX7 622 aa23■■□□□ 1.27
PTPRJ-208ENST00000615445 POLR3EQ9NVU0 708 aa23■■□□□ 1.27
PTPRJ-208ENST00000615445 USP31Q70CQ4 1352 aa23■■□□□ 1.27
PTPRJ-208ENST00000615445 TLDC2A0PJX2 215 aa23■■□□□ 1.27
PTPRJ-208ENST00000615445 KIF23Q02241 960 aaPredicted RBP23■■□□□ 1.27
PTPRJ-208ENST00000615445 SLFNL1Q499Z3 407 aa23■■□□□ 1.27
PTPRJ-208ENST00000615445 ABCA6Q8N139 1617 aa22.99■■□□□ 1.27
PTPRJ-208ENST00000615445 SH2B2O14492 632 aaPredicted RBP22.99■■□□□ 1.27
PTPRJ-208ENST00000615445 LRMPQ12912 555 aa22.99■■□□□ 1.27
PTPRJ-208ENST00000615445 NLRX1Q86UT6 975 aa22.99■■□□□ 1.27
PTPRJ-208ENST00000615445 ABCB5Q2M3G0 1257 aa22.99■■□□□ 1.27
PTPRJ-208ENST00000615445 CCDC25Q86WR0 208 aa22.99■■□□□ 1.27
PTPRJ-208ENST00000615445 MYOCDQ8IZQ8 938 aa22.99■■□□□ 1.27
PTPRJ-208ENST00000615445 RDH13Q8NBN7 331 aa22.99■■□□□ 1.27
PTPRJ-208ENST00000615445 NOX5Q96PH1 765 aa22.99■■□□□ 1.27
PTPRJ-208ENST00000615445 DBNDD1Q9H9R9 158 aa22.99■■□□□ 1.27
PTPRJ-208ENST00000615445 IFNAR1P17181 557 aa22.99■■□□□ 1.27
PTPRJ-208ENST00000615445 KRT27Q7Z3Y8 459 aa22.99■■□□□ 1.27
PTPRJ-208ENST00000615445 RASGRP4Q8TDF6 673 aa22.99■■□□□ 1.27
PTPRJ-208ENST00000615445 GPHNQ9NQX3 736 aaPredicted RBP22.99■■□□□ 1.27
PTPRJ-208ENST00000615445 KCNJ18B7U540 433 aa22.98■■□□□ 1.27
PTPRJ-208ENST00000615445 GTPBP6O43824 516 aaPredicted RBP22.98■■□□□ 1.27
PTPRJ-208ENST00000615445 KCNJ12Q14500 433 aa22.98■■□□□ 1.27
PTPRJ-208ENST00000615445 RRAGAQ7L523 313 aa22.98■■□□□ 1.27
PTPRJ-208ENST00000615445 BSDC1Q9NW68 430 aaPredicted RBP22.98■■□□□ 1.27
PTPRJ-208ENST00000615445 TULP4Q9NRJ4 1543 aa22.98■■□□□ 1.27
PTPRJ-208ENST00000615445 STX10O60499 249 aa22.98■■□□□ 1.27
PTPRJ-208ENST00000615445 IRX3P78415 501 aaPredicted RBP22.98■■□□□ 1.27
PTPRJ-208ENST00000615445 TMC4Q7Z404 712 aa22.98■■□□□ 1.27
PTPRJ-208ENST00000615445 CSRNP2Q9H175 543 aa22.98■■□□□ 1.27
PTPRJ-208ENST00000615445 AZI2Q9H6S1 392 aa22.98■■□□□ 1.27
PTPRJ-208ENST00000615445 SOS2Q07890 1332 aaPredicted RBP22.98■■□□□ 1.27
PTPRJ-208ENST00000615445 NR5A1Q13285 461 aa22.98■■□□□ 1.27
PTPRJ-208ENST00000615445 MORC3Q14149 939 aa22.98■■□□□ 1.27
PTPRJ-208ENST00000615445 PPP1R7Q15435 360 aa22.98■■□□□ 1.27
PTPRJ-208ENST00000615445 USP17L8P0C7I0 530 aa22.98■■□□□ 1.27
PTPRJ-208ENST00000615445 U2AF2P26368 475 aaKnown RBP eCLIP22.98■■□□□ 1.27
PTPRJ-208ENST00000615445 CALCOCO2Q13137 446 aa22.98■■□□□ 1.27
PTPRJ-208ENST00000615445 SEL1L2Q5TEA6 688 aa22.98■■□□□ 1.27
PTPRJ-208ENST00000615445 MCTP2Q6DN12 878 aa22.98■■□□□ 1.27
PTPRJ-208ENST00000615445 DDX25Q9UHL0 483 aaKnown RBP22.98■■□□□ 1.27
PTPRJ-208ENST00000615445 GNL3Q9BVP2 549 aaKnown RBP eCLIP22.97■■□□□ 1.27
PTPRJ-208ENST00000615445 MTRF1LQ9UGC7 380 aaKnown RBP22.97■■□□□ 1.27
PTPRJ-208ENST00000615445 SERPINB13Q9UIV8 391 aa22.97■■□□□ 1.27
PTPRJ-208ENST00000615445 RCOR1Q9UKL0 485 aa22.97■■□□□ 1.27
PTPRJ-208ENST00000615445 TESPA1A2RU30 521 aaPredicted RBP22.97■■□□□ 1.27
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PTPRJ-208ENST00000615445 MRPL11Q9Y3B7 192 aaKnown RBP22.97■■□□□ 1.27
PTPRJ-208ENST00000615445 E9PCH4 1651 aa22.97■■□□□ 1.27
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PTPRJ-208ENST00000615445 OR8K1Q8NGG5 319 aa22.97■■□□□ 1.27
PTPRJ-208ENST00000615445 STRBPQ96SI9 672 aaKnown RBP22.97■■□□□ 1.27
PTPRJ-208ENST00000615445 PSMB7Q99436 277 aa22.97■■□□□ 1.27
PTPRJ-208ENST00000615445 LRRC7Q96NW7 1537 aa22.97■■□□□ 1.27
PTPRJ-208ENST00000615445 DNAJC21Q5F1R6 531 aaKnown RBP22.97■■□□□ 1.27
PTPRJ-208ENST00000615445 SEPT12Q8IYM1 358 aa22.97■■□□□ 1.27
PTPRJ-208ENST00000615445 LINC00301Q8NCQ3 95 aa22.97■■□□□ 1.27
PTPRJ-208ENST00000615445 PPP1R14CQ8TAE6 165 aa22.97■■□□□ 1.27
PTPRJ-208ENST00000615445 ZFP91Q96JP5 570 aaPredicted RBP22.97■■□□□ 1.27
PTPRJ-208ENST00000615445 SMIM23A6NLE4 172 aa22.96■■□□□ 1.27
PTPRJ-208ENST00000615445 PPP6R2O75170 966 aa22.96■■□□□ 1.27
PTPRJ-208ENST00000615445 POLR2MP0CAP2 368 aa22.96■■□□□ 1.27
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PTPRJ-208ENST00000615445 CROCC2H7BZ55 1655 aa22.96■■□□□ 1.27
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PTPRJ-208ENST00000615445 CAPN2P17655 700 aa22.96■■□□□ 1.27
PTPRJ-208ENST00000615445 LIFRP42702 1097 aa22.96■■□□□ 1.27
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PTPRJ-208ENST00000615445 EEF2KMTQ96G04 330 aa22.96■■□□□ 1.27
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PTPRJ-208ENST00000615445 TUBB2AQ13885 445 aa22.96■■□□□ 1.27
PTPRJ-208ENST00000615445 TYW1BQ6NUM6 668 aa22.96■■□□□ 1.27
PTPRJ-208ENST00000615445 SPICE1Q8N0Z3 855 aa22.96■■□□□ 1.27
PTPRJ-208ENST00000615445 MRFAP1L1Q96HT8 127 aa22.96■■□□□ 1.27
PTPRJ-208ENST00000615445 AIFM3Q96NN9 605 aa22.96■■□□□ 1.27
PTPRJ-208ENST00000615445 TUBB2BQ9BVA1 445 aa22.96■■□□□ 1.27
PTPRJ-208ENST00000615445 ZHX1Q9UKY1 873 aaPredicted RBP22.96■■□□□ 1.27
PTPRJ-208ENST00000615445 CSRNP1Q96S65 589 aa22.96■■□□□ 1.27
PTPRJ-208ENST00000615445 COMMD10Q9Y6G5 202 aa22.96■■□□□ 1.27
PTPRJ-208ENST00000615445 RPS6KA4O75676 772 aa22.95■■□□□ 1.26
PTPRJ-208ENST00000615445 SFMBT2Q5VUG0 894 aa22.95■■□□□ 1.26
PTPRJ-208ENST00000615445 C8orf74Q6P047 294 aa22.95■■□□□ 1.26
PTPRJ-208ENST00000615445 RPN1P04843 607 aaKnown RBP22.95■■□□□ 1.26
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