RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000567147.5

RNPS1-222, Transcript of RNA binding protein with serine rich domain 1, humanhuman

TSL 3 BASIC

Gene RNPS1, Length 830 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNPS1-222ENST00000567147 COG2Q14746 738 aa20.9■□□□□ 0.94
RNPS1-222ENST00000567147 ZMYM1Q5SVZ6 1142 aa20.9■□□□□ 0.94
RNPS1-222ENST00000567147 EPB41L4AQ9HCS5 686 aaPredicted RBP20.9■□□□□ 0.94
RNPS1-222ENST00000567147 HOXC10Q9NYD6 342 aa20.9■□□□□ 0.94
RNPS1-222ENST00000567147 SUPT16HQ9Y5B9 1047 aaKnown RBP20.9■□□□□ 0.94
RNPS1-222ENST00000567147 IGHDP01880 384 aa20.89■□□□□ 0.93
RNPS1-222ENST00000567147 EEF2P13639 858 aaKnown RBP20.89■□□□□ 0.93
RNPS1-222ENST00000567147 ATP2B2Q01814 1243 aa20.89■□□□□ 0.93
RNPS1-222ENST00000567147 B4GALNT3Q6L9W6 998 aa20.89■□□□□ 0.93
RNPS1-222ENST00000567147 LBX2Q6XYB7 198 aa20.89■□□□□ 0.93
RNPS1-222ENST00000567147 SMC5Q8IY18 1101 aa20.89■□□□□ 0.93
RNPS1-222ENST00000567147 IFNL3Q8IZI9 196 aa20.89■□□□□ 0.93
RNPS1-222ENST00000567147 LPAR1Q92633 364 aa20.89■□□□□ 0.93
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RNPS1-222ENST00000567147 LNPKQ9C0E8 428 aa20.89■□□□□ 0.93
RNPS1-222ENST00000567147 SH2D4AQ9H788 454 aa20.89■□□□□ 0.93
RNPS1-222ENST00000567147 MKNK2Q9HBH9 465 aa20.89■□□□□ 0.93
RNPS1-222ENST00000567147 LTBP2Q14767 1821 aa20.88■□□□□ 0.93
RNPS1-222ENST00000567147 PRUNE2Q8WUY3 3088 aa20.88■□□□□ 0.93
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RNPS1-222ENST00000567147 GNL3Q9BVP2 549 aaKnown RBP eCLIP20.88■□□□□ 0.93
RNPS1-222ENST00000567147 NACAP1Q9BZK3 213 aa20.88■□□□□ 0.93
RNPS1-222ENST00000567147 VCPKMTQ9H867 229 aa20.88■□□□□ 0.93
RNPS1-222ENST00000567147 BTBD7Q9P203 1132 aa20.88■□□□□ 0.93
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RNPS1-222ENST00000567147 ATP11BQ9Y2G3 1177 aa20.86■□□□□ 0.93
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RNPS1-222ENST00000567147 GJC2Q5T442 439 aaPredicted RBP20.85■□□□□ 0.93
RNPS1-222ENST00000567147 ZNF444Q8N0Y2 327 aaPredicted RBP20.85■□□□□ 0.93
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RNPS1-222ENST00000567147 CDX2Q99626 313 aaPredicted RBP20.85■□□□□ 0.93
RNPS1-222ENST00000567147 ZNF287Q9HBT7 754 aa20.85■□□□□ 0.93
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RNPS1-222ENST00000567147 PRDM1O75626 825 aa20.84■□□□□ 0.93
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RNPS1-222ENST00000567147 NUCB1Q02818 461 aa20.84■□□□□ 0.93
RNPS1-222ENST00000567147 C9orf50Q5SZB4 431 aa20.84■□□□□ 0.93
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RNPS1-222ENST00000567147 CCDC129Q6ZRS4 1044 aa20.84■□□□□ 0.93
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RNPS1-222ENST00000567147 RAD21O60216 631 aa20.83■□□□□ 0.93
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RNPS1-222ENST00000567147 DNM1LO00429 736 aa20.82■□□□□ 0.92
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RNPS1-222ENST00000567147 SAMD1Q6SPF0 538 aaPredicted RBP20.82■□□□□ 0.92
RNPS1-222ENST00000567147 MAFAQ8NHW3 353 aaPredicted RBP20.82■□□□□ 0.92
RNPS1-222ENST00000567147 MOV10L1Q9BXT6 1211 aaKnown RBP20.82■□□□□ 0.92
RNPS1-222ENST00000567147 SEMA6BQ9H3T3 888 aa20.82■□□□□ 0.92
RNPS1-222ENST00000567147 HELLSQ9NRZ9 838 aa20.82■□□□□ 0.92
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RNPS1-222ENST00000567147 IVNS1ABPQ9Y6Y0 642 aa20.82■□□□□ 0.92
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RNPS1-222ENST00000567147 SPATC1LQ9H0A9 340 aa20.81■□□□□ 0.92
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RNPS1-222ENST00000567147 GRB14Q14449 540 aa20.8■□□□□ 0.92
RNPS1-222ENST00000567147 VPS53Q5VIR6 699 aa20.8■□□□□ 0.92
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RNPS1-222ENST00000567147 F5H6K3 240 aa20.79■□□□□ 0.92
RNPS1-222ENST00000567147 CYBAP13498 195 aa20.79■□□□□ 0.92
RNPS1-222ENST00000567147 KLRC3Q07444 240 aa20.79■□□□□ 0.92
RNPS1-222ENST00000567147 PLS1Q14651 629 aa20.79■□□□□ 0.92
RNPS1-222ENST00000567147 TRIM60Q495X7 471 aa20.79■□□□□ 0.92
RNPS1-222ENST00000567147 MCMDC2Q4G0Z9 681 aa20.79■□□□□ 0.92
RNPS1-222ENST00000567147 FAM83BQ5T0W9 1011 aa20.79■□□□□ 0.92
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