RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000525778.5

SOGA3-203, Transcript of SOGA family member 3, humanhuman

APPRIS P1 TSL 5 BASIC

Gene SOGA3, Length 4,077 nt, Biotype protein coding.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SOGA3-203ENST00000525778 A0A1B0GTH6 734 aa20.12■□□□□ 0.81
SOGA3-203ENST00000525778 MAP2K7O14733 419 aa20.12■□□□□ 0.81
SOGA3-203ENST00000525778 CTNNA1P35221 906 aaKnown RBP20.12■□□□□ 0.81
SOGA3-203ENST00000525778 CLTAP09496 248 aa20.12■□□□□ 0.81
SOGA3-203ENST00000525778 ZNF654Q8IZM8 581 aa20.12■□□□□ 0.81
SOGA3-203ENST00000525778 FOXP1Q9H334 677 aaPredicted RBP20.12■□□□□ 0.81
SOGA3-203ENST00000525778 NR1D1P20393 614 aa20.11■□□□□ 0.81
SOGA3-203ENST00000525778 KIF5BP33176 963 aa20.11■□□□□ 0.81
SOGA3-203ENST00000525778 AKNAD1Q5T1N1 836 aa20.11■□□□□ 0.81
SOGA3-203ENST00000525778 ZFYVE27Q5T4F4 411 aa20.11■□□□□ 0.81
SOGA3-203ENST00000525778 FANCBQ8NB91 859 aa20.11■□□□□ 0.81
SOGA3-203ENST00000525778 TACO1Q9BSH4 297 aaKnown RBP20.11■□□□□ 0.81
SOGA3-203ENST00000525778 NLRC4Q9NPP4 1024 aa20.11■□□□□ 0.81
SOGA3-203ENST00000525778 LRWD1Q9UFC0 647 aa20.11■□□□□ 0.81
SOGA3-203ENST00000525778 SIRT1Q96EB6 747 aa20.11■□□□□ 0.81
SOGA3-203ENST00000525778 NSRP1Q9H0G5 558 aaKnown RBP20.11■□□□□ 0.81
SOGA3-203ENST00000525778 SLC24A3Q9HC58 644 aa20.11■□□□□ 0.81
SOGA3-203ENST00000525778 CEP104O60308 925 aa20.11■□□□□ 0.81
SOGA3-203ENST00000525778 HEXIM1O94992 359 aaKnown RBP20.11■□□□□ 0.81
SOGA3-203ENST00000525778 GKAP1Q5VSY0 366 aaPredicted RBP20.11■□□□□ 0.81
SOGA3-203ENST00000525778 SH2B2O14492 632 aaPredicted RBP20.1■□□□□ 0.81
SOGA3-203ENST00000525778 RPN1P04843 607 aaKnown RBP20.1■□□□□ 0.81
SOGA3-203ENST00000525778 KIAA0753Q2KHM9 967 aa20.1■□□□□ 0.81
SOGA3-203ENST00000525778 CD163L1Q9NR16 1453 aa20.1■□□□□ 0.81
SOGA3-203ENST00000525778 GTPBP6O43824 516 aaPredicted RBP20.1■□□□□ 0.81
SOGA3-203ENST00000525778 RAPGEF1Q13905 1077 aa20.1■□□□□ 0.81
SOGA3-203ENST00000525778 IFI16Q16666 785 aaKnown RBP20.1■□□□□ 0.81
SOGA3-203ENST00000525778 PTPROQ16827 1216 aa20.1■□□□□ 0.81
SOGA3-203ENST00000525778 CCDC155Q8N6L0 562 aa20.1■□□□□ 0.81
SOGA3-203ENST00000525778 NEFHP12036 1026 aa20.1■□□□□ 0.81
SOGA3-203ENST00000525778 CDC27P30260 824 aa20.1■□□□□ 0.81
SOGA3-203ENST00000525778 IGHMBP2P38935 993 aaKnown RBP20.1■□□□□ 0.81
SOGA3-203ENST00000525778 USP5P45974 858 aa20.1■□□□□ 0.81
SOGA3-203ENST00000525778 ALS2CLQ60I27 953 aa20.1■□□□□ 0.81
SOGA3-203ENST00000525778 SH2D3CQ8N5H7 860 aa20.1■□□□□ 0.81
SOGA3-203ENST00000525778 KIFC2Q96AC6 838 aa20.1■□□□□ 0.81
SOGA3-203ENST00000525778 TUBGCP2Q9BSJ2 902 aa20.1■□□□□ 0.81
SOGA3-203ENST00000525778 RTL9Q8NET4 1388 aa20.09■□□□□ 0.81
SOGA3-203ENST00000525778 USP32Q8NFA0 1604 aa20.09■□□□□ 0.81
SOGA3-203ENST00000525778 ZNF185O15231 689 aa20.09■□□□□ 0.81
SOGA3-203ENST00000525778 ECM2O94769 699 aaPredicted RBP20.09■□□□□ 0.81
SOGA3-203ENST00000525778 A1BGP04217 495 aa20.09■□□□□ 0.81
SOGA3-203ENST00000525778 ILDR1Q86SU0 546 aaPredicted RBP20.09■□□□□ 0.81
SOGA3-203ENST00000525778 SLC52A2Q9HAB3 445 aa20.09■□□□□ 0.81
SOGA3-203ENST00000525778 VAT1LQ9HCJ6 419 aa20.09■□□□□ 0.81
SOGA3-203ENST00000525778 EXOC5O00471 708 aa20.09■□□□□ 0.81
SOGA3-203ENST00000525778 SLC8A1P32418 973 aa20.09■□□□□ 0.81
SOGA3-203ENST00000525778 SPTY2D1Q68D10 685 aaPredicted RBP20.09■□□□□ 0.81
SOGA3-203ENST00000525778 MB21D2Q8IYB1 491 aaPredicted RBP20.09■□□□□ 0.81
SOGA3-203ENST00000525778 ZNF622Q969S3 477 aaKnown RBP eCLIP20.09■□□□□ 0.81
SOGA3-203ENST00000525778 KRT12Q99456 494 aa20.09■□□□□ 0.81
SOGA3-203ENST00000525778 MKNK2Q9HBH9 465 aa20.09■□□□□ 0.81
SOGA3-203ENST00000525778 NFU1Q9UMS0 254 aa20.09■□□□□ 0.81
SOGA3-203ENST00000525778 TNFRSF11AQ9Y6Q6 616 aaPredicted RBP20.09■□□□□ 0.81
SOGA3-203ENST00000525778 TNRQ92752 1358 aa20.09■□□□□ 0.81
SOGA3-203ENST00000525778 PPRC1Q5VV67 1664 aaKnown RBP20.08■□□□□ 0.81
SOGA3-203ENST00000525778 TTC26A0AVF1 554 aa20.08■□□□□ 0.81
SOGA3-203ENST00000525778 MYO1FO00160 1098 aa20.08■□□□□ 0.81
SOGA3-203ENST00000525778 EIF3HO15372 352 aaKnown RBP eCLIP20.08■□□□□ 0.81
SOGA3-203ENST00000525778 KIF4AO95239 1232 aa20.08■□□□□ 0.81
SOGA3-203ENST00000525778 MOCS3O95396 460 aa20.08■□□□□ 0.81
SOGA3-203ENST00000525778 TCP11X2Q5H9J9 407 aa20.08■□□□□ 0.81
SOGA3-203ENST00000525778 EMBQ6PCB8 327 aa20.08■□□□□ 0.81
SOGA3-203ENST00000525778 USP49Q70CQ1 688 aa20.08■□□□□ 0.81
SOGA3-203ENST00000525778 HEATR3Q7Z4Q2 680 aa20.08■□□□□ 0.81
SOGA3-203ENST00000525778 UBA5Q9GZZ9 404 aa20.08■□□□□ 0.81
SOGA3-203ENST00000525778 NHEJ1Q9H9Q4 299 aaPredicted RBP20.08■□□□□ 0.81
SOGA3-203ENST00000525778 FMNL1O95466 1100 aaPredicted RBP20.08■□□□□ 0.81
SOGA3-203ENST00000525778 CALML3P27482 149 aa20.08■□□□□ 0.81
SOGA3-203ENST00000525778 FNBP4Q8N3X1 1017 aaPredicted RBP20.08■□□□□ 0.81
SOGA3-203ENST00000525778 TCP11Q8WWU5 503 aa20.08■□□□□ 0.81
SOGA3-203ENST00000525778 STRN4Q9NRL3 753 aa20.08■□□□□ 0.81
SOGA3-203ENST00000525778 ADD3Q9UEY8 706 aaKnown RBP20.08■□□□□ 0.81
SOGA3-203ENST00000525778 STIM2Q9P246 746 aa20.08■□□□□ 0.8
SOGA3-203ENST00000525778 IFNAR1P17181 557 aa20.07■□□□□ 0.8
SOGA3-203ENST00000525778 CHRNA2Q15822 529 aa20.07■□□□□ 0.8
SOGA3-203ENST00000525778 RAB21Q9UL25 225 aa20.07■□□□□ 0.8
SOGA3-203ENST00000525778 APBA1Q02410 837 aa20.07■□□□□ 0.8
SOGA3-203ENST00000525778 CCNI2Q6ZMN8 369 aaPredicted RBP20.07■□□□□ 0.8
SOGA3-203ENST00000525778 SWAP70Q9UH65 585 aa20.07■□□□□ 0.8
SOGA3-203ENST00000525778 TFR2Q9UP52 801 aa20.07■□□□□ 0.8
SOGA3-203ENST00000525778 ZC3H13Q5T200 1668 aaKnown RBP20.07■□□□□ 0.8
SOGA3-203ENST00000525778 MEFVO15553 781 aaPredicted RBP20.07■□□□□ 0.8
SOGA3-203ENST00000525778 STARD3NLO95772 234 aa20.07■□□□□ 0.8
SOGA3-203ENST00000525778 GUCY1A3Q02108 690 aa20.07■□□□□ 0.8
SOGA3-203ENST00000525778 TMEM266Q2M3C6 531 aa20.07■□□□□ 0.8
SOGA3-203ENST00000525778 GDAQ9Y2T3 454 aa20.07■□□□□ 0.8
SOGA3-203ENST00000525778 ROBO2Q9HCK4 1378 aa20.07■□□□□ 0.8
SOGA3-203ENST00000525778 GYPCP04921 128 aa20.07■□□□□ 0.8
SOGA3-203ENST00000525778 PPARAQ07869 468 aa20.07■□□□□ 0.8
SOGA3-203ENST00000525778 SLC9C1Q4G0N8 1177 aa20.07■□□□□ 0.8
SOGA3-203ENST00000525778 IFNL3Q8IZI9 196 aa20.07■□□□□ 0.8
SOGA3-203ENST00000525778 RAB34Q9BZG1 259 aa20.07■□□□□ 0.8
SOGA3-203ENST00000525778 ZSWIM5Q9P217 1185 aa20.07■□□□□ 0.8
SOGA3-203ENST00000525778 PDE6AP16499 860 aa20.06■□□□□ 0.8
SOGA3-203ENST00000525778 RASSF7Q02833 373 aa20.06■□□□□ 0.8
SOGA3-203ENST00000525778 HIBCHQ6NVY1 386 aaPredicted RBP20.06■□□□□ 0.8
SOGA3-203ENST00000525778 EIF4ENIF1Q9NRA8 985 aaKnown RBP20.06■□□□□ 0.8
SOGA3-203ENST00000525778 RWDD2AQ9UIY3 292 aa20.06■□□□□ 0.8
SOGA3-203ENST00000525778 CPS1P31327 1500 aa20.06■□□□□ 0.8
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 15.1 ms