RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000492741.5

PSPC1-204, Transcript of paraspeckle component 1, humanhuman

TSL 2

Gene PSPC1, Length 1,709 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PSPC1-204ENST00000492741 VCPKMTQ9H867 229 aa25.6■■□□□ 1.69
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PSPC1-204ENST00000492741 ZNF543Q08ER8 600 aa25.59■■□□□ 1.69
PSPC1-204ENST00000492741 C2orf69Q8N8R5 385 aa25.59■■□□□ 1.69
PSPC1-204ENST00000492741 WDR18Q9BV38 432 aa25.59■■□□□ 1.69
PSPC1-204ENST00000492741 ELP3Q9H9T3 547 aa25.59■■□□□ 1.69
PSPC1-204ENST00000492741 TRIM75PA6NK02 468 aa25.58■■□□□ 1.69
PSPC1-204ENST00000492741 GMCL1Q96IK5 515 aa25.58■■□□□ 1.69
PSPC1-204ENST00000492741 GBA2Q9HCG7 927 aaPredicted RBP25.58■■□□□ 1.69
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PSPC1-204ENST00000492741 ITGBL1O95965 494 aaPredicted RBP25.57■■□□□ 1.68
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PSPC1-204ENST00000492741 KIAA1683Q9H0B3 1180 aa25.57■■□□□ 1.68
PSPC1-204ENST00000492741 BMP3P12645 472 aa25.57■■□□□ 1.68
PSPC1-204ENST00000492741 PDCP20941 246 aa25.57■■□□□ 1.68
PSPC1-204ENST00000492741 USP14P54578 494 aa25.57■■□□□ 1.68
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PSPC1-204ENST00000492741 NUP88Q99567 741 aaPredicted RBP25.57■■□□□ 1.68
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PSPC1-204ENST00000492741 BACE1P56817 501 aa25.55■■□□□ 1.68
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PSPC1-204ENST00000492741 SLC10A4Q96EP9 437 aa25.55■■□□□ 1.68
PSPC1-204ENST00000492741 CPVLQ9H3G5 476 aa25.55■■□□□ 1.68
PSPC1-204ENST00000492741 STK36Q9NRP7 1315 aa25.55■■□□□ 1.68
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PSPC1-204ENST00000492741 KIAA1755Q5JYT7 1200 aa25.54■■□□□ 1.68
PSPC1-204ENST00000492741 LDLRAD1Q5T700 205 aa25.54■■□□□ 1.68
PSPC1-204ENST00000492741 ERO1BQ86YB8 467 aa25.54■■□□□ 1.68
PSPC1-204ENST00000492741 CIZ1Q9ULV3 898 aaPredicted RBP25.54■■□□□ 1.68
PSPC1-204ENST00000492741 AFG3L2Q9Y4W6 797 aa25.54■■□□□ 1.68
PSPC1-204ENST00000492741 CNTNAP5Q8WYK1 1306 aa25.54■■□□□ 1.68
PSPC1-204ENST00000492741 hCG_1642624A0A1W2PR95 340 aa25.54■■□□□ 1.68
PSPC1-204ENST00000492741 C19orf81C9J6K1 198 aa25.54■■□□□ 1.68
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PSPC1-204ENST00000492741 H3BQV1 296 aa25.52■■□□□ 1.68
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PSPC1-204ENST00000492741 RBM27Q9P2N5 1060 aaKnown RBP25.52■■□□□ 1.68
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PSPC1-204ENST00000492741 OPTNQ96CV9 577 aa25.51■■□□□ 1.68
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PSPC1-204ENST00000492741 ADGRF4Q8IZF3 695 aa25.51■■□□□ 1.67
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PSPC1-204ENST00000492741 AIFM3Q96NN9 605 aa25.5■■□□□ 1.67
PSPC1-204ENST00000492741 RIOX1Q9H6W3 641 aa25.5■■□□□ 1.67
PSPC1-204ENST00000492741 PKP1Q13835 747 aa25.49■■□□□ 1.67
PSPC1-204ENST00000492741 SLC35G1Q2M3R5 365 aa25.49■■□□□ 1.67
PSPC1-204ENST00000492741 CHURC1Q8WUH1 139 aa25.49■■□□□ 1.67
PSPC1-204ENST00000492741 IRF6O14896 467 aa25.49■■□□□ 1.67
PSPC1-204ENST00000492741 XBP1P17861 261 aa25.49■■□□□ 1.67
PSPC1-204ENST00000492741 VCAM1P19320 739 aa25.49■■□□□ 1.67
PSPC1-204ENST00000492741 FOXD4L5Q5VV16 416 aaPredicted RBP25.49■■□□□ 1.67
PSPC1-204ENST00000492741 FOXD4L4Q8WXT5 416 aaPredicted RBP25.49■■□□□ 1.67
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