RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000477334.1

RBM39-231, Transcript of RNA binding motif protein 39, human

TSL 2

Gene RBM39, Length 949 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

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RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
RBM39-231	ENST00000477334	MBNL3	Q9NUK0	354 aa	Known RBP	6.62	□□□□□ -1.35
RBM39-231	ENST00000477334	SLC12A7	Q9Y666	1083 aa		6.62	□□□□□ -1.35
RBM39-231	ENST00000477334	FAM155A	B1AL88	458 aa	Predicted RBP	6.61	□□□□□ -1.35
RBM39-231	ENST00000477334	KLF4	O43474	513 aa		6.61	□□□□□ -1.35
RBM39-231	ENST00000477334	TP53	P04637	393 aa	Predicted RBP	6.61	□□□□□ -1.35
RBM39-231	ENST00000477334	KIR3DL1	P43629	444 aa		6.61	□□□□□ -1.35
RBM39-231	ENST00000477334	PMS1	P54277	932 aa	Known RBP	6.61	□□□□□ -1.35
RBM39-231	ENST00000477334	RNF4	P78317	190 aa		6.61	□□□□□ -1.35
RBM39-231	ENST00000477334	TNK2	Q07912	1038 aa		6.61	□□□□□ -1.35
RBM39-231	ENST00000477334	GNPTAB	Q3T906	1256 aa		6.61	□□□□□ -1.35
RBM39-231	ENST00000477334	ANGEL2	Q5VTE6	544 aa	Known RBP	6.61	□□□□□ -1.35
RBM39-231	ENST00000477334	CDKAL1	Q5VV42	579 aa		6.61	□□□□□ -1.35
RBM39-231	ENST00000477334	ATG4D	Q86TL0	474 aa	Predicted RBP	6.61	□□□□□ -1.35
RBM39-231	ENST00000477334	PPFIBP1	Q86W92	1011 aa		6.61	□□□□□ -1.35
RBM39-231	ENST00000477334	SPACA3	Q8IXA5	215 aa		6.61	□□□□□ -1.35
RBM39-231	ENST00000477334	POU5F2	Q8N7G0	328 aa		6.61	□□□□□ -1.35
RBM39-231	ENST00000477334	PMFBP1	Q8TBY8	1022 aa		6.61	□□□□□ -1.35
RBM39-231	ENST00000477334	PI4K2B	Q8TCG2	481 aa		6.61	□□□□□ -1.35
RBM39-231	ENST00000477334	HIRIP3	Q9BW71	556 aa	Predicted RBP	6.61	□□□□□ -1.35
RBM39-231	ENST00000477334	ASPN	Q9BXN1	380 aa		6.61	□□□□□ -1.35
RBM39-231	ENST00000477334	KRTAP4-2	Q9BYR5	136 aa		6.61	□□□□□ -1.35
RBM39-231	ENST00000477334	PHAX	Q9H814	394 aa	Known RBP	6.61	□□□□□ -1.35
RBM39-231	ENST00000477334	ZNF214	Q9UL59	606 aa	Predicted RBP	6.61	□□□□□ -1.35
RBM39-231	ENST00000477334	CAPN6	Q9Y6Q1	641 aa		6.61	□□□□□ -1.35
RBM39-231	ENST00000477334	ZNF865	P0CJ78	1059 aa	Predicted RBP	6.6	□□□□□ -1.35
RBM39-231	ENST00000477334	NKPD1	Q17RQ9	610 aa		6.6	□□□□□ -1.35
RBM39-231	ENST00000477334	VHLL	Q6RSH7	139 aa		6.6	□□□□□ -1.35
RBM39-231	ENST00000477334	CCDC144CP	Q8IYA2	1237 aa		6.6	□□□□□ -1.35
RBM39-231	ENST00000477334	CELF2-AS1	Q8N7Q2	184 aa		6.6	□□□□□ -1.35
RBM39-231	ENST00000477334	DTWD2	Q8NBA8	298 aa		6.6	□□□□□ -1.35
RBM39-231	ENST00000477334	LRRN4CL	Q8ND94	238 aa		6.6	□□□□□ -1.35
RBM39-231	ENST00000477334	MICAL1	Q8TDZ2	1067 aa		6.6	□□□□□ -1.35
RBM39-231	ENST00000477334	ASB11	Q8WXH4	323 aa		6.6	□□□□□ -1.35
RBM39-231	ENST00000477334	ARMC5	Q96C12	935 aa		6.6	□□□□□ -1.35
RBM39-231	ENST00000477334	TRIM55	Q9BYV6	548 aa		6.6	□□□□□ -1.35
RBM39-231	ENST00000477334	ST7	Q9NRC1	585 aa		6.6	□□□□□ -1.35
RBM39-231	ENST00000477334		B2RBV5	119 aa		6.59	□□□□□ -1.35
RBM39-231	ENST00000477334	DDAH1	O94760	285 aa		6.59	□□□□□ -1.35
RBM39-231	ENST00000477334	SLC7A5	Q01650	507 aa		6.59	□□□□□ -1.35
RBM39-231	ENST00000477334	RBL2	Q08999	1139 aa		6.59	□□□□□ -1.35
RBM39-231	ENST00000477334	RAB33A	Q14088	237 aa		6.59	□□□□□ -1.35
RBM39-231	ENST00000477334	NBPF9	Q3BBW0	867 aa		6.59	□□□□□ -1.35
RBM39-231	ENST00000477334	BBS9	Q3SYG4	887 aa		6.59	□□□□□ -1.35
RBM39-231	ENST00000477334	AXDND1	Q5T1B0	1012 aa	Predicted RBP	6.59	□□□□□ -1.35
RBM39-231	ENST00000477334	DCAF15	Q66K64	600 aa		6.59	□□□□□ -1.35
RBM39-231	ENST00000477334	C6orf15	Q6UXA7	325 aa	Predicted RBP	6.59	□□□□□ -1.35
RBM39-231	ENST00000477334	C22orf34	Q6ZV56	151 aa		6.59	□□□□□ -1.35
RBM39-231	ENST00000477334	KLHL6	Q8WZ60	621 aa		6.59	□□□□□ -1.35
RBM39-231	ENST00000477334	UBXN4	Q92575	508 aa		6.59	□□□□□ -1.35
RBM39-231	ENST00000477334	KCNH3	Q9ULD8	1083 aa		6.59	□□□□□ -1.35
RBM39-231	ENST00000477334	CARMIL2	Q6F5E8	1435 aa		6.59	□□□□□ -1.36
RBM39-231	ENST00000477334	CLCN7	P51798	805 aa		6.58	□□□□□ -1.36
RBM39-231	ENST00000477334	SNW1	Q13573	536 aa	Known RBP	6.58	□□□□□ -1.36
RBM39-231	ENST00000477334	AUH	Q13825	339 aa	Known RBP	6.58	□□□□□ -1.36
RBM39-231	ENST00000477334	FXN	Q16595	210 aa		6.58	□□□□□ -1.36
RBM39-231	ENST00000477334	KIAA1211L	Q6NV74	962 aa		6.58	□□□□□ -1.36
RBM39-231	ENST00000477334	SLC23A3	Q6PIS1	610 aa		6.58	□□□□□ -1.36
RBM39-231	ENST00000477334	HSPA12B	Q96MM6	686 aa		6.58	□□□□□ -1.36
RBM39-231	ENST00000477334	FBXL21	Q9UKT6	434 aa		6.58	□□□□□ -1.36
RBM39-231	ENST00000477334	AFDN-AS1	Q9Y6Z5	254 aa	Predicted RBP	6.58	□□□□□ -1.36
RBM39-231	ENST00000477334		H3BS24	57 aa		6.57	□□□□□ -1.36
RBM39-231	ENST00000477334	U2SURP	O15042	1029 aa	Known RBP	6.57	□□□□□ -1.36
RBM39-231	ENST00000477334	IKZF1	Q13422	519 aa		6.57	□□□□□ -1.36
RBM39-231	ENST00000477334	FAM178B	Q8IXR5	827 aa		6.57	□□□□□ -1.36
RBM39-231	ENST00000477334	PIWIL2	Q8TC59	973 aa	Known RBP	6.57	□□□□□ -1.36
RBM39-231	ENST00000477334	FAM168A	Q92567	244 aa		6.57	□□□□□ -1.36
RBM39-231	ENST00000477334	SMARCC1	Q92922	1105 aa	Predicted RBP	6.57	□□□□□ -1.36
RBM39-231	ENST00000477334	PRDM14	Q9GZV8	571 aa		6.57	□□□□□ -1.36
RBM39-231	ENST00000477334	ST14	Q9Y5Y6	855 aa		6.57	□□□□□ -1.36
RBM39-231	ENST00000477334	PITPNM2	Q9BZ72	1349 aa		6.56	□□□□□ -1.36
RBM39-231	ENST00000477334	SHISA3	A0PJX4	238 aa		6.56	□□□□□ -1.36
RBM39-231	ENST00000477334	CCDC85C	A6NKD9	419 aa		6.56	□□□□□ -1.36
RBM39-231	ENST00000477334	WASH4P	A8MWX3	477 aa		6.56	□□□□□ -1.36
RBM39-231	ENST00000477334	GJB6	O95452	261 aa		6.56	□□□□□ -1.36
RBM39-231	ENST00000477334	C8A	P07357	584 aa		6.56	□□□□□ -1.36
RBM39-231	ENST00000477334	DDR2	Q16832	855 aa		6.56	□□□□□ -1.36
RBM39-231	ENST00000477334	TMC3	Q7Z5M5	1100 aa		6.56	□□□□□ -1.36
RBM39-231	ENST00000477334	C7orf61	Q8IZ16	206 aa		6.56	□□□□□ -1.36
RBM39-231	ENST00000477334	HAUS7	Q99871	368 aa		6.56	□□□□□ -1.36
RBM39-231	ENST00000477334	ASCC2	Q9H1I8	757 aa	Predicted RBP	6.56	□□□□□ -1.36
RBM39-231	ENST00000477334	ZSWIM5	Q9P217	1185 aa		6.56	□□□□□ -1.36
RBM39-231	ENST00000477334	PCDHB12	Q9Y5F1	795 aa		6.56	□□□□□ -1.36
RBM39-231	ENST00000477334	SHOX	O15266	292 aa		6.55	□□□□□ -1.36
RBM39-231	ENST00000477334	EPHX1	P07099	455 aa		6.55	□□□□□ -1.36
RBM39-231	ENST00000477334	ZP2	Q05996	745 aa		6.55	□□□□□ -1.36
RBM39-231	ENST00000477334	NMI	Q13287	307 aa	Predicted RBP	6.55	□□□□□ -1.36
RBM39-231	ENST00000477334	NCAPH	Q15003	741 aa		6.55	□□□□□ -1.36
RBM39-231	ENST00000477334	HEATR6	Q6AI08	1181 aa	Known RBP	6.55	□□□□□ -1.36
RBM39-231	ENST00000477334	FLAD1	Q8NFF5	587 aa		6.55	□□□□□ -1.36
RBM39-231	ENST00000477334	UBE2F	Q969M7	185 aa		6.55	□□□□□ -1.36
RBM39-231	ENST00000477334	DUSP15	Q9H1R2	295 aa	Predicted RBP	6.55	□□□□□ -1.36
RBM39-231	ENST00000477334	PRDM7	Q9NQW5	492 aa		6.55	□□□□□ -1.36
RBM39-231	ENST00000477334	SEMA3G	Q9NS98	782 aa		6.55	□□□□□ -1.36
RBM39-231	ENST00000477334	ZNF451	Q9Y4E5	1061 aa		6.55	□□□□□ -1.36
RBM39-231	ENST00000477334	MEIS1	O00470	390 aa		6.54	□□□□□ -1.36
RBM39-231	ENST00000477334	CBFA2T2	O43439	604 aa		6.54	□□□□□ -1.36
RBM39-231	ENST00000477334	IGSF3	O75054	1194 aa		6.54	□□□□□ -1.36
RBM39-231	ENST00000477334	CD247	P20963	164 aa		6.54	□□□□□ -1.36
RBM39-231	ENST00000477334	CLEC16A	Q2KHT3	1053 aa		6.54	□□□□□ -1.36
RBM39-231	ENST00000477334	ANKRD39	Q53RE8	183 aa		6.54	□□□□□ -1.36

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