RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000424082.6

RALGPS1-208, Transcript of Ral GEF with PH domain and SH3 binding motif 1, humanhuman

TSL 2 BASIC

Gene RALGPS1, Length 2,362 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RALGPS1-208ENST00000424082 FXR1P51114 621 aaKnown RBP eCLIP20.71■□□□□ 0.91
RALGPS1-208ENST00000424082 HSP90B2PQ58FF3 399 aa20.71■□□□□ 0.91
RALGPS1-208ENST00000424082 GOLGA6L1Q8N7Z2 621 aa20.71■□□□□ 0.91
RALGPS1-208ENST00000424082 ACRBPQ8NEB7 543 aa20.71■□□□□ 0.91
RALGPS1-208ENST00000424082 UBAC1Q9BSL1 405 aa20.71■□□□□ 0.91
RALGPS1-208ENST00000424082 SLC5A1P13866 664 aa20.71■□□□□ 0.91
RALGPS1-208ENST00000424082 CCT6AP40227 531 aaKnown RBP20.71■□□□□ 0.91
RALGPS1-208ENST00000424082 MKRN1Q9UHC7 482 aaKnown RBP20.71■□□□□ 0.91
RALGPS1-208ENST00000424082 NIP7Q9Y221 180 aaKnown RBP eCLIP20.71■□□□□ 0.91
RALGPS1-208ENST00000424082 MROH5Q6ZUA9 1318 aa20.7■□□□□ 0.91
RALGPS1-208ENST00000424082 DOCK2Q92608 1830 aa20.7■□□□□ 0.9
RALGPS1-208ENST00000424082 FECHP22830 423 aa20.7■□□□□ 0.9
RALGPS1-208ENST00000424082 MAGEA9P43362 315 aa20.7■□□□□ 0.9
RALGPS1-208ENST00000424082 DPYDQ12882 1025 aa20.7■□□□□ 0.9
RALGPS1-208ENST00000424082 CTR9Q6PD62 1173 aa20.7■□□□□ 0.9
RALGPS1-208ENST00000424082 LRRC31Q6UY01 552 aa20.7■□□□□ 0.9
RALGPS1-208ENST00000424082 SH3RF1Q7Z6J0 888 aa20.7■□□□□ 0.9
RALGPS1-208ENST00000424082 RREB1Q92766 1687 aa20.7■□□□□ 0.9
RALGPS1-208ENST00000424082 LRRIQ3A6PVS8 624 aaPredicted RBP20.7■□□□□ 0.9
RALGPS1-208ENST00000424082 PPP1R3GB7ZBB8 358 aa20.7■□□□□ 0.9
RALGPS1-208ENST00000424082 TUBBP07437 444 aa20.7■□□□□ 0.9
RALGPS1-208ENST00000424082 CT47A1Q5JQC4 288 aaPredicted RBP20.7■□□□□ 0.9
RALGPS1-208ENST00000424082 TMTC2Q8N394 836 aa20.7■□□□□ 0.9
RALGPS1-208ENST00000424082 CCDC51Q96ER9 411 aa20.7■□□□□ 0.9
RALGPS1-208ENST00000424082 TNKSO95271 1327 aa20.69■□□□□ 0.9
RALGPS1-208ENST00000424082 PHACTR2O75167 634 aa20.69■□□□□ 0.9
RALGPS1-208ENST00000424082 BCAMP50895 628 aa20.69■□□□□ 0.9
RALGPS1-208ENST00000424082 PKN1Q16512 942 aa20.69■□□□□ 0.9
RALGPS1-208ENST00000424082 CNGA4Q8IV77 575 aa20.69■□□□□ 0.9
RALGPS1-208ENST00000424082 NOA1Q8NC60 698 aaKnown RBP20.69■□□□□ 0.9
RALGPS1-208ENST00000424082 SDR42E1Q8WUS8 393 aa20.69■□□□□ 0.9
RALGPS1-208ENST00000424082 EP400Q96L91 3159 aa20.69■□□□□ 0.9
RALGPS1-208ENST00000424082 MINDY4BA8MYZ0 360 aa20.68■□□□□ 0.9
RALGPS1-208ENST00000424082 PPARAQ07869 468 aa20.68■□□□□ 0.9
RALGPS1-208ENST00000424082 CTAGE1Q96RT6 745 aa20.68■□□□□ 0.9
RALGPS1-208ENST00000424082 RNF26Q9BY78 433 aaPredicted RBP20.68■□□□□ 0.9
RALGPS1-208ENST00000424082 ACBD3Q9H3P7 528 aa20.68■□□□□ 0.9
RALGPS1-208ENST00000424082 MED4Q9NPJ6 270 aa20.68■□□□□ 0.9
RALGPS1-208ENST00000424082 CTNND2Q9UQB3 1225 aa20.68■□□□□ 0.9
RALGPS1-208ENST00000424082 PNPLA7Q6ZV29 1317 aa20.68■□□□□ 0.9
RALGPS1-208ENST00000424082 EIF3CLB5ME19 914 aaKnown RBP20.68■□□□□ 0.9
RALGPS1-208ENST00000424082 GNAT2P19087 354 aa20.68■□□□□ 0.9
RALGPS1-208ENST00000424082 CDC25AP30304 524 aa20.68■□□□□ 0.9
RALGPS1-208ENST00000424082 AKAP17AQ02040 695 aaKnown RBP20.68■□□□□ 0.9
RALGPS1-208ENST00000424082 FILIP1LQ4L180 1135 aa20.68■□□□□ 0.9
RALGPS1-208ENST00000424082 GSDMAQ96QA5 445 aa20.68■□□□□ 0.9
RALGPS1-208ENST00000424082 EIF3CQ99613 913 aaKnown RBP20.68■□□□□ 0.9
RALGPS1-208ENST00000424082 KRT2P35908 639 aa20.67■□□□□ 0.9
RALGPS1-208ENST00000424082 ARHGAP25P42331 645 aa20.67■□□□□ 0.9
RALGPS1-208ENST00000424082 ADGRA1Q86SQ6 560 aa20.67■□□□□ 0.9
RALGPS1-208ENST00000424082 PHF20Q9BVI0 1012 aa20.67■□□□□ 0.9
RALGPS1-208ENST00000424082 ARAP2Q8WZ64 1704 aa20.67■□□□□ 0.9
RALGPS1-208ENST00000424082 RNF225M0QZC1 329 aaPredicted RBP20.67■□□□□ 0.9
RALGPS1-208ENST00000424082 ERVK-24P63145 666 aa20.67■□□□□ 0.9
RALGPS1-208ENST00000424082 SEC23AQ15436 765 aa20.67■□□□□ 0.9
RALGPS1-208ENST00000424082 ZNF174Q15697 407 aa20.67■□□□□ 0.9
RALGPS1-208ENST00000424082 WDR93Q6P2C0 686 aa20.67■□□□□ 0.9
RALGPS1-208ENST00000424082 TMTC1Q8IUR5 882 aa20.67■□□□□ 0.9
RALGPS1-208ENST00000424082 BLZF1Q9H2G9 400 aa20.67■□□□□ 0.9
RALGPS1-208ENST00000424082 RNF41Q9H4P4 317 aaPredicted RBP20.67■□□□□ 0.9
RALGPS1-208ENST00000424082 FAM204AQ9H8W3 233 aa20.67■□□□□ 0.9
RALGPS1-208ENST00000424082 MYO1AQ9UBC5 1043 aa20.67■□□□□ 0.9
RALGPS1-208ENST00000424082 COL5A3P25940 1745 aaPredicted RBP20.67■□□□□ 0.9
RALGPS1-208ENST00000424082 ITIH6Q6UXX5 1313 aa20.66■□□□□ 0.9
RALGPS1-208ENST00000424082 SEMA3EO15041 775 aa20.66■□□□□ 0.9
RALGPS1-208ENST00000424082 NTSR2O95665 410 aa20.66■□□□□ 0.9
RALGPS1-208ENST00000424082 AMPD2Q01433 879 aa20.66■□□□□ 0.9
RALGPS1-208ENST00000424082 LRP2BPQ9P2M1 347 aa20.66■□□□□ 0.9
RALGPS1-208ENST00000424082 MYO6Q9UM54 1294 aa20.66■□□□□ 0.9
RALGPS1-208ENST00000424082 IQSEC3Q9UPP2 1182 aaPredicted RBP20.66■□□□□ 0.9
RALGPS1-208ENST00000424082 V9GY48 417 aaPredicted RBP20.66■□□□□ 0.9
RALGPS1-208ENST00000424082 PLEKHA8P1O95397 391 aa20.66■□□□□ 0.9
RALGPS1-208ENST00000424082 XBP1P17861 261 aa20.66■□□□□ 0.9
RALGPS1-208ENST00000424082 RCAN1P53805 252 aa20.66■□□□□ 0.9
RALGPS1-208ENST00000424082 KRT31Q15323 416 aa20.66■□□□□ 0.9
RALGPS1-208ENST00000424082 PACS2Q86VP3 889 aa20.66■□□□□ 0.9
RALGPS1-208ENST00000424082 BCORQ6W2J9 1755 aa20.66■□□□□ 0.9
RALGPS1-208ENST00000424082 LRP5O75197 1615 aa20.66■□□□□ 0.9
RALGPS1-208ENST00000424082 SPATA31A6Q5VVP1 1343 aa20.65■□□□□ 0.9
RALGPS1-208ENST00000424082 CORO7P57737 925 aa20.65■□□□□ 0.9
RALGPS1-208ENST00000424082 TTC31Q49AM3 519 aaPredicted RBP20.65■□□□□ 0.9
RALGPS1-208ENST00000424082 NCAPH2Q6IBW4 605 aa20.65■□□□□ 0.9
RALGPS1-208ENST00000424082 ENAHQ8N8S7 591 aaPredicted RBP20.65■□□□□ 0.9
RALGPS1-208ENST00000424082 CICQ96RK0 1608 aaPredicted RBP20.65■□□□□ 0.9
RALGPS1-208ENST00000424082 XDHP47989 1333 aa20.65■□□□□ 0.9
RALGPS1-208ENST00000424082 FUT2Q10981 343 aa20.65■□□□□ 0.9
RALGPS1-208ENST00000424082 MTA3Q9BTC8 594 aa20.65■□□□□ 0.9
RALGPS1-208ENST00000424082 VPS16Q9H269 839 aa20.65■□□□□ 0.9
RALGPS1-208ENST00000424082 VIPAS39Q9H9C1 493 aa20.65■□□□□ 0.9
RALGPS1-208ENST00000424082 ABHD10Q9NUJ1 306 aa20.65■□□□□ 0.9
RALGPS1-208ENST00000424082 N4BP3O15049 544 aa20.64■□□□□ 0.89
RALGPS1-208ENST00000424082 HSPA1LP34931 641 aa20.64■□□□□ 0.89
RALGPS1-208ENST00000424082 AARSP49588 968 aaKnown RBP eCLIP20.64■□□□□ 0.89
RALGPS1-208ENST00000424082 PARP10Q53GL7 1025 aa20.64■□□□□ 0.89
RALGPS1-208ENST00000424082 ICE2Q659A1 982 aa20.64■□□□□ 0.89
RALGPS1-208ENST00000424082 ESR2Q92731 530 aa20.64■□□□□ 0.89
RALGPS1-208ENST00000424082 FERMT2Q96AC1 680 aa20.64■□□□□ 0.89
RALGPS1-208ENST00000424082 RNF40O75150 1001 aa20.64■□□□□ 0.89
RALGPS1-208ENST00000424082 PTGDRQ13258 359 aa20.64■□□□□ 0.89
RALGPS1-208ENST00000424082 CERS3Q8IU89 383 aa20.64■□□□□ 0.89
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 75.3 ms