RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000335523.7

VSTM2B-201, Transcript of V-set and transmembrane domain containing 2B, humanhuman

APPRIS P1 TSL 5 BASIC

Gene VSTM2B, Length 1,488 nt, Biotype protein coding.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VSTM2B-201ENST00000335523 MTMR6Q9Y217 621 aa22.65■■□□□ 1.22
VSTM2B-201ENST00000335523 POLR2AP24928 1970 aaKnown RBP22.65■■□□□ 1.22
VSTM2B-201ENST00000335523 VPS37CA5D8V6 355 aaPredicted RBP22.64■■□□□ 1.21
VSTM2B-201ENST00000335523 NDUFB10O96000 172 aa22.64■■□□□ 1.21
VSTM2B-201ENST00000335523 ZSCAN22P10073 491 aaPredicted RBP22.64■■□□□ 1.21
VSTM2B-201ENST00000335523 HSPA6P17066 643 aa22.64■■□□□ 1.21
VSTM2B-201ENST00000335523 MAP1SQ66K74 1059 aaPredicted RBP22.64■■□□□ 1.21
VSTM2B-201ENST00000335523 FRMPD2Q68DX3 1309 aaPredicted RBP22.63■■□□□ 1.21
VSTM2B-201ENST00000335523 SSC5DA1L4H1 1573 aa22.63■■□□□ 1.21
VSTM2B-201ENST00000335523 POTEIP0CG38 1075 aa22.63■■□□□ 1.21
VSTM2B-201ENST00000335523 POTEJP0CG39 1038 aa22.63■■□□□ 1.21
VSTM2B-201ENST00000335523 XBP1P17861 261 aa22.63■■□□□ 1.21
VSTM2B-201ENST00000335523 ECE1P42892 770 aa22.63■■□□□ 1.21
VSTM2B-201ENST00000335523 TRIM29Q14134 588 aa22.63■■□□□ 1.21
VSTM2B-201ENST00000335523 FEZ1Q99689 392 aa22.63■■□□□ 1.21
VSTM2B-201ENST00000335523 WDR18Q9BV38 432 aa22.63■■□□□ 1.21
VSTM2B-201ENST00000335523 GPCPD1Q9NPB8 672 aa22.63■■□□□ 1.21
VSTM2B-201ENST00000335523 ISY1Q9ULR0 285 aaKnown RBP22.63■■□□□ 1.21
VSTM2B-201ENST00000335523 ZDHHC9Q9Y397 364 aa22.63■■□□□ 1.21
VSTM2B-201ENST00000335523 CSADQ9Y600 493 aa22.63■■□□□ 1.21
VSTM2B-201ENST00000335523 CNTNAP5Q8WYK1 1306 aa22.62■■□□□ 1.21
VSTM2B-201ENST00000335523 PTPRAP18433 802 aa22.62■■□□□ 1.21
VSTM2B-201ENST00000335523 TTLL12Q14166 644 aaPredicted RBP22.62■■□□□ 1.21
VSTM2B-201ENST00000335523 ARMC9Q7Z3E5 817 aa22.62■■□□□ 1.21
VSTM2B-201ENST00000335523 FBXO18Q8NFZ0 1043 aa22.62■■□□□ 1.21
VSTM2B-201ENST00000335523 VCPKMTQ9H867 229 aa22.62■■□□□ 1.21
VSTM2B-201ENST00000335523 FZD1Q9UP38 647 aa22.62■■□□□ 1.21
VSTM2B-201ENST00000335523 BMP3P12645 472 aa22.61■■□□□ 1.21
VSTM2B-201ENST00000335523 RRP36Q96EU6 259 aaKnown RBP22.61■■□□□ 1.21
VSTM2B-201ENST00000335523 KIAA1683Q9H0B3 1180 aa22.61■■□□□ 1.21
VSTM2B-201ENST00000335523 FRMD4AQ9P2Q2 1039 aaPredicted RBP22.61■■□□□ 1.21
VSTM2B-201ENST00000335523 ATP6V1DQ9Y5K8 247 aa22.61■■□□□ 1.21
VSTM2B-201ENST00000335523 USP17L10C9JJH3 530 aa22.6■■□□□ 1.21
VSTM2B-201ENST00000335523 USP14P54578 494 aa22.6■■□□□ 1.21
VSTM2B-201ENST00000335523 MAP3K11Q16584 847 aa22.6■■□□□ 1.21
VSTM2B-201ENST00000335523 FOXD4L5Q5VV16 416 aaPredicted RBP22.6■■□□□ 1.21
VSTM2B-201ENST00000335523 KCTD1Q719H9 257 aa22.6■■□□□ 1.21
VSTM2B-201ENST00000335523 ZNF280CQ8ND82 737 aa22.6■■□□□ 1.21
VSTM2B-201ENST00000335523 FOXD4L4Q8WXT5 416 aaPredicted RBP22.6■■□□□ 1.21
VSTM2B-201ENST00000335523 TNPO1Q92973 898 aaKnown RBP22.6■■□□□ 1.21
VSTM2B-201ENST00000335523 UBA5Q9GZZ9 404 aa22.6■■□□□ 1.21
VSTM2B-201ENST00000335523 RIOX1Q9H6W3 641 aa22.6■■□□□ 1.21
VSTM2B-201ENST00000335523 ZHX2Q9Y6X8 837 aa22.6■■□□□ 1.21
VSTM2B-201ENST00000335523 FOSBP53539 338 aa22.6■■□□□ 1.21
VSTM2B-201ENST00000335523 PKN1Q16512 942 aa22.6■■□□□ 1.21
VSTM2B-201ENST00000335523 PFKFB3Q16875 520 aaPredicted RBP22.6■■□□□ 1.21
VSTM2B-201ENST00000335523 CHADLQ6NUI6 762 aa22.6■■□□□ 1.21
VSTM2B-201ENST00000335523 PPP1R3FQ6ZSY5 799 aaPredicted RBP22.6■■□□□ 1.21
VSTM2B-201ENST00000335523 RASGRP2Q7LDG7 609 aa22.6■■□□□ 1.21
VSTM2B-201ENST00000335523 CCDC84Q86UT8 332 aaPredicted RBP22.6■■□□□ 1.21
VSTM2B-201ENST00000335523 ANKRD13AQ8IZ07 590 aa22.6■■□□□ 1.21
VSTM2B-201ENST00000335523 LPAR1Q92633 364 aa22.6■■□□□ 1.21
VSTM2B-201ENST00000335523 VAT1LQ9HCJ6 419 aa22.6■■□□□ 1.21
VSTM2B-201ENST00000335523 SEC63Q9UGP8 760 aaKnown RBP22.6■■□□□ 1.21
VSTM2B-201ENST00000335523 CYTH3O43739 400 aa22.59■■□□□ 1.21
VSTM2B-201ENST00000335523 F13A1P00488 732 aa22.59■■□□□ 1.21
VSTM2B-201ENST00000335523 SCG2P13521 617 aa22.59■■□□□ 1.21
VSTM2B-201ENST00000335523 SPP2Q13103 211 aa22.59■■□□□ 1.21
VSTM2B-201ENST00000335523 VGLL4Q14135 290 aa22.59■■□□□ 1.21
VSTM2B-201ENST00000335523 SPICE1Q8N0Z3 855 aa22.59■■□□□ 1.21
VSTM2B-201ENST00000335523 PIBF1Q8WXW3 757 aa22.59■■□□□ 1.21
VSTM2B-201ENST00000335523 AIFM3Q96NN9 605 aa22.59■■□□□ 1.21
VSTM2B-201ENST00000335523 hCG_1642624A0A1W2PR95 340 aa22.58■■□□□ 1.2
VSTM2B-201ENST00000335523 C19orf81C9J6K1 198 aa22.58■■□□□ 1.2
VSTM2B-201ENST00000335523 APLP1P51693 650 aa22.58■■□□□ 1.2
VSTM2B-201ENST00000335523 ZYXQ15942 572 aaKnown RBP22.58■■□□□ 1.2
VSTM2B-201ENST00000335523 TTBK2Q6IQ55 1244 aa22.58■■□□□ 1.2
VSTM2B-201ENST00000335523 ZSCAN16Q9H4T2 348 aaPredicted RBP22.58■■□□□ 1.2
VSTM2B-201ENST00000335523 UNCXA6NJT0 531 aa22.57■■□□□ 1.2
VSTM2B-201ENST00000335523 TMEM232C9JQI7 657 aa22.57■■□□□ 1.2
VSTM2B-201ENST00000335523 BACE1P56817 501 aa22.57■■□□□ 1.2
VSTM2B-201ENST00000335523 GUCY1B3Q02153 619 aa22.57■■□□□ 1.2
VSTM2B-201ENST00000335523 IKQ13123 557 aaPredicted RBP22.57■■□□□ 1.2
VSTM2B-201ENST00000335523 SAFBQ15424 915 aaKnown RBP eCLIP22.57■■□□□ 1.2
VSTM2B-201ENST00000335523 SLC35G1Q2M3R5 365 aa22.57■■□□□ 1.2
VSTM2B-201ENST00000335523 KRT40Q6A162 431 aa22.57■■□□□ 1.2
VSTM2B-201ENST00000335523 MCTP1Q6DN14 999 aa22.57■■□□□ 1.2
VSTM2B-201ENST00000335523 ADGRF4Q8IZF3 695 aa22.57■■□□□ 1.2
VSTM2B-201ENST00000335523 CHURC1Q8WUH1 139 aa22.57■■□□□ 1.2
VSTM2B-201ENST00000335523 GBP4Q96PP9 640 aa22.57■■□□□ 1.2
VSTM2B-201ENST00000335523 CPVLQ9H3G5 476 aa22.57■■□□□ 1.2
VSTM2B-201ENST00000335523 SNCAIPQ9Y6H5 919 aa22.57■■□□□ 1.2
VSTM2B-201ENST00000335523 CEP350Q5VT06 3117 aa22.56■■□□□ 1.2
VSTM2B-201ENST00000335523 UBE2Q2LH0YL09 131 aa22.56■■□□□ 1.2
VSTM2B-201ENST00000335523 TRAF5O00463 557 aa22.56■■□□□ 1.2
VSTM2B-201ENST00000335523 OTUD7BQ6GQQ9 843 aa22.56■■□□□ 1.2
VSTM2B-201ENST00000335523 BTNL9Q6UXG8 535 aa22.56■■□□□ 1.2
VSTM2B-201ENST00000335523 FAM177A1Q8N128 213 aaPredicted RBP22.56■■□□□ 1.2
VSTM2B-201ENST00000335523 NUP88Q99567 741 aaPredicted RBP22.56■■□□□ 1.2
VSTM2B-201ENST00000335523 SH3GLB2Q9NR46 395 aa22.56■■□□□ 1.2
VSTM2B-201ENST00000335523 MYH4Q9Y623 1939 aa22.56■■□□□ 1.2
VSTM2B-201ENST00000335523 PLA2G6O60733 806 aa22.55■■□□□ 1.2
VSTM2B-201ENST00000335523 SLC16A2P36021 539 aa22.55■■□□□ 1.2
VSTM2B-201ENST00000335523 FKBP1BP68106 108 aa22.55■■□□□ 1.2
VSTM2B-201ENST00000335523 MTMR2Q13614 643 aa22.55■■□□□ 1.2
VSTM2B-201ENST00000335523 KIAA1755Q5JYT7 1200 aa22.55■■□□□ 1.2
VSTM2B-201ENST00000335523 FAM83BQ5T0W9 1011 aa22.55■■□□□ 1.2
VSTM2B-201ENST00000335523 ZNF408Q9H9D4 720 aa22.55■■□□□ 1.2
VSTM2B-201ENST00000335523 JMJD4Q9H9V9 463 aa22.55■■□□□ 1.2
VSTM2B-201ENST00000335523 FEM1BQ9UK73 627 aa22.55■■□□□ 1.2
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 16.9 ms