RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000312060.9

CTU2-201, Transcript of cytosolic thiouridylase subunit 2, humanhuman

APPRIS P3 TSL 5 BASIC

Gene CTU2, Length 1,672 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTU2-201ENST00000312060 CCDC96Q2M329 555 aa25.71■■□□□ 1.71
CTU2-201ENST00000312060 GPATCH4Q5T3I0 446 aaKnown RBP25.71■■□□□ 1.71
CTU2-201ENST00000312060 WDR18Q9BV38 432 aa25.71■■□□□ 1.71
CTU2-201ENST00000312060 VCPKMTQ9H867 229 aa25.71■■□□□ 1.71
CTU2-201ENST00000312060 GPCPD1Q9NPB8 672 aa25.71■■□□□ 1.71
CTU2-201ENST00000312060 CHMP5Q9NZZ3 219 aa25.71■■□□□ 1.71
CTU2-201ENST00000312060 ZHX2Q9Y6X8 837 aa25.71■■□□□ 1.71
CTU2-201ENST00000312060 STK36Q9NRP7 1315 aa25.7■■□□□ 1.71
CTU2-201ENST00000312060 LARP1BQ659C4 914 aaKnown RBP25.7■■□□□ 1.7
CTU2-201ENST00000312060 ZNF280CQ8ND82 737 aa25.7■■□□□ 1.7
CTU2-201ENST00000312060 GMCL1Q96IK5 515 aa25.7■■□□□ 1.7
CTU2-201ENST00000312060 RNF26Q9BY78 433 aaPredicted RBP25.7■■□□□ 1.7
CTU2-201ENST00000312060 ZBTB4Q9P1Z0 1013 aaPredicted RBP25.7■■□□□ 1.7
CTU2-201ENST00000312060 USP17L10C9JJH3 530 aa25.69■■□□□ 1.7
CTU2-201ENST00000312060 PDCP20941 246 aa25.69■■□□□ 1.7
CTU2-201ENST00000312060 AKAP17AQ02040 695 aaKnown RBP25.69■■□□□ 1.7
CTU2-201ENST00000312060 SPP2Q13103 211 aa25.69■■□□□ 1.7
CTU2-201ENST00000312060 KCTD1Q719H9 257 aa25.69■■□□□ 1.7
CTU2-201ENST00000312060 SPICE1Q8N0Z3 855 aa25.69■■□□□ 1.7
CTU2-201ENST00000312060 KIAA1683Q9H0B3 1180 aa25.69■■□□□ 1.7
CTU2-201ENST00000312060 ISY1Q9ULR0 285 aaKnown RBP25.69■■□□□ 1.7
CTU2-201ENST00000312060 ITGBL1O95965 494 aaPredicted RBP25.68■■□□□ 1.7
CTU2-201ENST00000312060 SMARCA1P28370 1054 aa25.68■■□□□ 1.7
CTU2-201ENST00000312060 V9GY48 417 aaPredicted RBP25.68■■□□□ 1.7
CTU2-201ENST00000312060 CNTNAP5Q8WYK1 1306 aa25.68■■□□□ 1.7
CTU2-201ENST00000312060 UBE2Q2LH0YL09 131 aa25.68■■□□□ 1.7
CTU2-201ENST00000312060 PRPF3O43395 683 aaKnown RBP25.68■■□□□ 1.7
CTU2-201ENST00000312060 BMP3P12645 472 aa25.68■■□□□ 1.7
CTU2-201ENST00000312060 SYT1P21579 422 aa25.68■■□□□ 1.7
CTU2-201ENST00000312060 KIAA1755Q5JYT7 1200 aa25.68■■□□□ 1.7
CTU2-201ENST00000312060 UBA5Q9GZZ9 404 aa25.68■■□□□ 1.7
CTU2-201ENST00000312060 DEXIO95424 95 aa25.67■■□□□ 1.7
CTU2-201ENST00000312060 NUCB2P80303 420 aa25.67■■□□□ 1.7
CTU2-201ENST00000312060 MTMR2Q13614 643 aa25.67■■□□□ 1.7
CTU2-201ENST00000312060 TTBK2Q6IQ55 1244 aa25.67■■□□□ 1.7
CTU2-201ENST00000312060 NUP88Q99567 741 aaPredicted RBP25.67■■□□□ 1.7
CTU2-201ENST00000312060 SPZ1Q9BXG8 430 aa25.67■■□□□ 1.7
CTU2-201ENST00000312060 CPVLQ9H3G5 476 aa25.67■■□□□ 1.7
CTU2-201ENST00000312060 CYTH3O43739 400 aa25.66■■□□□ 1.7
CTU2-201ENST00000312060 CELF2O95319 508 aaKnown RBP25.66■■□□□ 1.7
CTU2-201ENST00000312060 USP14P54578 494 aa25.66■■□□□ 1.7
CTU2-201ENST00000312060 BACE1P56817 501 aa25.66■■□□□ 1.7
CTU2-201ENST00000312060 FKBP1BP68106 108 aa25.66■■□□□ 1.7
CTU2-201ENST00000312060 PKP1Q13835 747 aa25.66■■□□□ 1.7
CTU2-201ENST00000312060 LDLRAD1Q5T700 205 aa25.66■■□□□ 1.7
CTU2-201ENST00000312060 WASF1Q92558 559 aa25.66■■□□□ 1.7
CTU2-201ENST00000312060 CLMNQ96JQ2 1002 aa25.66■■□□□ 1.7
CTU2-201ENST00000312060 ELP3Q9H9T3 547 aa25.66■■□□□ 1.7
CTU2-201ENST00000312060 AFG3L2Q9Y4W6 797 aa25.66■■□□□ 1.7
CTU2-201ENST00000312060 PTPRFP10586 1907 aa25.66■■□□□ 1.7
CTU2-201ENST00000312060 TRIM75PA6NK02 468 aa25.65■■□□□ 1.7
CTU2-201ENST00000312060 STX6O43752 255 aa25.65■■□□□ 1.7
CTU2-201ENST00000312060 SLC35G1Q2M3R5 365 aa25.65■■□□□ 1.7
CTU2-201ENST00000312060 ALG1Q9BT22 464 aa25.65■■□□□ 1.7
CTU2-201ENST00000312060 GBA2Q9HCG7 927 aaPredicted RBP25.65■■□□□ 1.7
CTU2-201ENST00000312060 hCG_1642624A0A1W2PR95 340 aa25.64■■□□□ 1.7
CTU2-201ENST00000312060 KIF3CO14782 793 aa25.64■■□□□ 1.7
CTU2-201ENST00000312060 PDIA4P13667 645 aaKnown RBP25.64■■□□□ 1.7
CTU2-201ENST00000312060 ERO1BQ86YB8 467 aa25.64■■□□□ 1.7
CTU2-201ENST00000312060 C2orf69Q8N8R5 385 aa25.64■■□□□ 1.7
CTU2-201ENST00000312060 LPAR1Q92633 364 aa25.64■■□□□ 1.7
CTU2-201ENST00000312060 VAT1LQ9HCJ6 419 aa25.64■■□□□ 1.7
CTU2-201ENST00000312060 RBM27Q9P2N5 1060 aaKnown RBP25.64■■□□□ 1.7
CTU2-201ENST00000312060 UNCXA6NJT0 531 aa25.64■■□□□ 1.69
CTU2-201ENST00000312060 C19orf81C9J6K1 198 aa25.64■■□□□ 1.69
CTU2-201ENST00000312060 PPATQ06203 517 aa25.64■■□□□ 1.69
CTU2-201ENST00000312060 FAM83BQ5T0W9 1011 aa25.64■■□□□ 1.69
CTU2-201ENST00000312060 PIBF1Q8WXW3 757 aa25.64■■□□□ 1.69
CTU2-201ENST00000312060 RIOX1Q9H6W3 641 aa25.64■■□□□ 1.69
CTU2-201ENST00000312060 EMILIN3Q9NT22 766 aa25.64■■□□□ 1.69
CTU2-201ENST00000312060 TMEM232C9JQI7 657 aa25.63■■□□□ 1.69
CTU2-201ENST00000312060 SLC16A2P36021 539 aa25.63■■□□□ 1.69
CTU2-201ENST00000312060 FOSBP53539 338 aa25.63■■□□□ 1.69
CTU2-201ENST00000312060 PKN1Q16512 942 aa25.63■■□□□ 1.69
CTU2-201ENST00000312060 CNKSR2Q8WXI2 1034 aa25.63■■□□□ 1.69
CTU2-201ENST00000312060 C8orf76Q96K31 380 aa25.63■■□□□ 1.69
CTU2-201ENST00000312060 AIFM3Q96NN9 605 aa25.63■■□□□ 1.69
CTU2-201ENST00000312060 H3BQV1 296 aa25.62■■□□□ 1.69
CTU2-201ENST00000312060 IFFO2Q5TF58 517 aa25.62■■□□□ 1.69
CTU2-201ENST00000312060 ADGRF4Q8IZF3 695 aa25.62■■□□□ 1.69
CTU2-201ENST00000312060 WDR33Q9C0J8 1336 aaKnown RBP25.61■■□□□ 1.69
CTU2-201ENST00000312060 VPS37CA5D8V6 355 aaPredicted RBP25.61■■□□□ 1.69
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CTU2-201ENST00000312060 IKQ13123 557 aaPredicted RBP25.61■■□□□ 1.69
CTU2-201ENST00000312060 DGKZQ13574 1117 aa25.61■■□□□ 1.69
CTU2-201ENST00000312060 CST9Q5W186 159 aa25.61■■□□□ 1.69
CTU2-201ENST00000312060 RBM46Q8TBY0 533 aaKnown RBP25.61■■□□□ 1.69
CTU2-201ENST00000312060 RRP36Q96EU6 259 aaKnown RBP25.61■■□□□ 1.69
CTU2-201ENST00000312060 OTUD5Q96G74 571 aa25.61■■□□□ 1.69
CTU2-201ENST00000312060 WDR46O15213 610 aaKnown RBP25.61■■□□□ 1.69
CTU2-201ENST00000312060 HMGCS2P54868 508 aa25.61■■□□□ 1.69
CTU2-201ENST00000312060 SLC10A4Q96EP9 437 aa25.61■■□□□ 1.69
CTU2-201ENST00000312060 MTMR6Q9Y217 621 aa25.61■■□□□ 1.69
CTU2-201ENST00000312060 ZDHHC9Q9Y397 364 aa25.61■■□□□ 1.69
CTU2-201ENST00000312060 BRD1O95696 1058 aa25.6■■□□□ 1.69
CTU2-201ENST00000312060 SCG2P13521 617 aa25.6■■□□□ 1.69
CTU2-201ENST00000312060 STAT2P52630 851 aa25.6■■□□□ 1.69
CTU2-201ENST00000312060 PFKFB3Q16875 520 aaPredicted RBP25.6■■□□□ 1.69
CTU2-201ENST00000312060 BTNL9Q6UXG8 535 aa25.6■■□□□ 1.69
CTU2-201ENST00000312060 HOMER1Q86YM7 354 aa25.6■■□□□ 1.69
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