RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000217398.3

PXMP4-201, Transcript of peroxisomal membrane protein 4, humanhuman

TSL 2 BASIC

Gene PXMP4, Length 979 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Endoplasmic reticulum, Nucleus, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PXMP4-201ENST00000217398 ABRAQ8N0Z2 381 aa21.88■■□□□ 1.09
PXMP4-201ENST00000217398 EPB41L4AQ9HCS5 686 aaPredicted RBP21.88■■□□□ 1.09
PXMP4-201ENST00000217398 RNF113AO15541 343 aaKnown RBP21.87■■□□□ 1.09
PXMP4-201ENST00000217398 MSCO60682 206 aa21.87■■□□□ 1.09
PXMP4-201ENST00000217398 DPP9Q86TI2 863 aa21.87■■□□□ 1.09
PXMP4-201ENST00000217398 DDRGK1Q96HY6 314 aa21.87■■□□□ 1.09
PXMP4-201ENST00000217398 LRCH3Q96II8 777 aa21.87■■□□□ 1.09
PXMP4-201ENST00000217398 IGKV6D-41A0A0C4DH26 115 aa21.86■■□□□ 1.09
PXMP4-201ENST00000217398 M0R2C6 588 aa21.86■■□□□ 1.09
PXMP4-201ENST00000217398 PI4K2BQ8TCG2 481 aa21.86■■□□□ 1.09
PXMP4-201ENST00000217398 ZNF214Q9UL59 606 aaPredicted RBP21.86■■□□□ 1.09
PXMP4-201ENST00000217398 PPP1R9AQ9ULJ8 1098 aa21.86■■□□□ 1.09
PXMP4-201ENST00000217398 LTBP2Q14767 1821 aa21.85■■□□□ 1.09
PXMP4-201ENST00000217398 GPAA1O43292 621 aa21.85■■□□□ 1.09
PXMP4-201ENST00000217398 NCAPG2Q86XI2 1143 aa21.85■■□□□ 1.09
PXMP4-201ENST00000217398 RIOX2Q8IUF8 465 aa21.85■■□□□ 1.09
PXMP4-201ENST00000217398 MAML3Q96JK9 1138 aa21.85■■□□□ 1.09
PXMP4-201ENST00000217398 COL6A3P12111 3177 aa21.85■■□□□ 1.09
PXMP4-201ENST00000217398 DNM1LO00429 736 aa21.84■■□□□ 1.09
PXMP4-201ENST00000217398 VWA5AO00534 786 aa21.84■■□□□ 1.09
PXMP4-201ENST00000217398 SLC25A27O95847 323 aa21.84■■□□□ 1.09
PXMP4-201ENST00000217398 ZFYP08048 801 aaPredicted RBP21.84■■□□□ 1.09
PXMP4-201ENST00000217398 CNGA1P29973 690 aa21.84■■□□□ 1.09
PXMP4-201ENST00000217398 PLS1Q14651 629 aa21.84■■□□□ 1.09
PXMP4-201ENST00000217398 FAM83BQ5T0W9 1011 aa21.84■■□□□ 1.09
PXMP4-201ENST00000217398 OTUD7AQ8TE49 926 aaPredicted RBP21.84■■□□□ 1.09
PXMP4-201ENST00000217398 NYAP2Q9P242 653 aa21.84■■□□□ 1.09
PXMP4-201ENST00000217398 TTC41PQ6P2S7 1318 aa21.83■■□□□ 1.09
PXMP4-201ENST00000217398 SALL3Q9BXA9 1300 aa21.83■■□□□ 1.09
PXMP4-201ENST00000217398 SEPT4O43236 478 aa21.83■■□□□ 1.09
PXMP4-201ENST00000217398 PRAMEF19Q5SWL8 479 aa21.83■■□□□ 1.09
PXMP4-201ENST00000217398 SENP6Q9GZR1 1112 aaPredicted RBP21.83■■□□□ 1.09
PXMP4-201ENST00000217398 GOPCQ9HD26 462 aa21.83■■□□□ 1.09
PXMP4-201ENST00000217398 MINDY4BA8MYZ0 360 aa21.82■■□□□ 1.08
PXMP4-201ENST00000217398 ZNF792Q3KQV3 632 aa21.82■■□□□ 1.08
PXMP4-201ENST00000217398 LRIT3Q3SXY7 679 aa21.82■■□□□ 1.08
PXMP4-201ENST00000217398 GPATCH3Q96I76 525 aa21.82■■□□□ 1.08
PXMP4-201ENST00000217398 SEC62Q99442 399 aaKnown RBP21.82■■□□□ 1.08
PXMP4-201ENST00000217398 NUP88Q99567 741 aaPredicted RBP21.82■■□□□ 1.08
PXMP4-201ENST00000217398 FCER1AP12319 257 aa21.81■■□□□ 1.08
PXMP4-201ENST00000217398 STAT3P40763 770 aa21.81■■□□□ 1.08
PXMP4-201ENST00000217398 LAMA2P24043 3122 aaKnown RBP21.8■■□□□ 1.08
PXMP4-201ENST00000217398 PATL2C9JE40 543 aaKnown RBP21.8■■□□□ 1.08
PXMP4-201ENST00000217398 F5H6K3 240 aa21.8■■□□□ 1.08
PXMP4-201ENST00000217398 NDUFB10O96000 172 aa21.8■■□□□ 1.08
PXMP4-201ENST00000217398 GNAT2P19087 354 aa21.8■■□□□ 1.08
PXMP4-201ENST00000217398 KLRC3Q07444 240 aa21.8■■□□□ 1.08
PXMP4-201ENST00000217398 GJC2Q5T442 439 aaPredicted RBP21.8■■□□□ 1.08
PXMP4-201ENST00000217398 ANO1Q5XXA6 986 aa21.8■■□□□ 1.08
PXMP4-201ENST00000217398 SAMD1Q6SPF0 538 aaPredicted RBP21.8■■□□□ 1.08
PXMP4-201ENST00000217398 IFNL3Q8IZI9 196 aa21.8■■□□□ 1.08
PXMP4-201ENST00000217398 TDHQ8IZJ6 230 aa21.8■■□□□ 1.08
PXMP4-201ENST00000217398 STK11IPQ8N1F8 1099 aa21.8■■□□□ 1.08
PXMP4-201ENST00000217398 MKL1Q969V6 931 aa21.8■■□□□ 1.08
PXMP4-201ENST00000217398 SLC5A4Q9NY91 659 aa21.8■■□□□ 1.08
PXMP4-201ENST00000217398 DIS3Q9Y2L1 958 aaKnown RBP21.8■■□□□ 1.08
PXMP4-201ENST00000217398 PLIN4Q96Q06 1357 aa21.79■■□□□ 1.08
PXMP4-201ENST00000217398 FOXP2O15409 715 aa21.79■■□□□ 1.08
PXMP4-201ENST00000217398 PGK2P07205 417 aa21.79■■□□□ 1.08
PXMP4-201ENST00000217398 ZMYM1Q5SVZ6 1142 aa21.79■■□□□ 1.08
PXMP4-201ENST00000217398 GPR153Q6NV75 609 aa21.79■■□□□ 1.08
PXMP4-201ENST00000217398 MMP19Q99542 508 aa21.79■■□□□ 1.08
PXMP4-201ENST00000217398 MKNK2Q9HBH9 465 aa21.79■■□□□ 1.08
PXMP4-201ENST00000217398 PRDM1O75626 825 aa21.78■■□□□ 1.08
PXMP4-201ENST00000217398 ATN1P54259 1190 aaPredicted RBP21.78■■□□□ 1.08
PXMP4-201ENST00000217398 SNX17Q15036 470 aa21.78■■□□□ 1.08
PXMP4-201ENST00000217398 ARRDC4Q8NCT1 418 aa21.78■■□□□ 1.08
PXMP4-201ENST00000217398 CEP95Q96GE4 821 aa21.78■■□□□ 1.08
PXMP4-201ENST00000217398 SLF1Q9BQI6 1058 aa21.78■■□□□ 1.08
PXMP4-201ENST00000217398 NRBP1Q9UHY1 535 aa21.78■■□□□ 1.08
PXMP4-201ENST00000217398 RIPK3Q9Y572 518 aa21.78■■□□□ 1.08
PXMP4-201ENST00000217398 ATP2A1O14983 1001 aa21.77■■□□□ 1.08
PXMP4-201ENST00000217398 TDO2P48775 406 aa21.77■■□□□ 1.08
PXMP4-201ENST00000217398 LRRC41Q15345 812 aa21.77■■□□□ 1.08
PXMP4-201ENST00000217398 FAM47AQ5JRC9 791 aa21.77■■□□□ 1.08
PXMP4-201ENST00000217398 TINF2Q9BSI4 451 aa21.77■■□□□ 1.08
PXMP4-201ENST00000217398 UBE2OQ9C0C9 1292 aaKnown RBP21.77■■□□□ 1.08
PXMP4-201ENST00000217398 MTMR4Q9NYA4 1195 aa21.77■■□□□ 1.08
PXMP4-201ENST00000217398 CLIP2Q9UDT6 1046 aa21.77■■□□□ 1.08
PXMP4-201ENST00000217398 SYNPO2Q9UMS6 1093 aa21.77■■□□□ 1.08
PXMP4-201ENST00000217398 MCM3APO60318 1980 aa21.76■■□□□ 1.07
PXMP4-201ENST00000217398 DNAJC25-GNG10A0A024R161 153 aa21.76■■□□□ 1.07
PXMP4-201ENST00000217398 ZNF865P0CJ78 1059 aaPredicted RBP21.76■■□□□ 1.07
PXMP4-201ENST00000217398 TAL1P17542 331 aaPredicted RBP21.76■■□□□ 1.07
PXMP4-201ENST00000217398 COPB2P35606 906 aa21.76■■□□□ 1.07
PXMP4-201ENST00000217398 RRP1P56182 461 aaKnown RBP21.76■■□□□ 1.07
PXMP4-201ENST00000217398 RTP1P59025 263 aa21.76■■□□□ 1.07
PXMP4-201ENST00000217398 MDM2Q00987 491 aaPredicted RBP21.76■■□□□ 1.07
PXMP4-201ENST00000217398 SLC39A5Q6ZMH5 540 aa21.76■■□□□ 1.07
PXMP4-201ENST00000217398 DHX30Q7L2E3 1194 aaKnown RBP eCLIP21.76■■□□□ 1.07
PXMP4-201ENST00000217398 NEDD1Q8NHV4 660 aa21.76■■□□□ 1.07
PXMP4-201ENST00000217398 TEX13BQ9BXU2 312 aa21.76■■□□□ 1.07
PXMP4-201ENST00000217398 ERC2O15083 957 aa21.75■■□□□ 1.07
PXMP4-201ENST00000217398 RAD21O60216 631 aa21.75■■□□□ 1.07
PXMP4-201ENST00000217398 KCTD2Q14681 263 aa21.75■■□□□ 1.07
PXMP4-201ENST00000217398 PRPF38AQ8NAV1 312 aaKnown RBP21.75■■□□□ 1.07
PXMP4-201ENST00000217398 MX1P20591 662 aa21.74■■□□□ 1.07
PXMP4-201ENST00000217398 LRRFIP1Q32MZ4 808 aaKnown RBP21.74■■□□□ 1.07
PXMP4-201ENST00000217398 SNRNP48Q6IEG0 339 aaKnown RBP21.74■■□□□ 1.07
PXMP4-201ENST00000217398 ZNF444Q8N0Y2 327 aaPredicted RBP21.74■■□□□ 1.07
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 19.1 ms