RNA–Protein interactions for RNA: YOL054W

PSH1, Transcript of E3 ubiquitin ligase targeting centromere-binding protein Cse4p, yeast

Gene PSH1, Length 1,221 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
PSH1	YOL054W	TAF6	P53040	516 aa		5.81	□□□□□ -1.48
PSH1	YOL054W	NNF2	P53253	936 aa		5.81	□□□□□ -1.48
PSH1	YOL054W	YNL144C	P53907	740 aa		5.81	□□□□□ -1.48
PSH1	YOL054W	ARP4	P80428	489 aa		5.81	□□□□□ -1.48
PSH1	YOL054W	YMR027W	Q04371	470 aa		5.81	□□□□□ -1.48
PSH1	YOL054W	YDR222W	Q04925	415 aa		5.81	□□□□□ -1.48
PSH1	YOL054W	ECM38	Q05902	660 aa	Predicted RBP	5.81	□□□□□ -1.48
PSH1	YOL054W	ADY3	Q07732	790 aa		5.81	□□□□□ -1.48
PSH1	YOL054W	SWM1	Q12379	170 aa		5.81	□□□□□ -1.48
PSH1	YOL054W	PMA1	P05030	918 aa	Known RBP	5.8	□□□□□ -1.48
PSH1	YOL054W	PWP1	P21304	576 aa	Known RBP	5.8	□□□□□ -1.48
PSH1	YOL054W	CLB4	P24871	460 aa		5.8	□□□□□ -1.48
PSH1	YOL054W	SSE1	P32589	693 aa	Known RBP	5.8	□□□□□ -1.48
PSH1	YOL054W	MRS6	P32864	603 aa	Known RBP	5.8	□□□□□ -1.48
PSH1	YOL054W	UBP11	P36026	717 aa		5.8	□□□□□ -1.48
PSH1	YOL054W	CCL1	P37366	393 aa		5.8	□□□□□ -1.48
PSH1	YOL054W	APN2	P38207	520 aa		5.8	□□□□□ -1.48
PSH1	YOL054W	FAT1	P38225	669 aa		5.8	□□□□□ -1.48
PSH1	YOL054W	SPC97	P38863	823 aa		5.8	□□□□□ -1.48
PSH1	YOL054W	URM1	P40554	99 aa	Predicted RBP	5.8	□□□□□ -1.48
PSH1	YOL054W	MET12	P46151	657 aa		5.8	□□□□□ -1.48
PSH1	YOL054W	AVT1	P47082	602 aa		5.8	□□□□□ -1.48
PSH1	YOL054W	LIF1	P53150	421 aa		5.8	□□□□□ -1.48
PSH1	YOL054W	LSC1	P53598	329 aa	Known RBP	5.8	□□□□□ -1.48
PSH1	YOL054W	BRE5	P53741	515 aa	Known RBP	5.8	□□□□□ -1.48
PSH1	YOL054W	SPO19	Q03029	223 aa		5.8	□□□□□ -1.48
PSH1	YOL054W	YMR210W	Q03649	449 aa		5.8	□□□□□ -1.48
PSH1	YOL054W	GTB1	Q04924	702 aa		5.8	□□□□□ -1.48
PSH1	YOL054W	VHS3	Q08438	674 aa		5.8	□□□□□ -1.48
PSH1	YOL054W	UPC2	Q12151	913 aa		5.8	□□□□□ -1.48
PSH1	YOL054W	NOP56	Q12460	504 aa	Known RBP RIP-Chip data	5.8	□□□□□ -1.48	not detected
PSH1	YOL054W	TUB3	P09734	445 aa	Known RBP	5.79	□□□□□ -1.48
PSH1	YOL054W	GPI10	P30777	616 aa		5.79	□□□□□ -1.48
PSH1	YOL054W	SIN4	P32259	974 aa		5.79	□□□□□ -1.48
PSH1	YOL054W	MUD1	P32605	298 aa	Known RBP	5.79	□□□□□ -1.48
PSH1	YOL054W	TOA1	P32773	286 aa		5.79	□□□□□ -1.48
PSH1	YOL054W	PFA3	P42836	336 aa		5.79	□□□□□ -1.48
PSH1	YOL054W	PHO86	P46956	311 aa		5.79	□□□□□ -1.48
PSH1	YOL054W	SET2	P46995	733 aa	Known RBP	5.79	□□□□□ -1.48
PSH1	YOL054W	GCV2	P49095	1034 aa		5.79	□□□□□ -1.48
PSH1	YOL054W	CRF1	Q04930	467 aa		5.79	□□□□□ -1.48
PSH1	YOL054W	YPT6	Q99260	215 aa		5.79	□□□□□ -1.48
PSH1	YOL054W	RIF1	P29539	1916 aa		5.79	□□□□□ -1.48
PSH1	YOL054W	TUB2	P02557	457 aa	Known RBP	5.78	□□□□□ -1.48
PSH1	YOL054W	HIS5	P07172	385 aa		5.78	□□□□□ -1.48
PSH1	YOL054W	KAR4	P25583	335 aa		5.78	□□□□□ -1.48
PSH1	YOL054W	RPL5	P26321	297 aa	Known RBP	5.78	□□□□□ -1.48
PSH1	YOL054W	TPS2	P31688	896 aa	Known RBP	5.78	□□□□□ -1.48
PSH1	YOL054W	EFB1	P32471	206 aa	Known RBP	5.78	□□□□□ -1.48
PSH1	YOL054W	CSG2	P35206	410 aa		5.78	□□□□□ -1.48
PSH1	YOL054W	APT2	P36973	181 aa		5.78	□□□□□ -1.48
PSH1	YOL054W	PHO88	P38264	188 aa	Predicted RBP	5.78	□□□□□ -1.48
PSH1	YOL054W	RFC3	P38629	340 aa		5.78	□□□□□ -1.48
PSH1	YOL054W	LAM1	P38851	1228 aa		5.78	□□□□□ -1.48
PSH1	YOL054W	LIN1	P38852	340 aa	Predicted RBP	5.78	□□□□□ -1.48
PSH1	YOL054W	YHR202W	P38887	602 aa		5.78	□□□□□ -1.48
PSH1	YOL054W	DUN1	P39009	513 aa		5.78	□□□□□ -1.48
PSH1	YOL054W	BEM4	P39011	633 aa		5.78	□□□□□ -1.48
PSH1	YOL054W	HOS4	P40480	1083 aa		5.78	□□□□□ -1.48
PSH1	YOL054W	VHR1	P40522	640 aa		5.78	□□□□□ -1.48
PSH1	YOL054W	HIS6	P40545	261 aa		5.78	□□□□□ -1.48
PSH1	YOL054W	RPA49	Q01080	415 aa	Predicted RBP	5.78	□□□□□ -1.48
PSH1	YOL054W	PPM1	Q04081	328 aa		5.78	□□□□□ -1.48
PSH1	YOL054W	MUS81	Q04149	632 aa	Predicted RBP	5.78	□□□□□ -1.48
PSH1	YOL054W	UFO1	Q04511	668 aa		5.78	□□□□□ -1.48
PSH1	YOL054W	GPB1	Q08886	897 aa		5.78	□□□□□ -1.48
PSH1	YOL054W	OCA6	Q12454	224 aa		5.78	□□□□□ -1.48
PSH1	YOL054W	RPS9B	P05755	195 aa	Known RBP	5.77	□□□□□ -1.49
PSH1	YOL054W	CMD1	P06787	147 aa	Known RBP	5.77	□□□□□ -1.49
PSH1	YOL054W	GLN4	P13188	809 aa	Known RBP	5.77	□□□□□ -1.49
PSH1	YOL054W	PHO81	P17442	1178 aa		5.77	□□□□□ -1.49
PSH1	YOL054W	REC107	P21651	314 aa		5.77	□□□□□ -1.49
PSH1	YOL054W	DAL2	P25335	343 aa		5.77	□□□□□ -1.49
PSH1	YOL054W	ICL1	P28240	557 aa	Predicted RBP	5.77	□□□□□ -1.49
PSH1	YOL054W	LIP5	P32875	414 aa		5.77	□□□□□ -1.49
PSH1	YOL054W	COY1	P34237	679 aa		5.77	□□□□□ -1.49
PSH1	YOL054W	PCA1	P38360	1216 aa		5.77	□□□□□ -1.49
PSH1	YOL054W	ALG5	P40350	334 aa		5.77	□□□□□ -1.49
PSH1	YOL054W	GVP36	P40531	326 aa	Known RBP	5.77	□□□□□ -1.49
PSH1	YOL054W	AIM21	P40563	679 aa		5.77	□□□□□ -1.49
PSH1	YOL054W	SAE2	P46946	345 aa		5.77	□□□□□ -1.49
PSH1	YOL054W	LIA1	P47120	325 aa	Known RBP	5.77	□□□□□ -1.49
PSH1	YOL054W	YML6	P51998	286 aa		5.77	□□□□□ -1.49
PSH1	YOL054W	TAM41	P53230	385 aa		5.77	□□□□□ -1.49
PSH1	YOL054W	ASI2	P53895	289 aa		5.77	□□□□□ -1.49
PSH1	YOL054W	NOP15	P53927	220 aa	Predicted RBP	5.77	□□□□□ -1.49
PSH1	YOL054W	PLB2	Q03674	706 aa		5.77	□□□□□ -1.49
PSH1	YOL054W	FMN1	Q03778	218 aa		5.77	□□□□□ -1.49
PSH1	YOL054W	IVY1	Q04934	453 aa		5.77	□□□□□ -1.49
PSH1	YOL054W	RXT3	Q07458	294 aa		5.77	□□□□□ -1.49
PSH1	YOL054W	BRE4	Q07660	1125 aa		5.77	□□□□□ -1.49
PSH1	YOL054W	YDL177C	Q12257	170 aa		5.77	□□□□□ -1.49
PSH1	YOL054W	RRD2	Q12461	358 aa		5.77	□□□□□ -1.49
PSH1	YOL054W	TY1B-A	O13527	1196 aa	Known RBP	5.76	□□□□□ -1.49
PSH1	YOL054W	RPS17A	P02407	136 aa	Known RBP	5.76	□□□□□ -1.49
PSH1	YOL054W	BI2	P03873	423 aa		5.76	□□□□□ -1.49
PSH1	YOL054W	ILS1	P09436	1072 aa	Known RBP	5.76	□□□□□ -1.49
PSH1	YOL054W	RPS17B	P14127	136 aa	Known RBP	5.76	□□□□□ -1.49
PSH1	YOL054W	SNA3	P14359	133 aa		5.76	□□□□□ -1.49
PSH1	YOL054W	EST1	P17214	699 aa	Predicted RBP	5.76	□□□□□ -1.49

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