RNA–Protein interactions for RNA: YKR057W

RPS21A, Transcript of Protein component of the small (40S) ribosomal subunit, yeastyeast

Gene RPS21A, Length 264 nt, Biotype protein coding.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
RPS21AYKR057W LSG1P53145 640 aaKnown RBP3.3□□□□□ -1.88
RPS21AYKR057W CUL3P53202 744 aa3.3□□□□□ -1.88
RPS21AYKR057W PEX8P53248 589 aa3.3□□□□□ -1.88
RPS21AYKR057W COP1P53622 1201 aaKnown RBP3.3□□□□□ -1.88
RPS21AYKR057W ARE2P53629 642 aaKnown RBP3.3□□□□□ -1.88
RPS21AYKR057W DUS1P53759 423 aaKnown RBP3.3□□□□□ -1.88
RPS21AYKR057W YNL095CP53932 642 aa3.3□□□□□ -1.88
RPS21AYKR057W YNL010WP53981 241 aaKnown RBP3.3□□□□□ -1.88
RPS21AYKR057W HXT15P54854 567 aa3.3□□□□□ -1.88
RPS21AYKR057W RSC9Q03124 581 aa3.3□□□□□ -1.88
RPS21AYKR057W ABZ2Q03266 374 aa3.3□□□□□ -1.88
RPS21AYKR057W TLG1Q03322 224 aa3.3□□□□□ -1.88
RPS21AYKR057W SLD5Q03406 294 aa3.3□□□□□ -1.88
RPS21AYKR057W YML037CQ03703 340 aa3.3□□□□□ -1.88
RPS21AYKR057W CSN9Q03981 162 aa3.3□□□□□ -1.88
RPS21AYKR057W ARP9Q05123 467 aa3.3□□□□□ -1.88
RPS21AYKR057W CDC123Q05791 360 aa3.3□□□□□ -1.88
RPS21AYKR057W DUS3Q06053 668 aaKnown RBP3.3□□□□□ -1.88
RPS21AYKR057W ECM7Q06200 448 aa3.3□□□□□ -1.88
RPS21AYKR057W JIP5Q06214 492 aaPredicted RBP3.3□□□□□ -1.88
RPS21AYKR057W RSC2Q06488 889 aa3.3□□□□□ -1.88
RPS21AYKR057W YLR413WQ06689 675 aa3.3□□□□□ -1.88
RPS21AYKR057W ISA1Q07821 250 aaPredicted RBP3.3□□□□□ -1.88
RPS21AYKR057W YOL019WQ08157 551 aa3.3□□□□□ -1.88
RPS21AYKR057W DIS3Q08162 1001 aaKnown RBP3.3□□□□□ -1.88
RPS21AYKR057W NGL1Q08213 363 aaKnown RBP3.3□□□□□ -1.88
RPS21AYKR057W YOL159CQ08300 171 aa3.3□□□□□ -1.88
RPS21AYKR057W RSB1Q08417 382 aa3.3□□□□□ -1.88
RPS21AYKR057W PUS7Q08647 676 aaKnown RBP3.3□□□□□ -1.88
RPS21AYKR057W FLC1Q08967 793 aa3.3□□□□□ -1.88
RPS21AYKR057W ULA1Q12059 462 aa3.3□□□□□ -1.88
RPS21AYKR057W VPS54Q12071 889 aa3.3□□□□□ -1.88
RPS21AYKR057W MED2Q12124 431 aa3.3□□□□□ -1.88
RPS21AYKR057W YPL119C-AQ3E751 87 aa3.3□□□□□ -1.88
RPS21AYKR057W VPS5Q92331 675 aa3.3□□□□□ -1.88
RPS21AYKR057W MED11Q99278 115 aa3.3□□□□□ -1.88
RPS21AYKR057W GAL10P04397 699 aa3.29□□□□□ -1.88
RPS21AYKR057W MET17P06106 444 aa3.29□□□□□ -1.88
RPS21AYKR057W TPK1P06244 397 aa3.29□□□□□ -1.88
RPS21AYKR057W PUT2P07275 575 aa3.29□□□□□ -1.88
RPS21AYKR057W ASP3-2P0CX77 362 aa3.29□□□□□ -1.88
RPS21AYKR057W ASP3-3P0CX78 362 aa3.29□□□□□ -1.88
RPS21AYKR057W ASP3-4P0CX79 362 aa3.29□□□□□ -1.88
RPS21AYKR057W ASP3-1P0CZ17 362 aa3.29□□□□□ -1.88
RPS21AYKR057W WHI2P12611 486 aa3.29□□□□□ -1.88
RPS21AYKR057W KGD1P20967 1014 aaKnown RBP3.29□□□□□ -1.88
RPS21AYKR057W SEC15P22224 910 aa3.29□□□□□ -1.88
RPS21AYKR057W RVS161P25343 265 aaKnown RBP3.29□□□□□ -1.88
RPS21AYKR057W CMK1P27466 446 aaKnown RBP3.29□□□□□ -1.88
RPS21AYKR057W DPH2P32461 534 aa3.29□□□□□ -1.88
RPS21AYKR057W PAH1P32567 862 aa3.29□□□□□ -1.88
RPS21AYKR057W AIM26P32858 118 aa3.29□□□□□ -1.88
RPS21AYKR057W RGT1P32862 1170 aa3.29□□□□□ -1.88
RPS21AYKR057W SHP1P34223 423 aa3.29□□□□□ -1.88
RPS21AYKR057W MAC1P35192 417 aa3.29□□□□□ -1.88
RPS21AYKR057W VPS21P36017 210 aaKnown RBP3.29□□□□□ -1.88
RPS21AYKR057W ROT2P38138 954 aa3.29□□□□□ -1.88
RPS21AYKR057W MAP2P38174 421 aaKnown RBP3.29□□□□□ -1.88
RPS21AYKR057W ECM13P38195 257 aa3.29□□□□□ -1.88
RPS21AYKR057W RFS1P38234 210 aaKnown RBP3.29□□□□□ -1.88
RPS21AYKR057W ECM8P38246 354 aa3.29□□□□□ -1.88
RPS21AYKR057W FTH1P38310 465 aa3.29□□□□□ -1.88
RPS21AYKR057W PPE1P38796 400 aa3.29□□□□□ -1.88
RPS21AYKR057W NMD3P38861 518 aaKnown RBP3.29□□□□□ -1.88
RPS21AYKR057W AIM18P38884 321 aa3.29□□□□□ -1.88
RPS21AYKR057W YHR218WP38899 603 aa3.29□□□□□ -1.88
RPS21AYKR057W FAD1P38913 306 aa3.29□□□□□ -1.88
RPS21AYKR057W LYS9P38999 446 aa3.29□□□□□ -1.88
RPS21AYKR057W CEM1P39525 442 aa3.29□□□□□ -1.88
RPS21AYKR057W YER156CP40093 338 aaKnown RBP3.29□□□□□ -1.88
RPS21AYKR057W SER33P40510 469 aa3.29□□□□□ -1.88
RPS21AYKR057W LEM3P42838 414 aa3.29□□□□□ -1.88
RPS21AYKR057W RRT5P43607 289 aa3.29□□□□□ -1.88
RPS21AYKR057W IRC6P43615 237 aa3.29□□□□□ -1.88
RPS21AYKR057W SCD6P45978 349 aaKnown RBP RIP-Chip data3.29□□□□□ -1.88not detected
RPS21AYKR057W YJL132WP47014 750 aa3.29□□□□□ -1.88
RPS21AYKR057W EAF6P47128 113 aa3.29□□□□□ -1.88
RPS21AYKR057W IMD3P50095 523 aaKnown RBP3.29□□□□□ -1.88
RPS21AYKR057W RAI1P53063 387 aaKnown RBP3.29□□□□□ -1.88
RPS21AYKR057W SPC105P53148 917 aa3.29□□□□□ -1.88
RPS21AYKR057W TWF1P53250 332 aa3.29□□□□□ -1.88
RPS21AYKR057W CLD1P53264 445 aa3.29□□□□□ -1.88
RPS21AYKR057W YGR283CP53336 341 aaPredicted RBP3.29□□□□□ -1.88
RPS21AYKR057W SLM2P53955 656 aa3.29□□□□□ -1.88
RPS21AYKR057W SPR6Q01684 191 aa3.29□□□□□ -1.88
RPS21AYKR057W SLU7Q02775 382 aaKnown RBP3.29□□□□□ -1.88
RPS21AYKR057W GAS3Q03655 524 aa3.29□□□□□ -1.88
RPS21AYKR057W FIN1Q03898 291 aa3.29□□□□□ -1.88
RPS21AYKR057W DOT1Q04089 582 aaKnown RBP3.29□□□□□ -1.88
RPS21AYKR057W PEX10Q05568 337 aa3.29□□□□□ -1.88
RPS21AYKR057W YPR196WQ06595 470 aa3.29□□□□□ -1.88
RPS21AYKR057W DTD1Q07648 150 aaKnown RBP3.29□□□□□ -1.88
RPS21AYKR057W TPO1Q07824 586 aa3.29□□□□□ -1.88
RPS21AYKR057W YLL032CQ07834 825 aaKnown RBP RIP-Chip data3.29□□□□□ -1.88not detected
RPS21AYKR057W FMP25Q08023 583 aa3.29□□□□□ -1.88
RPS21AYKR057W DNL4Q08387 944 aaPredicted RBP3.29□□□□□ -1.88
RPS21AYKR057W NRT1Q08485 598 aa3.29□□□□□ -1.88
RPS21AYKR057W THI21Q08975 551 aa3.29□□□□□ -1.88
RPS21AYKR057W TY3A-GQ12173 290 aa3.29□□□□□ -1.88
RPS21AYKR057W OSW2Q12202 724 aa3.29□□□□□ -1.88
Retrieved 100 of 5,963 RNA–protein pairs in 12.3 ms