RNA–Protein interactions for RNA: YGL229C

SAP4, Transcript of Protein required for function of the Sit4p protein phosphatase, yeast

Gene SAP4, Length 2,457 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
SAP4	YGL229C	STB6	P36085	766 aa		4.54	□□□□□ -1.68
SAP4	YGL229C	LDB7	P38210	180 aa		4.54	□□□□□ -1.68
SAP4	YGL229C	RFC3	P38629	340 aa		4.54	□□□□□ -1.68
SAP4	YGL229C	RPH1	P39956	796 aa		4.54	□□□□□ -1.68
SAP4	YGL229C	AXL1	P40851	1208 aa		4.54	□□□□□ -1.68
SAP4	YGL229C	FLC3	P53121	802 aa		4.54	□□□□□ -1.68
SAP4	YGL229C	GTR1	Q00582	310 aa		4.54	□□□□□ -1.68
SAP4	YGL229C	NHP10	Q03435	203 aa		4.54	□□□□□ -1.68
SAP4	YGL229C	RPN4	Q03465	531 aa		4.54	□□□□□ -1.68
SAP4	YGL229C	HPT1	Q04178	221 aa	Known RBP	4.54	□□□□□ -1.68
SAP4	YGL229C	SEG1	Q04279	960 aa		4.54	□□□□□ -1.68
SAP4	YGL229C	GTB1	Q04924	702 aa		4.54	□□□□□ -1.68
SAP4	YGL229C	YLR046C	Q12253	270 aa		4.54	□□□□□ -1.68
SAP4	YGL229C	YLR149C	Q99296	730 aa		4.54	□□□□□ -1.68
SAP4	YGL229C	RHO2	P06781	192 aa		4.53	□□□□□ -1.68
SAP4	YGL229C	DCC1	P25559	380 aa		4.53	□□□□□ -1.68
SAP4	YGL229C	GEX1	P25596	615 aa		4.53	□□□□□ -1.68
SAP4	YGL229C	PDB1	P32473	366 aa	Known RBP	4.53	□□□□□ -1.68
SAP4	YGL229C	LIP5	P32875	414 aa		4.53	□□□□□ -1.68
SAP4	YGL229C	GEX2	P36173	615 aa		4.53	□□□□□ -1.68
SAP4	YGL229C	ARP1	P38696	384 aa		4.53	□□□□□ -1.68
SAP4	YGL229C	CHS6	P40955	746 aa		4.53	□□□□□ -1.68
SAP4	YGL229C	IME4	P41833	600 aa		4.53	□□□□□ -1.68
SAP4	YGL229C	AIM14	P53109	570 aa		4.53	□□□□□ -1.68
SAP4	YGL229C	MRM2	P53123	320 aa		4.53	□□□□□ -1.68
SAP4	YGL229C	SLM2	P53955	656 aa		4.53	□□□□□ -1.68
SAP4	YGL229C	YDR132C	Q03900	495 aa		4.53	□□□□□ -1.68
SAP4	YGL229C	YDR338C	Q05497	695 aa		4.53	□□□□□ -1.68
SAP4	YGL229C	BLS1	Q06071	122 aa		4.53	□□□□□ -1.68
SAP4	YGL229C	LCB5	Q06147	687 aa	Known RBP	4.53	□□□□□ -1.68
SAP4	YGL229C	YCS4	Q06156	1176 aa		4.53	□□□□□ -1.68
SAP4	YGL229C	TMA46	Q12000	345 aa	Known RBP	4.53	□□□□□ -1.68
SAP4	YGL229C	TGL5	Q12043	749 aa		4.53	□□□□□ -1.68
SAP4	YGL229C	VPS13	Q07878	3144 aa		4.53	□□□□□ -1.68
SAP4	YGL229C	RAD3	P06839	778 aa		4.53	□□□□□ -1.68
SAP4	YGL229C	ERG20	P08524	352 aa	Known RBP	4.53	□□□□□ -1.68
SAP4	YGL229C	NMT1	P14743	455 aa		4.53	□□□□□ -1.68
SAP4	YGL229C	PRP4	P20053	465 aa	Known RBP	4.53	□□□□□ -1.68
SAP4	YGL229C	ARG1	P22768	420 aa		4.53	□□□□□ -1.68
SAP4	YGL229C	SEC14	P24280	304 aa	Known RBP	4.53	□□□□□ -1.68
SAP4	YGL229C	YCR090C	P25654	182 aa	Known RBP	4.53	□□□□□ -1.68
SAP4	YGL229C	TFA2	P36145	328 aa		4.53	□□□□□ -1.68
SAP4	YGL229C	VRP1	P37370	817 aa		4.53	□□□□□ -1.68
SAP4	YGL229C	FZO1	P38297	855 aa		4.53	□□□□□ -1.68
SAP4	YGL229C	MUP3	P38734	546 aa		4.53	□□□□□ -1.68
SAP4	YGL229C	DUN1	P39009	513 aa		4.53	□□□□□ -1.68
SAP4	YGL229C	FRT2	P39734	528 aa		4.53	□□□□□ -1.68
SAP4	YGL229C	UBP7	P40453	1071 aa		4.53	□□□□□ -1.68
SAP4	YGL229C	HOS4	P40480	1083 aa		4.53	□□□□□ -1.68
SAP4	YGL229C	AIM23	P47015	356 aa		4.53	□□□□□ -1.68
SAP4	YGL229C	MAD3	P47074	515 aa		4.53	□□□□□ -1.68
SAP4	YGL229C	AMA1	P50082	593 aa		4.53	□□□□□ -1.68
SAP4	YGL229C	YPR114W	Q06107	315 aa		4.53	□□□□□ -1.68
SAP4	YGL229C	SEC10	Q06245	871 aa		4.53	□□□□□ -1.68
SAP4	YGL229C	GTT2	Q12390	233 aa		4.53	□□□□□ -1.68
SAP4	YGL229C	GAL11	P19659	1081 aa		4.52	□□□□□ -1.69
SAP4	YGL229C	BET2	P20133	325 aa		4.52	□□□□□ -1.69
SAP4	YGL229C	RPB4	P20433	221 aa	Predicted RBP	4.52	□□□□□ -1.69
SAP4	YGL229C	PYC2	P32327	1180 aa	Known RBP	4.52	□□□□□ -1.69
SAP4	YGL229C	GCD11	P32481	527 aa	Known RBP	4.52	□□□□□ -1.69
SAP4	YGL229C	YSC84	P32793	468 aa		4.52	□□□□□ -1.69
SAP4	YGL229C	ALY1	P36117	915 aa		4.52	□□□□□ -1.69
SAP4	YGL229C	FTH1	P38310	465 aa		4.52	□□□□□ -1.69
SAP4	YGL229C	GND1	P38720	489 aa	Known RBP	4.52	□□□□□ -1.69
SAP4	YGL229C	BZZ1	P38822	633 aa		4.52	□□□□□ -1.69
SAP4	YGL229C	DOT6	P40059	670 aa	Known RBP	4.52	□□□□□ -1.69
SAP4	YGL229C	GYP8	P43570	497 aa		4.52	□□□□□ -1.69
SAP4	YGL229C	MIG2	P53035	382 aa		4.52	□□□□□ -1.69
SAP4	YGL229C	SAP4	P53036	818 aa		4.52	□□□□□ -1.69
SAP4	YGL229C	BOL2	P53082	120 aa		4.52	□□□□□ -1.69
SAP4	YGL229C	TIM13	P53299	105 aa		4.52	□□□□□ -1.69
SAP4	YGL229C	PIR1	Q03178	341 aa		4.52	□□□□□ -1.69
SAP4	YGL229C	CCE1	Q03702	353 aa		4.52	□□□□□ -1.69
SAP4	YGL229C	YDR131C	Q03899	556 aa		4.52	□□□□□ -1.69
SAP4	YGL229C	RPN9	Q04062	393 aa	Known RBP	4.52	□□□□□ -1.69
SAP4	YGL229C	TMN2	Q04562	672 aa		4.52	□□□□□ -1.69
SAP4	YGL229C	HDA3	Q06623	655 aa		4.52	□□□□□ -1.69
SAP4	YGL229C	PSR1	Q07800	427 aa		4.52	□□□□□ -1.69
SAP4	YGL229C	NUS1	Q12063	375 aa		4.52	□□□□□ -1.69
SAP4	YGL229C	MDY2	Q12285	212 aa		4.52	□□□□□ -1.69
SAP4	YGL229C	HEM2	P05373	342 aa		4.52	□□□□□ -1.69
SAP4	YGL229C	YMR085W	P0CF18	432 aa		4.52	□□□□□ -1.69
SAP4	YGL229C	PRP6	P19735	899 aa	Predicted RBP	4.52	□□□□□ -1.69
SAP4	YGL229C	KIN3	P22209	435 aa		4.52	□□□□□ -1.69
SAP4	YGL229C	PXA2	P34230	853 aa		4.52	□□□□□ -1.69
SAP4	YGL229C	NEM1	P38757	446 aa		4.52	□□□□□ -1.69
SAP4	YGL229C	ERP5	P38819	212 aa		4.52	□□□□□ -1.69
SAP4	YGL229C	ACO2	P39533	789 aa		4.52	□□□□□ -1.69
SAP4	YGL229C	PYK2	P52489	506 aa	Known RBP	4.52	□□□□□ -1.69
SAP4	YGL229C	NUP84	P52891	726 aa		4.52	□□□□□ -1.69
SAP4	YGL229C	SPC105	P53148	917 aa		4.52	□□□□□ -1.69
SAP4	YGL229C	UBP2	Q01476	1272 aa		4.52	□□□□□ -1.69
SAP4	YGL229C	NPL3	Q01560	414 aa	Known RBP RIP-Chip data	4.52	□□□□□ -1.69	not detected
SAP4	YGL229C	YOR012W	Q12351	137 aa		4.52	□□□□□ -1.69
SAP4	YGL229C	PDH1	Q12428	516 aa	Known RBP	4.52	□□□□□ -1.69
SAP4	YGL229C	AHA1	Q12449	350 aa	Known RBP	4.52	□□□□□ -1.69
SAP4	YGL229C	NHA1	Q99271	985 aa		4.52	□□□□□ -1.69
SAP4	YGL229C	STE2	D6VTK4	431 aa		4.51	□□□□□ -1.69
SAP4	YGL229C	SEM1	O94742	89 aa		4.51	□□□□□ -1.69
SAP4	YGL229C	GLN4	P13188	809 aa	Known RBP	4.51	□□□□□ -1.69

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