RNA–Protein interactions for RNA: YBR228W

SLX1, Transcript of Endonuclease involved in DNA recombination and repair, yeast

Gene SLX1, Length 915 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
SLX1	YBR228W	VPS8	P39702	1274 aa		4.85	□□□□□ -1.63
SLX1	YBR228W	SSP120	P39931	234 aa	Known RBP	4.85	□□□□□ -1.63
SLX1	YBR228W	VFA1	P40080	203 aa		4.85	□□□□□ -1.63
SLX1	YBR228W	RAD26	P40352	1085 aa		4.85	□□□□□ -1.63
SLX1	YBR228W	EAF6	P47128	113 aa		4.85	□□□□□ -1.63
SLX1	YBR228W	YGL081W	P53156	320 aa		4.85	□□□□□ -1.63
SLX1	YBR228W	RAD34	Q06665	692 aa		4.85	□□□□□ -1.63
SLX1	YBR228W	BUD7	Q08754	746 aa		4.85	□□□□□ -1.63
SLX1	YBR228W	PSF3	Q12146	194 aa		4.85	□□□□□ -1.63
SLX1	YBR228W	DBP10	Q12389	995 aa	Known RBP	4.85	□□□□□ -1.63
SLX1	YBR228W	FIG2	P25653	1609 aa		4.84	□□□□□ -1.63
SLX1	YBR228W	SUP35	P05453	685 aa	Known RBP	4.84	□□□□□ -1.63
SLX1	YBR228W	SMY1	P32364	656 aa	Known RBP	4.84	□□□□□ -1.63
SLX1	YBR228W	YBR071W	P38243	211 aa		4.84	□□□□□ -1.63
SLX1	YBR228W	SYF1	Q04048	859 aa	Predicted RBP	4.84	□□□□□ -1.63
SLX1	YBR228W	LYS21	Q12122	440 aa	Known RBP	4.84	□□□□□ -1.63
SLX1	YBR228W	GET3	Q12154	354 aa	Known RBP	4.84	□□□□□ -1.63
SLX1	YBR228W	TMA17	Q12513	150 aa		4.84	□□□□□ -1.63
SLX1	YBR228W	AIM17	P23180	465 aa	Known RBP	4.83	□□□□□ -1.64
SLX1	YBR228W	YCR061W	P25639	631 aa		4.83	□□□□□ -1.64
SLX1	YBR228W	RPS7A	P26786	190 aa	Known RBP	4.83	□□□□□ -1.64
SLX1	YBR228W	FRD1	P32614	470 aa	Known RBP	4.83	□□□□□ -1.64
SLX1	YBR228W	GND1	P38720	489 aa	Known RBP	4.83	□□□□□ -1.64
SLX1	YBR228W	NOP2	P40991	618 aa	Known RBP	4.83	□□□□□ -1.64
SLX1	YBR228W	YJR120W	P47157	116 aa		4.83	□□□□□ -1.64
SLX1	YBR228W	DOS2	P54858	310 aa		4.83	□□□□□ -1.64
SLX1	YBR228W	ERO1	Q03103	563 aa		4.83	□□□□□ -1.64
SLX1	YBR228W	TRS31	Q03337	283 aa		4.83	□□□□□ -1.64
SLX1	YBR228W	SNU66	Q12420	587 aa	Predicted RBP	4.83	□□□□□ -1.64
SLX1	YBR228W	GSC2	P40989	1895 aa		4.82	□□□□□ -1.64
SLX1	YBR228W	ILV2	P07342	687 aa	Known RBP	4.82	□□□□□ -1.64
SLX1	YBR228W	TFC4	P33339	1025 aa		4.82	□□□□□ -1.64
SLX1	YBR228W	ERV46	P39727	415 aa		4.82	□□□□□ -1.64
SLX1	YBR228W	MAF1	P41910	395 aa		4.82	□□□□□ -1.64
SLX1	YBR228W	BOP3	P53958	396 aa		4.82	□□□□□ -1.64
SLX1	YBR228W	NKP2	Q06162	153 aa		4.82	□□□□□ -1.64
SLX1	YBR228W	THI3	Q07471	609 aa		4.82	□□□□□ -1.64
SLX1	YBR228W	ATX2	Q12067	313 aa		4.82	□□□□□ -1.64
SLX1	YBR228W	NCB2	Q92317	146 aa		4.82	□□□□□ -1.64
SLX1	YBR228W	SEC18	P18759	758 aa	Known RBP	4.81	□□□□□ -1.64
SLX1	YBR228W	SIP1	P32578	815 aa		4.81	□□□□□ -1.64
SLX1	YBR228W	RFC1	P38630	861 aa	Known RBP	4.81	□□□□□ -1.64
SLX1	YBR228W	YNL144C	P53907	740 aa		4.81	□□□□□ -1.64
SLX1	YBR228W	PHM6	Q05637	104 aa		4.81	□□□□□ -1.64
SLX1	YBR228W	ECM22	Q05958	814 aa	Predicted RBP	4.81	□□□□□ -1.64
SLX1	YBR228W	SRL1	Q08673	210 aa		4.81	□□□□□ -1.64
SLX1	YBR228W	NUR1	Q12066	484 aa		4.81	□□□□□ -1.64
SLX1	YBR228W	POM152	P39685	1337 aa		4.8	□□□□□ -1.64
SLX1	YBR228W	PDR18	P53756	1333 aa		4.8	□□□□□ -1.64
SLX1	YBR228W	SES1	P07284	462 aa	Known RBP	4.8	□□□□□ -1.64
SLX1	YBR228W	CDC16	P09798	840 aa		4.8	□□□□□ -1.64
SLX1	YBR228W	PHO3	P24031	467 aa		4.8	□□□□□ -1.64
SLX1	YBR228W	KTR3	P38130	404 aa	Predicted RBP	4.8	□□□□□ -1.64
SLX1	YBR228W	SPL2	P38839	148 aa		4.8	□□□□□ -1.64
SLX1	YBR228W	YAT2	P40017	923 aa		4.8	□□□□□ -1.64
SLX1	YBR228W	SCS2	P40075	244 aa	Known RBP	4.8	□□□□□ -1.64
SLX1	YBR228W	YGL242C	P53066	181 aa		4.8	□□□□□ -1.64
SLX1	YBR228W	YNL034W	P53963	612 aa		4.8	□□□□□ -1.64
SLX1	YBR228W	YAT1	P80235	687 aa		4.8	□□□□□ -1.64
SLX1	YBR228W	ECM16	Q04217	1267 aa	Known RBP	4.8	□□□□□ -1.64
SLX1	YBR228W	DSE3	Q08729	430 aa		4.8	□□□□□ -1.64
SLX1	YBR228W	RRI1	Q12468	440 aa		4.8	□□□□□ -1.64
SLX1	YBR228W	RAD50	P12753	1312 aa		4.79	□□□□□ -1.64
SLX1	YBR228W	KRE2	P27809	442 aa		4.79	□□□□□ -1.64
SLX1	YBR228W	ARB1	P40024	610 aa	Known RBP	4.79	□□□□□ -1.64
SLX1	YBR228W	YPT11	P48559	417 aa		4.79	□□□□□ -1.64
SLX1	YBR228W	ORC5	P50874	479 aa		4.79	□□□□□ -1.64
SLX1	YBR228W	MLC1	P53141	149 aa		4.79	□□□□□ -1.64
SLX1	YBR228W	RPT4	P53549	437 aa	Known RBP	4.79	□□□□□ -1.64
SLX1	YBR228W	ACS1	Q01574	713 aa		4.79	□□□□□ -1.64
SLX1	YBR228W	VTC3	Q02725	835 aa		4.79	□□□□□ -1.64
SLX1	YBR228W	UBX3	Q12229	455 aa		4.79	□□□□□ -1.64
SLX1	YBR228W	GRX6	Q12438	231 aa		4.79	□□□□□ -1.64
SLX1	YBR228W	KGD2	P19262	463 aa	Predicted RBP	4.78	□□□□□ -1.64
SLX1	YBR228W	ICL1	P28240	557 aa	Predicted RBP	4.78	□□□□□ -1.64
SLX1	YBR228W	TGL1	P34163	548 aa		4.78	□□□□□ -1.64
SLX1	YBR228W	RPF2	P36160	344 aa	Known RBP	4.78	□□□□□ -1.64
SLX1	YBR228W	VBA2	P38358	474 aa	Known RBP	4.78	□□□□□ -1.64
SLX1	YBR228W	POL31	P46957	487 aa		4.78	□□□□□ -1.64
SLX1	YBR228W	COG6	P53959	839 aa		4.78	□□□□□ -1.64
SLX1	YBR228W	ARA2	Q04212	335 aa		4.78	□□□□□ -1.64
SLX1	YBR228W	TRI1	Q05024	226 aa		4.78	□□□□□ -1.64
SLX1	YBR228W	YPL191C	Q08930	360 aa		4.78	□□□□□ -1.64
SLX1	YBR228W	SLX4	Q12098	748 aa		4.78	□□□□□ -1.64
SLX1	YBR228W	YPT1	P01123	206 aa	Known RBP	4.77	□□□□□ -1.65
SLX1	YBR228W	VAS1	P07806	1104 aa	Known RBP	4.77	□□□□□ -1.65
SLX1	YBR228W	MSS51	P32335	436 aa		4.77	□□□□□ -1.65
SLX1	YBR228W	TOM71	P38825	639 aa	Known RBP	4.77	□□□□□ -1.65
SLX1	YBR228W	IRC4	Q03036	179 aa		4.77	□□□□□ -1.65
SLX1	YBR228W	UBX2	Q04228	584 aa		4.77	□□□□□ -1.65
SLX1	YBR228W	RRI2	Q12348	645 aa		4.77	□□□□□ -1.65
SLX1	YBR228W	TOP1	P04786	769 aa		4.76	□□□□□ -1.65
SLX1	YBR228W	PIF1	P07271	859 aa		4.76	□□□□□ -1.65
SLX1	YBR228W	CNA1	P23287	553 aa		4.76	□□□□□ -1.65
SLX1	YBR228W	LCB1	P25045	558 aa	Known RBP	4.76	□□□□□ -1.65
SLX1	YBR228W	GSH1	P32477	678 aa		4.76	□□□□□ -1.65
SLX1	YBR228W	SAW1	P39735	261 aa		4.76	□□□□□ -1.65
SLX1	YBR228W	PEX14	P53112	341 aa		4.76	□□□□□ -1.65
SLX1	YBR228W	PIB2	P53191	635 aa		4.76	□□□□□ -1.65
SLX1	YBR228W	YMR034C	Q05131	434 aa	Predicted RBP	4.76	□□□□□ -1.65

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