RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000615445.4

PTPRJ-208, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type J, humanhuman

APPRIS ALT2 TSL 5 BASIC

Gene PTPRJ, Length 4,773 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Endoplasmic reticulum, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRJ-208ENST00000615445 NT5C3AQ9H0P0 336 aa23.08■■□□□ 1.28
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PTPRJ-208ENST00000615445 IFT74Q96LB3 600 aa23.08■■□□□ 1.28
PTPRJ-208ENST00000615445 ZNF408Q9H9D4 720 aa23.08■■□□□ 1.28
PTPRJ-208ENST00000615445 PTGDRQ13258 359 aa23.07■■□□□ 1.28
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PTPRJ-208ENST00000615445 NCAPD2Q15021 1401 aa23.07■■□□□ 1.28
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PTPRJ-208ENST00000615445 NEK8Q86SG6 692 aa23.07■■□□□ 1.28
PTPRJ-208ENST00000615445 TMEM87AQ8NBN3 555 aa23.07■■□□□ 1.28
PTPRJ-208ENST00000615445 KRBA2Q6ZNG9 492 aa23.07■■□□□ 1.28
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PTPRJ-208ENST00000615445 RTEL1Q9NZ71 1219 aa23.06■■□□□ 1.28
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PTPRJ-208ENST00000615445 RNF26Q9BY78 433 aaPredicted RBP23.05■■□□□ 1.28
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PTPRJ-208ENST00000615445 SLC39A14Q15043 492 aa23.04■■□□□ 1.28
PTPRJ-208ENST00000615445 PRR16Q569H4 304 aa23.04■■□□□ 1.28
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PTPRJ-208ENST00000615445 CARD6Q9BX69 1037 aa23.04■■□□□ 1.28
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PTPRJ-208ENST00000615445 A0A1W2PQ27 194 aa23.03■■□□□ 1.28
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PTPRJ-208ENST00000615445 A0A1W2PQD8 194 aa23.03■■□□□ 1.28
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PTPRJ-208ENST00000615445 FANCLQ9NW38 375 aa23.02■■□□□ 1.28
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PTPRJ-208ENST00000615445 MCAMP43121 646 aa23.01■■□□□ 1.27
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PTPRJ-208ENST00000615445 THRAP3Q9Y2W1 955 aaKnown RBP23.01■■□□□ 1.27
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PTPRJ-208ENST00000615445 ATP2A1O14983 1001 aa23.01■■□□□ 1.27
PTPRJ-208ENST00000615445 GPBP1Q86WP2 473 aa23.01■■□□□ 1.27
PTPRJ-208ENST00000615445 KIFAP3Q92845 792 aa23.01■■□□□ 1.27
PTPRJ-208ENST00000615445 FOXP1Q9H334 677 aaPredicted RBP23.01■■□□□ 1.27
PTPRJ-208ENST00000615445 KDM3AQ9Y4C1 1321 aa23.01■■□□□ 1.27
PTPRJ-208ENST00000615445 ALAS1P13196 640 aa23.01■■□□□ 1.27
PTPRJ-208ENST00000615445 TERF1P54274 439 aa23.01■■□□□ 1.27
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