RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000506197.2

SMIM20-201, Transcript of small integral membrane protein 20, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene SMIM20, Length 935 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMIM20-201ENST00000506197 RGS19P49795 217 aa23.58■■□□□ 1.37
SMIM20-201ENST00000506197 NEK4P51957 841 aa23.58■■□□□ 1.37
SMIM20-201ENST00000506197 EXOSC10Q01780 885 aaKnown RBP23.58■■□□□ 1.37
SMIM20-201ENST00000506197 ATP2B2Q01814 1243 aa23.58■■□□□ 1.37
SMIM20-201ENST00000506197 ICA1Q05084 483 aa23.58■■□□□ 1.37
SMIM20-201ENST00000506197 CRHR2Q13324 411 aa23.58■■□□□ 1.37
SMIM20-201ENST00000506197 CCL15Q16663 113 aa23.58■■□□□ 1.37
SMIM20-201ENST00000506197 TMEM67Q5HYA8 995 aa23.58■■□□□ 1.37
SMIM20-201ENST00000506197 TCEANC2Q96MN5 208 aa23.58■■□□□ 1.37
SMIM20-201ENST00000506197 GNL3Q9BVP2 549 aaKnown RBP eCLIP23.58■■□□□ 1.37
SMIM20-201ENST00000506197 PDRG1Q9NUG6 133 aa23.58■■□□□ 1.37
SMIM20-201ENST00000506197 HPS5Q9UPZ3 1129 aa23.58■■□□□ 1.37
SMIM20-201ENST00000506197 USP17L5A8MUK1 530 aa23.57■■□□□ 1.36
SMIM20-201ENST00000506197 GUCY1A2P33402 732 aa23.57■■□□□ 1.36
SMIM20-201ENST00000506197 COL9A3Q14050 684 aaPredicted RBP23.57■■□□□ 1.36
SMIM20-201ENST00000506197 WTAPQ15007 396 aa23.57■■□□□ 1.36
SMIM20-201ENST00000506197 ERO1BQ86YB8 467 aa23.57■■□□□ 1.36
SMIM20-201ENST00000506197 BRI3BPQ8WY22 251 aa23.57■■□□□ 1.36
SMIM20-201ENST00000506197 LRRC2Q9BYS8 371 aa23.57■■□□□ 1.36
SMIM20-201ENST00000506197 AS3MTQ9HBK9 375 aa23.57■■□□□ 1.36
SMIM20-201ENST00000506197 ARHGEF10LQ9HCE6 1279 aa23.57■■□□□ 1.36
SMIM20-201ENST00000506197 IL17RBQ9NRM6 502 aa23.57■■□□□ 1.36
SMIM20-201ENST00000506197 MTMR4Q9NYA4 1195 aa23.57■■□□□ 1.36
SMIM20-201ENST00000506197 STX8Q9UNK0 236 aa23.57■■□□□ 1.36
SMIM20-201ENST00000506197 TTLL1O95922 423 aa23.56■■□□□ 1.36
SMIM20-201ENST00000506197 PTPRAP18433 802 aa23.56■■□□□ 1.36
SMIM20-201ENST00000506197 MLLT1Q03111 559 aaPredicted RBP23.56■■□□□ 1.36
SMIM20-201ENST00000506197 IFIT1BQ5T764 474 aaKnown RBP23.56■■□□□ 1.36
SMIM20-201ENST00000506197 CLEC10AQ8IUN9 316 aa23.56■■□□□ 1.36
SMIM20-201ENST00000506197 ENAHQ8N8S7 591 aaPredicted RBP23.56■■□□□ 1.36
SMIM20-201ENST00000506197 TTC14Q96N46 770 aa23.56■■□□□ 1.36
SMIM20-201ENST00000506197 TBC1D2Q9BYX2 928 aa23.56■■□□□ 1.36
SMIM20-201ENST00000506197 FRMD4AQ9P2Q2 1039 aaPredicted RBP23.56■■□□□ 1.36
SMIM20-201ENST00000506197 SH2B2O14492 632 aaPredicted RBP23.55■■□□□ 1.36
SMIM20-201ENST00000506197 TNRC18O15417 2968 aaPredicted RBP23.55■■□□□ 1.36
SMIM20-201ENST00000506197 FBXO46Q6PJ61 603 aaPredicted RBP23.55■■□□□ 1.36
SMIM20-201ENST00000506197 Q6ZUG5 572 aa23.55■■□□□ 1.36
SMIM20-201ENST00000506197 DGKHQ86XP1 1220 aa23.55■■□□□ 1.36
SMIM20-201ENST00000506197 IL27Q8NEV9 243 aa23.55■■□□□ 1.36
SMIM20-201ENST00000506197 SH2D4AQ9H788 454 aa23.55■■□□□ 1.36
SMIM20-201ENST00000506197 NYAP2Q9P242 653 aa23.55■■□□□ 1.36
SMIM20-201ENST00000506197 ST18O60284 1047 aa23.54■■□□□ 1.36
SMIM20-201ENST00000506197 EEF2P13639 858 aaKnown RBP23.54■■□□□ 1.36
SMIM20-201ENST00000506197 SOX10P56693 466 aa23.54■■□□□ 1.36
SMIM20-201ENST00000506197 PPIL2Q13356 520 aa23.54■■□□□ 1.36
SMIM20-201ENST00000506197 NFXL1Q6ZNB6 911 aa23.54■■□□□ 1.36
SMIM20-201ENST00000506197 CCDC84Q86UT8 332 aaPredicted RBP23.54■■□□□ 1.36
SMIM20-201ENST00000506197 TMTC2Q8N394 836 aa23.54■■□□□ 1.36
SMIM20-201ENST00000506197 IGDCC4Q8TDY8 1250 aa23.54■■□□□ 1.36
SMIM20-201ENST00000506197 FEZ1Q99689 392 aa23.54■■□□□ 1.36
SMIM20-201ENST00000506197 CLIP2Q9UDT6 1046 aa23.54■■□□□ 1.36
SMIM20-201ENST00000506197 ZHX2Q9Y6X8 837 aa23.54■■□□□ 1.36
SMIM20-201ENST00000506197 TOP1P11387 765 aaKnown RBP23.53■■□□□ 1.36
SMIM20-201ENST00000506197 ANKRD1Q15327 319 aa23.53■■□□□ 1.36
SMIM20-201ENST00000506197 SEC23AQ15436 765 aa23.53■■□□□ 1.36
SMIM20-201ENST00000506197 TAF1CQ15572 869 aaPredicted RBP23.53■■□□□ 1.36
SMIM20-201ENST00000506197 ERO1AQ96HE7 468 aa23.53■■□□□ 1.36
SMIM20-201ENST00000506197 KAT14Q9H8E8 782 aa23.53■■□□□ 1.36
SMIM20-201ENST00000506197 LY9Q9HBG7 655 aa23.53■■□□□ 1.36
SMIM20-201ENST00000506197 PTPRFP10586 1907 aa23.53■■□□□ 1.36
SMIM20-201ENST00000506197 CENPFP49454 3210 aa23.52■■□□□ 1.36
SMIM20-201ENST00000506197 CCDC69A6NI79 296 aa23.52■■□□□ 1.36
SMIM20-201ENST00000506197 IRF6O14896 467 aa23.52■■□□□ 1.36
SMIM20-201ENST00000506197 CETPP11597 493 aa23.52■■□□□ 1.36
SMIM20-201ENST00000506197 LIFRP42702 1097 aa23.52■■□□□ 1.36
SMIM20-201ENST00000506197 PPATQ06203 517 aa23.52■■□□□ 1.36
SMIM20-201ENST00000506197 SNAPC2Q13487 334 aa23.52■■□□□ 1.36
SMIM20-201ENST00000506197 FAM43AQ8N2R8 423 aa23.52■■□□□ 1.36
SMIM20-201ENST00000506197 ZNF280CQ8ND82 737 aa23.52■■□□□ 1.36
SMIM20-201ENST00000506197 ANKS1AQ92625 1134 aa23.52■■□□□ 1.36
SMIM20-201ENST00000506197 WDR18Q9BV38 432 aa23.52■■□□□ 1.36
SMIM20-201ENST00000506197 TRIM17Q9Y577 477 aa23.52■■□□□ 1.36
SMIM20-201ENST00000506197 NOVP48745 357 aa23.51■■□□□ 1.35
SMIM20-201ENST00000506197 RCSD1Q6JBY9 416 aa23.51■■□□□ 1.35
SMIM20-201ENST00000506197 FBXL16Q8N461 479 aa23.51■■□□□ 1.35
SMIM20-201ENST00000506197 CD99L2Q8TCZ2 262 aa23.51■■□□□ 1.35
SMIM20-201ENST00000506197 BRF1Q92994 677 aa23.51■■□□□ 1.35
SMIM20-201ENST00000506197 TMEM47Q9BQJ4 181 aa23.51■■□□□ 1.35
SMIM20-201ENST00000506197 ALDH8A1Q9H2A2 487 aaPredicted RBP23.51■■□□□ 1.35
SMIM20-201ENST00000506197 GPHNQ9NQX3 736 aaPredicted RBP23.51■■□□□ 1.35
SMIM20-201ENST00000506197 PDE4DIPQ5VU43 2346 aa23.51■■□□□ 1.35
SMIM20-201ENST00000506197 AK2P54819 239 aa23.5■■□□□ 1.35
SMIM20-201ENST00000506197 OTOP1Q7RTM1 612 aa23.5■■□□□ 1.35
SMIM20-201ENST00000506197 LRRC47Q8N1G4 583 aaKnown RBP23.5■■□□□ 1.35
SMIM20-201ENST00000506197 ACER1Q8TDN7 264 aa23.5■■□□□ 1.35
SMIM20-201ENST00000506197 MKL1Q969V6 931 aa23.5■■□□□ 1.35
SMIM20-201ENST00000506197 AGXT2Q9BYV1 514 aa23.5■■□□□ 1.35
SMIM20-201ENST00000506197 ZFYVE28Q9HCC9 887 aa23.5■■□□□ 1.35
SMIM20-201ENST00000506197 GOPCQ9HD26 462 aa23.5■■□□□ 1.35
SMIM20-201ENST00000506197 SYNPO2Q9UMS6 1093 aa23.5■■□□□ 1.35
SMIM20-201ENST00000506197 TRIM75PA6NK02 468 aa23.49■■□□□ 1.35
SMIM20-201ENST00000506197 USP17L10C9JJH3 530 aa23.49■■□□□ 1.35
SMIM20-201ENST00000506197 SP3Q02447 781 aa23.49■■□□□ 1.35
SMIM20-201ENST00000506197 SPP2Q13103 211 aa23.49■■□□□ 1.35
SMIM20-201ENST00000506197 SYNE3Q6ZMZ3 975 aa23.49■■□□□ 1.35
SMIM20-201ENST00000506197 CATIPQ7Z7H3 387 aa23.49■■□□□ 1.35
SMIM20-201ENST00000506197 SIAH1Q8IUQ4 282 aa23.49■■□□□ 1.35
SMIM20-201ENST00000506197 PNMA1Q8ND90 353 aa23.49■■□□□ 1.35
SMIM20-201ENST00000506197 ZCCHC17Q9NP64 241 aaKnown RBP23.49■■□□□ 1.35
SMIM20-201ENST00000506197 NAP1L2Q9ULW6 460 aaPredicted RBP23.49■■□□□ 1.35
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 103.1 ms