RNA–Protein interactions for RNA: YNL207W

RIO2, Essential serine kinase involved in the processing of 20S pre-rRNA, yeast

Gene RIO2, Length 1,278 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
RIO2	YNL207W	BUD16	P39988	312 aa		3.06	□□□□□ -1.92
RIO2	YNL207W	SSM4	P40318	1319 aa		3.06	□□□□□ -1.92
RIO2	YNL207W	SAP185	P40856	1058 aa		3.06	□□□□□ -1.92
RIO2	YNL207W	MDV1	P47025	714 aa		3.06	□□□□□ -1.92
RIO2	YNL207W	YGR079W	P53249	370 aa		3.06	□□□□□ -1.92
RIO2	YNL207W	MOT3	P54785	490 aa	Known RBP	3.06	□□□□□ -1.92
RIO2	YNL207W	MRPL13	Q02204	264 aa		3.06	□□□□□ -1.92
RIO2	YNL207W	NUP53	Q03790	475 aa		3.06	□□□□□ -1.92
RIO2	YNL207W	THI3	Q07471	609 aa		3.06	□□□□□ -1.92
RIO2	YNL207W	SRL1	Q08673	210 aa		3.06	□□□□□ -1.92
RIO2	YNL207W	ATX2	Q12067	313 aa		3.06	□□□□□ -1.92
RIO2	YNL207W	RVB2	Q12464	471 aa	Known RBP	3.06	□□□□□ -1.92
RIO2	YNL207W	RRI1	Q12468	440 aa		3.06	□□□□□ -1.92
RIO2	YNL207W	ADE3	P07245	946 aa	Known RBP	3.05	□□□□□ -1.92
RIO2	YNL207W	SWI4	P25302	1093 aa	Known RBP	3.05	□□□□□ -1.92
RIO2	YNL207W	LAC1	P28496	418 aa		3.05	□□□□□ -1.92
RIO2	YNL207W	XRS2	P33301	854 aa		3.05	□□□□□ -1.92
RIO2	YNL207W	VPS24	P36095	224 aa	Known RBP	3.05	□□□□□ -1.92
RIO2	YNL207W	ARN1	P38731	627 aa		3.05	□□□□□ -1.92
RIO2	YNL207W	VPS41	P38959	992 aa		3.05	□□□□□ -1.92
RIO2	YNL207W	SMK1	P41808	388 aa		3.05	□□□□□ -1.92
RIO2	YNL207W	ZAP1	P47043	880 aa		3.05	□□□□□ -1.92
RIO2	YNL207W	ORC5	P50874	479 aa		3.05	□□□□□ -1.92
RIO2	YNL207W	IMA1	P53051	589 aa		3.05	□□□□□ -1.92
RIO2	YNL207W	YRB30	P53107	440 aa	Predicted RBP	3.05	□□□□□ -1.92
RIO2	YNL207W	LSC1	P53598	329 aa	Known RBP	3.05	□□□□□ -1.92
RIO2	YNL207W	MTG1	Q03151	367 aa	Predicted RBP	3.05	□□□□□ -1.92
RIO2	YNL207W	TRS130	Q03660	1102 aa		3.05	□□□□□ -1.92
RIO2	YNL207W	SNA4	Q07549	140 aa		3.05	□□□□□ -1.92
RIO2	YNL207W	PUF2	Q12221	1075 aa	Known RBP RIP-Chip data	3.05	□□□□□ -1.92	not detected
RIO2	YNL207W	SUL2	Q12325	893 aa		3.05	□□□□□ -1.92
RIO2	YNL207W	SPO16	P17122	198 aa		3.04	□□□□□ -1.92
RIO2	YNL207W	URK1	P27515	501 aa		3.04	□□□□□ -1.92
RIO2	YNL207W	TPA1	P40032	644 aa	Known RBP	3.04	□□□□□ -1.92
RIO2	YNL207W	YIL161W	P40449	235 aa	Known RBP	3.04	□□□□□ -1.92
RIO2	YNL207W	IML2	P47031	731 aa		3.04	□□□□□ -1.92
RIO2	YNL207W	GTB1	Q04924	702 aa		3.04	□□□□□ -1.92
RIO2	YNL207W	ATG23	Q06671	453 aa		3.04	□□□□□ -1.92
RIO2	YNL207W	MLH2	Q07980	695 aa		3.04	□□□□□ -1.92
RIO2	YNL207W	TPK1	P06244	397 aa		3.03	□□□□□ -1.92
RIO2	YNL207W	YFL068W	P0CX99	160 aa		3.03	□□□□□ -1.92
RIO2	YNL207W	YLL066W-A	P0CY00	160 aa		3.03	□□□□□ -1.92
RIO2	YNL207W	YLL067W-A	P0CY01	160 aa		3.03	□□□□□ -1.92
RIO2	YNL207W	BIK1	P11709	440 aa		3.03	□□□□□ -1.92
RIO2	YNL207W	PCT1	P13259	424 aa		3.03	□□□□□ -1.92
RIO2	YNL207W	YCR043C	P25361	127 aa		3.03	□□□□□ -1.92
RIO2	YNL207W	DBF20	P32328	564 aa		3.03	□□□□□ -1.92
RIO2	YNL207W	ARP2	P32381	391 aa	Known RBP	3.03	□□□□□ -1.92
RIO2	YNL207W	SPC72	P39723	622 aa		3.03	□□□□□ -1.92
RIO2	YNL207W	PUG1	P40100	303 aa		3.03	□□□□□ -1.92
RIO2	YNL207W	YIR016W	P40572	265 aa		3.03	□□□□□ -1.92
RIO2	YNL207W	YPT11	P48559	417 aa		3.03	□□□□□ -1.92
RIO2	YNL207W	PIG1	Q06216	648 aa		3.03	□□□□□ -1.92
RIO2	YNL207W	BUD7	Q08754	746 aa		3.03	□□□□□ -1.92
RIO2	YNL207W	UBX3	Q12229	455 aa		3.03	□□□□□ -1.92
RIO2	YNL207W	CDC15	P27636	974 aa		3.02	□□□□□ -1.93
RIO2	YNL207W	MSS51	P32335	436 aa		3.02	□□□□□ -1.93
RIO2	YNL207W	OCT1	P35999	772 aa		3.02	□□□□□ -1.93
RIO2	YNL207W	TEF4	P36008	412 aa	Known RBP	3.02	□□□□□ -1.93
RIO2	YNL207W	ARC40	P38328	384 aa	Known RBP	3.02	□□□□□ -1.93
RIO2	YNL207W	PHM8	P40025	321 aa		3.02	□□□□□ -1.93
RIO2	YNL207W	KAP123	P40069	1113 aa	Known RBP	3.02	□□□□□ -1.93
RIO2	YNL207W	DJP1	P40564	432 aa		3.02	□□□□□ -1.93
RIO2	YNL207W	MSY1	P48527	492 aa		3.02	□□□□□ -1.93
RIO2	YNL207W	YGR021W	P53212	290 aa		3.02	□□□□□ -1.93
RIO2	YNL207W	ECM22	Q05958	814 aa	Predicted RBP	3.02	□□□□□ -1.93
RIO2	YNL207W	PDR8	Q06149	701 aa		3.02	□□□□□ -1.93
RIO2	YNL207W	CSR1	Q06705	408 aa	Known RBP	3.02	□□□□□ -1.93
RIO2	YNL207W	DSE3	Q08729	430 aa		3.02	□□□□□ -1.93
RIO2	YNL207W	ERG27	Q12452	347 aa	Known RBP	3.02	□□□□□ -1.93
RIO2	YNL207W	ATP2	P00830	511 aa	Known RBP	3.01	□□□□□ -1.93
RIO2	YNL207W	RPL42A	P0CX27	106 aa	Known RBP	3.01	□□□□□ -1.93
RIO2	YNL207W	RPL42B	P0CX28	106 aa	Known RBP	3.01	□□□□□ -1.93
RIO2	YNL207W	NOP1	P15646	327 aa	Known RBP	3.01	□□□□□ -1.93
RIO2	YNL207W	YSP3	P25036	478 aa		3.01	□□□□□ -1.93
RIO2	YNL207W	YCL049C	P25577	312 aa		3.01	□□□□□ -1.93
RIO2	YNL207W	CNS1	P33313	385 aa		3.01	□□□□□ -1.93
RIO2	YNL207W	GEX2	P36173	615 aa		3.01	□□□□□ -1.93
RIO2	YNL207W	PSY4	P38193	441 aa		3.01	□□□□□ -1.93
RIO2	YNL207W	YBR138C	P38277	524 aa		3.01	□□□□□ -1.93
RIO2	YNL207W	IST3	P40565	148 aa	Predicted RBP	3.01	□□□□□ -1.93
RIO2	YNL207W	TES1	P41903	349 aa	Known RBP	3.01	□□□□□ -1.93
RIO2	YNL207W	ASE1	P50275	885 aa		3.01	□□□□□ -1.93
RIO2	YNL207W	BOP3	P53958	396 aa		3.01	□□□□□ -1.93
RIO2	YNL207W	CAC2	Q04199	468 aa		3.01	□□□□□ -1.93
RIO2	YNL207W	YDR109C	Q04585	715 aa		3.01	□□□□□ -1.93
RIO2	YNL207W	YMR034C	Q05131	434 aa	Predicted RBP	3.01	□□□□□ -1.93
RIO2	YNL207W	GSH2	Q08220	491 aa		3.01	□□□□□ -1.93
RIO2	YNL207W	NDD1	Q08887	554 aa		3.01	□□□□□ -1.93
RIO2	YNL207W	SWT1	Q12104	458 aa		3.01	□□□□□ -1.93
RIO2	YNL207W	GPA1	P08539	472 aa		3	□□□□□ -1.93
RIO2	YNL207W	SUI3	P09064	285 aa	Known RBP	3	□□□□□ -1.93
RIO2	YNL207W	YML003W	P0CF16	290 aa		3	□□□□□ -1.93
RIO2	YNL207W	ASG1	P40467	964 aa		3	□□□□□ -1.93
RIO2	YNL207W	MAF1	P41910	395 aa		3	□□□□□ -1.93
RIO2	YNL207W	YGL036W	P53185	909 aa	Predicted RBP	3	□□□□□ -1.93
RIO2	YNL207W	DCP2	P53550	970 aa	Known RBP	3	□□□□□ -1.93
RIO2	YNL207W	YNL144C	P53907	740 aa		3	□□□□□ -1.93
RIO2	YNL207W	YMR018W	Q04364	514 aa		3	□□□□□ -1.93
RIO2	YNL207W	BAG7	Q12128	409 aa		3	□□□□□ -1.93

Retrieved 100 of 5,963 RNA–protein pairs in 307.3 ms