RNA–Protein interactions for RNA: YNL093W

YPT53, Transcript of Stress-induced Rab family GTPase, yeast

Gene YPT53, Length 663 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
YPT53	YNL093W	VID22	Q05934	901 aa		4.13	□□□□□ -1.75
YPT53	YNL093W	YLR225C	Q05948	407 aa	Known RBP	4.13	□□□□□ -1.75
YPT53	YNL093W	BOP2	Q06150	570 aa		4.13	□□□□□ -1.75
YPT53	YNL093W	YCS4	Q06156	1176 aa		4.13	□□□□□ -1.75
YPT53	YNL093W	ATG17	Q06410	417 aa		4.13	□□□□□ -1.75
YPT53	YNL093W	SNA4	Q07549	140 aa		4.13	□□□□□ -1.75
YPT53	YNL093W	TLG2	Q08144	397 aa		4.13	□□□□□ -1.75
YPT53	YNL093W	ABP140	Q08641	628 aa	Known RBP	4.13	□□□□□ -1.75
YPT53	YNL093W	TGL5	Q12043	749 aa		4.13	□□□□□ -1.75
YPT53	YNL093W	YPR027C	Q12079	277 aa		4.13	□□□□□ -1.75
YPT53	YNL093W	CHS5	Q12114	671 aa	Known RBP	4.13	□□□□□ -1.75
YPT53	YNL093W	LDB17	Q12342	491 aa		4.13	□□□□□ -1.75
YPT53	YNL093W	YLL067C	Q07888	1374 aa		4.13	□□□□□ -1.75
YPT53	YNL093W	ECM5	Q03214	1411 aa		4.12	□□□□□ -1.75
YPT53	YNL093W	NOT3	P06102	836 aa	Known RBP	4.12	□□□□□ -1.75
YPT53	YNL093W	TOP3	P13099	656 aa		4.12	□□□□□ -1.75
YPT53	YNL093W	YAK1	P14680	807 aa		4.12	□□□□□ -1.75
YPT53	YNL093W	OLE1	P21147	510 aa	Known RBP	4.12	□□□□□ -1.75
YPT53	YNL093W	DPB2	P24482	689 aa	Predicted RBP	4.12	□□□□□ -1.75
YPT53	YNL093W	CLB1	P24868	471 aa		4.12	□□□□□ -1.75
YPT53	YNL093W	YCR016W	P25617	290 aa	Known RBP	4.12	□□□□□ -1.75
YPT53	YNL093W	ERG1	P32476	496 aa	Known RBP	4.12	□□□□□ -1.75
YPT53	YNL093W	AFG2	P32794	780 aa		4.12	□□□□□ -1.75
YPT53	YNL093W	MRPL37	P36532	105 aa		4.12	□□□□□ -1.75
YPT53	YNL093W	YRO2	P38079	344 aa		4.12	□□□□□ -1.75
YPT53	YNL093W	RGD1	P38339	666 aa		4.12	□□□□□ -1.75
YPT53	YNL093W	MUP3	P38734	546 aa		4.12	□□□□□ -1.75
YPT53	YNL093W	WSS1	P38838	269 aa		4.12	□□□□□ -1.75
YPT53	YNL093W	LIN1	P38852	340 aa	Predicted RBP	4.12	□□□□□ -1.75
YPT53	YNL093W	STT3	P39007	718 aa	Known RBP	4.12	□□□□□ -1.75
YPT53	YNL093W	YER010C	P40011	234 aa		4.12	□□□□□ -1.75
YPT53	YNL093W	PHB1	P40961	287 aa		4.12	□□□□□ -1.75
YPT53	YNL093W	BNA6	P43619	295 aa		4.12	□□□□□ -1.75
YPT53	YNL093W	NET1	P47035	1189 aa		4.12	□□□□□ -1.75
YPT53	YNL093W	MNT2	P53059	558 aa		4.12	□□□□□ -1.75
YPT53	YNL093W	DSD1	P53095	428 aa		4.12	□□□□□ -1.75
YPT53	YNL093W	RIM8	P53179	542 aa		4.12	□□□□□ -1.75
YPT53	YNL093W	ARC35	P53731	342 aa	Known RBP	4.12	□□□□□ -1.75
YPT53	YNL093W	SIW14	P53965	281 aa		4.12	□□□□□ -1.75
YPT53	YNL093W	KTR6	P54070	446 aa		4.12	□□□□□ -1.75
YPT53	YNL093W	ROD1	Q02805	837 aa		4.12	□□□□□ -1.75
YPT53	YNL093W	YPL109C	Q02981	657 aa		4.12	□□□□□ -1.75
YPT53	YNL093W	SKY1	Q03656	742 aa		4.12	□□□□□ -1.75
YPT53	YNL093W	ATC1	Q04005	294 aa		4.12	□□□□□ -1.75
YPT53	YNL093W	NHX1	Q04121	633 aa		4.12	□□□□□ -1.75
YPT53	YNL093W	SEG1	Q04279	960 aa		4.12	□□□□□ -1.75
YPT53	YNL093W	MRPL1	Q04599	285 aa		4.12	□□□□□ -1.75
YPT53	YNL093W	SEC10	Q06245	871 aa		4.12	□□□□□ -1.75
YPT53	YNL093W	LUC7	Q07508	261 aa	Predicted RBP	4.12	□□□□□ -1.75
YPT53	YNL093W	TCO89	Q08921	799 aa		4.12	□□□□□ -1.75
YPT53	YNL093W	FMP40	Q08968	688 aa	Predicted RBP	4.12	□□□□□ -1.75
YPT53	YNL093W	SPE3	Q12074	293 aa	Known RBP	4.12	□□□□□ -1.75
YPT53	YNL093W	DCS2	Q12123	353 aa		4.12	□□□□□ -1.75
YPT53	YNL093W	GPM3	Q12326	303 aa		4.12	□□□□□ -1.75
YPT53	YNL093W	MRPL23	Q12487	163 aa	Predicted RBP	4.12	□□□□□ -1.75
YPT53	YNL093W	LSO2	Q3E772	92 aa	Known RBP	4.12	□□□□□ -1.75
YPT53	YNL093W	HBN1	Q96VH4	193 aa		4.12	□□□□□ -1.75
YPT53	YNL093W	SRN2	Q99176	213 aa		4.12	□□□□□ -1.75
YPT53	YNL093W	STE2	D6VTK4	431 aa		4.11	□□□□□ -1.75
YPT53	YNL093W	FLP1	P03870	423 aa		4.11	□□□□□ -1.75
YPT53	YNL093W	APE1	P14904	514 aa		4.11	□□□□□ -1.75
YPT53	YNL093W	MDH1	P17505	334 aa	Known RBP RIP-Chip data	4.11	□□□□□ -1.75	not detected
YPT53	YNL093W	PRP2	P20095	876 aa	Predicted RBP	4.11	□□□□□ -1.75
YPT53	YNL093W	SEC62	P21825	274 aa		4.11	□□□□□ -1.75
YPT53	YNL093W	URA7	P28274	579 aa	Known RBP	4.11	□□□□□ -1.75
YPT53	YNL093W	HXT1	P32465	570 aa		4.11	□□□□□ -1.75
YPT53	YNL093W	SSO1	P32867	290 aa		4.11	□□□□□ -1.75
YPT53	YNL093W	RPT5	P33297	434 aa	Known RBP	4.11	□□□□□ -1.75
YPT53	YNL093W	OCT1	P35999	772 aa		4.11	□□□□□ -1.75
YPT53	YNL093W	KKQ8	P36004	724 aa		4.11	□□□□□ -1.75
YPT53	YNL093W	TPO5	P36029	618 aa		4.11	□□□□□ -1.75
YPT53	YNL093W	YKR015C	P36111	568 aa		4.11	□□□□□ -1.75
YPT53	YNL093W	GLG1	P36143	616 aa		4.11	□□□□□ -1.75
YPT53	YNL093W	MBP1	P39678	833 aa		4.11	□□□□□ -1.75
YPT53	YNL093W	RTR1	P40084	226 aa	Predicted RBP	4.11	□□□□□ -1.75
YPT53	YNL093W	ASG1	P40467	964 aa		4.11	□□□□□ -1.75
YPT53	YNL093W	MSS2	P40990	351 aa		4.11	□□□□□ -1.75
YPT53	YNL093W	SLS1	P42900	643 aa		4.11	□□□□□ -1.75
YPT53	YNL093W	ALK1	P43633	760 aa	Known RBP	4.11	□□□□□ -1.75
YPT53	YNL093W	RMR1	P53060	241 aa		4.11	□□□□□ -1.75
YPT53	YNL093W	YGR012W	P53206	393 aa		4.11	□□□□□ -1.75
YPT53	YNL093W	MNT4	P53745	580 aa		4.11	□□□□□ -1.75
YPT53	YNL093W	PDR16	P53860	351 aa	Known RBP	4.11	□□□□□ -1.75
YPT53	YNL093W	ABZ2	Q03266	374 aa		4.11	□□□□□ -1.75
YPT53	YNL093W	ADI1	Q03677	179 aa		4.11	□□□□□ -1.75
YPT53	YNL093W	GIM5	Q04493	163 aa		4.11	□□□□□ -1.75
YPT53	YNL093W	ARP10	Q04549	284 aa		4.11	□□□□□ -1.75
YPT53	YNL093W	GTO3	Q04806	366 aa		4.11	□□□□□ -1.75
YPT53	YNL093W	GFD1	Q04839	188 aa	Known RBP	4.11	□□□□□ -1.75
YPT53	YNL093W	GMC2	Q06201	188 aa		4.11	□□□□□ -1.75
YPT53	YNL093W	CMS1	Q07897	291 aa	Known RBP	4.11	□□□□□ -1.75
YPT53	YNL093W	PUS7	Q08647	676 aa	Known RBP	4.11	□□□□□ -1.75
YPT53	YNL093W	ICL2	Q12031	575 aa		4.11	□□□□□ -1.75
YPT53	YNL093W	YDL109C	Q12103	647 aa		4.11	□□□□□ -1.75
YPT53	YNL093W	HUA2	Q12134	243 aa		4.11	□□□□□ -1.75
YPT53	YNL093W	HXK2	P04807	486 aa	Known RBP	4.1	□□□□□ -1.75
YPT53	YNL093W	VAS1	P07806	1104 aa	Known RBP	4.1	□□□□□ -1.75
YPT53	YNL093W	YAP1	P19880	650 aa	Known RBP	4.1	□□□□□ -1.75
YPT53	YNL093W	ATP11	P32453	318 aa		4.1	□□□□□ -1.75
YPT53	YNL093W	UGA4	P32837	571 aa		4.1	□□□□□ -1.75

Retrieved 100 of 5,963 RNA–protein pairs in 20.2 ms