RNA–Protein interactions for RNA: YLR117C

CLF1, Transcript of Member of the NineTeen Complex (NTC), yeast

Gene CLF1, Length 2,064 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
CLF1	YLR117C	NAN1	Q02931	896 aa	Known RBP	4.82	□□□□□ -1.64
CLF1	YLR117C	GAL83	Q04739	417 aa		4.82	□□□□□ -1.64
CLF1	YLR117C	NGL1	Q08213	363 aa	Known RBP	4.82	□□□□□ -1.64
CLF1	YLR117C	YPL191C	Q08930	360 aa		4.82	□□□□□ -1.64
CLF1	YLR117C	DPH6	Q12429	685 aa		4.82	□□□□□ -1.64
CLF1	YLR117C	YHR213W-A	Q8TGT4	77 aa		4.82	□□□□□ -1.64
CLF1	YLR117C	POL4	P25615	582 aa		4.82	□□□□□ -1.64
CLF1	YLR117C	PTC6	P25646	442 aa		4.82	□□□□□ -1.64
CLF1	YLR117C	SSE2	P32590	693 aa	Known RBP	4.82	□□□□□ -1.64
CLF1	YLR117C	CYM1	P32898	989 aa		4.82	□□□□□ -1.64
CLF1	YLR117C	SEC61	P32915	480 aa		4.82	□□□□□ -1.64
CLF1	YLR117C	PAM1	P37304	830 aa	Known RBP	4.82	□□□□□ -1.64
CLF1	YLR117C	BAP2	P38084	609 aa		4.82	□□□□□ -1.64
CLF1	YLR117C	RXT2	P38255	430 aa		4.82	□□□□□ -1.64
CLF1	YLR117C	IMD2	P38697	523 aa	Known RBP	4.82	□□□□□ -1.64
CLF1	YLR117C	RIM4	P38741	713 aa		4.82	□□□□□ -1.64
CLF1	YLR117C	SBE22	P38814	852 aa		4.82	□□□□□ -1.64
CLF1	YLR117C	ATG7	P38862	630 aa		4.82	□□□□□ -1.64
CLF1	YLR117C	HAL5	P38970	855 aa	Known RBP	4.82	□□□□□ -1.64
CLF1	YLR117C	END3	P39013	349 aa		4.82	□□□□□ -1.64
CLF1	YLR117C	GID8	P40208	455 aa		4.82	□□□□□ -1.64
CLF1	YLR117C	ALA1	P40825	983 aa	Known RBP	4.82	□□□□□ -1.64
CLF1	YLR117C	CNN1	P43618	361 aa		4.82	□□□□□ -1.64
CLF1	YLR117C	RSM26	P47141	266 aa		4.82	□□□□□ -1.64
CLF1	YLR117C	YPT32	P51996	222 aa	Known RBP	4.82	□□□□□ -1.64
CLF1	YLR117C	MND1	P53102	219 aa		4.82	□□□□□ -1.64
CLF1	YLR117C	NUT1	P53114	1132 aa		4.82	□□□□□ -1.64
CLF1	YLR117C	APP1	P53933	587 aa		4.82	□□□□□ -1.64
CLF1	YLR117C	COG5	P53951	403 aa		4.82	□□□□□ -1.64
CLF1	YLR117C	YDR278C	Q05612	105 aa		4.82	□□□□□ -1.64
CLF1	YLR117C	GIC2	Q06648	383 aa		4.82	□□□□□ -1.64
CLF1	YLR117C	IWR1	Q07532	353 aa	Predicted RBP	4.82	□□□□□ -1.64
CLF1	YLR117C	ENV9	Q08651	330 aa		4.82	□□□□□ -1.64
CLF1	YLR117C	YLR053C	Q12026	108 aa		4.82	□□□□□ -1.64
CLF1	YLR117C	WRS1	Q12109	432 aa	Known RBP	4.82	□□□□□ -1.64
CLF1	YLR117C	TY3A-G	Q12173	290 aa		4.82	□□□□□ -1.64
CLF1	YLR117C	YDR061W	Q12298	539 aa		4.82	□□□□□ -1.64
CLF1	YLR117C	TSC13	Q99190	310 aa		4.82	□□□□□ -1.64
CLF1	YLR117C	TY3A-I	Q99219	290 aa		4.82	□□□□□ -1.64
CLF1	YLR117C	TRP2	P00899	507 aa	Known RBP	4.81	□□□□□ -1.64
CLF1	YLR117C	GAL1	P04385	528 aa		4.81	□□□□□ -1.64
CLF1	YLR117C	SAR1	P20606	190 aa	Known RBP	4.81	□□□□□ -1.64
CLF1	YLR117C	SGV1	P23293	657 aa	Known RBP	4.81	□□□□□ -1.64
CLF1	YLR117C	ASF2	P32448	525 aa	Predicted RBP	4.81	□□□□□ -1.64
CLF1	YLR117C	PPQ1	P32945	549 aa		4.81	□□□□□ -1.64
CLF1	YLR117C	RPT3	P33298	428 aa	Known RBP	4.81	□□□□□ -1.64
CLF1	YLR117C	GDH2	P33327	1092 aa	Known RBP	4.81	□□□□□ -1.64
CLF1	YLR117C	YHR045W	P38775	560 aa		4.81	□□□□□ -1.64
CLF1	YLR117C	EMP65	P40085	556 aa		4.81	□□□□□ -1.64
CLF1	YLR117C	COS4	P43542	379 aa		4.81	□□□□□ -1.64
CLF1	YLR117C	GPI8	P49018	411 aa		4.81	□□□□□ -1.64
CLF1	YLR117C	FMP48	P53233	369 aa		4.81	□□□□□ -1.64
CLF1	YLR117C	TWF1	P53250	332 aa		4.81	□□□□□ -1.64
CLF1	YLR117C	NOP19	P53317	196 aa	Predicted RBP	4.81	□□□□□ -1.64
CLF1	YLR117C	COS1	P53822	381 aa		4.81	□□□□□ -1.64
CLF1	YLR117C	ACS1	Q01574	713 aa		4.81	□□□□□ -1.64
CLF1	YLR117C	EGD1	Q02642	157 aa	Known RBP	4.81	□□□□□ -1.64
CLF1	YLR117C	YDR249C	Q03787	373 aa		4.81	□□□□□ -1.64
CLF1	YLR117C	YMR027W	Q04371	470 aa		4.81	□□□□□ -1.64
CLF1	YLR117C	YLR352W	Q06479	807 aa		4.81	□□□□□ -1.64
CLF1	YLR117C	INP54	Q08227	384 aa	Known RBP	4.81	□□□□□ -1.64
CLF1	YLR117C	THI21	Q08975	551 aa		4.81	□□□□□ -1.64
CLF1	YLR117C	TAH18	Q12181	623 aa		4.81	□□□□□ -1.64
CLF1	YLR117C	HRT3	Q12347	344 aa		4.81	□□□□□ -1.64
CLF1	YLR117C	RRI2	Q12348	645 aa		4.81	□□□□□ -1.64
CLF1	YLR117C	AVL9	Q12500	764 aa		4.81	□□□□□ -1.64
CLF1	YLR117C	YOS9	Q99220	542 aa		4.81	□□□□□ -1.64
CLF1	YLR117C	RHO1	P06780	209 aa	Known RBP	4.81	□□□□□ -1.64
CLF1	YLR117C	CTR86	P25355	563 aa		4.81	□□□□□ -1.64
CLF1	YLR117C	CAP1	P28495	268 aa	Known RBP	4.81	□□□□□ -1.64
CLF1	YLR117C	CYS4	P32582	507 aa	Known RBP	4.81	□□□□□ -1.64
CLF1	YLR117C	RRT2	P38332	387 aa		4.81	□□□□□ -1.64
CLF1	YLR117C	YDR089W	P38966	869 aa		4.81	□□□□□ -1.64
CLF1	YLR117C	FAA2	P39518	744 aa		4.81	□□□□□ -1.64
CLF1	YLR117C	YAT2	P40017	923 aa		4.81	□□□□□ -1.64
CLF1	YLR117C	KRE29	P40026	464 aa		4.81	□□□□□ -1.64
CLF1	YLR117C	TED1	P40533	473 aa		4.81	□□□□□ -1.64
CLF1	YLR117C	RTS2	P40962	232 aa		4.81	□□□□□ -1.64
CLF1	YLR117C	QRI1	P43123	477 aa	Known RBP	4.81	□□□□□ -1.64
CLF1	YLR117C	MAD3	P47074	515 aa		4.81	□□□□□ -1.64
CLF1	YLR117C	DAM1	P53267	343 aa		4.81	□□□□□ -1.64
CLF1	YLR117C	SOL4	P53315	255 aa		4.81	□□□□□ -1.64
CLF1	YLR117C	SRP1	Q02821	542 aa	Known RBP	4.81	□□□□□ -1.64
CLF1	YLR117C	SEG1	Q04279	960 aa		4.81	□□□□□ -1.64
CLF1	YLR117C	LOT6	Q07923	191 aa		4.81	□□□□□ -1.64
CLF1	YLR117C	THI20	Q08224	551 aa		4.81	□□□□□ -1.64
CLF1	YLR117C	SKI7	Q08491	747 aa	Predicted RBP	4.81	□□□□□ -1.64
CLF1	YLR117C	PGC1	Q08959	321 aa		4.81	□□□□□ -1.64
CLF1	YLR117C	FEX2	Q08991	375 aa		4.81	□□□□□ -1.64
CLF1	YLR117C	RAD59	Q12223	238 aa		4.81	□□□□□ -1.64
CLF1	YLR117C	SPE4	Q12455	300 aa		4.81	□□□□□ -1.64
CLF1	YLR117C	DCP1	Q12517	231 aa	Predicted RBP	4.81	□□□□□ -1.64
CLF1	YLR117C	COX4	P04037	155 aa		4.8	□□□□□ -1.64
CLF1	YLR117C	CBP6	P07253	162 aa	Predicted RBP	4.8	□□□□□ -1.64
CLF1	YLR117C	IDI1	P15496	288 aa		4.8	□□□□□ -1.64
CLF1	YLR117C	HNM1	P19807	563 aa		4.8	□□□□□ -1.64
CLF1	YLR117C	DBP2	P24783	546 aa	Known RBP	4.8	□□□□□ -1.64
CLF1	YLR117C	SAC1	P32368	623 aa	Known RBP	4.8	□□□□□ -1.64
CLF1	YLR117C	YSC84	P32793	468 aa		4.8	□□□□□ -1.64
CLF1	YLR117C	GUA1	P38625	525 aa	Known RBP	4.8	□□□□□ -1.64

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