RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000641643.1

SYT6-210, Transcript of synaptotagmin 6, humanhuman

BASIC

Gene SYT6, Length 1,587 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Exosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYT6-210ENST00000641643 PSMC4P43686 418 aa26.75■■□□□ 1.87
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SYT6-210ENST00000641643 ASCC2Q9H1I8 757 aaPredicted RBP26.75■■□□□ 1.87
SYT6-210ENST00000641643 IFNL3Q8IZI9 196 aa26.75■■□□□ 1.87
SYT6-210ENST00000641643 OSBPL3Q9H4L5 887 aa26.75■■□□□ 1.87
SYT6-210ENST00000641643 EMILIN3Q9NT22 766 aa26.75■■□□□ 1.87
SYT6-210ENST00000641643 SMIM22K7EJ46 135 aa26.74■■□□□ 1.87
SYT6-210ENST00000641643 HOXD10P28358 340 aa26.74■■□□□ 1.87
SYT6-210ENST00000641643 HOXA7P31268 230 aaPredicted RBP26.74■■□□□ 1.87
SYT6-210ENST00000641643 GUCY1A2P33402 732 aa26.74■■□□□ 1.87
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SYT6-210ENST00000641643 ANKRD13CQ8N6S4 541 aa26.74■■□□□ 1.87
SYT6-210ENST00000641643 LOC285556D6RIA3 1793 aa26.74■■□□□ 1.87
SYT6-210ENST00000641643 AKR1B1P15121 316 aa26.73■■□□□ 1.87
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SYT6-210ENST00000641643 ACER1Q8TDN7 264 aa26.73■■□□□ 1.87
SYT6-210ENST00000641643 KIAA1683Q9H0B3 1180 aa26.73■■□□□ 1.87
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SYT6-210ENST00000641643 EPB41L4AQ9HCS5 686 aaPredicted RBP26.73■■□□□ 1.87
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SYT6-210ENST00000641643 C12orf42Q96LP6 360 aa26.72■■□□□ 1.87
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SYT6-210ENST00000641643 ZNF287Q9HBT7 754 aa26.72■■□□□ 1.87
SYT6-210ENST00000641643 HELLSQ9NRZ9 838 aa26.72■■□□□ 1.87
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SYT6-210ENST00000641643 FAM110CQ1W6H9 321 aa26.71■■□□□ 1.87
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SYT6-210ENST00000641643 CCDC129Q6ZRS4 1044 aa26.71■■□□□ 1.87
SYT6-210ENST00000641643 ARHGEF10LQ9HCE6 1279 aa26.71■■□□□ 1.87
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SYT6-210ENST00000641643 PTCH2Q9Y6C5 1203 aa26.7■■□□□ 1.86
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SYT6-210ENST00000641643 PDE4BQ07343 736 aa26.66■■□□□ 1.86
SYT6-210ENST00000641643 NMIQ13287 307 aaPredicted RBP26.66■■□□□ 1.86
SYT6-210ENST00000641643 ZNF444Q8N0Y2 327 aaPredicted RBP26.66■■□□□ 1.86
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SYT6-210ENST00000641643 SDSP20132 328 aa26.65■■□□□ 1.86
SYT6-210ENST00000641643 CATSPERGQ6ZRH7 1159 aa26.65■■□□□ 1.86
SYT6-210ENST00000641643 CLEC10AQ8IUN9 316 aa26.65■■□□□ 1.86
SYT6-210ENST00000641643 COA7Q96BR5 231 aa26.65■■□□□ 1.86
SYT6-210ENST00000641643 RPAP3Q9H6T3 665 aaPredicted RBP26.65■■□□□ 1.86
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SYT6-210ENST00000641643 LPAR1Q92633 364 aa26.63■■□□□ 1.85
SYT6-210ENST00000641643 ARMC5Q96C12 935 aa26.63■■□□□ 1.85
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SYT6-210ENST00000641643 HTTP42858 3142 aa26.62■■□□□ 1.85
SYT6-210ENST00000641643 PDE4AP27815 886 aa26.62■■□□□ 1.85
SYT6-210ENST00000641643 SIAH1Q8IUQ4 282 aa26.62■■□□□ 1.85
SYT6-210ENST00000641643 CCAR1Q8IX12 1150 aaKnown RBP26.62■■□□□ 1.85
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SYT6-210ENST00000641643 CENPFP49454 3210 aa26.61■■□□□ 1.85
SYT6-210ENST00000641643 TANGO6Q9C0B7 1094 aa26.61■■□□□ 1.85
SYT6-210ENST00000641643 CCDC171Q6TFL3 1326 aa26.6■■□□□ 1.85
SYT6-210ENST00000641643 SPICE1Q8N0Z3 855 aa26.6■■□□□ 1.85
SYT6-210ENST00000641643 GOPCQ9HD26 462 aa26.6■■□□□ 1.85
SYT6-210ENST00000641643 TXNRD2Q9NNW7 524 aa26.6■■□□□ 1.85
SYT6-210ENST00000641643 RBPJLQ9UBG7 517 aa26.6■■□□□ 1.85
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